Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,258,871 |
G→T |
100% |
L173I (CTC→ATC) |
tdcB ← |
L‑threonine dehydratase, catabolic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,258,871 | 0 | G | T | 96.9%
| 706.1
/ 11.4
| 228 | L173I (CTC→ATC) | tdcB | L‑threonine dehydratase, catabolic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/2); new base T (107/114); total (112/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAC > CP009273/3258726‑3259015
|
tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGatat < 1:2609598/148‑1 (MQ=255)
tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGatat < 2:1328336/148‑1 (MQ=255)
gAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCt < 1:1989863/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt < 2:37785/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt > 2:653033/1‑148 (MQ=255)
aagaagCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTc > 1:3174596/1‑148 (MQ=255)
agaagCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCAGAGATATCTTca > 2:2878931/1‑147 (MQ=255)
gaagCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCa > 2:92670/1‑148 (MQ=255)
aagCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCAt > 2:448478/1‑148 (MQ=255)
agCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATa > 2:1599589/1‑148 (MQ=255)
gccgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATaa > 1:1371131/1‑148 (MQ=255)
gccgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATaa < 2:3218816/148‑1 (MQ=255)
gccgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATaa > 1:3447779/1‑148 (MQ=255)
gccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAAttt < 1:1424614/148‑1 (MQ=255)
gccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAAttt < 1:1159793/148‑1 (MQ=255)
ccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTc < 2:2507942/148‑1 (MQ=255)
tGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCaa > 2:2699995/1‑148 (MQ=255)
aaCGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCACTc < 2:1361666/148‑1 (MQ=255)
aaCGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATc > 2:1132610/1‑148 (MQ=255)
aaCGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATc > 2:1132935/1‑148 (MQ=255)
gTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGtt < 1:97966/148‑1 (MQ=255)
tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc < 1:2145132/148‑1 (MQ=255)
tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc < 1:2442884/148‑1 (MQ=255)
ttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTccc < 1:168560/148‑1 (MQ=255)
tACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCa < 1:1243009/148‑1 (MQ=255)
cGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAAt > 2:1576059/1‑148 (MQ=255)
aaTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACt < 1:1127389/148‑1 (MQ=255)
aaTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACt > 1:1981612/1‑148 (MQ=255)
aTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACtt < 2:2053547/148‑1 (MQ=255)
tAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACttt > 1:2921184/1‑148 (MQ=255)
acacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCg > 1:1023680/1‑148 (MQ=255)
acacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCg > 2:105548/1‑148 (MQ=255)
cacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCgg < 1:1538195/148‑1 (MQ=255)
cacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCgg < 2:3118899/148‑1 (MQ=255)
acGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGa < 2:2119913/148‑1 (MQ=255)
gAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatc < 1:2304866/148‑1 (MQ=255)
aaTGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatca > 1:3141874/1‑148 (MQ=255)
aTGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatcat < 1:653033/148‑1 (MQ=255)
ggTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAgg > 1:801269/1‑148 (MQ=255)
gTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGt > 2:3526001/1‑148 (MQ=255)
ttAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg > 1:3420315/1‑148 (MQ=255)
ttAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTACATGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg < 1:2661684/148‑1 (MQ=255)
tAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTgg < 2:746998/148‑1 (MQ=255)
aaTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTggg < 2:1023821/148‑1 (MQ=255)
aTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGa < 1:1823467/148‑1 (MQ=255)
tAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 2:2410546/1‑148 (MQ=255)
tAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 1:1931503/1‑148 (MQ=255)
aGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATa > 2:1994224/1‑148 (MQ=255)
aTTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaa > 2:1431649/1‑148 (MQ=255)
tAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 1:551497/148‑1 (MQ=255)
tAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 2:2938228/148‑1 (MQ=255)
tAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 2:2940539/148‑1 (MQ=255)
tAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 1:203697/148‑1 (MQ=255)
aTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAc > 1:2938484/1‑148 (MQ=255)
ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTc > 1:720937/1‑148 (MQ=255)
ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTc > 1:3027902/1‑148 (MQ=255)
ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTc < 1:1853703/148‑1 (MQ=255)
gCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCa < 1:776553/148‑1 (MQ=255)
cAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAt < 1:1599589/148‑1 (MQ=255)
tACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTc > 1:2815839/1‑148 (MQ=255)
cAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGAc < 1:105548/148‑1 (MQ=255)
aGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACa > 1:1030853/1‑148 (MQ=255)
gCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACaa > 2:2808148/1‑148 (MQ=255)
cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAt < 2:837666/148‑1 (MQ=255)
cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAt > 1:3108801/1‑148 (MQ=255)
cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAt > 2:2441893/1‑148 (MQ=255)
aaTTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAtt < 1:939890/148‑1 (MQ=255)
aCCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTc > 2:2449303/1‑148 (MQ=255)
ccaccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTACGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACtt > 2:1823368/1‑148 (MQ=255)
ccaccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACtt < 2:2583332/148‑1 (MQ=255)
caccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACttt > 2:3068166/1‑148 (MQ=255)
accaccaATTGGCACAAACACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCACTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTa > 2:2971322/1‑148 (MQ=255)
ccaccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAg > 2:1988570/1‑148 (MQ=255)
caccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGc < 1:152446/148‑1 (MQ=255)
accaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCg < 1:1414537/148‑1 (MQ=255)
accaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCg < 1:448478/148‑1 (MQ=255)
ggCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAgtgt < 2:1383942/148‑1 (MQ=255)
ggCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAgtgt > 2:3142352/1‑148 (MQ=255)
gCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTc < 1:2361267/148‑1 (MQ=255)
cacaATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCg > 2:2162012/1‑148 (MQ=255)
cacaATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCg < 2:1569558/148‑1 (MQ=255)
caATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGtt < 1:3233802/148‑1 (MQ=255)
aaTCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTg > 2:1891946/1‑148 (MQ=255)
aTCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTGGCGATAGTGTCGTTGa < 2:801269/148‑1 (MQ=255)
aTCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGa > 1:2755426/1‑148 (MQ=255)
tCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGaa > 1:3139203/1‑148 (MQ=255)
cGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAAGtt > 1:3418147/1‑148 (MQ=255)
ttATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTAt > 2:1799109/1‑148 (MQ=255)
tATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATc < 1:3197220/148‑1 (MQ=255)
tCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAc < 1:2251241/148‑1 (MQ=255)
tCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAc < 1:1653031/148‑1 (MQ=255)
tCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAc > 2:2019495/1‑148 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCAttc > 1:753021/1‑146 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGc < 2:3169691/148‑1 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGc < 1:3079347/148‑1 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGc < 1:1567855/148‑1 (MQ=255)
tAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATAACCATGCAGaa > 2:1231193/1‑148 (MQ=255)
agatATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAc > 1:852246/1‑148 (MQ=255)
agatATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAc > 2:1118675/1‑148 (MQ=255)
agatATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAATTTATCACCAATCAGAAc > 2:325795/1‑148 (MQ=255)
|
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAC > CP009273/3258726‑3259015
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGAGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258722‑3259020
|
GGAGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAT < SRR19973066.930108/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCT < SRR19973066.2627239/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTC < SRR19973066.2003877/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTC < SRR19973066.2003939/150‑1 (MQ=60)
GAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTC > SRR19973066.3195732/1‑150 (MQ=60)
AGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCAT > SRR19973066.1526741/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAA > SRR19973066.2639129/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAA > SRR19973066.3470835/1‑150 (MQ=60)
AAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAA > SRR19973066.1381050/1‑150 (MQ=60)
CGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTC > SRR19973066.752538/1‑150 (MQ=60)
GCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCC < SRR19973066.1434797/150‑1 (MQ=60)
GCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCC < SRR19973066.1168025/150‑1 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA < SRR19973066.1187270/150‑1 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA < SRR19973066.1681340/150‑1 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA < SRR19973066.2977447/150‑1 (MQ=60)
ATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGA > SRR19973066.128267/1‑150 (MQ=60)
CGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAA > SRR19973066.1486902/1‑150 (MQ=60)
CGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGAATTAAATGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCATCCATAATTTCCAGACCAA > SRR19973066.171351/1‑150 (MQ=60)
GTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGATTGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGTCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAAT < SRR19973066.1948257/150‑1 (MQ=60)
GTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAAT < SRR19973066.1162338/150‑1 (MQ=60)
GTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATAGCCACCGCAATACAAGCAATTAAACCGCCACCCCCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTACATAATTTCCAGACCAAT > SRR19973066.2020798/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCC < SRR19973066.99009/150‑1 (MQ=60)
GTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCC < SRR19973066.99015/150‑1 (MQ=60)
TTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCC < SRR19973066.2951458/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCT < SRR19973066.3202115/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCT < SRR19973066.2160021/150‑1 (MQ=60)
TTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCT < SRR19973066.2459526/150‑1 (MQ=60)
TTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTG < SRR19973066.170076/150‑1 (MQ=60)
TCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGG > SRR19973066.246965/1‑150 (MQ=60)
GACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCA > SRR19973066.1393942/1‑150 (MQ=60)
GACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCA > SRR19973066.3179012/1‑150 (MQ=60)
CTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGC > SRR19973066.3467769/1‑150 (MQ=60)
TACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAAT < SRR19973066.1251909/150‑1 (MQ=60)
ACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATC < SRR19973066.774939/150‑1 (MQ=60)
GCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCAC < SRR19973066.1607006/150‑1 (MQ=60)
CCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACT > SRR19973066.1995599/1‑150 (MQ=60)
CCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACT > SRR19973066.1995651/1‑150 (MQ=60)
AATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTT > SRR19973066.2940657/1‑150 (MQ=60)
AATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTT < SRR19973066.1135489/150‑1 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973066.1082333/1‑150 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973066.1031355/1‑150 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973066.1031214/1‑150 (MQ=60)
AACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGG > SRR19973066.2789999/1‑150 (MQ=60)
CACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGAT < SRR19973066.1548787/150‑1 (MQ=60)
CACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGAT < SRR19973066.1549177/150‑1 (MQ=60)
CACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGAT < SRR19973066.1549236/150‑1 (MQ=60)
CGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCA > SRR19973066.3162837/1‑150 (MQ=60)
GAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCAT < SRR19973066.2320652/150‑1 (MQ=60)
ATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCG < SRR19973066.657796/150‑1 (MQ=60)
TGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGT > SRR19973066.1774289/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGG > SRR19973066.807126/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGG > SRR19973066.807164/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGG > SRR19973066.807160/1‑150 (MQ=60)
GGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTCAGGTG > SRR19973066.923412/1‑150 (MQ=60)
GGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTG > SRR19973066.3443191/1‑150 (MQ=60)
TTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGG < SRR19973066.3116037/150‑1 (MQ=60)
TTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTACATGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGG < SRR19973066.2679519/150‑1 (MQ=60)
AATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAT > SRR19973066.1945217/1‑150 (MQ=60)
aaatatttaaatacaacaccaaaaacagaaataaaaaataaaaaACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA > SRR19973066.1276639/45‑150 (MQ=60)
ATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA > SRR19973066.1083906/1‑150 (MQ=60)
ATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA < SRR19973066.3063028/150‑1 (MQ=60)
ATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA < SRR19973066.1836483/150‑1 (MQ=60)
ATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA < SRR19973066.1836470/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAT < SRR19973066.2973846/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAT < SRR19973066.3266756/150‑1 (MQ=60)
TAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAC > SRR19973066.790603/1‑150 (MQ=60)
TAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAC < SRR19973066.555459/150‑1 (MQ=60)
TAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAC > SRR19973066.2958024/1‑150 (MQ=60)
TAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAC < SRR19973066.205415/150‑1 (MQ=60)
AATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACG < SRR19973066.548330/150‑1 (MQ=60)
GCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCT < SRR19973066.3129731/150‑1 (MQ=60)
GCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCT < SRR19973066.3129687/150‑1 (MQ=60)
CACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTC > SRR19973066.726276/1‑150 (MQ=60)
CACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTC > SRR19973066.1267289/1‑150 (MQ=60)
CACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTC < SRR19973066.445747/150‑1 (MQ=60)
CACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTC > SRR19973066.3048127/1‑150 (MQ=60)
CCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCA < SRR19973066.164726/150‑1 (MQ=60)
CCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCA < SRR19973066.1866969/150‑1 (MQ=60)
CGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAT < SRR19973066.1933244/150‑1 (MQ=60)
GCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATT < SRR19973066.782294/150‑1 (MQ=60)
CAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTT < SRR19973066.1611185/150‑1 (MQ=60)
CAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGATCCCTGGCCAGCAATCACTATCGGATCATCGTAAGGTGGGCTAAAAATACGGCCTTCCCTTT > SRR19973066.3340365/1‑150 (MQ=60)
AATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTC > SRR19973066.2834769/1‑150 (MQ=60)
CCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACA > SRR19973066.1038442/1‑150 (MQ=60)
CAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAA < SRR19973066.106647/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAT > SRR19973066.3129567/1‑150 (MQ=60)
CAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTT < SRR19973066.3205773/150‑1 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCATTCACTTTCGGATCTTCGTATGGTGGGATAAAAgttcggcggggggtgtcgcgccgggc > SRR19973066.2619141/1‑124 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC > SRR19973066.1580876/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC < SRR19973066.946732/150‑1 (MQ=60)
TAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCT > SRR19973066.2823967/1‑150 (MQ=60)
CCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACT < SRR19973066.420613/150‑1 (MQ=60)
CCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACT < SRR19973066.2368876/150‑1 (MQ=60)
CACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGA < SRR19973066.1964553/150‑1 (MQ=60)
CACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGA < SRR19973066.153867/150‑1 (MQ=60)
ACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAT < SRR19973066.1424679/150‑1 (MQ=60)
ACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAT < SRR19973066.1424687/150‑1 (MQ=60)
ACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGAT < SRR19973066.451934/150‑1 (MQ=60)
CCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATA < SRR19973066.961988/150‑1 (MQ=60)
AATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGT > SRR19973066.1056809/1‑150 (MQ=60)
TGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTC > SRR19973066.2460627/1‑150 (MQ=60)
GGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCG > SRR19973066.2109745/1‑150 (MQ=60)
GCACAATCACGTTATCGACATCATATATATCGTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCCCTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTCGCGATAGTGTCGT < SRR19973066.2377287/150‑1 (MQ=60)
GCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGT < SRR19973066.2377271/150‑1 (MQ=60)
CACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTT > SRR19973066.2171842/1‑150 (MQ=60)
CAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGA < SRR19973066.3255157/150‑1 (MQ=60)
CAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGA > SRR19973066.2773981/1‑150 (MQ=60)
CAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGA > SRR19973066.3254650/1‑150 (MQ=60)
AATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAA > SRR19973066.3160148/1‑150 (MQ=60)
AATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAA > SRR19973066.3160150/1‑150 (MQ=60)
CACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTT > SRR19973066.3441141/1‑150 (MQ=60)
CACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAAGTT > SRR19973066.3441008/1‑150 (MQ=60)
TTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCA < SRR19973066.676947/150‑1 (MQ=60)
TATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAC < SRR19973066.3218451/150‑1 (MQ=60)
ATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACC < SRR19973066.722465/150‑1 (MQ=60)
TCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCA < SRR19973066.1665065/150‑1 (MQ=60)
TCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCA < SRR19973066.2266759/150‑1 (MQ=60)
CGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCAT < SRR19973066.573395/150‑1 (MQ=60)
ACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTgtaagttttaaccaagc > SRR19973066.2693219/1‑133 (MQ=60)
ACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATTC > SRR19973066.758609/1‑150 (MQ=60)
ACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATAACCAAGC > SRR19973066.2852866/1‑150 (MQ=60)
CATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCA < SRR19973066.2297067/150‑1 (MQ=60)
CATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGGTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCA < SRR19973066.2296975/150‑1 (MQ=60)
ATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAG < SRR19973066.1579149/150‑1 (MQ=60)
ATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAG < SRR19973066.3099919/150‑1 (MQ=60)
ATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGTAGTTATCACCATGCAGAAC > SRR19973066.858405/1‑150 (MQ=60)
AGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAAGTTATCACCATGCAGAACGA > SRR19973066.1294752/1‑150 (MQ=60)
ATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGGTATCCCCCTGCAGAACGACG > SRR19973066.2110246/1‑150 (MQ=60)
TATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT < SRR19973066.3313293/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGGTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT < SRR19973066.3549468/150‑1 (MQ=60)
|
GGAGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258722‑3259020
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
