Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,024,983 |
C→G |
100% |
G86G (GGC→GGG) |
uacT → |
uric acid permease |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,024,983 | 0 | C | G | 99.6%
| 966.2
/ ‑3.9
| 238 | G86G (GGC→GGG) | uacT | uric acid permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base G (128/109); total (128/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024839‑3025127
|
ccTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGgcgc < 2:3149954/148‑1 (MQ=255)
ttGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCtt < 1:112375/148‑1 (MQ=255)
tGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCttt < 2:1687813/148‑1 (MQ=255)
tCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAt < 1:850395/148‑1 (MQ=255)
cATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATg < 1:3469979/148‑1 (MQ=255)
cATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATg > 2:2424836/1‑148 (MQ=255)
tGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCCACTGGGCCTCTAAAAAGAAGCTATTTCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTTCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATAGGGCGCGTTATggg > 2:745909/1‑148 (MQ=255)
cGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 1:3760379/148‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 2:1923281/148‑1 (MQ=255)
cGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATc < 1:2850414/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGc < 2:601737/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGc < 2:2519265/148‑1 (MQ=255)
gCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGa < 1:2457036/148‑1 (MQ=255)
ccTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGt < 1:3000939/148‑1 (MQ=255)
tctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCg > 1:3800346/1‑148 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCgg > 2:3733760/1‑148 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCgg > 2:845906/1‑148 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCgg > 1:448672/1‑148 (MQ=255)
ctTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCgg > 2:217487/1‑148 (MQ=255)
tATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTg < 2:910053/148‑1 (MQ=255)
tGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAc > 1:1909792/1‑148 (MQ=255)
tGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAc > 1:3156082/1‑148 (MQ=255)
gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAcc > 1:714589/1‑148 (MQ=255)
gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAcc < 2:335212/148‑1 (MQ=255)
gATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAcc < 1:2954701/148‑1 (MQ=255)
aTTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCt < 1:377231/148‑1 (MQ=255)
ttGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCtt < 2:143647/148‑1 (MQ=255)
tGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt > 2:3251577/1‑148 (MQ=255)
tGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCttt > 1:1051701/1‑148 (MQ=255)
ggTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtg < 2:753149/148‑1 (MQ=255)
gACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTtgctg < 2:336411/148‑1 (MQ=255)
aCCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAc > 2:2059229/1‑139 (MQ=255)
aCCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAc < 1:2059229/139‑1 (MQ=255)
ccGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTgctgct < 1:1644244/148‑1 (MQ=255)
cGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGctgctg > 2:1612511/1‑148 (MQ=255)
aCTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTa > 1:137197/1‑148 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTTacac > 1:2246264/1‑148 (MQ=255)
ggCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAacac > 1:321086/1‑148 (MQ=255)
tctcAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAt > 1:1422936/1‑148 (MQ=255)
aaaGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAg > 1:1015144/1‑148 (MQ=255)
aagaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGc > 2:541838/1‑148 (MQ=255)
gaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa > 1:2584609/1‑148 (MQ=255)
gaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa > 1:3127683/1‑148 (MQ=255)
gaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa < 2:674510/148‑1 (MQ=255)
gaagCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCa < 2:151934/148‑1 (MQ=255)
gCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTg < 2:3095755/148‑1 (MQ=255)
cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg < 2:2961788/148‑1 (MQ=255)
cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg < 2:1053290/148‑1 (MQ=255)
cTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTGTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTgg > 1:2730675/1‑148 (MQ=255)
tGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATg > 2:707272/1‑148 (MQ=255)
gCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 2:1241957/148‑1 (MQ=255)
gCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGa < 1:1258103/148‑1 (MQ=255)
aTGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAcc > 2:3736890/1‑148 (MQ=255)
tGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAccc > 1:1385352/1‑148 (MQ=255)
gCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCg > 2:2790833/1‑148 (MQ=255)
cTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCgg < 2:3782737/148‑1 (MQ=255)
tCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGa > 1:1718763/1‑148 (MQ=255)
ttAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGatat < 2:292018/148‑1 (MQ=255)
ttAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGatat > 2:3262354/1‑148 (MQ=255)
tAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATc > 2:1455369/1‑148 (MQ=255)
tAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATc > 2:1236143/1‑148 (MQ=255)
gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg < 1:155938/148‑1 (MQ=255)
gCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCgg < 1:2520522/148‑1 (MQ=255)
cTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGc > 1:100128/1‑148 (MQ=255)
tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGcc < 1:2302417/148‑1 (MQ=255)
tCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGAGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCAGTAACACCAATGATAGCCATAGGCATGAACCCGGATATCGTcc > 2:1411099/1‑148 (MQ=255)
ggATCTCTTGTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctg < 1:3543917/148‑1 (MQ=255)
gATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgc > 1:3632926/1‑148 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATTGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTTCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGActgctg > 1:150229/1‑148 (MQ=255)
tctcTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCctgctg > 1:3723566/1‑148 (MQ=255)
tctTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTggg < 1:1920625/148‑1 (MQ=255)
ttttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGa < 1:3791111/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGat < 2:819732/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGat < 2:2981798/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGat > 2:1512851/1‑148 (MQ=255)
tttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGat > 2:1371384/1‑148 (MQ=255)
ttGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGata < 2:3443035/148‑1 (MQ=255)
ctgcGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATAttt < 1:1512871/148‑1 (MQ=255)
gggATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTg < 2:233056/148‑1 (MQ=255)
ggATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGc > 1:3174739/1‑148 (MQ=255)
gATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGcc > 2:351943/1‑148 (MQ=255)
aTCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCa < 1:966133/148‑1 (MQ=255)
tCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAt < 1:3733824/148‑1 (MQ=255)
cacaTTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATc > 1:3147957/1‑148 (MQ=255)
attattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgcc > 2:1657355/1‑148 (MQ=255)
ttattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccg > 2:2508861/1‑148 (MQ=255)
tattGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATcgccgc > 2:715027/1‑148 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTTATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg > 1:865315/1‑148 (MQ=255)
tGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCggg < 2:1250477/148‑1 (MQ=255)
cAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGtt < 1:660693/148‑1 (MQ=255)
tGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa > 2:159040/1‑148 (MQ=255)
tGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa < 2:137197/148‑1 (MQ=255)
tGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTa < 1:568932/148‑1 (MQ=255)
atcggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATca > 2:182138/1‑148 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATCTTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcaca > 2:2636032/1‑147 (MQ=255)
cggtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcacc > 2:3220172/1‑148 (MQ=255)
gtatcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATcaccac > 2:1625841/1‑148 (MQ=255)
atcggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACat > 2:2720282/1‑148 (MQ=255)
cggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatta < 1:2740453/148‑1 (MQ=255)
cggGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACatta < 2:1008571/148‑1 (MQ=255)
|
CCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > CP009273/3024839‑3025127
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAGC > CP009273/3024834‑3025132
|
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTTGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAATCTATTTCGATGCTCAATAGCTCGGATCTCATTTTCTGCGGGATCGTCACAATATTTCAATGTATCGGTATCGGG > SRR19973069.3522302/1‑150 (MQ=60)
CTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTT < SRR19973069.3156069/150‑1 (MQ=60)
CTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTT < SRR19973069.948670/150‑1 (MQ=60)
TTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTA < SRR19973069.113478/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973069.980109/150‑1 (MQ=60)
TGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTAT < SRR19973069.977359/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973069.2717133/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973069.785857/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973069.856359/150‑1 (MQ=60)
TCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGG < SRR19973069.856672/150‑1 (MQ=60)
CATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGG < SRR19973069.3492421/150‑1 (MQ=60)
CGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCG < SRR19973069.2869185/150‑1 (MQ=60)
CGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCG < SRR19973069.3784829/150‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCC < SRR19973069.1750446/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATT < SRR19973069.2473545/150‑1 (MQ=60)
GTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATG > SRR19973069.1665241/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG > SRR19973069.3816686/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG > SRR19973069.3824961/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG > SRR19973069.3816672/1‑150 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973069.3020855/150‑1 (MQ=60)
CCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCG < SRR19973069.2954360/150‑1 (MQ=60)
CTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGG > SRR19973069.451951/1‑150 (MQ=60)
CTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCGTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGG > SRR19973069.451949/1‑150 (MQ=60)
CTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTG > SRR19973069.3734546/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCTATGCTCATTATATCGGATCTCTTTTTCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATAGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGCTGATTATGTAGGTGAC > SRR19973069.3177619/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAC > SRR19973069.1205793/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAC > SRR19973069.1922974/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAC > SRR19973069.3176796/1‑150 (MQ=60)
TATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGAC > SRR19973069.3176691/1‑150 (MQ=60)
ATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACC > SRR19973069.719619/1‑150 (MQ=60)
ATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACC > SRR19973069.1052689/1‑150 (MQ=60)
ccgatctTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCT < SRR19973069.2073510/143‑1 (MQ=60)
GATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTT < SRR19973069.2974314/150‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTTATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT < SRR19973069.3514630/150‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT < SRR19973069.379986/150‑1 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973069.1058998/1‑150 (MQ=60)
ATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTT > SRR19973069.1059189/1‑150 (MQ=60)
GACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCT < SRR19973069.2053748/150‑1 (MQ=60)
ACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTG < SRR19973069.2581251/150‑1 (MQ=60)
CCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGT < SRR19973069.1655560/150‑1 (MQ=60)
CGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTA > SRR19973069.138465/1‑150 (MQ=60)
CTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACA < SRR19973069.3429833/150‑1 (MQ=60)
TGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTTACAC > SRR19973069.2261391/1‑150 (MQ=60)
TGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACAC > SRR19973069.323204/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAT > SRR19973069.1432743/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAT > SRR19973069.1432878/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAT > SRR19973069.1498496/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAAT > SRR19973069.366857/1‑150 (MQ=60)
CTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGAT < SRR19973069.2278934/150‑1 (MQ=60)
TCAAAAGAAGCTAGTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATA < SRR19973069.1922427/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG < SRR19973069.3795572/150‑1 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG > SRR19973069.1021548/1‑150 (MQ=60)
CAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAG > SRR19973069.1022145/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCA > SRR19973069.2601812/1‑150 (MQ=60)
AAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCA > SRR19973069.3148204/1‑150 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCACTGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG > SRR19973069.2749024/1‑150 (MQ=60)
AGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTGTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGG > SRR19973069.2748957/1‑150 (MQ=60)
CTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGA > SRR19973069.2641828/1‑150 (MQ=60)
CTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGA > SRR19973069.3044458/1‑150 (MQ=60)
GCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAC < SRR19973069.1266596/150‑1 (MQ=60)
GCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAC < SRR19973069.1359213/150‑1 (MQ=60)
GCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAC < SRR19973069.3814787/150‑1 (MQ=60)
GATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCC > SRR19973069.1395015/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA > SRR19973069.2898511/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGA > SRR19973069.1730812/1‑150 (MQ=60)
GCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACACGGA > SRR19973069.2450210/1‑150 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCTGGCGCTTTATGGGGATACGCCTGCCCGTGATTATGTAGGTGAacttttattctgtaaaaccaaagataacaatattgatgaaacccgat > SRR19973069.1632048/1‑103 (MQ=60)
CTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAAACCGGAT > SRR19973069.1632254/1‑150 (MQ=60)
ATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCGGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTTCTGTAAAAACAATGATAGCCATTTGGATGAAACCGGATATC > SRR19973069.369327/1‑150 (MQ=60)
AGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGC > SRR19973069.3405596/1‑150 (MQ=60)
AGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGC > SRR19973069.101137/1‑150 (MQ=60)
GCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCC < SRR19973069.157309/150‑1 (MQ=60)
GCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCC < SRR19973069.2537282/150‑1 (MQ=60)
TCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTG < SRR19973069.2318080/150‑1 (MQ=60)
CGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGC > SRR19973069.3656678/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT > SRR19973069.25482/1‑150 (MQ=60)
GGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT < SRR19973069.3566953/150‑1 (MQ=60)
GGATCTCTTGTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCT < SRR19973069.3566930/150‑1 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATTGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTTCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGACTGCTG > SRR19973069.151556/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG > SRR19973069.3747867/1‑150 (MQ=60)
GATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTG < SRR19973069.646955/150‑1 (MQ=60)
ATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGG > SRR19973069.2986755/1‑150 (MQ=60)
TCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGA < SRR19973069.1933839/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT > SRR19973069.1453129/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGAT > SRR19973069.3780165/1‑150 (MQ=60)
TTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATA < SRR19973069.2415990/150‑1 (MQ=60)
TTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATA < SRR19973069.3815691/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGG < SRR19973069.1523118/150‑1 (MQ=60)
CTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGG < SRR19973069.1523323/150‑1 (MQ=60)
CGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGC > SRR19973069.3195402/1‑150 (MQ=60)
GGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCA < SRR19973069.1383894/150‑1 (MQ=60)
GGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCA < SRR19973069.1393285/150‑1 (MQ=60)
ATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACT < SRR19973069.972571/150‑1 (MQ=60)
CGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAT > SRR19973069.319591/1‑150 (MQ=60)
CGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTAT > SRR19973069.50537/1‑150 (MQ=60)
CGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACAAT > SRR19973069.1119052/1‑150 (MQ=60)
GTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATC < SRR19973069.990004/150‑1 (MQ=60)
GTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATC > SRR19973069.3168541/1‑150 (MQ=60)
GTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATC > SRR19973069.305456/1‑150 (MQ=60)
TCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCG < SRR19973069.3758099/150‑1 (MQ=60)
TCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCG < SRR19973069.851837/150‑1 (MQ=60)
TCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCG < SRR19973069.3758165/150‑1 (MQ=60)
ACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCC > SRR19973069.212067/1‑150 (MQ=60)
ACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCGTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCC > SRR19973069.1924232/1‑150 (MQ=60)
ATTGCAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTTATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGG > SRR19973069.871358/1‑150 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT < SRR19973069.2176815/150‑1 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT < SRR19973069.665161/150‑1 (MQ=60)
CAATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTT < SRR19973069.665156/150‑1 (MQ=60)
ATGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTAT < SRR19973069.3764471/150‑1 (MQ=60)
TGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATC < SRR19973069.572877/150‑1 (MQ=60)
TGTATCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATC < SRR19973069.2819172/150‑1 (MQ=60)
TCGGTATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCA < SRR19973069.154649/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTA > SRR19973069.3170540/1‑150 (MQ=60)
TCGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTAT < SRR19973069.645850/150‑1 (MQ=60)
CGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT < SRR19973069.2758776/150‑1 (MQ=60)
CGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > SRR19973069.1269334/1‑150 (MQ=60)
CGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > SRR19973069.3740365/1‑150 (MQ=60)
CGGGCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATT > SRR19973069.1269233/1‑150 (MQ=60)
GCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAGC < SRR19973069.3510515/150‑1 (MQ=60)
GCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAGC < SRR19973069.712236/150‑1 (MQ=60)
|
CACGTCCTTGTCATGTACGCAGGTGCAGTCGCTGTTCCTCTTATGATTGGTGACCGACTGGGCCTCTCAAAAGAAGCTATTGCGATGCTCATTAGCTCGGATCTCTTTTGCTGCGGGATCGTCACATTATTGCAATGTATCGGTATCGGCCGCTTTATGGGGATCCGCCTGCCGGTGATTATGTCGGTGACCTTTGCTGCTGTAACACCAATGATAGCCATTGGGATGAACCCGGATATCGGCCTGCTGGGGATATTTGGTGCCACTATCGCCGCGGGTTTTATCACCACATTATTAGC > CP009273/3024834‑3025132
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
