Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,097,822 |
G→T |
100% |
E115* (GAA→TAA) |
pfkA → |
6‑phosphofructokinase I |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,097,822 | 0 | G | T | 98.9%
| 862.1
/ 0.7
| 264 | E115* (GAA→TAA) | pfkA | 6‑phosphofructokinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (152/109); total (152/112) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.52e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
TACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCG > CP009273/4097677‑4097967
|
aCGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATg > 1:4188532/1‑150 (MQ=255)
aCGTTCCTCGGGTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATg < 2:3109253/150‑1 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCt > 1:1143307/1‑150 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCt > 2:965217/1‑150 (MQ=255)
cTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc > 2:1675882/1‑150 (MQ=255)
cTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc > 1:14098/1‑150 (MQ=255)
cTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTc > 2:837818/1‑150 (MQ=255)
tCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTcc < 2:4270208/150‑1 (MQ=255)
tCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTcc < 2:3343152/150‑1 (MQ=255)
ggTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCg < 2:516738/150‑1 (MQ=255)
tGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCAt > 1:3550578/1‑150 (MQ=255)
cgTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGt < 1:4375948/150‑1 (MQ=255)
gAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGc < 1:1980492/150‑1 (MQ=255)
cgcgACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATc > 1:245445/1‑150 (MQ=255)
cgcgACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATc > 1:2839501/1‑150 (MQ=255)
cgacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGa < 2:1216144/150‑1 (MQ=255)
cgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACaa > 2:485081/1‑150 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAAc < 2:4512859/150‑1 (MQ=255)
agaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACg > 1:1662192/1‑150 (MQ=255)
aTCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGACACAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATc > 1:3108347/1‑150 (MQ=255)
aTCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATc > 1:2235438/1‑150 (MQ=255)
tCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCa > 2:307620/1‑150 (MQ=255)
tCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCa < 2:2702723/150‑1 (MQ=255)
ccGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaa < 1:4554662/150‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa < 1:3264263/150‑1 (MQ=255)
cgcgCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa < 1:3264797/150‑1 (MQ=255)
gcgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAg > 1:1846224/1‑150 (MQ=255)
gcgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAg < 2:4951985/150‑1 (MQ=255)
cgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAgg < 1:3902845/150‑1 (MQ=255)
gcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGc > 2:2439627/1‑150 (MQ=255)
gcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGc > 2:4959027/1‑150 (MQ=255)
cGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCAc > 1:90995/1‑150 (MQ=255)
cGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCAc > 1:2717272/1‑150 (MQ=255)
gTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACt > 1:1319697/1‑150 (MQ=255)
gTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACt > 1:1320038/1‑150 (MQ=255)
ggCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTATGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGa > 2:2746783/1‑150 (MQ=255)
gCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGAAGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGAc < 1:409888/150‑1 (MQ=255)
aTCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTac < 1:1386294/150‑1 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTaca < 2:3439869/150‑1 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTaca > 2:4062492/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTacac > 1:992187/1‑150 (MQ=255)
cGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTacac > 1:3817175/1‑150 (MQ=255)
gAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACt > 2:2155174/1‑150 (MQ=255)
aaaaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTa > 1:3438605/1‑150 (MQ=255)
aCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCg < 2:2799139/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCgg > 2:3648337/1‑150 (MQ=255)
ccTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCgg > 2:315458/1‑150 (MQ=255)
cTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGt > 2:184335/1‑150 (MQ=255)
aaaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttct < 2:2156343/150‑1 (MQ=255)
aaaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttct > 1:1720334/1‑150 (MQ=255)
aaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttctt > 1:2544858/1‑150 (MQ=255)
aaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc > 2:4691680/1‑150 (MQ=255)
aaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc < 2:4792221/150‑1 (MQ=255)
aaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGATCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa > 1:3173673/1‑150 (MQ=255)
ggTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcg > 2:1427761/1‑150 (MQ=255)
gTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcgc > 1:46733/1‑150 (MQ=255)
gTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcgc > 1:3753661/1‑150 (MQ=255)
aTCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTg < 1:4407804/150‑1 (MQ=255)
aTCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTg > 2:4440081/1‑150 (MQ=255)
cGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAg > 2:255334/1‑150 (MQ=255)
cGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAg > 1:1213494/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCAcc > 2:1097918/1‑150 (MQ=255)
gcTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGt > 2:822196/1‑150 (MQ=255)
gcTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGt < 1:2016396/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGtt < 1:4725152/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGtt < 1:2353607/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCATACATGGGTGAAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCAATATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCTGTTTCTTCAATGCGCTGAGCAcagat > 1:489689/1‑146 (MQ=255)
gtggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTa > 1:587284/1‑150 (MQ=255)
tggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAg < 1:800712/150‑1 (MQ=255)
ggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGa < 2:1027374/150‑1 (MQ=255)
ggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGa < 2:3788031/150‑1 (MQ=255)
ggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGa > 2:3746441/1‑150 (MQ=255)
ttATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAg > 2:2363790/1‑150 (MQ=255)
ttATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAg > 1:5109779/1‑150 (MQ=255)
aTCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCTATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCg > 2:3036866/1‑150 (MQ=255)
tCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGa > 1:2287759/1‑150 (MQ=255)
cggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGAt < 2:2966015/150‑1 (MQ=255)
cggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGAt > 2:3680048/1‑150 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATc > 1:1668296/1‑150 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATc < 1:2161077/150‑1 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATc < 2:3550578/150‑1 (MQ=255)
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TAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCGTATT < SRR19973063.4066736/150‑1 (MQ=60)
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GCGGTACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCGTATT > CP009273/4097673‑4097971
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |