Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,024,983 |
C→G |
G86G (GGC→GGG) |
uacT → |
uric acid permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,024,983 | 0 | C | G | 100.0%
| 964.1
/ NA
| 244 | G86G (GGC→GGG) | uacT | uric acid permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (130/114); total (130/114) |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > CP009273/3024836‑3025129
|
cGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAAAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATATCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCg > 1:1074136/1‑150 (MQ=255)
ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCtt < 2:3463052/150‑1 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAt > 1:2213144/1‑150 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCACTCAAAAGAAACTATTGCGATGCTAATTATCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAt > 1:2602345/1‑150 (MQ=255)
gTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATg > 2:3699250/1‑150 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgg < 1:2210002/150‑1 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgg < 1:312734/150‑1 (MQ=255)
tGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGa < 2:3690334/150‑1 (MQ=255)
tGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGa < 2:1110199/150‑1 (MQ=255)
gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGAt < 1:2443485/150‑1 (MQ=255)
tACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 1:914462/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATcc < 2:919730/150‑1 (MQ=255)
cAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGcc < 2:3487317/150‑1 (MQ=255)
tGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCGGcc > 2:961815/1‑150 (MQ=255)
cAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATTTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCgg > 1:1279249/1‑150 (MQ=255)
cAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCgg < 2:165680/150‑1 (MQ=255)
aGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt > 2:3156571/1‑150 (MQ=255)
gTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 1:1465229/150‑1 (MQ=255)
gTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 1:2706663/150‑1 (MQ=255)
gTCGCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 1:3303002/150‑1 (MQ=255)
gCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGAtt < 2:3283404/150‑1 (MQ=255)
tctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGt > 2:2516407/1‑150 (MQ=255)
tctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGt < 2:3042710/150‑1 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTg > 2:1758468/1‑150 (MQ=255)
ttATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGa > 1:433211/1‑150 (MQ=255)
gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 2:755849/150‑1 (MQ=255)
tGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTTTGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtgc < 1:300931/150‑1 (MQ=255)
ccGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGt < 2:507201/150‑1 (MQ=255)
gACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTaa < 1:2744119/150‑1 (MQ=255)
cTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAaca < 1:1876554/150‑1 (MQ=255)
gggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAcc < 2:1400186/150‑1 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCa > 1:1601786/1‑150 (MQ=255)
gCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCaa > 2:1461633/1‑150 (MQ=255)
ctctCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATg < 1:2106948/150‑1 (MQ=255)
ctctCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATg < 1:2781762/150‑1 (MQ=255)
ctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGAt < 2:3802442/150‑1 (MQ=255)
aaaaGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGc > 1:3666771/1‑150 (MQ=255)
aagaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa < 2:2196376/150‑1 (MQ=255)
gCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTggg < 2:1259543/150‑1 (MQ=255)
cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGa > 2:3141462/1‑150 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt < 1:3387253/150‑1 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt > 1:1643557/1‑150 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt > 2:1544016/1‑150 (MQ=255)
gATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAccc > 2:608224/1‑150 (MQ=255)
gATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAccc < 1:2843769/150‑1 (MQ=255)
aTGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCg < 2:470521/150‑1 (MQ=255)
tGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg > 2:3503219/1‑150 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGat > 2:2623685/1‑150 (MQ=255)
tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGata > 2:2961952/1‑150 (MQ=255)
tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAAAACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGata > 2:1062162/1‑150 (MQ=255)
cATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGatat > 1:831614/1‑150 (MQ=255)
cATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGatat > 2:3104290/1‑150 (MQ=255)
ttAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCg < 1:438215/150‑1 (MQ=255)
tAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg > 1:1377341/1‑150 (MQ=255)
aGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGc > 1:1419699/1‑150 (MQ=255)
gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGcc < 1:1741721/150‑1 (MQ=255)
cTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCct > 2:3381562/1‑150 (MQ=255)
tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctg < 1:961815/150‑1 (MQ=255)
cGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTAAGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgc > 2:3380566/1‑150 (MQ=255)
gATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 2:1213298/1‑150 (MQ=255)
gATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 1:2343669/1‑150 (MQ=255)
gATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 2:2442553/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTgg > 1:2002934/1‑150 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGatat > 2:2850508/1‑150 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGatat > 1:1064536/1‑150 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGatat > 2:633465/1‑150 (MQ=255)
gctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTg < 2:2005142/150‑1 (MQ=255)
gctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTg < 1:3776199/150‑1 (MQ=255)
ctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTgg < 2:72118/150‑1 (MQ=255)
tgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGt < 2:1412822/150‑1 (MQ=255)
tgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGt > 1:3721912/1‑150 (MQ=255)
tgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGt < 2:10968/150‑1 (MQ=255)
gggATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 2:2644363/1‑150 (MQ=255)
gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAc > 2:843893/1‑150 (MQ=255)
tCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTa < 1:3381478/150‑1 (MQ=255)
cGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAt > 2:3311147/1‑150 (MQ=255)
gTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATc < 1:3156571/150‑1 (MQ=255)
cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgc > 1:2506946/1‑150 (MQ=255)
cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgc > 2:3545274/1‑150 (MQ=255)
cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgc > 2:1827299/1‑150 (MQ=255)
acaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 2:2925594/1‑150 (MQ=255)
acaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 2:3731139/1‑150 (MQ=255)
caTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccg > 2:2704090/1‑150 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTCTCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 2:2339991/1‑150 (MQ=255)
ttattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCcgcg > 2:2026459/1‑150 (MQ=255)
ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGNt < 1:609004/150‑1 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtt < 2:555785/150‑1 (MQ=255)
gCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGttt < 2:2759121/150‑1 (MQ=255)
aaTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa < 2:2031098/150‑1 (MQ=255)
aTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAt < 1:2338596/150‑1 (MQ=255)
gtatcggtatcgGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATca < 1:535693/150‑1 (MQ=255)
atcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc > 1:1901262/1‑150 (MQ=255)
atcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc > 2:2767500/1‑150 (MQ=255)
tcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacca > 2:1916435/1‑150 (MQ=255)
ggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACcaca > 2:981445/1‑150 (MQ=255)
gtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACat > 1:2768670/1‑150 (MQ=255)
gtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACat < 2:1377341/150‑1 (MQ=255)
tatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatt < 1:2950025/150‑1 (MQ=255)
tatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatt < 1:1758468/150‑1 (MQ=255)
cggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACattatt > 2:2950319/1‑150 (MQ=255)
|
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > CP009273/3024836‑3025129
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024834‑3025131
|
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGG < SRR19973061.1770537/150‑1 (MQ=60)
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGG < SRR19973061.1770362/150‑1 (MQ=60)
CGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAAAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATATCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCG > SRR19973061.1076892/1‑150 (MQ=60)
CCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTT < SRR19973061.2829304/150‑1 (MQ=60)
CCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTT < SRR19973061.2829230/150‑1 (MQ=60)
TTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTA < SRR19973061.2778986/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973061.1976220/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT > SRR19973061.2218705/1‑150 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCACTCAAAAGAAACTATTGCGATGCTAATTATCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT > SRR19973061.2609030/1‑150 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973061.2215551/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCATCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCAAATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973061.2215567/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973061.313552/150‑1 (MQ=60)
TGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCAAATGCGATGCACATTAGCACGGATCACATTTTCTGCGGGATCGTCACAATAATTCAATGTATCGGTATAGGGCGCTTTATGGGGA > SRR19973061.452041/1‑150 (MQ=60)
GTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGAT < SRR19973061.2449716/150‑1 (MQ=60)
TACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATC < SRR19973061.916804/150‑1 (MQ=60)
TACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATC < SRR19973061.916779/150‑1 (MQ=60)
ACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTAGTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCC < SRR19973061.3190791/150‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTG < SRR19973061.43701/150‑1 (MQ=60)
TGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCAATTGCGATTCTCATTATCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAATATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCatcc > SRR19973061.1754154/1‑146 (MQ=60)
CAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATTTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGG > SRR19973061.1282407/1‑150 (MQ=60)
CAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGG > SRR19973061.338328/1‑150 (MQ=60)
GTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973061.2713627/150‑1 (MQ=60)
GTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973061.1468918/150‑1 (MQ=60)
GTCGCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973061.3311505/150‑1 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA > SRR19973061.991804/1‑150 (MQ=60)
TCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTC < SRR19973061.3146617/150‑1 (MQ=60)
CTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTG < SRR19973061.404412/150‑1 (MQ=60)
TTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGA > SRR19973061.434392/1‑150 (MQ=60)
TTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGA > SRR19973061.434502/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAC > SRR19973061.3110408/1‑150 (MQ=60)
ATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACC > SRR19973061.3021567/1‑150 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT < SRR19973061.1950848/150‑1 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT > SRR19973061.2768051/1‑150 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT > SRR19973061.2766226/1‑150 (MQ=60)
TGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT > SRR19973061.2201896/1‑150 (MQ=60)
TGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTTTGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGC < SRR19973061.301729/150‑1 (MQ=60)
GGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCT < SRR19973061.2641280/150‑1 (MQ=60)
GTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTG < SRR19973061.1790476/150‑1 (MQ=60)
GACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAA < SRR19973061.2751179/150‑1 (MQ=60)
CTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACA < SRR19973061.1326923/150‑1 (MQ=60)
CTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACA < SRR19973061.1881225/150‑1 (MQ=60)
TGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAC > SRR19973061.584631/1‑150 (MQ=60)
TGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAC > SRR19973061.584650/1‑150 (MQ=60)
GGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCA > SRR19973061.1605768/1‑150 (MQ=60)
GGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCA > SRR19973061.1605445/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAT < SRR19973061.2276498/150‑1 (MQ=60)
CTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATG < SRR19973061.2788916/150‑1 (MQ=60)
CTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATG < SRR19973061.2112236/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG < SRR19973061.1465781/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG > SRR19973061.1608958/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGC > SRR19973061.3676145/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGC > SRR19973061.3209689/1‑150 (MQ=60)
AAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGC > SRR19973061.3676149/1‑150 (MQ=60)
GAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATT < SRR19973061.1619543/150‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCCTTGG > SRR19973061.1787125/1‑150 (MQ=60)
CTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGA > SRR19973061.676569/1‑150 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT < SRR19973061.3395956/150‑1 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT > SRR19973061.2910818/1‑150 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT > SRR19973061.1647685/1‑150 (MQ=60)
TGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAA > SRR19973061.949762/1‑150 (MQ=60)
GATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCC < SRR19973061.2851055/150‑1 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGTATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGAT < SRR19973061.296764/150‑1 (MQ=60)
CATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAT < SRR19973061.190429/150‑1 (MQ=60)
CATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAT > SRR19973061.833785/1‑150 (MQ=60)
ATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATC < SRR19973061.3590667/150‑1 (MQ=60)
TTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCG < SRR19973061.439407/150‑1 (MQ=60)
TAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGG > SRR19973061.1380821/1‑150 (MQ=60)
AGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGC > SRR19973061.1423220/1‑150 (MQ=60)
AGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGC > SRR19973061.1423279/1‑150 (MQ=60)
GCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCC > SRR19973061.3394137/1‑150 (MQ=60)
GCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCC < SRR19973061.1746100/150‑1 (MQ=60)
CTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTAATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCT > SRR19973061.266460/1‑150 (MQ=60)
TCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTG > SRR19973061.2423869/1‑150 (MQ=60)
TCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGGATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTG < SRR19973061.964243/150‑1 (MQ=60)
CGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGC > SRR19973061.1686774/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG > SRR19973061.2349551/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG > SRR19973061.2349621/1‑150 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973061.2120369/1‑150 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973061.205571/1‑150 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973061.2007954/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAT > SRR19973061.1067272/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAT > SRR19973061.2459414/1‑150 (MQ=60)
TTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAT > SRR19973061.2459521/1‑150 (MQ=60)
TGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTT > SRR19973061.3781442/1‑150 (MQ=60)
GCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTG < SRR19973061.3785837/150‑1 (MQ=60)
TGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGT > SRR19973061.3731423/1‑150 (MQ=60)
GCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTG < SRR19973061.1371636/150‑1 (MQ=60)
TCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTA < SRR19973061.3390169/150‑1 (MQ=60)
TCGTCACATTAGTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTA < SRR19973061.3390253/150‑1 (MQ=60)
GTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATC < SRR19973061.3164684/150‑1 (MQ=60)
CACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGC > SRR19973061.2513334/1‑150 (MQ=60)
CATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCG < SRR19973061.2713628/150‑1 (MQ=60)
TTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGNT < SRR19973061.610573/150‑1 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT > SRR19973061.3764477/1‑150 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT > SRR19973061.851479/1‑150 (MQ=60)
ATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973061.2344532/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCA < SRR19973061.537111/150‑1 (MQ=60)
ATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACC > SRR19973061.1905972/1‑150 (MQ=60)
ATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACC > SRR19973061.22767/1‑150 (MQ=60)
CGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCAC > SRR19973061.107555/1‑150 (MQ=60)
GGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACA > SRR19973061.1183571/1‑150 (MQ=60)
GTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACAT < SRR19973061.2539539/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACAT > SRR19973061.2775795/1‑150 (MQ=60)
TATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATT < SRR19973061.1762872/150‑1 (MQ=60)
TATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATT < SRR19973061.2957630/150‑1 (MQ=60)
TCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTAT < SRR19973061.1465313/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973061.459938/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973061.459918/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > SRR19973061.1690269/1‑150 (MQ=60)
GGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973061.2002709/150‑1 (MQ=60)
|
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024834‑3025131
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
