Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,024,983 |
C→G |
100% |
G86G (GGC→GGG) |
uacT → |
uric acid permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,024,983 | 0 | C | G | 99.5%
| 852.9
/ ‑3.8
| 210 | G86G (GGC→GGG) | uacT | uric acid permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (96/113); total (96/114) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024838‑3025127
|
tCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCg < 1:2416497/148‑1 (MQ=255)
ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGgcgc < 2:611045/148‑1 (MQ=255)
ttGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCtt < 1:3465053/148‑1 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACCTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCttt > 2:849432/1‑148 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTTGTGAACGACAGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATTCTCAATAGCTCGGATCTCTTTTTCTGCGGGTTCGTCACATTATTTCAATGTATAGGTATCGGGCGCTTTAt > 2:144438/1‑148 (MQ=255)
aTGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgg < 2:1620660/148‑1 (MQ=255)
gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTATCTACGATCACTTTTTCTGCGGGATAGTCACATTATTGCAATGTCTCTGTATCGGGCGCTTTATgggg > 2:2620072/1‑148 (MQ=255)
gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgggg < 2:3542758/148‑1 (MQ=255)
gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTACACTTATGAATTGTGACCCACTGGGCCACTAAAAAGAATCTATATCGATGCACAATAGCTCCGATCACTTTTTCTGCGGGATCGACACCTTATTGCAATGTATCGGTAACTGGCGCTTTAAgggg > 2:298907/1‑148 (MQ=255)
tGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTg < 2:1407758/148‑1 (MQ=255)
gTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCgg < 2:474809/148‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt < 2:1343450/148‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt > 1:441824/1‑148 (MQ=255)
tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt < 1:639627/148‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt < 2:2464967/148‑1 (MQ=255)
cGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 2:3239534/148‑1 (MQ=255)
cGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg > 2:2050912/1‑148 (MQ=255)
cGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 2:1479967/148‑1 (MQ=255)
gCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGa > 1:321390/1‑148 (MQ=255)
tGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGAtt > 2:2120811/1‑148 (MQ=255)
gTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTa > 1:224460/1‑148 (MQ=255)
tCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATg < 1:2963784/148‑1 (MQ=255)
tCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATg < 1:2207423/148‑1 (MQ=255)
tCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATg < 1:2428119/148‑1 (MQ=255)
ccTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGt < 1:715973/148‑1 (MQ=255)
tATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTg < 2:1360953/148‑1 (MQ=255)
tATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTg > 2:2932557/1‑148 (MQ=255)
aTGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCTCATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGa < 1:298907/148‑1 (MQ=255)
tGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAc < 1:3087794/148‑1 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 2:2155571/148‑1 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 2:359872/148‑1 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 2:1083462/148‑1 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATAGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt > 1:190346/1‑148 (MQ=255)
gTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtgc < 1:1421099/148‑1 (MQ=255)
cGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATg > 1:364310/1‑129 (MQ=255)
aCTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTa < 2:1300007/148‑1 (MQ=255)
aCTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTa < 2:3078233/148‑1 (MQ=255)
tGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTAACCTTTGCTGCTGTAac < 2:2707541/148‑1 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAacac > 2:195571/1‑148 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAacac > 1:2494583/1‑148 (MQ=255)
gCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAcc > 1:1245198/1‑148 (MQ=255)
ccTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCa > 1:556809/1‑148 (MQ=255)
tcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGa < 1:2428691/148‑1 (MQ=255)
tcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGa < 2:112114/148‑1 (MQ=255)
aagaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGc < 2:2564051/148‑1 (MQ=255)
agaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGcc < 2:2940173/148‑1 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTggg > 1:2523345/1‑148 (MQ=255)
ttGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt > 1:2073159/1‑148 (MQ=255)
tGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATg > 1:772600/1‑148 (MQ=255)
gATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAc < 1:2464376/148‑1 (MQ=255)
aTGCTCATTAGCTAGGATCTCTTTTGCTGCGGGATAGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAcc > 2:908912/1‑148 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCAtt > 2:537724/1‑135 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg < 2:1127837/148‑1 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg < 1:2756029/148‑1 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg > 1:3311928/1‑148 (MQ=255)
tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa > 1:2670403/1‑148 (MQ=255)
cATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGat > 2:1055766/1‑148 (MQ=255)
cATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGat > 1:3442772/1‑148 (MQ=255)
aTTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGata > 1:2116990/1‑148 (MQ=255)
tAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATTGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTTGGATGAACCCGGATATc > 1:2925095/1‑148 (MQ=255)
tAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCATTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATc > 2:275047/1‑148 (MQ=255)
cTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGc < 2:495529/148‑1 (MQ=255)
aTCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgct > 1:451237/1‑148 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg < 2:911635/148‑1 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 2:1655345/1‑148 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg < 2:1145080/148‑1 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 1:2099803/1‑148 (MQ=255)
ctTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTgggg < 1:2403787/148‑1 (MQ=255)
ttttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGa > 1:2957144/1‑148 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGat > 1:1080673/1‑148 (MQ=255)
tgctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGatat < 1:3423809/148‑1 (MQ=255)
tgctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAACGGCCTGCTGGGGatat < 1:3163271/148‑1 (MQ=255)
gcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTgg < 2:2253900/148‑1 (MQ=255)
gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 1:769362/1‑148 (MQ=255)
aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGccc > 2:3411280/1‑147 (MQ=255)
aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCa > 1:1659755/1‑148 (MQ=255)
tCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAc > 2:778628/1‑148 (MQ=255)
gTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTa < 2:894525/148‑1 (MQ=255)
gTCACAGTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTa < 2:2435308/148‑1 (MQ=255)
tCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAt < 2:181270/148‑1 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 2:410776/1‑148 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 2:2204971/1‑148 (MQ=255)
tattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 1:822277/1‑148 (MQ=255)
attGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCcgcg > 1:1203306/1‑148 (MQ=255)
attGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCcgcg < 2:2508553/148‑1 (MQ=255)
ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 2:2810581/1‑148 (MQ=255)
ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg < 2:1605005/148‑1 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg > 1:671550/1‑148 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg < 1:97634/148‑1 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg < 1:1589730/148‑1 (MQ=255)
aTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtttt < 1:3051312/148‑1 (MQ=255)
aTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtttt < 1:3050270/148‑1 (MQ=255)
tGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa < 2:1794058/148‑1 (MQ=255)
tatcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATc < 1:1490343/148‑1 (MQ=255)
tatcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATc < 1:1290623/148‑1 (MQ=255)
tcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcac > 1:350013/1‑148 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc < 1:181099/148‑1 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc < 1:2050912/148‑1 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGAGTTTTATcacc > 2:3334838/1‑148 (MQ=255)
gtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcaccac > 2:2788217/1‑148 (MQ=255)
|
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024838‑3025127
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > CP009273/3024836‑3025129
|
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCG < SRR19973066.476363/150‑1 (MQ=60)
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCG < SRR19973066.1778280/150‑1 (MQ=60)
GTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTGCGCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCACTCAAAAAAAGATATTTCGATGCTCATTAGCGCGGATCTCTTTTTCTGCGGGATCGTCACAAAATTTCAAAGTATCGGTATCGGGCGC > SRR19973066.3128700/1‑150 (MQ=60)
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCT < SRR19973066.2432859/150‑1 (MQ=60)
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCT < SRR19973066.2432637/150‑1 (MQ=60)
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCT < SRR19973066.2432873/150‑1 (MQ=60)
TTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTA < SRR19973066.3488214/150‑1 (MQ=60)
TTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTA < SRR19973066.3488161/150‑1 (MQ=60)
TGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGA < SRR19973066.188849/150‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCC < SRR19973066.324137/150‑1 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGT > SRR19973066.445239/1‑150 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA < SRR19973066.644237/150‑1 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA > SRR19973066.2081709/1‑150 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA > SRR19973066.323808/1‑150 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA < SRR19973066.644244/150‑1 (MQ=60)
CTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTA > SRR19973066.226470/1‑150 (MQ=60)
CTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTA > SRR19973066.226275/1‑150 (MQ=60)
TCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTC < SRR19973066.2444626/150‑1 (MQ=60)
TCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTC < SRR19973066.2983402/150‑1 (MQ=60)
TCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTC < SRR19973066.2222716/150‑1 (MQ=60)
TCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTC < SRR19973066.2983406/150‑1 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973066.721272/150‑1 (MQ=60)
CATCTTATGATTGGTGAACGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGTTGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCATTGTATCGGTATCGGGCTCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973066.721271/150‑1 (MQ=60)
ATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCTCATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACC < SRR19973066.301018/150‑1 (MQ=60)
ATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACC < SRR19973066.2637752/150‑1 (MQ=60)
TGATTTGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT > SRR19973066.1806821/1‑150 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT < SRR19973066.3108422/150‑1 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT < SRR19973066.289013/150‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT > SRR19973066.191758/1‑150 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATAGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT > SRR19973066.191990/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973066.3414782/1‑150 (MQ=60)
TGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGC > SRR19973066.312757/1‑150 (MQ=60)
GTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTG < SRR19973066.1431268/150‑1 (MQ=60)
GTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTG < SRR19973066.1579010/150‑1 (MQ=60)
ACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCagatcggaagagcacac > SRR19973066.367169/1‑133 (MQ=60)
GACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAA > SRR19973066.2513529/1‑150 (MQ=60)
CTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACA > SRR19973066.2031716/1‑150 (MQ=60)
CTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAGTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACA > SRR19973066.1295870/1‑150 (MQ=60)
TGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAC > SRR19973066.2511588/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACC > SRR19973066.801845/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACC > SRR19973066.1254121/1‑150 (MQ=60)
GGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCA > SRR19973066.560798/1‑150 (MQ=60)
TCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGANA < SRR19973066.2445208/150‑1 (MQ=60)
TCAAAAGAAGCTAGTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTTCTGCGGGATCGTCTCATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATA < SRR19973066.2445166/150‑1 (MQ=60)
AAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGC < SRR19973066.1157449/150‑1 (MQ=60)
AAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGC > SRR19973066.351654/1‑150 (MQ=60)
GAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATT > SRR19973066.503023/1‑150 (MQ=60)
tcttccgatctTGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG < SRR19973066.541634/139‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG < SRR19973066.1463361/150‑1 (MQ=60)
GCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGG > SRR19973066.2540508/1‑150 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT > SRR19973066.2087498/1‑150 (MQ=60)
ATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATG > SRR19973066.778318/1‑150 (MQ=60)
GATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCC < SRR19973066.2481242/150‑1 (MQ=60)
GATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCC < SRR19973066.2481177/150‑1 (MQ=60)
TGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGG > SRR19973066.3333902/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGTCCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA > SRR19973066.1252121/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA > SRR19973066.2688254/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA > SRR19973066.3037540/1‑150 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGAT > SRR19973066.3465803/1‑150 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGAT < SRR19973066.2774592/150‑1 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGAT < SRR19973066.3074180/150‑1 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAACCGGAT > SRR19973066.3465729/1‑150 (MQ=60)
TCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATA > SRR19973066.2131621/1‑150 (MQ=60)
ATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATTGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTTGGATGAACCCGGATATC > SRR19973066.2944582/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT > SRR19973066.453273/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT > SRR19973066.454705/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG > SRR19973066.2114256/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG > SRR19973066.2114231/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG < SRR19973066.2751584/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973066.219447/1‑150 (MQ=60)
TCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGG < SRR19973066.771582/150‑1 (MQ=60)
TCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGG < SRR19973066.1625306/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGA > SRR19973066.2976854/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGA > SRR19973066.2976742/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT < SRR19973066.2420037/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT < SRR19973066.2954979/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT > SRR19973066.1088566/1‑150 (MQ=60)
TGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTT < SRR19973066.3184354/150‑1 (MQ=60)
TGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTT < SRR19973066.3446705/150‑1 (MQ=60)
TGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAACGGCCTGCTGGGGATATTT < SRR19973066.3184339/150‑1 (MQ=60)
TGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGT > SRR19973066.858249/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973066.775061/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973066.2439927/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973066.775062/1‑150 (MQ=60)
GGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCA > SRR19973066.1671850/1‑150 (MQ=60)
GGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCA > SRR19973066.444350/1‑150 (MQ=60)
GGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCA > SRR19973066.2250064/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973066.828283/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973066.24973/1‑150 (MQ=60)
TTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCG > SRR19973066.1211679/1‑150 (MQ=60)
TATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGG > SRR19973066.324847/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGG > SRR19973066.676467/1‑150 (MQ=60)
TGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTT < SRR19973066.98679/150‑1 (MQ=60)
TGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTT < SRR19973066.1601235/150‑1 (MQ=60)
GCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTT < SRR19973066.653055/150‑1 (MQ=60)
ATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973066.3071719/150‑1 (MQ=60)
ATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973066.3070756/150‑1 (MQ=60)
ATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973066.3070671/150‑1 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTTCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATAAC > SRR19973066.352760/1‑150 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCAC > SRR19973066.352743/1‑150 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCAC < SRR19973066.1500775/150‑1 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCAC < SRR19973066.1300878/150‑1 (MQ=60)
TATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCAC < SRR19973066.1299963/150‑1 (MQ=60)
ATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACC > SRR19973066.2924813/1‑150 (MQ=60)
CGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCAC < SRR19973066.2065163/150‑1 (MQ=60)
CGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCAC < SRR19973066.182684/150‑1 (MQ=60)
CGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCACTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT < SRR19973066.2118152/150‑1 (MQ=60)
|
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > CP009273/3024836‑3025129
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
