Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,258,871 |
G→T |
100% |
L173I (CTC→ATC) |
tdcB ← |
L‑threonine dehydratase, catabolic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,258,871 | 0 | G | T | 100.0%
| 622.0
/ NA
| 187 | L173I (CTC→ATC) | tdcB | L‑threonine dehydratase, catabolic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (84/103); total (84/103) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAC > CP009273/3258726‑3259015
|
tGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGatat < 1:1271224/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATc < 1:2732534/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt < 2:2899851/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt < 1:2205975/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt < 1:165734/148‑1 (MQ=255)
aaaGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCtt < 1:165493/148‑1 (MQ=255)
agaagCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTcc < 1:1927159/148‑1 (MQ=255)
agCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATa < 2:1571697/148‑1 (MQ=255)
ccgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAAt > 2:3763815/1‑148 (MQ=255)
cgccATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAAtt < 2:3132538/148‑1 (MQ=255)
aTGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCa > 1:3182729/1‑148 (MQ=255)
aTGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCa < 1:262003/148‑1 (MQ=255)
aTGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCa > 1:607042/1‑148 (MQ=255)
aTGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCa > 1:2048376/1‑148 (MQ=255)
tGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAg < 2:2076156/148‑1 (MQ=255)
tGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAg < 2:147572/148‑1 (MQ=255)
tGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAg < 2:3568568/148‑1 (MQ=255)
aCGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCg < 1:588121/148‑1 (MQ=255)
aCGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCg < 1:2507070/148‑1 (MQ=255)
gTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGTGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGtt < 2:3708040/148‑1 (MQ=255)
gTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGtt < 1:2716955/148‑1 (MQ=255)
ttttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTc > 2:1890107/1‑148 (MQ=255)
tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc > 2:1137472/1‑148 (MQ=255)
tttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTcc > 2:2185915/1‑148 (MQ=255)
ttCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTccc < 1:2510772/148‑1 (MQ=255)
aCTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGcc < 1:3799577/148‑1 (MQ=255)
gTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGc > 1:2606093/1‑148 (MQ=255)
tACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCa < 2:1977439/148‑1 (MQ=255)
aTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACtt < 2:3647586/148‑1 (MQ=255)
aTAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACtt > 1:1794608/1‑148 (MQ=255)
acacGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGAAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCATACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCg > 1:1527612/1‑148 (MQ=255)
acGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGa < 1:797369/148‑1 (MQ=255)
cGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGat > 2:76036/1‑148 (MQ=255)
gAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatc < 1:1956555/148‑1 (MQ=255)
aaTGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatca < 1:1412545/148‑1 (MQ=255)
aaTGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatca < 2:583061/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGatcatc > 1:3238414/1‑148 (MQ=255)
ggTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCg > 1:2979953/1‑148 (MQ=255)
gTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGt > 1:3554885/1‑148 (MQ=255)
gggTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAg < 1:2089814/148‑1 (MQ=255)
ggTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAgg < 1:1559094/148‑1 (MQ=255)
gTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGt > 1:1456922/1‑148 (MQ=255)
gTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGt < 1:1765016/148‑1 (MQ=255)
ttAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg > 2:426422/1‑148 (MQ=255)
ttAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTg < 1:1762035/148‑1 (MQ=255)
tAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTgg > 2:1025927/1‑148 (MQ=255)
aTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGa > 1:3157548/1‑148 (MQ=255)
aTAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCGTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGa < 1:2595258/148‑1 (MQ=255)
tAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 2:657722/1‑148 (MQ=255)
tAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAt > 1:1939980/1‑148 (MQ=255)
gATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaa < 1:1902206/148‑1 (MQ=255)
ttAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaaaa < 2:3817987/148‑1 (MQ=255)
ttAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATaaaaa > 2:2090895/1‑148 (MQ=255)
tAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAGTTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAt < 2:3321310/148‑1 (MQ=255)
aaTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATa < 1:3644437/148‑1 (MQ=255)
aTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAc > 2:2639766/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAc > 2:2559246/1‑148 (MQ=255)
aTTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAc > 1:3339477/1‑148 (MQ=255)
tGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACgg < 1:26635/148‑1 (MQ=255)
ccACCGCAATACCATCAATTAAACCGCCACCACCAATTGTCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGcc < 2:2954313/148‑1 (MQ=255)
ccACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGcc < 1:1510408/148‑1 (MQ=255)
ccGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTc < 1:1161312/148‑1 (MQ=255)
aTACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAttt < 2:373319/148‑1 (MQ=255)
aTACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAttt < 1:3728325/148‑1 (MQ=255)
aTACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAttt > 1:930588/1‑148 (MQ=255)
aTACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCAttt > 1:2354677/1‑148 (MQ=255)
tACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTc > 2:1920825/1‑148 (MQ=255)
ccAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGa < 1:1337255/148‑1 (MQ=255)
aGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACa < 2:1422805/148‑1 (MQ=255)
cAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAt > 2:3114362/1‑148 (MQ=255)
aaTTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATAGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCACTCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAtt < 2:1774099/148‑1 (MQ=255)
aTTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAttt > 2:2379392/1‑148 (MQ=255)
ttAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTc > 1:48623/1‑148 (MQ=255)
tAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCg > 2:1812499/1‑148 (MQ=255)
aCCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTc > 1:3693698/1‑148 (MQ=255)
ccGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCa > 1:122344/1‑148 (MQ=255)
ccGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCa > 1:826427/1‑148 (MQ=255)
caccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGc > 1:2875808/1‑148 (MQ=255)
ccaATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGa > 1:3202025/1‑148 (MQ=255)
aTTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAg < 2:3406854/148‑1 (MQ=255)
aTTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAg < 1:622846/148‑1 (MQ=255)
tGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAgtg > 1:458566/1‑148 (MQ=255)
acaATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGt < 2:44867/148‑1 (MQ=255)
caATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGtt > 2:1553793/1‑148 (MQ=255)
aTCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGa < 1:1684592/148‑1 (MQ=255)
aTCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGa < 2:1587943/148‑1 (MQ=255)
tCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGAGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGaa < 2:610854/148‑1 (MQ=255)
cacttgaTCGAAATCATATATATCTTCCATTATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTAGGATCATCGTAATGTGGTATAAAAATTCGGCCTTCCATTTCGACTATTTCTCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAg < 2:2724212/142‑1 (MQ=255)
cACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAg < 1:3030676/148‑1 (MQ=255)
tATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATc > 1:693399/1‑148 (MQ=255)
tCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCAc < 2:667512/148‑1 (MQ=255)
catcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGGAGTTATCACCATg < 2:2357609/148‑1 (MQ=255)
catcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATg < 1:3773195/148‑1 (MQ=255)
catcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATg < 2:480829/148‑1 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGc < 1:52658/148‑1 (MQ=255)
atcatAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGc < 2:922778/148‑1 (MQ=255)
catAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAg > 1:473631/1‑148 (MQ=255)
catAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAg > 2:3184751/1‑148 (MQ=255)
agatATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGTAGGTATCACCATGCAGAAc > 2:1730783/1‑148 (MQ=255)
agatATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATAACCATGCAGAAc > 1:3141178/1‑148 (MQ=255)
|
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAC > CP009273/3258726‑3259015
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258724‑3259020
|
AGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATAT < SRR19973069.935013/150‑1 (MQ=60)
AGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATAT > SRR19973069.2581696/1‑150 (MQ=60)
AGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATAT < SRR19973069.2676181/150‑1 (MQ=60)
TGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCT < SRR19973069.1279768/150‑1 (MQ=60)
GGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTT > SRR19973069.2679285/1‑150 (MQ=60)
GGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTT < SRR19973069.2750824/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCC < SRR19973069.2220935/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCC < SRR19973069.167162/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCC < SRR19973069.167161/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCC < SRR19973069.468829/150‑1 (MQ=60)
AAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCC < SRR19973069.166920/150‑1 (MQ=60)
AGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCAT < SRR19973069.1940399/150‑1 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.2062597/1‑150 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.2062603/1‑150 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.611120/1‑150 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.579991/1‑150 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.3203450/1‑150 (MQ=60)
CCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCA > SRR19973069.3203423/1‑150 (MQ=60)
ATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGA < SRR19973069.263889/150‑1 (MQ=60)
TGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATC > SRR19973069.154281/1‑150 (MQ=60)
ACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTT < SRR19973069.592135/150‑1 (MQ=60)
ACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTT < SRR19973069.2523787/150‑1 (MQ=60)
GTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCC < SRR19973069.2735163/150‑1 (MQ=60)
GTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCC < SRR19973069.806891/150‑1 (MQ=60)
TTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTG < SRR19973069.2527503/150‑1 (MQ=60)
GACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCA > SRR19973069.2691212/1‑150 (MQ=60)
ACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAG < SRR19973069.3824190/150‑1 (MQ=60)
CTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGC > SRR19973069.2623504/1‑150 (MQ=60)
TGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCA < SRR19973069.1524282/150‑1 (MQ=60)
CAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTT > SRR19973069.863017/1‑150 (MQ=60)
CAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTT > SRR19973069.1807245/1‑150 (MQ=60)
AATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTT < SRR19973069.3190598/150‑1 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973069.984189/1‑150 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973069.1428102/1‑150 (MQ=60)
TAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGAAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCATACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCG > SRR19973069.1538121/1‑150 (MQ=60)
AACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGG > SRR19973069.3578109/1‑150 (MQ=60)
AACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGATATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGG > SRR19973069.3725670/1‑150 (MQ=60)
CACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGAT < SRR19973069.2627282/150‑1 (MQ=60)
ACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATC < SRR19973069.803022/150‑1 (MQ=60)
ACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATC < SRR19973069.298377/150‑1 (MQ=60)
GAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCAT < SRR19973069.1969557/150‑1 (MQ=60)
GAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCAT < SRR19973069.1970106/150‑1 (MQ=60)
AATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATC > SRR19973069.3259610/1‑150 (MQ=60)
AATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATC < SRR19973069.1422392/150‑1 (MQ=60)
AATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATC < SRR19973069.3794545/150‑1 (MQ=60)
ATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCG > SRR19973069.3000262/1‑150 (MQ=60)
ATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCG > SRR19973069.2999736/1‑150 (MQ=60)
TGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGT > SRR19973069.3578005/1‑150 (MQ=60)
CGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCACTCACTTTCGGATCATCGTAAGG > SRR19973069.1671224/1‑150 (MQ=60)
GGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGT < SRR19973069.2104271/150‑1 (MQ=60)
GGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGT > SRR19973069.1467086/1‑150 (MQ=60)
GGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTG < SRR19973069.1569741/150‑1 (MQ=60)
GTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGG < SRR19973069.1777460/150‑1 (MQ=60)
TTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGG < SRR19973069.1774459/150‑1 (MQ=60)
TAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGA > SRR19973069.2526840/1‑150 (MQ=60)
TAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGA > SRR19973069.3178160/1‑150 (MQ=60)
AATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAT > SRR19973069.1953333/1‑150 (MQ=60)
AATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAT > SRR19973069.740414/1‑150 (MQ=60)
AATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGAT > SRR19973069.1953240/1‑150 (MQ=60)
ATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCGTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATA < SRR19973069.2612577/150‑1 (MQ=60)
GATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAA < SRR19973069.1915355/150‑1 (MQ=60)
GATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAA < SRR19973069.1915357/150‑1 (MQ=60)
TTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAAT < SRR19973069.2824296/150‑1 (MQ=60)
TAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATAC > SRR19973069.3361342/1‑150 (MQ=60)
AATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACG < SRR19973069.3668310/150‑1 (MQ=60)
AATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACG < SRR19973069.2746333/150‑1 (MQ=60)
AATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACG < SRR19973069.3668315/150‑1 (MQ=60)
TGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCC < SRR19973069.27023/150‑1 (MQ=60)
CCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTT < SRR19973069.1520790/150‑1 (MQ=60)
CCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTT < SRR19973069.1520850/150‑1 (MQ=60)
ACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCC < SRR19973069.3261375/150‑1 (MQ=60)
CCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCA < SRR19973069.1169386/150‑1 (MQ=60)
CAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTT > SRR19973069.936903/1‑150 (MQ=60)
CAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTT > SRR19973069.2370683/1‑150 (MQ=60)
ATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCG < SRR19973069.3752643/150‑1 (MQ=60)
ACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGAC > SRR19973069.1421836/1‑150 (MQ=60)
CCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACA < SRR19973069.1346488/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAT < SRR19973069.1741929/150‑1 (MQ=60)
AGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAAT < SRR19973069.1789081/150‑1 (MQ=60)
CAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTT > SRR19973069.503484/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC > SRR19973069.1807538/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC > SRR19973069.2410642/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC > SRR19973069.49236/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTC > SRR19973069.49201/1‑150 (MQ=60)
AAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTC > SRR19973069.3717849/1‑150 (MQ=60)
AACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCA > SRR19973069.123505/1‑150 (MQ=60)
AACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCA > SRR19973069.832253/1‑150 (MQ=60)
CACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAG > SRR19973069.1626736/1‑150 (MQ=60)
CACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAG < SRR19973069.2200533/150‑1 (MQ=60)
ACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGC > SRR19973069.2894677/1‑150 (MQ=60)
CACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGA > SRR19973069.3222853/1‑150 (MQ=60)
ATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTG < SRR19973069.626984/150‑1 (MQ=60)
ATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTG < SRR19973069.626986/150‑1 (MQ=60)
ATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTG > SRR19973069.461924/1‑150 (MQ=60)
ATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAG < SRR19973069.1251083/150‑1 (MQ=60)
ATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAG < SRR19973069.1696350/150‑1 (MQ=60)
ATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAA > SRR19973069.2283528/1‑150 (MQ=60)
ATCACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGGTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAG < SRR19973069.390275/150‑1 (MQ=60)
CACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCACTCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTT < SRR19973069.3085928/150‑1 (MQ=60)
CACGTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTT < SRR19973069.3050775/150‑1 (MQ=60)
GTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATC > SRR19973069.3808286/1‑150 (MQ=60)
GTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATC > SRR19973069.698266/1‑150 (MQ=60)
GTTATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAAGTTATC > SRR19973069.697008/1‑150 (MQ=60)
ATCGACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACC < SRR19973069.3484690/150‑1 (MQ=60)
ACATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGC > SRR19973069.2006094/1‑150 (MQ=60)
CATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCA < SRR19973069.3797706/150‑1 (MQ=60)
ATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAG < SRR19973069.53317/150‑1 (MQ=60)
ATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAG > SRR19973069.477077/1‑150 (MQ=60)
ATCATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAG > SRR19973069.128859/1‑150 (MQ=60)
ATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAAC > SRR19973069.3162454/1‑150 (MQ=60)
ATAGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATAACCATGCAGAAC > SRR19973069.3161739/1‑150 (MQ=60)
AGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGA > SRR19973069.499746/1‑150 (MQ=60)
AGATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGA > SRR19973069.1811236/1‑150 (MQ=60)
ATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACT < SRR19973069.429549/150‑1 (MQ=60)
ATATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCACTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACT < SRR19973069.3376039/150‑1 (MQ=60)
TATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTGGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > SRR19973069.1309885/1‑150 (MQ=60)
|
AGTGGAAAGAAGCCGCCATGCCGTGAACGTTTTCAGACTGTACGCCAATAACACGAATGGTCGGGTTAATAGATTTAATTGCCACCGCAATACCAGCAATTAAACCGCCACCACCAATTGGCACAATCACGTTATCGACATCATAGAGATCTTCCATAATTTCCAGACCAATCGTTCCCTGGCCAGCAATCACTTTCGGATCATCGTAAGGTGGGATAAAAATACGGCCTTCCATTTCGACAATTTCGCTCACTTTAGCGATAGTGTCGTTGAAGTTATCACCATGCAGAACGACTT > CP009273/3258724‑3259020
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
