Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
385,815 |
G→T |
89.4% |
pseudogene (109/1458 nt) |
yaiT → |
pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 385,815 | 0 | G | T | 89.4%
| 628.4
/ 70.3
| 246 | pseudogene (109/1458 nt) | yaiT | pseudogene, autotransporter family;putative structure; Not classified; interrupted by IS3; putative flagellin structural protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (11/15); new base T (132/88); total (143/103) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.53e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
GATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACG > CP009273/385672‑385959
|
gATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATaa < 2:2844047/148‑1 (MQ=255)
aTCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAAt < 1:1000880/148‑1 (MQ=255)
tCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATc < 1:2563243/148‑1 (MQ=255)
tCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATc < 1:1669533/148‑1 (MQ=255)
cTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGt > 2:3104781/1‑148 (MQ=255)
tattaCGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTa > 2:2391602/1‑148 (MQ=255)
tattaCGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTa < 2:161548/148‑1 (MQ=255)
cGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCa > 1:1934722/1‑148 (MQ=255)
gTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCAc < 2:1188498/148‑1 (MQ=255)
tCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACt < 2:1631215/148‑1 (MQ=255)
tCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACt > 2:965104/1‑148 (MQ=255)
ccTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTg < 1:903011/148‑1 (MQ=255)
ccTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTg > 2:1726557/1‑148 (MQ=255)
cTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGa < 1:1149899/148‑1 (MQ=255)
cTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGa > 1:1849308/1‑148 (MQ=255)
cTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGa < 2:1861475/148‑1 (MQ=255)
aggaggGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGAGTg > 2:420102/1‑148 (MQ=255)
ggaggGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTgg > 2:1423855/1‑148 (MQ=255)
ggATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATc > 1:346831/1‑148 (MQ=255)
ggATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATc < 2:913132/148‑1 (MQ=255)
gACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCatat > 1:6525/1‑148 (MQ=255)
cAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATgg < 2:1409189/148‑1 (MQ=255)
cAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTACACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATgg > 1:2348186/1‑148 (MQ=255)
aTGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATa < 1:3097371/148‑1 (MQ=255)
aTGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATa > 1:821359/1‑148 (MQ=255)
cACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAagg > 1:1595705/1‑148 (MQ=255)
cTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAaggca < 2:2586846/148‑1 (MQ=255)
cTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAaggca > 1:1380729/1‑148 (MQ=255)
cTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAaggca < 2:2242555/148‑1 (MQ=255)
ccTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAaggcagg < 1:3218670/148‑1 (MQ=255)
ccTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAaggcagg > 2:2426918/1‑148 (MQ=255)
gAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACt < 2:191948/148‑1 (MQ=255)
aaaaGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGt > 1:998651/1‑148 (MQ=255)
aaaaGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGt > 1:2672039/1‑148 (MQ=255)
aaaGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTa > 2:2776629/1‑148 (MQ=255)
aGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGa < 2:1502103/148‑1 (MQ=255)
aGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGa > 2:515965/1‑148 (MQ=255)
gAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGAt > 1:692945/1‑148 (MQ=255)
gAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGAt < 2:1527278/148‑1 (MQ=255)
aaaCTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATg > 2:1726777/1‑148 (MQ=255)
aCTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGc > 2:255334/1‑148 (MQ=255)
agtaTCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTAt > 2:1957686/1‑148 (MQ=255)
cacaATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTaaa > 2:3008090/1‑148 (MQ=255)
cacaATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTaaa < 2:2148763/148‑1 (MQ=255)
acaATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAAc > 2:2456236/1‑148 (MQ=255)
aaTTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACta > 1:766709/1‑148 (MQ=255)
aTTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACtat < 2:211662/148‑1 (MQ=255)
ttAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACtata < 2:2142964/148‑1 (MQ=255)
tAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAg < 1:438014/148‑1 (MQ=255)
gCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTg < 1:1450321/148‑1 (MQ=255)
gCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTg > 1:2510835/1‑148 (MQ=255)
cATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTgg < 2:521079/148‑1 (MQ=255)
aTTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGt < 2:3273680/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGtt < 1:3003937/148‑1 (MQ=255)
gCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTa > 2:1723212/1‑148 (MQ=255)
gCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTa < 2:737512/148‑1 (MQ=255)
aCTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTAtt > 1:1958895/1‑148 (MQ=255)
aCTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTAtt > 1:2315182/1‑148 (MQ=255)
tctGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTac > 1:3188523/1‑148 (MQ=255)
tctGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTac > 1:724661/1‑148 (MQ=255)
tGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTacaa > 2:1180307/1‑148 (MQ=255)
aTCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTacaacaaca < 2:3192172/148‑1 (MQ=255)
tCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAacac > 1:152161/1‑148 (MQ=255)
aCCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCa < 1:2106388/148‑1 (MQ=255)
aCCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCa > 2:2193972/1‑148 (MQ=255)
ccTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCaa < 1:2628820/148‑1 (MQ=255)
ctctCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAt < 2:1380729/148‑1 (MQ=255)
ctctCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAt > 1:1702563/1‑148 (MQ=255)
ctctCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAt < 2:2599028/148‑1 (MQ=255)
cAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTg < 2:2103353/148‑1 (MQ=255)
aGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGa < 1:2268942/148‑1 (MQ=255)
cTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGAttt > 1:1954/1‑148 (MQ=255)
cTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGAttt < 2:2348186/148‑1 (MQ=255)
tGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGAt < 1:150437/148‑1 (MQ=255)
gcagcaAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAATGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATc < 2:395458/148‑1 (MQ=255)
aaaCTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTAAGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTcc < 2:2273978/148‑1 (MQ=255)
aaCTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCt > 2:169/1‑148 (MQ=255)
aaCTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCt > 2:165/1‑148 (MQ=255)
aaCTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCt < 2:2928514/148‑1 (MQ=255)
cTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCttt > 2:1359690/1‑148 (MQ=255)
cTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCttt > 1:3255706/1‑148 (MQ=255)
cTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCttt > 2:3081538/1‑148 (MQ=255)
cTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCttt > 2:3081640/1‑148 (MQ=255)
aTGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTaa > 2:1050881/1‑148 (MQ=255)
gATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACg > 2:755613/1‑148 (MQ=255)
gATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACg > 1:133967/1‑148 (MQ=255)
gATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACg > 1:1798013/1‑148 (MQ=255)
aTACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACgg < 2:182869/148‑1 (MQ=255)
aTACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACgg > 2:1573280/1‑148 (MQ=255)
tACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGc > 1:2480121/1‑148 (MQ=255)
ccTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGa > 1:144193/1‑148 (MQ=255)
tGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATa > 2:228335/1‑148 (MQ=255)
ggACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATAc > 1:1084985/1‑148 (MQ=255)
gACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATAcc > 1:1741670/1‑148 (MQ=255)
aCTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCg > 1:104763/1‑148 (MQ=255)
aCTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCg > 1:2381255/1‑148 (MQ=255)
atatCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTaa < 1:1200148/148‑1 (MQ=255)
atatCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTaa < 2:1318908/148‑1 (MQ=255)
atCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACg > 1:2290638/1‑148 (MQ=255)
atCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACg > 2:1300913/1‑148 (MQ=255)
|
GATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACG > CP009273/385672‑385959
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TTGATGGATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGC > CP009273/385666‑385961
|
TTGATGGATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCT < SRR19973070.2465325/150‑1 (MQ=60)
TTGATGGATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCT < SRR19973070.2465379/150‑1 (MQ=60)
GATGGATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTAT < SRR19973070.1484204/150‑1 (MQ=60)
ATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCC < SRR19973070.1008012/150‑1 (MQ=60)
TCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCNC < SRR19973070.1680993/150‑1 (MQ=60)
TCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCC < SRR19973070.2558943/150‑1 (MQ=60)
TCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCC < SRR19973070.2579991/150‑1 (MQ=60)
CAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCG > SRR19973070.2336802/1‑150 (MQ=60)
CAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACCCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCG > SRR19973070.2189408/1‑150 (MQ=60)
ACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTT > SRR19973070.1065873/1‑150 (MQ=60)
TTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTAC > SRR19973070.114021/1‑150 (MQ=60)
TACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCA > SRR19973070.1947734/1‑150 (MQ=60)
TACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCA < SRR19973070.117912/150‑1 (MQ=60)
ACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCAC < SRR19973070.895860/150‑1 (MQ=60)
GTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTT > SRR19973070.485750/1‑150 (MQ=60)
CCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGA > SRR19973070.1861984/1‑150 (MQ=60)
CCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGAT < SRR19973070.909417/150‑1 (MQ=60)
CTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATT < SRR19973070.1157910/150‑1 (MQ=60)
TGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTG < SRR19973070.1517910/150‑1 (MQ=60)
TGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTG > SRR19973070.1970658/1‑150 (MQ=60)
GAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGG > SRR19973070.1328033/1‑150 (MQ=60)
AGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATC > SRR19973070.349354/1‑150 (MQ=60)
GGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCA < SRR19973070.741692/150‑1 (MQ=60)
ATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATAT > SRR19973070.6622/1‑150 (MQ=60)
GACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTACACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGG > SRR19973070.2363762/1‑150 (MQ=60)
ACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGA > SRR19973070.800775/1‑150 (MQ=60)
ACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGA > SRR19973070.801055/1‑150 (MQ=60)
AAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATA > SRR19973070.826957/1‑150 (MQ=60)
AAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATA > SRR19973070.2947234/1‑150 (MQ=60)
ATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAG < SRR19973070.3117312/150‑1 (MQ=60)
ATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAG < SRR19973070.3117332/150‑1 (MQ=60)
TGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGG > SRR19973070.1606857/1‑150 (MQ=60)
CACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCA > SRR19973070.1390088/1‑150 (MQ=60)
CACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCA < SRR19973070.2824893/150‑1 (MQ=60)
CTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGG > SRR19973070.429941/1‑150 (MQ=60)
CCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCA < SRR19973070.3239475/150‑1 (MQ=60)
CCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCA < SRR19973070.3239482/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACT < SRR19973070.3158385/150‑1 (MQ=60)
GAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGT > SRR19973070.1005773/1‑150 (MQ=60)
GAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGT > SRR19973070.1005703/1‑150 (MQ=60)
GAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGT > SRR19973070.2689394/1‑150 (MQ=60)
AAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTA > SRR19973070.1953586/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAG > SRR19973070.1990158/1‑150 (MQ=60)
AAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGAT > SRR19973070.698026/1‑150 (MQ=60)
AAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGAT > SRR19973070.697890/1‑150 (MQ=60)
AAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGC > SRR19973070.1837352/1‑150 (MQ=60)
GTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTAT > SRR19973070.262969/1‑150 (MQ=60)
GTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTAT > SRR19973070.1888118/1‑150 (MQ=60)
ATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAA > SRR19973070.3311857/1‑150 (MQ=60)
ACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTA > SRR19973070.772092/1‑150 (MQ=60)
ACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTA > SRR19973070.1604877/1‑150 (MQ=60)
ACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTA > SRR19973070.2441494/1‑150 (MQ=60)
AATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATA > SRR19973070.2514210/1‑150 (MQ=60)
ATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAG > SRR19973070.23343/1‑150 (MQ=60)
TAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTG > SRR19973070.2527180/1‑150 (MQ=60)
TAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTG < SRR19973070.441190/150‑1 (MQ=60)
GCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGT < SRR19973070.1460622/150‑1 (MQ=60)
GCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGT < SRR19973070.1460452/150‑1 (MQ=60)
GCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGT < SRR19973070.1460408/150‑1 (MQ=60)
TTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTT < SRR19973070.3023139/150‑1 (MQ=60)
GCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATT > SRR19973070.2330569/1‑150 (MQ=60)
GCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATT > SRR19973070.2330590/1‑150 (MQ=60)
GCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATT > SRR19973070.1972088/1‑150 (MQ=60)
ACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTAC > SRR19973070.729806/1‑150 (MQ=60)
ACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTAC > SRR19973070.3209152/1‑150 (MQ=60)
ACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTAC > SRR19973070.729786/1‑150 (MQ=60)
TGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACA > SRR19973070.1262142/1‑150 (MQ=60)
GGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAA > SRR19973070.357870/1‑150 (MQ=60)
GGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAA > SRR19973070.2595688/1‑150 (MQ=60)
TATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTTCAACAAAAC > SRR19973070.154446/1‑150 (MQ=60)
TATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACAC > SRR19973070.153439/1‑150 (MQ=60)
TATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAATAACAC < SRR19973070.2396974/150‑1 (MQ=60)
ACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAT < SRR19973070.2120516/150‑1 (MQ=60)
ACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAAT > SRR19973070.1714302/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATG < SRR19973070.2645967/150‑1 (MQ=60)
CCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATG < SRR19973070.2646111/150‑1 (MQ=60)
CTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGG > SRR19973070.1963071/1‑150 (MQ=60)
AGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATT < SRR19973070.1676558/150‑1 (MQ=60)
AGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATT < SRR19973070.2284006/150‑1 (MQ=60)
AGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATT < SRR19973070.2284124/150‑1 (MQ=60)
GGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTT > SRR19973070.2298133/1‑150 (MQ=60)
GGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTT > SRR19973070.1990/1‑150 (MQ=60)
GGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGANAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTT > SRR19973070.1691296/1‑150 (MQ=60)
CTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCG < SRR19973070.3275705/150‑1 (MQ=60)
TGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCA < SRR19973070.151709/150‑1 (MQ=60)
CAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGT > SRR19973070.943239/1‑150 (MQ=60)
CAAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCT < SRR19973070.3215959/150‑1 (MQ=60)
AAACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTT > SRR19973070.1395491/1‑150 (MQ=60)
AACTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTT > SRR19973070.3276677/1‑150 (MQ=60)
CTATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAA < SRR19973070.2510975/150‑1 (MQ=60)
CTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGGTTTCGATCAGTCCTTTAA > SRR19973070.1738393/1‑150 (MQ=60)
CTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAA > SRR19973070.1738571/1‑150 (MQ=60)
ATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACG > SRR19973070.1810429/1‑150 (MQ=60)
ATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACG > SRR19973070.1810777/1‑150 (MQ=60)
ATGATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACG > SRR19973070.135133/1‑150 (MQ=60)
GATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGC > SRR19973070.2496262/1‑150 (MQ=60)
ATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCG > SRR19973070.3149695/1‑150 (MQ=60)
ATACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCG > SRR19973070.1806915/1‑150 (MQ=60)
TACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGA > SRR19973070.145434/1‑150 (MQ=60)
TACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGA > SRR19973070.145429/1‑150 (MQ=60)
TACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGA > SRR19973070.145271/1‑150 (MQ=60)
ACCTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGAT > SRR19973070.1020873/1‑150 (MQ=60)
CTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATAC > SRR19973070.1095778/1‑150 (MQ=60)
CTGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATAC > SRR19973070.1092512/1‑150 (MQ=60)
TGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACC > SRR19973070.68428/1‑150 (MQ=60)
TGGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACC > SRR19973070.1753749/1‑150 (MQ=60)
GGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCG > SRR19973070.2396990/1‑150 (MQ=60)
GGACTTATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCG > SRR19973070.105752/1‑150 (MQ=60)
ACTTATATCTATAATCCCGTTACAGAACTTTATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGAACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTT < SRR19973070.2007528/150‑1 (MQ=60)
ATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACG > SRR19973070.2305866/1‑150 (MQ=60)
ATATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACG < SRR19973070.1208576/150‑1 (MQ=60)
ATCTATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGC < SRR19973070.1375037/150‑1 (MQ=60)
|
TTGATGGATCAACTTATTACGTCCCTGAGGAGGGATGACAAATGCACTCCTGGAAAAAGAAACTTGTAGTATCACAATTAGCATTGGCTTGCACTCTGGCTATCACCTCTCAGGCTAATGCAGCAAACTATGATACCTGGACTTATATCGATAATCCCGTTACAGCACTTGATTGGGATCATATGGATAAGGCAGGCACTGTAGATGGCAACTATGTAAACTATAGTGGTTTTGTCTATTACAACAACACCAATGGTGATTTCGATCAGTCCTTTAACGGCGATACCGTTAACGGC > CP009273/385666‑385961
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
