Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,097,822 |
G→T |
100% |
E115* (GAA→TAA) |
pfkA → |
6‑phosphofructokinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,097,822 | 0 | G | T | 100.0%
| 705.5
/ NA
| 210 | E115* (GAA→TAA) | pfkA | 6‑phosphofructokinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (112/98); total (112/98) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGC > CP009273/4097677‑4097966
|
tACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTaa < 1:1037276/148‑1 (MQ=255)
gTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATg < 1:2603426/148‑1 (MQ=255)
tcctccGTTCAGCGCGTTGACCGGAATTACGCGACGAGAAAATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGAGGAATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGCTGACGGTTCATACAAGGGTGCAATCCGTCTGACATAAATggt > 2:1569023/1‑147 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg > 2:2919543/1‑148 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg < 2:199368/148‑1 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg > 1:1241389/1‑148 (MQ=255)
ccTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGc < 1:1602545/148‑1 (MQ=255)
tCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCtt < 1:930323/148‑1 (MQ=255)
cGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc < 2:2358674/148‑1 (MQ=255)
cGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc > 1:224355/1‑148 (MQ=255)
cGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc < 1:1903527/148‑1 (MQ=255)
cGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc > 2:936685/1‑148 (MQ=255)
ggTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTcc < 2:1093769/148‑1 (MQ=255)
ttCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCg > 1:2300529/1‑148 (MQ=255)
tGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGc < 1:2613000/148‑1 (MQ=255)
gcgcGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCa > 2:3256686/1‑148 (MQ=255)
cgcgTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCAt > 1:2529405/1‑148 (MQ=255)
cgcgTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCAt < 2:2532734/148‑1 (MQ=255)
cgTTTCCCGGACTTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCg < 2:2826721/148‑1 (MQ=255)
tttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGt < 1:2446724/148‑1 (MQ=255)
ttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTc < 1:3120606/148‑1 (MQ=255)
ttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTc > 1:2448279/1‑148 (MQ=255)
ccGGACTTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGc < 2:2430363/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCggg > 1:1556952/1‑148 (MQ=255)
aaTTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTAGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCggg < 1:541934/148‑1 (MQ=255)
aaTTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTAGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCggg < 1:2069614/148‑1 (MQ=255)
ttCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCa > 1:1088888/1‑148 (MQ=255)
ttCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCa > 1:1193498/1‑148 (MQ=255)
tCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCAc > 2:3241240/1‑148 (MQ=255)
ccGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACt < 1:3231037/148‑1 (MQ=255)
ccGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACt < 1:1850039/148‑1 (MQ=255)
ccGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACt < 1:179857/148‑1 (MQ=255)
cgacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATc > 2:477276/1‑148 (MQ=255)
cgacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATc > 1:662058/1‑148 (MQ=255)
acgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGa > 2:607965/1‑148 (MQ=255)
cgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGAc > 1:1192903/1‑148 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTCTCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 1:828051/148‑1 (MQ=255)
gaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAAc > 1:732027/1‑148 (MQ=255)
aaCATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACg > 1:2783071/1‑148 (MQ=255)
cATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGAc > 2:212440/1‑148 (MQ=255)
cATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGAc > 2:1882969/1‑148 (MQ=255)
cATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGAc < 1:1446040/148‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaa < 2:1414778/148‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaa < 1:588179/148‑1 (MQ=255)
cgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa < 1:197008/148‑1 (MQ=255)
gTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCa < 2:2505523/148‑1 (MQ=255)
tGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCAc < 2:1371169/148‑1 (MQ=255)
gCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTg > 1:334474/1‑148 (MQ=255)
tATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGAc > 1:3055219/1‑148 (MQ=255)
tATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGAc > 2:2939750/1‑148 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTa > 1:2922915/1‑148 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTa > 1:1195139/1‑148 (MQ=255)
aaaaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTacac > 2:823590/1‑148 (MQ=255)
aaaaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTacac > 2:275750/1‑148 (MQ=255)
aaaaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTacac > 1:1837158/1‑148 (MQ=255)
aCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTAt > 1:1399638/1‑148 (MQ=255)
aCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTAt > 2:2773794/1‑148 (MQ=255)
cTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCg > 1:1326219/1‑148 (MQ=255)
tGAAAAAACGTGCTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGAAGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCCTCGGTCTGCCGGGCACTATCGACCACGACATCAAAGGCACTGACTACACTCTCgg > 2:1793219/1‑148 (MQ=255)
gAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGt < 1:2049677/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGtt < 2:412293/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGttt < 1:81748/148‑1 (MQ=255)
aaaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGttt < 2:1726623/148‑1 (MQ=255)
aaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttc > 2:1954476/1‑148 (MQ=255)
aaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttct > 1:2238838/1‑148 (MQ=255)
aCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc > 1:290929/1‑148 (MQ=255)
aCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc > 1:1634940/1‑148 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa < 2:518043/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa > 1:853666/1‑148 (MQ=255)
tGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACt > 1:2770454/1‑148 (MQ=255)
ggTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTg > 2:2651737/1‑148 (MQ=255)
tATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACAGTATCGGTTTCTTCACTgcg > 1:1238259/1‑148 (MQ=255)
tATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcg > 2:1579766/1‑148 (MQ=255)
aTCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcgc > 2:730819/1‑148 (MQ=255)
cGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTg < 1:197869/148‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc > 1:1406780/1‑132 (MQ=255)
cTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCg > 2:2854653/1‑148 (MQ=255)
ggtggtTATCGGCGGTGAAGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGtt > 2:2684589/1‑148 (MQ=255)
aTCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAg < 1:363874/148‑1 (MQ=255)
aTCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAg < 1:2993686/148‑1 (MQ=255)
tCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGc > 2:2593263/1‑148 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGa < 2:2734853/148‑1 (MQ=255)
gcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGAt < 2:1532637/148‑1 (MQ=255)
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CGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCAC < SRR19973070.651137/150‑1 (MQ=60)
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|
CGGTACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCGTATT > CP009273/4097674‑4097971
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
