Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,711,397 |
C→T |
100% |
R28Q (CGA→CAA) |
tyrS ← |
tyrosyl‑tRNA synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,711,397 | 0 | C | T | 99.6%
| 720.6
/ ‑4.5
| 222 | R28Q (CGA→CAA) | tyrS | tyrosyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (119/102); total (120/102) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
CGTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTCGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCG > CP009273/1711252‑1711540
|
cgccgcCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGc < 1:2467519/148‑1 (MQ=255)
ccgccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTa > 1:621971/1‑148 (MQ=255)
aCCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCtt > 1:869897/1‑148 (MQ=255)
cgcAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcg > 2:1443230/1‑148 (MQ=255)
ccGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccgt < 2:831585/148‑1 (MQ=255)
cGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccgtc > 1:699450/1‑148 (MQ=255)
ggCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCa > 1:2198227/1‑148 (MQ=255)
gCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCAc < 2:767912/148‑1 (MQ=255)
gCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCAc < 2:295889/148‑1 (MQ=255)
gCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCAc < 1:1630932/148‑1 (MQ=255)
ttGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCt < 1:2436922/148‑1 (MQ=255)
tgtgGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTg < 2:125606/148‑1 (MQ=255)
tgGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTggg > 1:983342/1‑148 (MQ=255)
ggCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGc < 1:3409777/148‑1 (MQ=255)
gCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCt > 1:1064821/1‑148 (MQ=255)
ctgctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGc < 2:2806731/148‑1 (MQ=255)
gctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGccc > 2:2863269/1‑148 (MQ=255)
ctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGcccc < 1:57198/148‑1 (MQ=255)
ctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGcccc < 1:936843/148‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGct > 2:1328129/1‑148 (MQ=255)
aGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctc < 2:1858457/148‑1 (MQ=255)
aGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctc < 2:1724866/148‑1 (MQ=255)
gCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctct < 1:1617863/148‑1 (MQ=255)
gCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctct < 1:3026817/148‑1 (MQ=255)
cGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCtt > 2:1957646/1‑148 (MQ=255)
ttCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCa < 1:2543872/148‑1 (MQ=255)
ttCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCa > 2:635896/1‑148 (MQ=255)
ttCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCa < 1:1829330/148‑1 (MQ=255)
ggCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTg > 2:2326996/1‑148 (MQ=255)
gCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGt < 1:3257094/148‑1 (MQ=255)
gCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGt > 2:1061864/1‑148 (MQ=255)
aaCAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTaa < 2:498419/148‑1 (MQ=255)
cAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATc > 2:1388470/1‑148 (MQ=255)
aaTGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCa < 1:3021818/148‑1 (MQ=255)
aTGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCaa < 1:2160367/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGt < 1:1536335/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGt < 2:38483/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGt < 2:2397563/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGt < 2:2554392/148‑1 (MQ=255)
gAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGtt > 1:2336884/1‑148 (MQ=255)
aCAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTAc < 1:1708472/148‑1 (MQ=255)
aaGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTg > 1:1324263/1‑148 (MQ=255)
gATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCTCCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCt > 2:601300/1‑148 (MQ=255)
gATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCt < 2:2828855/148‑1 (MQ=255)
ccccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGcc > 1:1431292/1‑148 (MQ=255)
ccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCAt < 1:139735/148‑1 (MQ=255)
ccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCAt > 2:148474/1‑148 (MQ=255)
cAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATc < 1:581002/148‑1 (MQ=255)
cAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATc > 2:314286/1‑148 (MQ=255)
cAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATc > 1:3212533/1‑148 (MQ=255)
aaaTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCa > 1:2884423/1‑148 (MQ=255)
aaTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaa > 2:1862686/1‑148 (MQ=255)
aaTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaa > 1:1670756/1‑148 (MQ=255)
aTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaaa < 2:187615/148‑1 (MQ=255)
aTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaaa > 2:905301/1‑148 (MQ=255)
gCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc < 2:1181820/148‑1 (MQ=255)
gCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc < 2:2158818/148‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAt > 1:103106/1‑148 (MQ=255)
tGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAt < 1:128844/148‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAt > 1:102727/1‑148 (MQ=255)
gTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATg < 1:1773041/148‑1 (MQ=255)
cAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGta > 1:2739747/1‑148 (MQ=255)
cAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGta > 2:2079668/1‑148 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtat < 2:1459923/148‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtat > 2:2340947/1‑148 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtat < 2:1916958/148‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtat < 2:1742262/148‑1 (MQ=255)
gCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtata < 1:2941649/148‑1 (MQ=255)
gCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtata > 1:1561894/1‑148 (MQ=255)
cGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtatat > 1:2425722/1‑148 (MQ=255)
tAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAAc > 2:1678700/1‑148 (MQ=255)
tAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAAc > 2:1678576/1‑148 (MQ=255)
ggATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGa > 2:2440193/1‑148 (MQ=255)
gATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGAc > 2:1498544/1‑148 (MQ=255)
gATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGAc > 1:223295/1‑148 (MQ=255)
tCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTg > 2:2490890/1‑148 (MQ=255)
aaGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCAc > 1:1039647/1‑148 (MQ=255)
tgCCGCAATAGAGCGCGAGCGGGCTGTGCGCCAGTTGCTCTGCAAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCAcc < 2:2739747/147‑1 (MQ=255)
aGCCGAAATAGAGCGCGATGGGGCCTTGCGCCTGTTGCTGTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCGGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCAAGTTACTGGTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCAcc < 2:958696/148‑1 (MQ=255)
gCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCt > 2:3324534/1‑148 (MQ=255)
gCATTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAATTTTTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTg < 1:799861/148‑1 (MQ=255)
gCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATAAAAATCTCCATTTATATAACGACTGCACCTTTg < 1:2505693/148‑1 (MQ=255)
aaTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGcc > 1:2000906/1‑148 (MQ=255)
aaTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTGCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCATGTTACTGCTTGCCAACAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGcc < 1:819078/148‑1 (MQ=255)
aTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCg > 2:3476141/1‑148 (MQ=255)
aTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCg > 1:2851919/1‑148 (MQ=255)
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agagCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGt < 2:287398/148‑1 (MQ=255)
cgcgATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTacac > 1:3359148/1‑148 (MQ=255)
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gATGGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCCGCCCCGGCTCTTGCAATTGTTTAATCACGTTACTGGTTGCCATCAAATTCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGAc < 1:1611301/148‑1 (MQ=255)
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BRESEQ :: bam2aln output
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AAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAA > SRR19973066.3366115/1‑150 (MQ=60)
AATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATAAAAA > SRR19973066.3402291/1‑150 (MQ=60)
AGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCA > SRR19973066.1421890/1‑150 (MQ=60)
GCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAT < SRR19973066.2940319/150‑1 (MQ=60)
GCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAT > SRR19973066.103814/1‑150 (MQ=60)
GCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAT < SRR19973066.1728281/150‑1 (MQ=60)
GCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAT > SRR19973066.104186/1‑150 (MQ=60)
GCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAT > SRR19973066.104196/1‑150 (MQ=60)
TGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGT < SRR19973066.130115/150‑1 (MQ=60)
GTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTA > SRR19973066.2758175/1‑150 (MQ=60)
GTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTA < SRR19973066.1785729/150‑1 (MQ=60)
GTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTA > SRR19973066.965723/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATA > SRR19973066.1572991/1‑150 (MQ=60)
CAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATA > SRR19973066.1573138/1‑150 (MQ=60)
AGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATAT > SRR19973066.2442225/1‑150 (MQ=60)
AGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATAT > SRR19973066.2442200/1‑150 (MQ=60)
GCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATA < SRR19973066.2961198/150‑1 (MQ=60)
GGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAAC > SRR19973066.581981/1‑150 (MQ=60)
AGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGAC > SRR19973066.225108/1‑150 (MQ=60)
GGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACT < SRR19973066.2882491/150‑1 (MQ=60)
ATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGC > SRR19973066.2226958/1‑150 (MQ=60)
ATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGC > SRR19973066.2226739/1‑150 (MQ=60)
ATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGC > SRR19973066.2523277/1‑150 (MQ=60)
CGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCAC > SRR19973066.1047299/1‑150 (MQ=60)
CGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCAC > SRR19973066.997990/1‑150 (MQ=60)
GCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTT > SRR19973066.1636861/1‑150 (MQ=60)
CGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGC > SRR19973066.180097/1‑150 (MQ=60)
CGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGC > SRR19973066.2027793/1‑150 (MQ=60)
GCATTAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAATTTTTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCC < SRR19973066.805737/150‑1 (MQ=60)
GCAATAGCGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAAATTTTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCC < SRR19973066.805201/150‑1 (MQ=60)
GCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATAAAAATCTCCATTTATATAACGACTGCACCTTTGCC < SRR19973066.2522757/150‑1 (MQ=60)
GCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCC < SRR19973066.3580912/150‑1 (MQ=60)
GCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCC > SRR19973066.2014965/1‑150 (MQ=60)
CAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCG > SRR19973066.2871084/1‑150 (MQ=60)
AATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGG > SRR19973066.1510998/1‑150 (MQ=60)
AATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTGCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCATGTTACTGCTTGCCAACAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGG < SRR19973066.825066/150‑1 (MQ=60)
GTGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCTATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCAATCAATATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACA < SRR19973066.878313/150‑1 (MQ=60)
AGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACAC > SRR19973066.3381548/1‑150 (MQ=60)
GCGGGATCGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGATAACGCTTCCTCGTCCTTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGATGTTGAATTTTTTTAAAAAAGTTTCTGCTTGCAAACAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACG < SRR19973066.316026/150‑1 (MQ=60)
CGATCGGGCGTGGCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCCGCCCCCGCTCTTGCAATTTTTTAAACAAGTTACTGCTTGCCATAAAAATCTCCATTTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACT < SRR19973066.2483613/150‑1 (MQ=60)
GATGGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCCGCCCCGGCTCTTGCAATTGTTTAATCACGTTACTGGTTGCCATCAAATTCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTT < SRR19973066.1622989/150‑1 (MQ=60)
GATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCAACAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTT < SRR19973066.1506118/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGCCTTGCGCCTGTTGCTCTGCTACCGCTCCCTCGTCCGTCACGGGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAATTTTTTTAATCATGTTAGTGCTTGCCATCAAAATCCCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTT < SRR19973066.2809975/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTT > SRR19973066.3514971/1‑150 (MQ=60)
GGGGCCTTGCGCCTGTTGATCTGCTAACGCTTCCTCGTCCTTCACCTGGGCAACACGCCCCCGCGTTTGCAATTGTTTAATCATGTTACTGCTTGCAAAAAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTC < SRR19973066.1075658/150‑1 (MQ=60)
CGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCGGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAATTTGTTTAATCATGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTC < SRR19973066.1758424/150‑1 (MQ=60)
CGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGATAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATTTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTC < SRR19973066.1075599/150‑1 (MQ=60)
CGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGATAACGCTTCCTCGTCCGACACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTC < SRR19973066.150417/150‑1 (MQ=60)
CTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAG > SRR19973066.663852/1‑150 (MQ=60)
CTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAG > SRR19973066.663809/1‑150 (MQ=60)
GCGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCATTTTTTAAATCAAGTTACGGCTTGCCATAAAAAACTCAATGTATAAAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATG < SRR19973066.1330623/150‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCG > SRR19973066.3071328/1‑150 (MQ=60)
GCCAGTTGCTCTGCTAACGCGTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCCGCACCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCG < SRR19973066.792861/150‑1 (MQ=60)
AGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAA > SRR19973066.472600/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAG > SRR19973066.668732/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGATACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTTTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATTTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAG < SRR19973066.1069651/150‑1 (MQ=60)
TGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAGAG > SRR19973066.529043/1‑150 (MQ=60)
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GACCCGTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTCGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAGAG > CP009273/1711248‑1711546
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |