Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,665,772 |
G→T |
E123* (GAA→TAA) |
hcaD → |
phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,665,772 | 0 | G | T | 100.0%
| 703.4
/ NA
| 217 | E123* (GAA→TAA) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (92/125); total (92/125) |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
CATCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACA > CP009273/2665625‑2665918
|
tGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgct < 2:2478338/150‑1 (MQ=255)
tGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgct > 1:3057861/1‑150 (MQ=255)
tGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgct < 2:2898711/150‑1 (MQ=255)
gCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctg < 2:2061105/150‑1 (MQ=255)
gCAGTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctg < 2:1559069/150‑1 (MQ=255)
cATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctgc > 1:3593625/1‑150 (MQ=255)
ttCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCtt < 1:1784017/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCttt < 2:535187/150‑1 (MQ=255)
tCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCttt < 2:2804580/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTa < 1:1175501/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCAAAGGGATAACACTGCTTTa > 1:3350741/1‑150 (MQ=255)
cGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTAc > 2:489075/1‑150 (MQ=255)
cGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTAc < 2:1836632/150‑1 (MQ=255)
cGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCACTGCCGTTGCTTTATTCACTGGGATAACGCTGCTTTaa > 1:451028/1‑149 (MQ=255)
cGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCACGACCGCAGCCGTTGCTTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTAc > 1:238334/1‑150 (MQ=255)
tAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCCCTGCCGATGCATGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTAc > 1:267515/1‑150 (MQ=255)
ccATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGcc < 2:1868631/150‑1 (MQ=255)
aTCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCAt < 1:1035844/150‑1 (MQ=255)
aTCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCAt < 1:3388624/150‑1 (MQ=255)
aaaCGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCGTTACCCTACGCCATGCCg > 2:786767/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATTCACTGGGATAACACAGCTTTAACCAACGCCATTCCgg > 1:787493/1‑150 (MQ=255)
cTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGAt < 1:1520352/150‑1 (MQ=255)
tGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCAGCCGTTGCATTATTCACTGGGATAACACTGCATTACCCAACGCCCTGCCAGTGATg > 1:2600602/1‑150 (MQ=255)
ggTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATgcc < 2:1342288/150‑1 (MQ=255)
ggTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATgcc < 2:1434092/150‑1 (MQ=255)
gTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATgccg < 1:612839/150‑1 (MQ=255)
gcgACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCa < 1:3251509/150‑1 (MQ=255)
cacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACt < 2:2558955/150‑1 (MQ=255)
cacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACt < 1:2698702/150‑1 (MQ=255)
acacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTg < 2:1511045/150‑1 (MQ=255)
acacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCAGCTTTACCCTACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACTg > 1:3052618/1‑150 (MQ=255)
cacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGc < 1:3190004/150‑1 (MQ=255)
agagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCgaga < 2:464451/150‑1 (MQ=255)
gTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGt < 2:3440533/150‑1 (MQ=255)
gTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGt < 2:1391179/150‑1 (MQ=255)
ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGtt < 1:2721501/150‑1 (MQ=255)
aGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCt < 2:3003382/150‑1 (MQ=255)
gtgtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTg < 1:627362/150‑1 (MQ=255)
gtgtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTg < 2:736937/150‑1 (MQ=255)
aaCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGcc > 2:2919503/1‑150 (MQ=255)
aCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGccc > 2:3777294/1‑150 (MQ=255)
cAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCCTGCCGGGGATGCCGCCCGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGa > 1:3526102/1‑150 (MQ=255)
aCGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAAc < 2:3654468/150‑1 (MQ=255)
cGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGCCCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACTCTGATTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGATAGAAGTTCTGCAGCCCGAACg < 2:2233192/150‑1 (MQ=255)
cGGCGAAAGCTGGCACTGGGATAAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACg > 2:1619072/1‑150 (MQ=255)
gCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGt > 2:243362/1‑150 (MQ=255)
gAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCAGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCAACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTATGCAGCCCGAACGGTCa > 1:894713/1‑150 (MQ=255)
aGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTc < 2:657679/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCg < 1:489075/150‑1 (MQ=255)
tGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTg < 2:2620506/150‑1 (MQ=255)
ggCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATTCACAAGGATAACACAGCATTACCCAACGCCAAGCCCGTGATGCCACCCAACATCGAGAAGTTCAGCAACCCGAACAGTCAATCGTGa > 1:1098935/1‑150 (MQ=255)
ggCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGa < 1:2707469/150‑1 (MQ=255)
tGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGGTGCTTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTACCCAACGCCCTGCCGGTGATGCCGCCCGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATc > 1:2680729/1‑150 (MQ=255)
tCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGc < 1:2820736/150‑1 (MQ=255)
cAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGcc < 1:2246366/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCgg < 2:1211324/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCgg < 2:3109652/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCgg < 1:2692267/150‑1 (MQ=255)
tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGaa > 2:102806/1‑150 (MQ=255)
tttttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGaa < 2:2685906/150‑1 (MQ=255)
tttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACt < 2:1268778/150‑1 (MQ=255)
ataGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGACCTAtt > 1:3759813/1‑150 (MQ=255)
taGCACCCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTg < 2:3115734/150‑1 (MQ=255)
taGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTg < 2:796854/150‑1 (MQ=255)
taGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTg < 1:1694888/150‑1 (MQ=255)
cAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATTCACAGGGATAAAGCTGCTTTAACCAACACCAAGCCGGTGATTCCGCCACACTGCGAGAAGTTATTCAGCCCGAACAGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACAATTTGTc > 1:2764475/1‑150 (MQ=255)
cAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACAGGGATAAAGCAGCTTTAACCAACCCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATAGGTGCCGGAAAAAATGGTc > 2:1105007/1‑150 (MQ=255)
aaCCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCt < 1:2015714/150‑1 (MQ=255)
aCCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTg < 1:2515079/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGa > 2:1898186/1‑150 (MQ=255)
cGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGa < 1:1676100/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGa > 2:1018125/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGaa > 2:603076/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGaa > 2:2507366/1‑150 (MQ=255)
ggCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGaa > 1:1809742/1‑150 (MQ=255)
ggCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGc > 1:309596/1‑150 (MQ=255)
gCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCTTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATAGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCt < 1:2359567/150‑1 (MQ=255)
gCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCt < 1:2920815/150‑1 (MQ=255)
cTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCa < 1:1912145/150‑1 (MQ=255)
cTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCa < 1:1330239/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCa < 1:2304685/150‑1 (MQ=255)
cGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCa > 2:3378761/1‑150 (MQ=255)
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GCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGG < SRR19973061.2699187/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAA < SRR19973061.1433562/150‑1 (MQ=60)
TTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACT < SRR19973061.1692604/150‑1 (MQ=60)
TTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACT < SRR19973061.2381520/150‑1 (MQ=60)
ATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGACCTATT > SRR19973061.3769426/1‑150 (MQ=60)
TAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTG < SRR19973061.1699144/150‑1 (MQ=60)
TAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTG < SRR19973061.2032257/150‑1 (MQ=60)
CAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATTCACAGGGATAAAGCTGCTTTAACCAACACCAAGCCGGTGATTCCGCCACACTGCGAGAAGTTATTCAGCCCGAACAGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACAATTTGTC > SRR19973061.2771591/1‑150 (MQ=60)
AACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCT < SRR19973061.1557391/150‑1 (MQ=60)
AACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCT < SRR19973061.2020779/150‑1 (MQ=60)
AACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCT < SRR19973061.793265/150‑1 (MQ=60)
AACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGGTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCT < SRR19973061.2018903/150‑1 (MQ=60)
ACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTG < SRR19973061.2521489/150‑1 (MQ=60)
CGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGA < SRR19973061.1680309/150‑1 (MQ=60)
GGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAA > SRR19973061.1814264/1‑150 (MQ=60)
GGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGC > SRR19973061.2455459/1‑150 (MQ=60)
GGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGC > SRR19973061.310409/1‑150 (MQ=60)
GCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATATCGCTGCTTTACCTTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATAGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCT < SRR19973061.2365563/150‑1 (MQ=60)
GCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCT < SRR19973061.2927995/150‑1 (MQ=60)
GCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCT < SRR19973061.2928318/150‑1 (MQ=60)
CTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCA < SRR19973061.1916873/150‑1 (MQ=60)
CTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCA < SRR19973061.1333583/150‑1 (MQ=60)
CGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGC > SRR19973061.2637566/1‑150 (MQ=60)
GACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCG > SRR19973061.2980729/1‑150 (MQ=60)
CGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCA < SRR19973061.2310528/150‑1 (MQ=60)
CTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACG > SRR19973061.3043622/1‑150 (MQ=60)
CTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACG < SRR19973061.1237411/150‑1 (MQ=60)
GCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCA > SRR19973061.3078408/1‑150 (MQ=60)
CGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGC > SRR19973061.3746823/1‑150 (MQ=60)
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GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG < SRR19973061.2644537/150‑1 (MQ=60)
GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG > SRR19973061.2710020/1‑150 (MQ=60)
TTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGAT > SRR19973061.281413/1‑150 (MQ=60)
TTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGAT < SRR19973061.1372762/150‑1 (MQ=60)
TGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGTTTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATG < SRR19973061.3048215/150‑1 (MQ=60)
GATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGT < SRR19973061.298346/150‑1 (MQ=60)
GCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAG > SRR19973061.3575960/1‑150 (MQ=60)
TAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTG < SRR19973061.2927000/150‑1 (MQ=60)
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TCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAGTG > CP009273/2665627‑2665921
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |