Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F159 I0 R1
|
879 |
305.9 |
9588012 |
96.6% |
9262019 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,062,424 |
G→T |
93.0% |
I71I (ATC→ATA) |
yihQ ← |
alpha‑glucosidase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,062,424 | 0 | G | T | 93.0%
| 792.3
/ 48.0
| 257 | I71I (ATC→ATA) | yihQ | alpha‑glucosidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/15); new base T (87/152); total (90/167) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
Only 100 of 257 total aligned reads displayed.
CGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > CP009273/4062278‑4062572
|
cgcAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATg < 1:4660141/150‑1 (MQ=255)
gcAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATgg < 1:3980357/150‑1 (MQ=255)
gcAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATgg < 1:2508944/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAGATACGTTTGTGGTTATGGTTTTCGTTTGGTAGGTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGc < 2:8199/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGc < 2:525507/150‑1 (MQ=255)
cAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGc < 2:3822849/150‑1 (MQ=255)
gCCAGATAGGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGt < 1:3632743/150‑1 (MQ=255)
ccAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTc < 1:3722876/150‑1 (MQ=255)
cAGATACGGTTGTGGTTCAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCg > 2:2333700/1‑150 (MQ=255)
cAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCg > 2:429758/1‑150 (MQ=255)
aGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCgg < 2:1330598/150‑1 (MQ=255)
aGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCgg < 2:1053795/150‑1 (MQ=255)
gATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGt < 2:1677822/150‑1 (MQ=255)
gATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGt < 2:4083016/150‑1 (MQ=255)
tACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTaa < 1:1524642/150‑1 (MQ=255)
gggTTGTGGTTAAGGGTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAgc < 1:3350003/149‑1 (MQ=255)
ggTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAgcg < 1:1457562/150‑1 (MQ=255)
tgtgGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCaa < 2:1857944/150‑1 (MQ=255)
tgtttAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtt < 1:2659557/147‑1 (MQ=255)
tgGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtt < 1:4484453/150‑1 (MQ=255)
gTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtttt > 1:869132/1‑150 (MQ=255)
gTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtttt > 2:1018611/1‑150 (MQ=255)
gTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAAtttt < 2:346965/150‑1 (MQ=255)
ttAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTtc > 1:1746334/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTtct < 1:1398607/150‑1 (MQ=255)
tAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTtct > 2:2677960/1‑150 (MQ=255)
tAAGGTTGTCGTATTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTtct > 1:1676097/1‑150 (MQ=255)
ggTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCt > 1:4777236/1‑150 (MQ=255)
ttGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTgg < 1:2125414/150‑2 (MQ=255)
ttGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGt > 1:2721268/1‑150 (MQ=255)
gTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAg < 1:2988372/150‑1 (MQ=255)
tCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGt < 2:1474253/150‑1 (MQ=255)
tCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGt < 2:4593812/150‑1 (MQ=255)
tCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGt < 2:3743434/150‑1 (MQ=255)
cGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGtt < 2:1778498/150‑1 (MQ=255)
ttttGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTa > 1:1844023/1‑150 (MQ=255)
tttGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTAt < 1:1300440/150‑1 (MQ=255)
ttGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATc > 1:188024/1‑150 (MQ=255)
tAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCttt < 2:123852/150‑1 (MQ=255)
tCCAGAAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATg < 1:2431278/150‑1 (MQ=255)
ccAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGc > 1:802416/1‑150 (MQ=255)
cAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCt > 1:660070/1‑150 (MQ=255)
aGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTg < 1:1306497/150‑1 (MQ=255)
cAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGaa < 2:935157/150‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAAtt < 2:3140936/150‑1 (MQ=255)
cGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTACCCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg < 2:3434741/150‑1 (MQ=255)
cGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg > 2:4524796/1‑150 (MQ=255)
cGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcg < 1:2817605/150‑1 (MQ=255)
gCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACcgc < 1:2682389/150‑1 (MQ=255)
aTCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACat < 1:457296/150‑1 (MQ=255)
cgtcgGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACatat > 2:1757130/1‑150 (MQ=255)
gtcgGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATc > 1:474810/1‑150 (MQ=255)
cAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGNAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTNAAATTACCGCGGAACATATCGatat > 1:501424/1‑150 (MQ=255)
cAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGatat > 2:4440991/1‑150 (MQ=255)
gagaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATCTCGATATcc > 2:4425388/1‑150 (MQ=255)
agaTATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCg < 2:3345713/150‑1 (MQ=255)
atatTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCt < 1:2611582/150‑1 (MQ=255)
atTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCtat > 1:3851334/1‑150 (MQ=255)
cAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATAcc < 1:239227/150‑1 (MQ=255)
aGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCt < 2:4220077/150‑1 (MQ=255)
cgcTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCaa > 1:1070192/1‑150 (MQ=255)
cgcTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCaa > 1:3549128/1‑150 (MQ=255)
cgcTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCaa < 1:1290469/150‑1 (MQ=255)
gcTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAAt < 2:1039429/150‑1 (MQ=255)
cTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATc > 2:4358458/1‑150 (MQ=255)
tAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATcc < 2:3912647/150‑1 (MQ=255)
tAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGAGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGGAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCAATACCTGAGCCACTcc > 2:3091670/1‑150 (MQ=255)
aaTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCa < 2:1069353/150‑1 (MQ=255)
aTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAt < 2:4460149/150‑1 (MQ=255)
aTGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAt < 1:1756196/150‑1 (MQ=255)
tGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATa < 2:3243038/150‑1 (MQ=255)
tGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATa < 2:188024/150‑1 (MQ=255)
tGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATa < 1:1132856/150‑1 (MQ=255)
tCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATaaa > 2:868666/1‑150 (MQ=255)
aGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACa < 1:1651880/150‑1 (MQ=255)
gAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACaa > 2:2465657/1‑150 (MQ=255)
aaCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAg < 2:4479005/150‑1 (MQ=255)
aCCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAgg < 2:474810/150‑1 (MQ=255)
ccACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGa > 2:3952007/1‑150 (MQ=255)
cACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAt < 1:683894/150‑1 (MQ=255)
cACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAt < 2:720064/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAtt > 1:1226656/1‑150 (MQ=255)
aCGGCGGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGGAGTTTATCGTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAtt > 1:2903084/1‑150 (MQ=255)
cGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGATCCAATCCATAAACAAGGATTa > 1:2021025/1‑150 (MQ=255)
cGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTa < 2:672166/150‑1 (MQ=255)
ggCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTAt < 2:58432/150‑1 (MQ=255)
tGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATACATAAACAAGGATTATCtt > 2:2858085/1‑150 (MQ=255)
gAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCttt < 1:4173601/150‑1 (MQ=255)
gAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTAt < 2:1648122/150‑1 (MQ=255)
aaTTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATg < 2:3993268/150‑1 (MQ=255)
tAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGt < 2:2036571/150‑1 (MQ=255)
aaccaTCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTaaaa < 1:3180082/150‑1 (MQ=255)
ccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATa < 2:369189/150‑1 (MQ=255)
ccaTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATa > 1:4218296/1‑150 (MQ=255)
caTCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATaa < 1:4440991/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGa < 1:948930/150‑1 (MQ=255)
cTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGttgttg < 1:1018611/150‑1 (MQ=255)
cTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGttgttg > 1:1038508/1‑150 (MQ=255)
gACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATg < 2:354783/150‑1 (MQ=255)
cGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTTAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTa > 1:1812083/1‑150 (MQ=255)
|
CGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > CP009273/4062278‑4062572
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAG > CP009273/4062275‑4062573
|
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT > SRR19973078.3591536/1‑150 (MQ=60)
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT > SRR19973078.1527245/1‑150 (MQ=60)
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACT > SRR19973078.1937121/1‑150 (MQ=60)
CGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATG < SRR19973078.4686503/150‑1 (MQ=60)
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGG < SRR19973078.2523343/150‑1 (MQ=60)
GCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGG < SRR19973078.4002816/150‑1 (MQ=60)
GCCAGATAGGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGT < SRR19973078.3653368/150‑1 (MQ=60)
CCAGATAGGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTC < SRR19973078.1534041/150‑1 (MQ=60)
CCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTC < SRR19973078.3744220/150‑1 (MQ=60)
CCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTC > SRR19973078.3968782/1‑150 (MQ=60)
CCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTC < SRR19973078.1321432/150‑1 (MQ=60)
TACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAA > SRR19973078.181367/1‑150 (MQ=60)
TACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAA < SRR19973078.1533829/150‑1 (MQ=60)
GGGTTGTGGTTAAGGGTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGC < SRR19973078.3369166/150‑1 (MQ=60)
CGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGC > SRR19973078.672775/1‑150 (MQ=60)
GGTTGTGGTTAAGGTTGTCTTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCG < SRR19973078.1466494/150‑1 (MQ=60)
GGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCG < SRR19973078.1466504/150‑1 (MQ=60)
TGTTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATT < SRR19973078.2674705/150‑1 (MQ=60)
TGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATT < SRR19973078.4509841/150‑1 (MQ=60)
GTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTT > SRR19973078.874462/1‑150 (MQ=60)
TTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTC > SRR19973078.1756974/1‑150 (MQ=60)
TTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTC > SRR19973078.4177232/1‑150 (MQ=60)
TAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCT > SRR19973078.1686362/1‑150 (MQ=60)
TAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCT < SRR19973078.1407272/150‑1 (MQ=60)
TAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTAGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCT < SRR19973078.1943827/150‑1 (MQ=60)
TAAGGTTGTCGTATTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCT > SRR19973078.1686301/1‑150 (MQ=60)
AAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTC > SRR19973078.4704072/1‑150 (MQ=60)
GGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCT > SRR19973078.4803996/1‑150 (MQ=60)
GTTGTCGTTTTTTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTG > SRR19973078.2675664/1‑150 (MQ=60)
GTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTG > SRR19973078.2675054/1‑150 (MQ=60)
GTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTG < SRR19973078.3738585/150‑1 (MQ=60)
TTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGG < SRR19973078.2137912/150‑1 (MQ=60)
TTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGT > SRR19973078.2736604/1‑150 (MQ=60)
GTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAG < SRR19973078.3005421/150‑1 (MQ=60)
GTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTT < SRR19973078.862743/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTA > SRR19973078.1855082/1‑150 (MQ=60)
TTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTAT < SRR19973078.3733706/150‑1 (MQ=60)
TTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTAT < SRR19973078.1308428/150‑1 (MQ=60)
TTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTAT < SRR19973078.1308565/150‑1 (MQ=60)
TTTGTAGTTCCAGAAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTAT < SRR19973078.47371/150‑1 (MQ=60)
TTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATC > SRR19973078.188303/1‑150 (MQ=60)
TTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATC > SRR19973078.189584/1‑150 (MQ=60)
TTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATC > SRR19973078.3261321/1‑150 (MQ=60)
GTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAA > SRR19973078.3537143/1‑150 (MQ=60)
TCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATG > SRR19973078.2742436/1‑150 (MQ=60)
TCCAGAAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATG < SRR19973078.2445140/150‑1 (MQ=60)
TCAAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATG < SRR19973078.2445134/150‑1 (MQ=60)
CCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGC > SRR19973078.807059/1‑150 (MQ=60)
CAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCT > SRR19973078.664255/1‑150 (MQ=60)
CAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCT > SRR19973078.4237787/1‑150 (MQ=60)
AGCAATACACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTG < SRR19973078.1314578/150‑1 (MQ=60)
AGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTG < SRR19973078.1314656/150‑1 (MQ=60)
CAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAA > SRR19973078.3821705/1‑150 (MQ=60)
CAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAA < SRR19973078.2510986/150‑1 (MQ=60)
AAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTA < SRR19973078.1163507/150‑1 (MQ=60)
AACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTAC < SRR19973078.3146322/150‑1 (MQ=60)
AACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTAC > SRR19973078.1589958/1‑150 (MQ=60)
ACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACC < SRR19973078.2736297/150‑1 (MQ=60)
CGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCG < SRR19973078.2833369/150‑1 (MQ=60)
CGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCG < SRR19973078.2833412/150‑1 (MQ=60)
GCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGC < SRR19973078.2697626/150‑1 (MQ=60)
ATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACAT < SRR19973078.460240/150‑1 (MQ=60)
GTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATC > SRR19973078.477910/1‑150 (MQ=60)
GTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATC < SRR19973078.3933913/150‑1 (MQ=60)
TCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCG > SRR19973078.4533242/1‑150 (MQ=60)
GCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATA < SRR19973078.1374255/150‑1 (MQ=60)
CAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGNAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTNAAATTACCGCGGAACATATCGATAT > SRR19973078.504717/1‑150 (MQ=60)
CAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATAT < SRR19973078.4485948/150‑1 (MQ=60)
CAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATAT < SRR19973078.3434590/150‑1 (MQ=60)
AGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATC < SRR19973078.2945298/150‑1 (MQ=60)
AGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATC < SRR19973078.1827859/150‑1 (MQ=60)
ATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCT < SRR19973078.940885/150‑1 (MQ=60)
ATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCT < SRR19973078.2626510/150‑1 (MQ=60)
ATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCT < SRR19973078.2626654/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTAT > SRR19973078.3873365/1‑150 (MQ=60)
ATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTAT > SRR19973078.636520/1‑150 (MQ=60)
CAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACC < SRR19973078.241066/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT < SRR19973078.1727793/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT > SRR19973078.801856/1‑150 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT < SRR19973078.2214720/150‑1 (MQ=60)
AGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCT > SRR19973078.2476243/1‑150 (MQ=60)
CGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGA < SRR19973078.4797017/150‑1 (MQ=60)
TGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGC > SRR19973078.4377329/1‑150 (MQ=60)
TGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGC > SRR19973078.1961465/1‑150 (MQ=60)
GCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCA > SRR19973078.2396377/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA > SRR19973078.1076444/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA > SRR19973078.1076480/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA > SRR19973078.1076783/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA > SRR19973078.3569167/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAA < SRR19973078.1298521/150‑1 (MQ=60)
ggtaaagtaattaccacgggcgtaatttatttACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAAT < SRR19973078.533401/118‑1 (MQ=60)
GCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATTCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAAT < SRR19973078.533513/150‑1 (MQ=60)
GCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAAT < SRR19973078.1308412/150‑1 (MQ=60)
CTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATC < SRR19973078.2563436/150‑1 (MQ=60)
CTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATC < SRR19973078.2563285/150‑1 (MQ=60)
ATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAT < SRR19973078.1765794/150‑1 (MQ=60)
ATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCAT < SRR19973078.1766892/150‑1 (MQ=60)
TGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATA < SRR19973078.1139671/150‑1 (MQ=60)
GTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAA > SRR19973078.4776830/1‑150 (MQ=60)
TCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAA > SRR19973078.4675768/1‑150 (MQ=60)
CAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAAC < SRR19973078.2095096/150‑1 (MQ=60)
AGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACA < SRR19973078.1661907/150‑1 (MQ=60)
AGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACA < SRR19973078.1661888/150‑1 (MQ=60)
GAACCACGGCTGAAATGAATTAACNAANCATCCGNTGACTGNCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGNAACATATCGATATCCGNNATACCTGAGCCAATCCATAAACAA > SRR19973078.1308628/1‑150 (MQ=60)
GAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAC > SRR19973078.4546925/1‑150 (MQ=60)
GAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAA < SRR19973078.1162304/150‑1 (MQ=60)
AACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAG > SRR19973078.2841037/1‑150 (MQ=60)
CCACGGCTGAAATGTATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGATATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACATGGA < SRR19973078.48340/150‑1 (MQ=60)
CACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAT < SRR19973078.688175/150‑1 (MQ=60)
CACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGAT < SRR19973078.2952653/150‑1 (MQ=60)
ACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATT > SRR19973078.1234157/1‑150 (MQ=60)
ACGGCGGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGGAGTTTATCGTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATT > SRR19973078.2919621/1‑150 (MQ=60)
CGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGATCCAATCCATAAACAAGGATTA > SRR19973078.2032835/1‑150 (MQ=60)
GAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTT < SRR19973078.4197424/150‑1 (MQ=60)
GAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTT > SRR19973078.3602052/1‑150 (MQ=60)
ATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCT < SRR19973078.1098897/150‑1 (MQ=60)
GAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTAT < SRR19973078.913280/150‑1 (MQ=60)
AATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATG < SRR19973078.4341648/150‑1 (MQ=60)
AACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACCTATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTT < SRR19973078.958916/150‑1 (MQ=60)
AACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAA < SRR19973078.3197766/150‑1 (MQ=60)
AACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAA < SRR19973078.750735/150‑1 (MQ=60)
CCATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATA > SRR19973078.4242325/1‑150 (MQ=60)
CATCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAA < SRR19973078.4466055/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGA < SRR19973078.954885/150‑1 (MQ=60)
TCCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGA < SRR19973078.954876/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCAGATATACCTGATCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAAAAAGAC > SRR19973078.1524909/1‑150 (MQ=60)
CGGTGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACG < SRR19973078.1818190/150‑1 (MQ=60)
TGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTG > SRR19973078.1415215/1‑150 (MQ=60)
TGACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATACGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGGTAAAATAAGACGTTG > SRR19973078.4123099/1‑150 (MQ=60)
ACTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTT < SRR19973078.1242880/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTG < SRR19973078.1024959/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTG < SRR19973078.1025756/150‑1 (MQ=60)
CTGGCTGACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTG > SRR19973078.1044932/1‑150 (MQ=60)
CTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCTATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGCACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTATAATAAGACGTTGTTG < SRR19973078.3172392/150‑1 (MQ=60)
ACTATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAACATGT > SRR19973078.1386564/1‑150 (MQ=60)
CGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTTAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > SRR19973078.1823027/1‑150 (MQ=60)
CGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTTAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTA > SRR19973078.1823069/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAG > SRR19973078.1814450/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAG > SRR19973078.1814971/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAG > SRR19973078.1815365/1‑150 (MQ=60)
|
AGGCGCAGCCAGATACGGTTGTGGTTAAGGTTGTCGTTTTGTAGTTCCAGCAATAAACGCCCCTGATCGTCGGCAGAGATATTCAGCGTGGCGCTAATGTCAGAACCACGGCTGAAATGAATTAACCAACCATCCGGTGACTGGCTGACGATGGCGTCGGTAAGCGCAATTTTCTCCTGTAGTTTATCTTTAATGCTGAAATTACCGCGGAACATATCGATATCCGCTATACCTGAGCCAATCCATAAACAAGGATTATCTTTGCTATGGGTTAAAATAAGACGTTGTTGAAAATGTAG > CP009273/4062275‑4062573
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |