Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,097,822 |
G→T |
100% |
E115* (GAA→TAA) |
pfkA → |
6‑phosphofructokinase I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,097,822 | 0 | G | T | 100.0%
| 646.5
/ NA
| 195 | E115* (GAA→TAA) | pfkA | 6‑phosphofructokinase I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (100/95); total (100/95) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TACGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGC > CP009273/4097677‑4097966
|
tACGGTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTaa > 2:242123/1‑148 (MQ=255)
cGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAAt < 1:2574854/148‑1 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg > 2:1966758/1‑148 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg > 2:193009/1‑148 (MQ=255)
tCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATggg > 1:1705712/1‑148 (MQ=255)
ccTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGc > 1:2097827/1‑148 (MQ=255)
cTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCt > 1:456907/1‑148 (MQ=255)
tCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCtt < 2:672486/148‑1 (MQ=255)
gcgcGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCa > 1:974953/1‑148 (MQ=255)
gcgcGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCa > 1:1378827/1‑148 (MQ=255)
tttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGt < 2:456907/148‑1 (MQ=255)
tttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGt > 2:720316/1‑148 (MQ=255)
tttCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGt > 2:1178245/1‑148 (MQ=255)
cccGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTg > 1:1796475/1‑148 (MQ=255)
tCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCAc > 1:1403719/1‑148 (MQ=255)
tCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCAc > 2:2646579/1‑148 (MQ=255)
ccGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACt < 2:2722184/148‑1 (MQ=255)
cgcgACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAACACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTa < 2:2201029/148‑1 (MQ=255)
gcgACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTAt > 2:2603139/1‑148 (MQ=255)
gcgACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTAt < 1:493410/148‑1 (MQ=255)
cgacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATc > 1:3221328/1‑148 (MQ=255)
gacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGACAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCg < 1:1498904/148‑1 (MQ=255)
gacgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCg < 1:1499072/148‑1 (MQ=255)
acgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGTCCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGa > 1:609122/1‑148 (MQ=255)
acgaGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGa > 2:779828/1‑148 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 1:168362/148‑1 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 2:2559612/148‑1 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 2:2972818/148‑1 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 1:1172582/148‑1 (MQ=255)
gagaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACa < 2:1222026/148‑1 (MQ=255)
gaACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAAc > 1:1045918/1‑148 (MQ=255)
aCATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGa > 1:2473620/1‑148 (MQ=255)
cATCCTCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGAc < 2:173576/148‑1 (MQ=255)
cATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGAc > 1:1759912/1‑148 (MQ=255)
tCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACAt > 2:2840141/1‑148 (MQ=255)
tCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACAt > 2:815391/1‑148 (MQ=255)
ccGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATc > 2:556787/1‑148 (MQ=255)
gcgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaa < 1:55836/148‑1 (MQ=255)
cgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAGAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa > 1:2875114/1‑148 (MQ=255)
cgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa < 2:1921385/148‑1 (MQ=255)
cgcCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCaaa > 2:854287/1‑148 (MQ=255)
gTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCa < 2:1476603/148‑1 (MQ=255)
tGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCAc < 1:3189322/148‑1 (MQ=255)
ggCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACt < 2:1844226/148‑1 (MQ=255)
ggCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACt > 1:881878/1‑148 (MQ=255)
cTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGa > 2:3346066/1‑148 (MQ=255)
aTCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACt < 1:3268493/148‑1 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTa < 1:582833/148‑1 (MQ=255)
tCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTa < 2:3219156/148‑1 (MQ=255)
aaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTa < 2:3388265/148‑1 (MQ=255)
aaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTa > 1:352978/1‑148 (MQ=255)
aaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTa > 1:1563410/1‑148 (MQ=255)
aaCCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCGGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTa > 1:2069616/1‑148 (MQ=255)
cTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCg > 1:855357/1‑148 (MQ=255)
tGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCgg > 2:919246/1‑148 (MQ=255)
tGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCgg < 1:797770/148‑1 (MQ=255)
tGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCgg < 2:2043159/148‑1 (MQ=255)
gAAAACACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGt < 2:2012815/148‑1 (MQ=255)
aaaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttc > 2:2755834/1‑148 (MQ=255)
aaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGCCGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttct < 1:2183027/148‑1 (MQ=255)
aaaCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttct > 1:3464754/1‑148 (MQ=255)
taCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttctt < 2:1018867/147‑1 (MQ=255)
aCGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTttcttc < 2:2487494/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa < 1:2840141/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa < 1:1371969/148‑1 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa > 1:2155493/1‑148 (MQ=255)
cGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCa < 2:3418099/148‑1 (MQ=255)
aTCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTgcgc > 2:1321324/1‑148 (MQ=255)
tCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCt > 1:1642529/1‑148 (MQ=255)
cGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTg < 1:2940196/148‑1 (MQ=255)
cGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTg > 1:1899001/1‑148 (MQ=255)
cgcgCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGc < 1:62243/148‑1 (MQ=255)
gtggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGTGTCTGACCTAAATGGGCGTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTg < 1:3306529/148‑1 (MQ=255)
gtggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTg > 1:325946/1‑148 (MQ=255)
gtggtTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTg > 2:2646101/1‑148 (MQ=255)
cggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCg > 1:2635583/1‑148 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGa < 2:2941404/148‑1 (MQ=255)
ggcggTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGa < 2:881878/148‑1 (MQ=255)
gTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGa > 1:654696/1‑148 (MQ=255)
tGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGAc < 2:1705712/148‑1 (MQ=255)
aCGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCg > 2:2226986/1‑148 (MQ=255)
cGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGt > 2:1552573/1‑148 (MQ=255)
gTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCt > 1:682823/1‑148 (MQ=255)
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CGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACT < SRR19973065.1381026/150‑1 (MQ=60)
CGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACT < SRR19973065.1381025/150‑1 (MQ=60)
TATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCT > SRR19973065.1653556/1‑150 (MQ=60)
ATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTG > SRR19973065.1911478/1‑150 (MQ=60)
ATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTG > SRR19973065.2137732/1‑150 (MQ=60)
CGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAG < SRR19973065.2958036/150‑1 (MQ=60)
CGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCAC < SRR19973065.62922/150‑1 (MQ=60)
CGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCAC < SRR19973065.62908/150‑1 (MQ=60)
CGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCAC < SRR19973065.62386/150‑1 (MQ=60)
TGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTG > SRR19973065.328214/1‑150 (MQ=60)
GTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGTGTCTGACCTAAATGGGCGTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTA < SRR19973065.3326677/150‑1 (MQ=60)
TTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAG < SRR19973065.2723866/150‑1 (MQ=60)
TATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGC > SRR19973065.1400568/1‑150 (MQ=60)
ATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCG > SRR19973065.2651866/1‑150 (MQ=60)
ATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCG > SRR19973065.429745/1‑150 (MQ=60)
ATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCG > SRR19973065.884926/1‑150 (MQ=60)
GGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATC < SRR19973065.1943980/150‑1 (MQ=60)
GCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCG < SRR19973065.1265969/150‑1 (MQ=60)
CGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGA > SRR19973065.659046/1‑150 (MQ=60)
CGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGA > SRR19973065.659012/1‑150 (MQ=60)
CGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCT > SRR19973065.687362/1‑150 (MQ=60)
CGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCT > SRR19973065.2272664/1‑150 (MQ=60)
CGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCT > SRR19973065.2272665/1‑150 (MQ=60)
GGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTG > SRR19973065.1952389/1‑150 (MQ=60)
GTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGC < SRR19973065.1781543/150‑1 (MQ=60)
GTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGC > SRR19973065.1899663/1‑150 (MQ=60)
TTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCG < SRR19973065.407828/150‑1 (MQ=60)
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CTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGA > SRR19973065.3461854/1‑150 (MQ=60)
ACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACA > SRR19973065.1055638/1‑150 (MQ=60)
ACATGGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACA > SRR19973065.465141/1‑150 (MQ=60)
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GGGTGCAATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTC < SRR19973065.2400843/150‑1 (MQ=60)
AATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTC < SRR19973065.3449846/150‑1 (MQ=60)
ATGCTTGTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATAGACAACGACATCAACGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCT < SRR19973065.3013420/150‑1 (MQ=60)
ATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAACGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCT < SRR19973065.3012461/150‑1 (MQ=60)
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ATGCGTCTGACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCT < SRR19973065.912836/150‑1 (MQ=60)
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ACCTAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCGT > SRR19973065.2444697/1‑150 (MQ=60)
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CGTTCCTCGGTTCTGCGCGTTTCCCGGAATTCCGCGACGAGAACATCCGCGCCGTGGCTATCGAAAACCTGAAAAAACGTGGTATCGACGCGCTGGTGGTTATCGGCGGTGACGGTTCCTACATGGGTGCAATGCGTCTGACCGAAATGGGCTTCCCGTGCATCGGTCTGCCGGGCACTATCGACAACGACATCAAAGGCACTGACTACACTATCGGTTTCTTCACTGCGCTGAGCACCGTTGTAGAAGCGATCGACCGTCTGCGTGACACCTCTTCTTCTCACCAGCGTATT > CP009273/4097679‑4097971
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
