Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F98 I0 R1
|
799 |
294.1 |
9752082 |
92.2% |
8991419 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,024,983 |
C→G |
61.6% |
G86G (GGC→GGG) |
uacT → |
uric acid permease |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,024,983 | 0 | C | G | 61.6%
| 346.1
/ inf
| 299 | G86G (GGC→GGG) | uacT | uric acid permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (49/66); new base G (87/97); total (136/163) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 303 total aligned reads displayed.
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024834‑3025131
|
cacGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTACTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCACTCAAAAGAACCTATTTCGATGCTCAATATCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGCTCGTCACATTATTTCAATGTATAGGTATCGGc > 2:895809/1‑150 (MQ=255)
gTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTTGTGACCCACTGGGCCTCACAAAATAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATATCTTTTTCTGCGGGATCGTCACAATATTTCAATTTATAGGTATAGGgcgc > 2:2451873/1‑150 (MQ=255)
tCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCt < 2:597459/150‑1 (MQ=255)
tCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCCCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCt < 1:2279861/150‑1 (MQ=255)
ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCtt < 1:965577/150‑1 (MQ=255)
cTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTTACCGACTGGGCCTCAAAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATAGGTATCGGGCGCttt > 2:1943470/1‑150 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAt < 2:1691841/150‑1 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAt < 1:4351842/150‑1 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATgg < 2:4390035/150‑1 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCACTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATgg > 2:2008724/1‑150 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTACTCTTATTATTTGTGACCGACAGGGCCACTCAAAAGAAGCTATTTCGATGCTCATTATCTCGGATCTCGTTTGCTGCGGGATCGTCACAATATTGCAAAGTATAGGTATAGGCCGCGTTAttg > 1:4866607/1‑148 (MQ=255)
gTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGAt < 2:2555634/150‑1 (MQ=255)
tACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATc < 2:3766224/150‑1 (MQ=255)
aCGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATcc < 2:1370976/150‑1 (MQ=255)
ggTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTg < 1:2640044/150‑1 (MQ=255)
tGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGcc < 1:1286200/150‑1 (MQ=255)
cAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCgg < 1:2998106/150‑1 (MQ=255)
aGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGt < 1:1580660/150‑1 (MQ=255)
aGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATACGCCTGCCGGt > 1:2248207/1‑150 (MQ=255)
gTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 2:1169117/150‑1 (MQ=255)
gTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTg < 1:1168667/150‑1 (MQ=255)
tCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGa < 1:3959274/150‑1 (MQ=255)
tctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGt < 2:2781425/150‑1 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTg < 2:3076283/150‑1 (MQ=255)
gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 1:2088368/150‑1 (MQ=255)
aTTGGTGTACGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTAGTGCTATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATTTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt < 2:3527245/150‑1 (MQ=255)
aTTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt > 1:910287/1‑150 (MQ=255)
aTTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt < 2:480684/150‑1 (MQ=255)
aTTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt > 1:3325048/1‑150 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtg < 2:2971846/150‑1 (MQ=255)
gTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtgctg < 2:4691970/150‑1 (MQ=255)
gACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTgctgct > 2:3097027/1‑150 (MQ=255)
aCCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGctgctg < 2:1416363/150‑1 (MQ=255)
ccGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAGTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGt > 2:4038398/1‑150 (MQ=255)
gggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAcc > 1:1521100/1‑150 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCa > 2:2791671/1‑150 (MQ=255)
tcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCTCTTTATGGGGATCAGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGATGCTGTAACAACAATGATa > 2:1802376/1‑150 (MQ=255)
cAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAg > 1:4415905/1‑150 (MQ=255)
aaaGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGcc > 1:2163232/1‑150 (MQ=255)
aagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCAtag > 2:4578821/1‑148 (MQ=255)
aagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTg > 1:693050/1‑150 (MQ=255)
agCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg < 1:623764/150‑1 (MQ=255)
cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGa < 1:304962/150‑1 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt < 1:251779/150‑1 (MQ=255)
tATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACATATGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAt > 2:2703373/1‑150 (MQ=255)
aTTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAGTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATg > 1:1042399/1‑150 (MQ=255)
ttGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 2:2342659/150‑1 (MQ=255)
ttGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 1:125197/150‑1 (MQ=255)
ttGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 2:4207062/150‑1 (MQ=255)
gtGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 2:2223926/149‑1 (MQ=255)
tGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGaa < 2:1752917/150‑1 (MQ=255)
gCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAc < 1:4566550/150‑1 (MQ=255)
gATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAccc < 2:359669/150‑1 (MQ=255)
tGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg > 1:2761170/1‑150 (MQ=255)
gCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa > 2:4181436/1‑150 (MQ=255)
gCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa < 2:428814/150‑1 (MQ=255)
gCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa < 1:708276/150‑1 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGat < 1:134134/150‑1 (MQ=255)
tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGata < 1:2451873/150‑1 (MQ=255)
cATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGatat < 1:3160460/150‑1 (MQ=255)
aTTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATc > 2:4728393/1‑150 (MQ=255)
aTTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATc > 2:1287478/1‑150 (MQ=255)
tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctg > 2:2024814/1‑150 (MQ=255)
tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctg > 2:4477509/1‑150 (MQ=255)
gATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg < 1:4258240/150‑1 (MQ=255)
aTCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTgg > 2:615955/1‑150 (MQ=255)
tctTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGa < 2:561241/150‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGatat > 2:3365951/1‑150 (MQ=255)
tgctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGAGTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAttt < 2:2905696/150‑1 (MQ=255)
gctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTg > 2:3232789/1‑150 (MQ=255)
gctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTg < 1:1377553/150‑1 (MQ=255)
ctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTgg > 2:2367479/1‑150 (MQ=255)
gggATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 1:1301543/1‑150 (MQ=255)
gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAACTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATTAACCCCGATATAGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAc > 1:4328275/1‑150 (MQ=255)
tCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcg < 2:820639/150‑1 (MQ=255)
tCACATTATTGCAAGGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcg < 2:3176142/150‑1 (MQ=255)
cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgc > 2:2366777/1‑150 (MQ=255)
acaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc < 2:2273922/150‑1 (MQ=255)
acaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 1:403133/1‑150 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 1:626919/1‑150 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 1:1916382/1‑150 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 1:297213/1‑150 (MQ=255)
tattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 2:1079611/1‑150 (MQ=255)
tattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 2:3031668/1‑150 (MQ=255)
tattGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCGGCCGGTGATTATGTCGGTGACCATTGCTGCTGTAACACCCAAGATAGCCAATGGGATGAACCCCGATATCGGCCTGCTGGGGCTATTTGGTGCCACTATCGCCGCgg > 1:3677134/1‑150 (MQ=255)
attGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg > 2:1605105/1‑150 (MQ=255)
ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGt > 1:2545933/1‑150 (MQ=255)
ttGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGt < 1:3404263/150‑1 (MQ=255)
gCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGttt < 1:1799472/150‑1 (MQ=255)
cAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtttt < 2:3836146/150‑1 (MQ=255)
cAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtttt > 1:4625434/1‑150 (MQ=255)
gtatcggtatcgGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATca < 1:418455/150‑1 (MQ=255)
tatcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcac > 2:3895116/1‑150 (MQ=255)
atcggtatcggCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATTTCGGTGACCTTTTCTGCTGTAACACCAAAGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc > 1:3751118/1‑150 (MQ=255)
tcggtatcggCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacca < 1:4671335/150‑1 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcaccac < 2:3704983/150‑1 (MQ=255)
gtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCCGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACat > 2:666831/1‑150 (MQ=255)
gCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAg < 1:1766904/150‑1 (MQ=255)
gCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAg < 1:1769141/150‑1 (MQ=255)
gCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAg < 1:2008724/150‑1 (MQ=255)
|
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024834‑3025131
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024835‑3025131
|
ACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGC < SRR19973081.4505038/150‑1 (MQ=60)
TCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCCCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCT < SRR19973081.2294224/150‑1 (MQ=60)
CCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTT < SRR19973081.972146/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973081.4378000/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973081.4378230/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973081.4380332/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973081.4545036/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973081.4545068/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTACTCTTATTATTTGTGACCGACAGGGCCACTCAAAAGAAGCTATTTCGATGCTCATTATCTCGGATCTCGTTTGCTGCGGGATCGTCACAATATTGCAAAGTATAGGTATAGGCCGCGTTATTG > SRR19973081.4895787/1‑150 (MQ=60)
CATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGG < SRR19973081.787338/150‑1 (MQ=60)
CATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGG < SRR19973081.4766528/150‑1 (MQ=60)
TGTACGCAGGTGCAGTCGCGGTTCCTCTTATGATTGGTGACCCACGGGGGCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCAATAGCTCGGATATCTTTTGCTGCGGGGGAGTCACAGTATTGGAAATTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGG > SRR19973081.4797656/1‑150 (MQ=60)
AGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCT < SRR19973081.4360854/150‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTG < SRR19973081.1923133/150‑1 (MQ=60)
GGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTG < SRR19973081.2656484/150‑1 (MQ=60)
TGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCC < SRR19973081.1294739/150‑1 (MQ=60)
CAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGG < SRR19973081.3016589/150‑1 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTATCTCGGATCTATTTTGCTGCGGGATAGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCatccggg > SRR19973081.4665349/1‑143 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGT > SRR19973081.2262509/1‑150 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGT < SRR19973081.1590846/150‑1 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATACGCCTGCCGGT > SRR19973081.2262427/1‑150 (MQ=60)
AGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAATATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATACGCCTGCCGGT > SRR19973081.3038862/1‑150 (MQ=60)
AGTCGCTGGTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGT > SRR19973081.2262516/1‑150 (MQ=60)
GTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973081.1176170/150‑1 (MQ=60)
GTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973081.3282498/150‑1 (MQ=60)
GTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTG < SRR19973081.1176905/150‑1 (MQ=60)
TCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGA < SRR19973081.3983489/150‑1 (MQ=60)
CTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTA < SRR19973081.1368135/150‑1 (MQ=60)
CTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTA < SRR19973081.1366309/150‑1 (MQ=60)
TGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTAT > SRR19973081.4089048/1‑150 (MQ=60)
TGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTAT > SRR19973081.3355114/1‑150 (MQ=60)
GTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATT > SRR19973081.3911387/1‑150 (MQ=60)
TTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGT < SRR19973081.769763/150‑1 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973081.3873336/150‑1 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973081.3737498/150‑1 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973081.264234/150‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT < SRR19973081.2101921/150‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT < SRR19973081.2101556/150‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT < SRR19973081.2101644/150‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCAACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT > SRR19973081.4811660/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973081.919392/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973081.3345408/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973081.1107874/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973081.916417/1‑150 (MQ=60)
TTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTG < SRR19973081.1778973/150‑1 (MQ=60)
TTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTG < SRR19973081.1778943/150‑1 (MQ=60)
TGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGC > SRR19973081.340075/1‑150 (MQ=60)
TGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGC > SRR19973081.272598/1‑150 (MQ=60)
TGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGC > SRR19973081.1967206/1‑150 (MQ=60)
ACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTG < SRR19973081.1333635/150‑1 (MQ=60)
ACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTG < SRR19973081.1331624/150‑1 (MQ=60)
GACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAA > SRR19973081.599965/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACC > SRR19973081.3155866/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACC > SRR19973081.1531080/1‑150 (MQ=60)
GGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACC > SRR19973081.4004979/1‑150 (MQ=60)
GCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAA < SRR19973081.1663951/150‑1 (MQ=60)
TCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGA > SRR19973081.304290/1‑150 (MQ=60)
CTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGAT > SRR19973081.225804/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG > SRR19973081.2499212/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG > SRR19973081.4442485/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCC > SRR19973081.4132791/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCC > SRR19973081.2177684/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCC > SRR19973081.2177010/1‑150 (MQ=60)
AAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCC > SRR19973081.2121870/1‑150 (MQ=60)
AAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTG > SRR19973081.697699/1‑150 (MQ=60)
AAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTG > SRR19973081.697706/1‑150 (MQ=60)
AAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTG > SRR19973081.4603266/1‑150 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG < SRR19973081.628108/150‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG < SRR19973081.628279/150‑1 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG < SRR19973081.628281/150‑1 (MQ=60)
CTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGA < SRR19973081.1556375/150‑1 (MQ=60)
CTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGA < SRR19973081.307225/150‑1 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT < SRR19973081.253819/150‑1 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT < SRR19973081.253803/150‑1 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT < SRR19973081.2346533/150‑1 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT > SRR19973081.3005481/1‑150 (MQ=60)
TATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGGATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGAT < SRR19973081.4677536/150‑1 (MQ=60)
ATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATG < SRR19973081.2555185/150‑1 (MQ=60)
ATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACAGTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATG > SRR19973081.1049410/1‑150 (MQ=60)
TTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGA < SRR19973081.126401/150‑1 (MQ=60)
GCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAC < SRR19973081.4594242/150‑1 (MQ=60)
CGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACC > SRR19973081.2350457/1‑150 (MQ=60)
ATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCG < SRR19973081.957191/150‑1 (MQ=60)
ATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCG > SRR19973081.624132/1‑150 (MQ=60)
TGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGG > SRR19973081.2778117/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA < SRR19973081.712998/150‑1 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGAT < SRR19973081.135410/150‑1 (MQ=60)
TCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATA < SRR19973081.2467016/150‑1 (MQ=60)
CATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATAT < SRR19973081.3179720/150‑1 (MQ=60)
TAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGG > SRR19973081.3644768/1‑150 (MQ=60)
TAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGG > SRR19973081.4013212/1‑150 (MQ=60)
TCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATACGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTTCTGTAACACCAATGATAGCCAATGGGATGAACCCGCATATCCGCCAG > SRR19973081.1457886/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT < SRR19973081.1278786/150‑1 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT < SRR19973081.1278767/150‑1 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG < SRR19973081.4284229/150‑1 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG < SRR19973081.1814447/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973081.2732265/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT < SRR19973081.1764492/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCATTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT > SRR19973081.654556/1‑150 (MQ=60)
GCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTG < SRR19973081.1386807/150‑1 (MQ=60)
TGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGT > SRR19973081.660800/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973081.1970057/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973081.1308203/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973081.1310238/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAAGATAGCCAATTGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC > SRR19973081.1310237/1‑150 (MQ=60)
GGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCC < SRR19973081.422569/150‑1 (MQ=60)
GATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTCTGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAC < SRR19973081.2857950/150‑1 (MQ=60)
GATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAAAACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAC > SRR19973081.4354564/1‑150 (MQ=60)
GATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAACTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATTAACCCCGATATAGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCAC > SRR19973081.4354568/1‑150 (MQ=60)
ATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACT < SRR19973081.4278422/150‑1 (MQ=60)
ATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACT < SRR19973081.1568577/150‑1 (MQ=60)
CACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGC > SRR19973081.1489361/1‑150 (MQ=60)
ACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCAGCAGTAACACCAATGATATCCATTGGGATGAACCCCGATATCGGCCTGCTGGGGATAATTTGTGCCACTATCGCC > SRR19973081.4283924/1‑150 (MQ=60)
ACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCC > SRR19973081.405705/1‑150 (MQ=60)
CATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCG < SRR19973081.4347123/150‑1 (MQ=60)
CATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCG < SRR19973081.3770710/150‑1 (MQ=60)
CATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCG > SRR19973081.4395551/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973081.631285/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTTGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973081.299453/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973081.299483/1‑150 (MQ=60)
ATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGC > SRR19973081.1928622/1‑150 (MQ=60)
TATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCGGCCGGTGATTATGTCGGTGACCATTGCTGCTGTAACACCCAAGATAGCCAATGGGATGAACCCCGATATCGGCCTGCTGGGGCTATTTGGTGCCACTATCGCCGCGG > SRR19973081.3699425/1‑150 (MQ=60)
TTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGT > SRR19973081.2561895/1‑150 (MQ=60)
TTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGT < SRR19973081.3425198/150‑1 (MQ=60)
TTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGT > SRR19973081.2561799/1‑150 (MQ=60)
TTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGT > SRR19973081.2561798/1‑150 (MQ=60)
TTGCAATGGATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGT < SRR19973081.1148541/150‑1 (MQ=60)
GCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTT < SRR19973081.1811223/150‑1 (MQ=60)
GCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTT < SRR19973081.1810383/150‑1 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT < SRR19973081.1191835/150‑1 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT > SRR19973081.4653519/1‑150 (MQ=60)
AGGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973081.709888/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCA < SRR19973081.421195/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCA < SRR19973081.4644676/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCA < SRR19973081.3475699/150‑1 (MQ=60)
ATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATTTCGGTGACCTTTTCTGCTGTAACACCAAAGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACC > SRR19973081.3774100/1‑150 (MQ=60)
TCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCA < SRR19973081.2933630/150‑1 (MQ=60)
TCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCA < SRR19973081.4699685/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACAT < SRR19973081.1805713/150‑1 (MQ=60)
GTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACAT > SRR19973081.3103538/1‑150 (MQ=60)
ATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > SRR19973081.3227309/1‑150 (MQ=60)
TCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTAT < SRR19973081.1430713/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973081.2481877/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973081.2021240/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973081.1778466/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973081.1780716/150‑1 (MQ=60)
GCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG < SRR19973081.2023635/150‑1 (MQ=60)
|
ACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAG > CP009273/3024835‑3025131
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |