Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,665,772 |
G→T |
86.0% |
E123* (GAA→TAA) |
hcaD → |
phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,665,772 | 0 | G | T | 86.0%
| 498.0
/ 67.7
| 223 | E123* (GAA→TAA) | hcaD | phenylpropionate dioxygenase, ferredoxin reductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (21/12); new base T (91/98); total (113/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 226 total aligned reads displayed.
CATCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAG > CP009273/2665625‑2665919
|
cATCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCGCTGCCGGTGCGTGATTCACTGGgaga > 2:1640925/1‑149 (MQ=255)
aTCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATaa < 1:2710664/149‑1 (MQ=255)
tCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGCGCTCGCCCCCGGCCCGGGCGGGATGCACGGGGGGAAc > 1:2098806/1‑149 (MQ=255)
tGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgc < 2:1422991/149‑1 (MQ=255)
aTTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACgctgc < 2:888098/149‑1 (MQ=255)
aTTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCCCAGCCCTTGCTTGTTGCACAGGGAGAAcccagc > 1:3924290/1‑144 (MQ=255)
ccGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCttt < 1:4099099/149‑1 (MQ=255)
ggTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTAc < 2:1040258/149‑1 (MQ=255)
gtgtAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTAcc < 2:34288/149‑1 (MQ=255)
aaCCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTAc < 1:3801416/149‑1 (MQ=255)
aaCCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTAc > 2:3539121/1‑149 (MQ=255)
ccATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCACCACCCCCGCCCGTGCTTGCTGCACAGGGATAACCCGGCGTTAaccaaacc > 1:4534321/1‑144 (MQ=255)
aTCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCGTGATGCACTGGGATAACGCTGCGTTAACCTACGCCa > 2:621778/1‑149 (MQ=255)
tCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCAt < 1:163226/149‑1 (MQ=255)
aaaCGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCAAGcc > 2:377413/1‑149 (MQ=255)
aCGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCCCTGCCGGTGGGTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCAACGCCCTGCCgg > 2:3719229/1‑149 (MQ=255)
gCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTg < 1:1518129/149‑1 (MQ=255)
gCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCGACGCCATGCCGGTg > 2:3577972/1‑149 (MQ=255)
acacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGa < 1:4573334/149‑1 (MQ=255)
acacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCAACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGa > 2:915884/1‑149 (MQ=255)
acacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCCTTGCTTGATGCACGGGGAGAAAGCTGCTTTTCACTACGCCCTGCCGGTGATGCCGCCaca > 2:915837/1‑147 (MQ=255)
acacacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGAGACCGCTGCCGTTGGGTGTTGGACAGGGCTAAAGCTGCTTTAACCGACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGa > 2:3675000/1‑149 (MQ=255)
cacacGAGAGATAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGAc < 2:2373243/149‑1 (MQ=255)
acacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCGTGATGCACTGGGATAACGCGGCTTTACCCTACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACt > 2:708431/1‑149 (MQ=255)
cacGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCGTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTg > 2:2712080/1‑149 (MQ=255)
cGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTTCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTAACCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCg > 2:4324530/1‑149 (MQ=255)
agagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCAGCCGTTGCGTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCCCACAGCgag > 2:4513061/1‑149 (MQ=255)
agagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGAACGCGGCCGTTGGTTGATTCAATGGGATAACGCAGCTTTACCCAAAGCCAATCCGGTGATGCCGCCACACAGCgag > 1:3089769/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGCGCGCGACCCCGGCCGGTGGGTGTTTGACACGGGTAAAGCTGCGTTACCCCAACCCCAGCCCGTGATGCCCCCACACAGCgaga > 1:3633968/1‑149 (MQ=255)
gTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAAAGCTGGGTTACCCTACGCCCTGCCGGTGATGCCGCCCGACAGCGAGAAg > 2:4257877/1‑149 (MQ=255)
ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGGAGCGCGACCCCTTCCCTTGGTTTTTGGACTGGGATAACGCTGCGTTTCCCCAAGCCATGCCGGTGATGCCCGCCGAATGCgaggatt > 1:2557772/1‑145 (MQ=255)
ttAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGt < 2:1271715/149‑1 (MQ=255)
tAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGtt < 2:3951291/149‑1 (MQ=255)
aGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTc < 2:3138375/149‑1 (MQ=255)
aGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTc < 2:3054320/149‑1 (MQ=255)
gtgtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCTCTCGACCCCTGCCGTTGCGTGATTCACGGGGGGAACGCAGCTTTTACCAACGCCCAGCCGGGGATGCCGCCAGACAGCGAGACGTTCt > 2:2046493/1‑149 (MQ=255)
gtgtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCt < 1:3745197/149‑1 (MQ=255)
tgtTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATTACGCTGCTTTAACCTAAGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTg > 2:2916803/1‑149 (MQ=255)
ttAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCa < 1:625664/149‑1 (MQ=255)
tAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTGTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGTCCGCGGCCGGTGCGGGTTGCCCAGGGCGAACGCGGCTGTAACCAACGCCAAGCCGGTGCTGCCGCCCGACAGCGAGAACTTCTGGAg > 2:3226304/1‑149 (MQ=255)
aaCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCGCTCGACCGCAGCCCTTGCTTGATGGACAGGGATAACGCTGCTTTAACCCAAGCCAAGCCCGTGATGCCGCCAGACAGCGACAAATTCAGCacc > 2:1663885/1‑147 (MQ=255)
aaCCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGc < 2:145903/149‑1 (MQ=255)
ccAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGccc < 1:2392085/149‑1 (MQ=255)
aCGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGaa < 2:1986102/149‑1 (MQ=255)
cGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAAc < 1:1417027/149‑1 (MQ=255)
cGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAAc < 2:3347518/149‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGt < 2:3219370/149‑1 (MQ=255)
cGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGt < 1:4312381/149‑1 (MQ=255)
gAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCCGCTCGACCGCGGCCGGTGGTTGTTTGACAGGGGTTACGCGGCGTTTACCGACGCCCAGCCGGGGGTGCCGCCCGCCAGCCCGGAGTTGAGCAGCCCGCACGGtg > 1:2998091/1‑148 (MQ=255)
tGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCCTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCAACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGt > 2:310688/1‑149 (MQ=255)
aCTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGTTGCACAGGGATAAAGCTGCGTTAACCAACCCCAAGCCGGTGATGCCCCCACACAGCGAGAAGTTATTCAGCCCCAACGGTCAGGCGGGAtt > 1:3157815/1‑149 (MQ=255)
tGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCCACCGCTGCCGTTTCTTGATGCACTGGGATAACGCAGCGTTAACCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCCGCCCGAACGGTCAGTCGGGATTAt > 2:4678143/1‑149 (MQ=255)
gggATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATc < 1:4480929/149‑1 (MQ=255)
gggATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCCTTGCTTGATGCACAGGGATAACGCAGCTTTACCCAACGCCCTGCCGGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCCGTCGGGATTATc > 2:1135666/1‑149 (MQ=255)
ggATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCTAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCg < 1:644803/149‑1 (MQ=255)
ggATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTAACCTACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTATGCAGCCCCAAACGTCAGTCGTGATTAtag > 2:2292534/1‑147 (MQ=255)
ggATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCAGCCGTTTCTTGATGCACAGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATTCCGCCAGACAGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCg > 2:1203204/1‑149 (MQ=255)
gATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCgg < 1:1882681/149‑1 (MQ=255)
aTCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCGCGACCGCTGCCCGTGCGTGATTCACAGGGAGAACGCAGCGTTACCCTACGCCAAGCCCGTGATGCCGCCAGACAGCGAGAAGTTATGCAGCCCCAACGGTCAGTCGGGATTATCGGt > 2:4589106/1‑149 (MQ=255)
aGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGTCCGCTGCCGTTTCTTGATTCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTATGCAGCCCCAACGGTCAGTCGTGATTATAGGTGcc > 2:2522200/1‑149 (MQ=255)
aGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCCTTGCTTGATTCCCTGGGATAACGCGGCGTTACCCTACGCCATGCCCGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGGCAGTCGGGATTAACGGTGcc > 2:711985/1‑149 (MQ=255)
gCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCCCTGCCGTTTCTTGATGCACTGGGGTAACGCTGCTTTTACCAACGCCCAGCCGGTGATTCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATAGGTGCCg > 2:4083473/1‑149 (MQ=255)
tttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAAc < 2:2784638/149‑1 (MQ=255)
ttATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACt < 2:2641235/149‑1 (MQ=255)
ataGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTAt < 1:1654692/149‑1 (MQ=255)
taGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTTATGCACTGGGATAAAGCTGCTTTACCCAACGCCAAGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTAtt > 2:309221/1‑149 (MQ=255)
taGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTAtt < 1:3257098/149‑1 (MQ=255)
gCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTGACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTgg < 2:2835554/149‑1 (MQ=255)
ccGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTg < 1:232797/149‑1 (MQ=255)
gcgcGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGaa < 2:3157815/149‑1 (MQ=255)
gcgcGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGaa < 2:3698243/149‑1 (MQ=255)
cgcgGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAAc < 1:2827317/149‑1 (MQ=255)
gcgGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACt > 1:3934289/1‑149 (MQ=255)
ggCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTgg > 1:106160/1‑149 (MQ=255)
gCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGc > 1:3922616/1‑149 (MQ=255)
gCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGc > 1:1535047/1‑149 (MQ=255)
cTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGcc < 1:4434954/149‑1 (MQ=255)
tCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCa < 1:277778/149‑1 (MQ=255)
tCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCa > 2:1699384/1‑149 (MQ=255)
gACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAgc < 2:2505737/149‑1 (MQ=255)
aCCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAgcg > 1:3940008/1‑149 (MQ=255)
gCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCAcgc > 1:898847/1‑149 (MQ=255)
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AGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCAACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACGGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGC > SRR19973071.1540363/1‑150 (MQ=60)
CTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCA < SRR19973071.4450611/150‑1 (MQ=60)
CTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCA < SRR19973071.4450652/150‑1 (MQ=60)
TCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAG < SRR19973071.278761/150‑1 (MQ=60)
TCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAG < SRR19973071.278797/150‑1 (MQ=60)
CGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGC > SRR19973071.4487411/1‑150 (MQ=60)
GACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCG > SRR19973071.3953861/1‑150 (MQ=60)
CCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCC > SRR19973071.3549765/1‑150 (MQ=60)
CCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCC > SRR19973071.1154014/1‑150 (MQ=60)
TGCCGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGC > SRR19973071.902102/1‑150 (MQ=60)
CGTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGC > SRR19973071.343683/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGACGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG > SRR19973071.877392/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG < SRR19973071.1396294/150‑1 (MQ=60)
GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG > SRR19973071.877281/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCG < SRR19973071.1396314/150‑1 (MQ=60)
TGCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCA < SRR19973071.1517931/150‑1 (MQ=60)
TGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCA > SRR19973071.4604918/1‑150 (MQ=60)
GCTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAG > SRR19973071.3657465/1‑150 (MQ=60)
CTTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGA > SRR19973071.3927327/1‑150 (MQ=60)
TTGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGAT < SRR19973071.4150486/150‑1 (MQ=60)
TGATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATG > SRR19973071.1478527/1‑150 (MQ=60)
ATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTA < SRR19973071.1933585/150‑1 (MQ=60)
ATGCACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTA < SRR19973071.1933527/150‑1 (MQ=60)
CACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGG > SRR19973071.481485/1‑150 (MQ=60)
CACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGG < SRR19973071.793117/150‑1 (MQ=60)
CACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGG < SRR19973071.793137/150‑1 (MQ=60)
CACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGG > SRR19973071.265669/1‑150 (MQ=60)
CACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGG > SRR19973071.324621/1‑150 (MQ=60)
ACTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGT > SRR19973071.4773147/1‑150 (MQ=60)
CTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTG < SRR19973071.21397/150‑1 (MQ=60)
CTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTG < SRR19973071.1845179/150‑1 (MQ=60)
CTGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTG < SRR19973071.21403/150‑1 (MQ=60)
TGGGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGA > SRR19973071.532870/1‑150 (MQ=60)
GGATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACA > SRR19973071.3246586/1‑150 (MQ=60)
GATAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAG < SRR19973071.4599995/150‑1 (MQ=60)
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TTCATCTGCATTCCGGTGTAACCATCAAAACGCTGGGTCGCGACACACGAGAGTTAGTGTTAACCAACGGCGAAAGCTGGCACTGGGATCAGCTTTTTATAGCAACCGGCGCGGCAGCTCGACCGCTGCCGTTGCTTGATGCACTGGGAGAACGCTGCTTTACCCTACGCCATGCCGGTGATGCCGCCAGACTGCGAGAAGTTCTGCAGCCCGAACGGTCAGTCGTGATTATCGGTGCCGGAACTATTGGTCTGGAACTGGCTGCCAGCGCCACGCAGCGCAGATGTAAGGTGACAG > CP009273/2665623‑2665919
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |