Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,062,424 |
G→T |
100% |
I71I (ATC→ATA) |
yihQ ← |
alpha‑glucosidase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,062,424 | 0 | G | T | 100.0%
| 682.5
/ NA
| 207 | I71I (ATC→ATA) | yihQ | alpha‑glucosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (97/110); total (97/110) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAA > CP009273/4062279‑4062567
|
gcAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTAt < 1:741239/148‑1 (MQ=255)
aGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATgg < 2:1981868/148‑1 (MQ=255)
ccAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCg < 2:2180097/148‑1 (MQ=255)
ccAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCg < 2:3453825/148‑1 (MQ=255)
aGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTc > 2:2221834/1‑148 (MQ=255)
aGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTc > 2:259945/1‑148 (MQ=255)
gATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCg < 2:1438893/148‑1 (MQ=255)
tACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGt > 1:272769/1‑148 (MQ=255)
tgtgGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAgcgc > 2:2819149/1‑148 (MQ=255)
ttAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAttt > 2:2497372/1‑148 (MQ=255)
tAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtttt > 1:444600/1‑148 (MQ=255)
tAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtttt > 2:2646508/1‑148 (MQ=255)
ggTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTtctc > 1:3519504/1‑148 (MQ=255)
ttGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCt > 1:733761/1‑148 (MQ=255)
gTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGt > 1:3265453/1‑148 (MQ=255)
tCGTTTTTTAGTTCCACCAAAACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTa < 1:1247456/148‑1 (MQ=255)
tCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTa > 2:2508562/1‑148 (MQ=255)
tCGTTTTGTAGTTCCAGAAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTa < 1:2733018/148‑1 (MQ=255)
ttGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTa > 2:1622633/1‑148 (MQ=255)
gTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATc < 2:1785572/148‑1 (MQ=255)
tAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCt > 1:431384/1‑148 (MQ=255)
tAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCt < 1:2276044/148‑1 (MQ=255)
tAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCt < 2:3466994/148‑1 (MQ=255)
tCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTaa > 2:837942/1‑148 (MQ=255)
cAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATg < 2:290318/148‑1 (MQ=255)
cAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATg < 2:1336699/148‑1 (MQ=255)
gCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCt < 2:1635631/148‑1 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGa > 1:477082/1‑148 (MQ=255)
aTAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGaa > 2:648760/1‑148 (MQ=255)
aaaCGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAAt > 2:706198/1‑148 (MQ=255)
aaaCGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAAt > 2:3456391/1‑148 (MQ=255)
ccccTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg < 2:1454555/148‑1 (MQ=255)
ccccTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg > 2:1711676/1‑148 (MQ=255)
ccccTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg < 1:3440028/148‑1 (MQ=255)
ccccTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg < 1:1275398/148‑1 (MQ=255)
cccTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcgc > 1:580263/1‑148 (MQ=255)
cTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCgg < 2:1603642/148‑1 (MQ=255)
tGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGa > 1:369562/1‑148 (MQ=255)
tGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGa > 2:2370837/1‑148 (MQ=255)
aTCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGacc > 2:63844/1‑146 (MQ=255)
aTCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAAc > 1:664893/1‑148 (MQ=255)
tcgtcgGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACa < 2:3076684/148‑1 (MQ=255)
cgtcgGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACAATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACat > 2:2291748/1‑148 (MQ=255)
gtcgGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACata < 1:112291/148‑1 (MQ=255)
ggCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCg < 2:1882519/148‑1 (MQ=255)
gCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGACCATATCGa > 1:3038713/1‑148 (MQ=255)
cAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGat < 2:127168/148‑1 (MQ=255)
agaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATc < 1:1622633/148‑1 (MQ=255)
agaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATc > 1:260452/1‑148 (MQ=255)
agaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATc > 1:367314/1‑148 (MQ=255)
gaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATcc > 2:3433367/1‑148 (MQ=255)
atatTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCg > 1:3397712/1‑148 (MQ=255)
atTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCt > 1:1831766/1‑148 (MQ=255)
cAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCtata < 2:317403/148‑1 (MQ=255)
cAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCtata < 2:317073/148‑1 (MQ=255)
aGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATAc > 2:1577744/1‑148 (MQ=255)
aGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATAc < 1:989220/148‑1 (MQ=255)
tGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGa > 2:3027238/1‑148 (MQ=255)
aaTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATc > 1:3336330/1‑148 (MQ=255)
aaTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATc > 1:3295465/1‑148 (MQ=255)
aTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATcc < 1:2221834/148‑1 (MQ=255)
aTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATcc > 2:2421338/1‑148 (MQ=255)
cAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATaa < 2:1918302/148‑1 (MQ=255)
gAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAAc < 1:1383171/148‑1 (MQ=255)
aaCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACa > 1:2301518/1‑148 (MQ=255)
aaCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACa < 2:1138110/148‑1 (MQ=255)
aCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCa > 2:423196/1‑141 (MQ=255)
aCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCa < 1:423208/141‑1 (MQ=255)
aCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACaa > 2:819975/1‑148 (MQ=255)
ccACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAg > 2:295367/1‑148 (MQ=255)
ccACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAg > 1:1636375/1‑148 (MQ=255)
aCGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGa < 1:1545609/148‑1 (MQ=255)
aCGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGa < 2:1715886/148‑1 (MQ=255)
cGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAt > 2:249232/1‑148 (MQ=255)
gCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTa < 1:1752721/148‑1 (MQ=255)
aaaTGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCtt > 1:2359976/1‑148 (MQ=255)
aTGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTg < 1:2253715/148‑1 (MQ=255)
aTGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTg < 2:444600/148‑1 (MQ=255)
tGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGc < 2:2766772/148‑1 (MQ=255)
aTTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTAt < 2:1893485/148‑1 (MQ=255)
ttAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATg < 2:2138284/148‑1 (MQ=255)
tAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATgg < 2:3519504/148‑1 (MQ=255)
ccaaccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCTATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGtt > 2:1899037/1‑148 (MQ=255)
ccaaccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGtt > 1:3112726/1‑148 (MQ=255)
caaccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTa > 2:2868989/1‑148 (MQ=255)
aaccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaa > 2:1878459/1‑148 (MQ=255)
aaccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaa > 2:74020/1‑148 (MQ=255)
accaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaaa < 2:1809026/148‑1 (MQ=255)
accaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaaa < 1:2508562/148‑1 (MQ=255)
ccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaaaa < 2:473495/148‑1 (MQ=255)
aTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATa < 1:2842662/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAg > 1:3185091/1‑148 (MQ=255)
ccGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAg > 2:544487/1‑148 (MQ=255)
ccGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAg < 1:1818515/148‑1 (MQ=255)
tGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACgt < 1:1065656/148‑1 (MQ=255)
gACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACgtt > 1:1029314/1‑148 (MQ=255)
aCTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGTTTAAAATAAGACgttg < 2:272870/148‑1 (MQ=255)
cTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACgttgt > 2:2606517/1‑148 (MQ=255)
cTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGaa < 1:861658/148‑1 (MQ=255)
tGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGaaa < 1:1221924/148‑1 (MQ=255)
|
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAA > CP009273/4062279‑4062567
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > CP009273/4062275‑4062572
|
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT > SRR19973066.1986473/1‑150 (MQ=60)
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT < SRR19973066.1076366/150‑1 (MQ=60)
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT > SRR19973066.1986456/1‑150 (MQ=60)
GGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTA < SRR19973066.3543866/150‑1 (MQ=60)
CGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATG < SRR19973066.2307292/150‑1 (MQ=60)
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGG < SRR19973066.746745/150‑1 (MQ=60)
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGG < SRR19973066.746151/150‑1 (MQ=60)
AGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCG < SRR19973066.2992941/150‑1 (MQ=60)
CCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTC > SRR19973066.3163548/1‑150 (MQ=60)
GATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGT > SRR19973066.274781/1‑150 (MQ=60)
GATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGT > SRR19973066.274882/1‑150 (MQ=60)
TACGTTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAA < SRR19973066.2582048/150‑1 (MQ=60)
GTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAT > SRR19973066.430099/1‑150 (MQ=60)
TGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATT < SRR19973066.1288585/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTT > SRR19973066.448028/1‑150 (MQ=60)
TTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTC > SRR19973066.2816861/1‑150 (MQ=60)
AAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTC > SRR19973066.3542941/1‑150 (MQ=60)
GGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCT < SRR19973066.1496277/150‑1 (MQ=60)
GGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCT > SRR19973066.739203/1‑150 (MQ=60)
TTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGT > SRR19973066.3286911/1‑150 (MQ=60)
TTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGT > SRR19973066.3286934/1‑150 (MQ=60)
GTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAG > SRR19973066.806482/1‑150 (MQ=60)
TCGTTTTTTAGTTCCACCAAAACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGT < SRR19973066.1256409/150‑1 (MQ=60)
TCGTTTTGTAGTTCCAGAAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGT < SRR19973066.2751403/150‑1 (MQ=60)
TGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCT > SRR19973066.434725/1‑150 (MQ=60)
TAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTT < SRR19973066.2292273/150‑1 (MQ=60)
TAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTT < SRR19973066.2291681/150‑1 (MQ=60)
AGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTA > SRR19973066.2004723/1‑150 (MQ=60)
TCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATG < SRR19973066.1782758/150‑1 (MQ=60)
GCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGA > SRR19973066.480654/1‑150 (MQ=60)
GCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGA > SRR19973066.480681/1‑150 (MQ=60)
ATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAAT < SRR19973066.434867/150‑1 (MQ=60)
TAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATT < SRR19973066.3349640/150‑1 (MQ=60)
ACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATTGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACC > SRR19973066.227886/1‑150 (MQ=60)
ACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACC < SRR19973066.3442909/150‑1 (MQ=60)
CGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCG < SRR19973066.1697055/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGC > SRR19973066.584334/1‑150 (MQ=60)
CCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCG < SRR19973066.3463040/150‑1 (MQ=60)
CCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCG < SRR19973066.1284608/150‑1 (MQ=60)
CCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCG < SRR19973066.1284547/150‑1 (MQ=60)
CCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCG > SRR19973066.615217/1‑150 (MQ=60)
CCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGA > SRR19973066.372458/1‑150 (MQ=60)
TGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAAC > SRR19973066.669749/1‑150 (MQ=60)
CGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACCTAT > SRR19973066.920264/1‑150 (MQ=60)
GTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATC < SRR19973066.1057293/150‑1 (MQ=60)
GTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATC < SRR19973066.113434/150‑1 (MQ=60)
GTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATC < SRR19973066.1234966/150‑1 (MQ=60)
CGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGACCATATCGA > SRR19973066.3059020/1‑150 (MQ=60)
CGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGA > SRR19973066.3059703/1‑150 (MQ=60)
AGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATC > SRR19973066.262410/1‑150 (MQ=60)
AGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATC > SRR19973066.370197/1‑150 (MQ=60)
GAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCC > SRR19973066.370963/1‑150 (MQ=60)
AGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCG < SRR19973066.1634393/150‑1 (MQ=60)
AGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCG > SRR19973066.3420384/1‑150 (MQ=60)
ATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCT > SRR19973066.1844844/1‑150 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT < SRR19973066.996519/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT < SRR19973066.996414/150‑1 (MQ=60)
GTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAG < SRR19973066.2664287/150‑1 (MQ=60)
TGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGC < SRR19973066.676678/150‑1 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA > SRR19973066.3366784/1‑150 (MQ=60)
CTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATC > SRR19973066.3317228/1‑150 (MQ=60)
CTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATC > SRR19973066.3358532/1‑150 (MQ=60)
ATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAT > SRR19973066.1583797/1‑150 (MQ=60)
ATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAT < SRR19973066.2237201/150‑1 (MQ=60)
gatctGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATA < SRR19973066.426494/145‑1 (MQ=60)
gatctGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATA < SRR19973066.426482/145‑1 (MQ=60)
AGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACA > SRR19973066.2317282/1‑150 (MQ=60)
GAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAA < SRR19973066.1393169/150‑1 (MQ=60)
AACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAG > SRR19973066.1648270/1‑150 (MQ=60)
AACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAG > SRR19973066.1648205/1‑150 (MQ=60)
ACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGG < SRR19973066.3365624/150‑1 (MQ=60)
ACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATT < SRR19973066.1556667/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTA < SRR19973066.1218115/150‑1 (MQ=60)
CGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACAGCGGAACATATCGATATCCGATATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTA < SRR19973066.359022/150‑1 (MQ=60)
GCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATC > SRR19973066.1100825/1‑150 (MQ=60)
GCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATC > SRR19973066.3226508/1‑150 (MQ=60)
GCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATC < SRR19973066.1765326/150‑1 (MQ=60)
CTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCT < SRR19973066.2467738/150‑1 (MQ=60)
TGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTT > SRR19973066.2375976/1‑150 (MQ=60)
TGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTT < SRR19973066.566083/150‑1 (MQ=60)
ATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCT < SRR19973066.2269250/150‑1 (MQ=60)
AACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTT > SRR19973066.3133514/1‑150 (MQ=60)
ACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAAT < SRR19973066.2525640/150‑1 (MQ=60)
ATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAG > SRR19973066.2254264/1‑150 (MQ=60)
ATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAG < SRR19973066.2861764/150‑1 (MQ=60)
ATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAG > SRR19973066.3206279/1‑150 (MQ=60)
TCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGA > SRR19973066.2352157/1‑150 (MQ=60)
CCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGAC < SRR19973066.1831472/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGAC < SRR19973066.1831571/150‑1 (MQ=60)
GTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTT > SRR19973066.2274073/1‑150 (MQ=60)
GTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTT > SRR19973066.1036894/1‑150 (MQ=60)
TGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTG < SRR19973066.1073469/150‑1 (MQ=60)
ACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTT < SRR19973066.3473398/150‑1 (MQ=60)
CTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAA < SRR19973066.867859/150‑1 (MQ=60)
TGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAAT < SRR19973066.1230555/150‑1 (MQ=60)
CTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > SRR19973066.2323711/1‑150 (MQ=60)
|
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > CP009273/4062275‑4062572
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |