Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,711,397 |
C→T |
100% |
R28Q (CGA→CAA) |
tyrS ← |
tyrosyl‑tRNA synthetase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,711,397 | 0 | C | T | 99.7%
| 1014.6
/ ‑4.6
| 292 | R28Q (CGA→CAA) | tyrS | tyrosyl‑tRNA synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base T (150/141); total (151/141) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 292 total aligned reads displayed.
CCGTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTCGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAA > CP009273/1711251‑1711542
|
ccGTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGc > 2:1902251/1‑149 (MQ=255)
gTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGctc < 1:2360828/149‑1 (MQ=255)
gTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGctc < 2:182981/149‑1 (MQ=255)
cgccgcCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCt < 1:540148/149‑1 (MQ=255)
ccgccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTaa < 1:1617034/149‑1 (MQ=255)
ccgccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTaa < 1:94776/149‑1 (MQ=255)
cgccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAAc < 1:4496345/149‑1 (MQ=255)
cgccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAAc > 1:4310606/1‑149 (MQ=255)
gccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACg > 2:2064425/1‑149 (MQ=255)
gccTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACg > 2:4455318/1‑149 (MQ=255)
tACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCtt < 1:1161616/149‑1 (MQ=255)
aGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTc < 1:360130/149‑1 (MQ=255)
gcAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtc < 1:1940515/149‑1 (MQ=255)
aaCCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccg < 2:3306676/149‑1 (MQ=255)
aaCCGGCGTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccg > 1:1352893/1‑149 (MQ=255)
aCCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccgt > 2:2361694/1‑149 (MQ=255)
ccGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTcgtccgtc > 2:898146/1‑149 (MQ=255)
ttGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTg > 2:2161908/1‑149 (MQ=255)
ggCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCt < 2:4701492/149‑1 (MQ=255)
gCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAg > 1:1771577/1‑149 (MQ=255)
gCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAg > 1:245313/1‑149 (MQ=255)
tgctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGccc > 1:182024/1‑149 (MQ=255)
tgctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGccc < 2:2306433/149‑1 (MQ=255)
gctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGcccc > 1:2696109/1‑149 (MQ=255)
gctgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGcccc < 2:4574972/149‑1 (MQ=255)
tgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCg > 1:679394/1‑149 (MQ=255)
tgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCg > 2:2007187/1‑149 (MQ=255)
tgGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCGGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTCCCAGCCCCCg > 1:3100735/1‑149 (MQ=255)
aaGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctc < 1:2896039/149‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctc < 2:3661509/149‑1 (MQ=255)
aaGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctc < 1:179520/149‑1 (MQ=255)
aGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGctct > 2:3744656/1‑149 (MQ=255)
cGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTg > 2:170314/1‑149 (MQ=255)
gTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGc > 1:716592/1‑149 (MQ=255)
tttCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCa > 1:2506865/1‑149 (MQ=255)
ttCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCaa < 1:1510801/149‑1 (MQ=255)
cAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAAtt < 2:2623131/149‑1 (MQ=255)
cAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAAtt < 2:2093713/149‑1 (MQ=255)
cAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAAtt > 1:2617147/1‑149 (MQ=255)
ggCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGt < 2:2911588/149‑1 (MQ=255)
gCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGtt > 1:4391701/1‑149 (MQ=255)
gCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGtt < 2:3797103/149‑1 (MQ=255)
cATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGttt < 1:2666268/149‑1 (MQ=255)
aTAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTa > 1:1391461/1‑149 (MQ=255)
tAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTaa > 1:1843451/1‑149 (MQ=255)
aCAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATc < 1:3264541/149‑1 (MQ=255)
aTGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAg > 1:146272/1‑149 (MQ=255)
gAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTa > 2:794422/1‑149 (MQ=255)
cAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTg > 2:1687503/1‑149 (MQ=255)
aaGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGc > 2:1778925/1‑149 (MQ=255)
aaGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGc > 2:3826533/1‑149 (MQ=255)
aGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCt > 1:234077/1‑149 (MQ=255)
tGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGc < 1:1076412/149‑1 (MQ=255)
ccccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCa > 2:2545055/1‑149 (MQ=255)
ccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATc < 2:2501926/149‑1 (MQ=255)
ccAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATc > 2:1199419/1‑149 (MQ=255)
cAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCa > 1:877448/1‑149 (MQ=255)
aaaTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaa > 2:1324155/1‑149 (MQ=255)
aaTGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCaaa < 1:3528721/149‑1 (MQ=255)
tGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAAt < 1:2294146/149‑1 (MQ=255)
aaGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAAtctc > 2:1280737/1‑149 (MQ=255)
aGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc > 2:4172988/1‑149 (MQ=255)
aGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc < 1:502563/149‑1 (MQ=255)
aGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc > 1:3758414/1‑149 (MQ=255)
aGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTcc > 2:543106/1‑149 (MQ=255)
gCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCa > 2:1917689/1‑149 (MQ=255)
gCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCa < 2:3499628/149‑1 (MQ=255)
tGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATg > 1:4242480/1‑149 (MQ=255)
tCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGta < 2:3845312/149‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtata < 1:3988649/149‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtata < 2:3032212/149‑1 (MQ=255)
aGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtata < 1:2166713/149‑1 (MQ=255)
gCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtatat < 2:4750099/149‑1 (MQ=255)
gCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtatat < 2:1110058/149‑1 (MQ=255)
gCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGtatat < 1:333671/149‑1 (MQ=255)
ggTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTTCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTAACAGCCCCAGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATAAAAATCTCCATGTATATaa < 2:3977719/149‑1 (MQ=255)
ggTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATaa < 1:1916803/149‑1 (MQ=255)
ggTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATaa > 1:2797798/1‑149 (MQ=255)
aGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGa < 2:1660813/149‑1 (MQ=255)
gATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACt < 1:1515063/149‑1 (MQ=255)
aTCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTg > 2:2760019/1‑149 (MQ=255)
aTCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTg > 1:3380642/1‑149 (MQ=255)
tCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCAAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAATTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGc < 1:4569767/149‑1 (MQ=255)
aGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCt < 2:2672901/149‑1 (MQ=255)
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TTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAAT < SRR19973071.1516280/150‑1 (MQ=60)
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ACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTG < SRR19973071.2408044/150‑1 (MQ=60)
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CCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATC < SRR19973071.4595824/150‑1 (MQ=60)
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CCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCA < SRR19973071.1414528/150‑1 (MQ=60)
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AAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAA > SRR19973071.3712808/1‑150 (MQ=60)
AAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGACCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAA > SRR19973071.4567496/1‑150 (MQ=60)
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CGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTCAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGA > SRR19973071.3454274/1‑150 (MQ=60)
GCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGAC > SRR19973071.2895140/1‑150 (MQ=60)
GCGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGAC > SRR19973071.2894983/1‑150 (MQ=60)
CGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACT > SRR19973071.3672013/1‑150 (MQ=60)
CGATCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACT < SRR19973071.355787/150‑1 (MQ=60)
GATCGAGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCTGCCCCCGCACTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTT < SRR19973071.2396181/150‑1 (MQ=60)
TCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTT > SRR19973071.1437071/1‑150 (MQ=60)
TCGGGCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTT > SRR19973071.1683110/1‑150 (MQ=60)
GCCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCC > SRR19973071.2715377/1‑150 (MQ=60)
CCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCA > SRR19973071.2966879/1‑150 (MQ=60)
CCTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAAATTGTTTAATCAATTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCA < SRR19973071.3369395/150‑1 (MQ=60)
CTTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCCTGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAG < SRR19973071.3579564/150‑1 (MQ=60)
TTGCGCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGA > SRR19973071.3056666/1‑150 (MQ=60)
CGCCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATAATGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCTTGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGC < SRR19973071.53639/150‑1 (MQ=60)
GCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCG > SRR19973071.3934293/1‑150 (MQ=60)
GCCAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCG > SRR19973071.4079583/1‑150 (MQ=60)
CCTGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACGTGGGCTCCCAGCCCCCGATCTTGAATTTTTTTAATAAATTTACTGCTTGCAAACAAAATCTCCATTTATAAAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGA < SRR19973071.1624863/150‑1 (MQ=60)
CAGTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAA > SRR19973071.4168682/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGGCCGTCACCGGGGCTCCCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCATGTTACTGCTTGCCATAAAAATCCCCATTTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAG < SRR19973071.2086926/150‑1 (MQ=60)
GTTGCTCTGCTAACGCGTCCTCGTCCGTCACGTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCACTTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCAGGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAG < SRR19973071.3824132/150‑1 (MQ=60)
TTGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGACACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGAAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTGGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAGA < SRR19973071.4590169/150‑1 (MQ=60)
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GACCCGTCGCGCCGCCTACCAGCGCAACCGGCTTGTGGCCCGCCTGCTGGAAGCGTTTCAGGCATAACAATGGAACAAGATGCCCCAAATGCAAGCTGTCAGCGGTAGGATCGAAGCCGCAATAGAGCGCGATCGGGCCTTGCGCCAGTCGCTCTGCTAACGCTTCCTCGTCCGTCACCTGGGCTACCAGCCCCCGCTCTTGCAATTGTTTAATCAAGTTACTGCTTGCCATCAAAATCTCCATGTATATAACGACTGCACCTTTGCCGGTACACGACTTTTCGCCAGATGCGAAAGA > CP009273/1711248‑1711545
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |