Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,009,187 |
G→T |
100% |
intergenic (+90/‑232) |
mocA → / → ygfK |
CTP:molybdopterin cytidylyltransferase/putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,009,187 | 0 | G | T | 98.8%
| 803.7
/ 0.2
| 248 | intergenic (+90/‑232) | mocA/ygfK | CTP:molybdopterin cytidylyltransferase/putative Fe‑S subunit oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/2); new base T (120/125); total (121/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
ATATTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGAGAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTCCCGCCAAACCTGGCAAGAGT > CP009273/3009042‑3009331
|
atTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTNCGTTCAAGTATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTgagaaaagataaaa > 1:1786190/1‑148 (MQ=255)
atTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTgagaaaagataaaa > 2:565147/1‑148 (MQ=255)
atTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTgagaaaagataaaa > 2:3070888/1‑148 (MQ=255)
atTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTgagaaaagataaaa > 2:2099015/1‑148 (MQ=255)
ttGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATaaaaa < 2:2220754/148‑1 (MQ=255)
tGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAAt < 1:458705/148‑1 (MQ=255)
aTACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTg > 2:216009/1‑148 (MQ=255)
tACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGa > 2:1186999/1‑148 (MQ=255)
tACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGa < 1:2155993/148‑1 (MQ=255)
cTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATa < 2:388727/148‑1 (MQ=255)
cTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATa > 2:150921/1‑148 (MQ=255)
ccGGACGACTTTAGTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATaaa < 1:1290527/148‑1 (MQ=255)
gacgacTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATgg > 2:2746629/1‑148 (MQ=255)
acgacTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATggg < 1:1380328/148‑1 (MQ=255)
acTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTg > 2:1904941/1‑148 (MQ=255)
cTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATTGGCTgg > 2:2855704/1‑148 (MQ=255)
cTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTgg > 2:2940492/1‑148 (MQ=255)
cTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTgg > 2:608279/1‑148 (MQ=255)
ttattaCAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCAATGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCa > 2:852969/1‑148 (MQ=255)
taCAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCaataa > 2:1054889/1‑148 (MQ=255)
taCAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCaataa > 1:686179/1‑148 (MQ=255)
taCAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCaataa > 1:1118600/1‑148 (MQ=255)
gCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCaataataat < 2:3277432/148‑1 (MQ=255)
cGAAGGAAAGTTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtt < 2:2993462/148‑1 (MQ=255)
cGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtt < 1:724593/148‑1 (MQ=255)
cGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtt < 2:1103033/148‑1 (MQ=255)
cGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtt < 1:3003975/148‑1 (MQ=255)
aaGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtttt > 1:3401973/1‑148 (MQ=255)
aaGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGAGTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAAtttt < 2:2310687/148‑1 (MQ=255)
aGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGAGAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTc < 2:2435380/148‑1 (MQ=255)
ggAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCa > 2:1544053/1‑148 (MQ=255)
aaGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGa < 2:1877412/148‑1 (MQ=255)
aGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAg < 1:1595559/148‑1 (MQ=255)
ggTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGt < 1:105869/148‑1 (MQ=255)
tataCTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGTGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGa > 2:3503235/1‑148 (MQ=255)
tataCTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGa > 1:3210438/1‑148 (MQ=255)
tGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTa > 1:987986/1‑148 (MQ=255)
gAAATTTAGAACACGTAGTTAAACGAGTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTaa < 1:2075025/148‑1 (MQ=255)
gAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTaa > 2:3174458/1‑148 (MQ=255)
tAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCa < 2:2028756/148‑1 (MQ=255)
gAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCAtt > 2:1975544/1‑148 (MQ=255)
gAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCAtt > 2:2044658/1‑148 (MQ=255)
aaaaCGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCAttt > 2:3243811/1‑148 (MQ=255)
aaaCGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTa > 1:2218055/1‑148 (MQ=255)
aaaCGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTa < 1:1055799/148‑1 (MQ=255)
aaCGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAg > 1:1599836/1‑148 (MQ=255)
aaCGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAg > 2:2914017/1‑148 (MQ=255)
cGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCa < 2:3380673/148‑1 (MQ=255)
gTAGTTAAACCATTGCGATCAAATATATAATCCTTCCGGCAAACATTATCATCATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAACATTGATACATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCAc < 1:1919502/148‑1 (MQ=255)
aGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCt > 1:3470163/1‑148 (MQ=255)
gTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCtg < 1:2550706/148‑1 (MQ=255)
ttAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCtgt > 1:2672069/1‑148 (MQ=255)
ttAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCtgt > 2:1678952/1‑148 (MQ=255)
aaCGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAg < 1:2434920/148‑1 (MQ=255)
aCGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGt < 2:1146343/148‑1 (MQ=255)
aCGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGt < 1:2561165/148‑1 (MQ=255)
cGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGtt > 2:1765356/1‑148 (MQ=255)
aTTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTAATTATCATAATGATAAGGTATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAATTTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCATGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCTCGTTTGAGttca < 2:1720325/148‑1 (MQ=255)
tttAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGccc < 2:713362/148‑1 (MQ=255)
tttAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGccc < 1:544744/148‑1 (MQ=255)
aTCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTaa < 1:184804/148‑1 (MQ=255)
aTCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTaa > 1:3272829/1‑148 (MQ=255)
ttCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGttt < 2:1276949/148‑1 (MQ=255)
ttCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGttt < 1:3356347/148‑1 (MQ=255)
cTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAgccgc < 1:1937898/148‑1 (MQ=255)
tCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAgccgcc < 2:2533554/148‑1 (MQ=255)
cATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCt > 2:3446624/1‑148 (MQ=255)
tCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACAt < 1:1904941/148‑1 (MQ=255)
tCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACAt > 1:1186682/1‑148 (MQ=255)
cATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACAtt > 1:203348/1‑148 (MQ=255)
tGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACAttttttt > 2:963176/1‑148 (MQ=255)
gATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTta > 1:342786/1‑148 (MQ=255)
aTAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtat > 1:3260313/1‑148 (MQ=255)
tAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATTAATGGGCTGGCAATTATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtata < 1:2099015/148‑1 (MQ=255)
tAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtata > 2:1675439/1‑148 (MQ=255)
tAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtata < 2:686179/148‑1 (MQ=255)
tAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtata < 2:3323026/148‑1 (MQ=255)
tAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTAAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTtata > 2:3043315/1‑148 (MQ=255)
aGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATAtt > 2:3301503/1‑148 (MQ=255)
ggAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATAttt < 2:75149/148‑1 (MQ=255)
ggAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATAttt < 2:1851977/148‑1 (MQ=255)
ggAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATAttt < 1:3512122/148‑1 (MQ=255)
gAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTc < 1:2299440/148‑1 (MQ=255)
gAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTc > 1:848190/1‑148 (MQ=255)
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GTAGTTAAACCATTGCGATCAAATATATAATCCTTCCGGCAAACATTATCATCATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAACATTGATACATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCT < SRR19973065.1932090/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGT > SRR19973065.1644764/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGT > SRR19973065.1644024/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGT > SRR19973065.2688626/1‑150 (MQ=60)
GTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTG < SRR19973065.2566672/150‑1 (MQ=60)
AACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTT < SRR19973065.2450274/150‑1 (MQ=60)
ACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTC < SRR19973065.2577177/150‑1 (MQ=60)
CGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCA > SRR19973065.2586180/1‑150 (MQ=60)
CGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCA < SRR19973065.490679/150‑1 (MQ=60)
AAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATCAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCTGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACACAAAG > SRR19973065.2507558/1‑150 (MQ=60)
ATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCC < SRR19973065.1865485/150‑1 (MQ=60)
ATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCC < SRR19973065.1865712/150‑1 (MQ=60)
TATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCC < SRR19973065.1145309/150‑1 (MQ=60)
TTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTT > SRR19973065.1327174/1‑150 (MQ=60)
TTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTT < SRR19973065.548268/150‑1 (MQ=60)
TAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCACTAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAA > SRR19973065.3292691/1‑150 (MQ=60)
TAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAA > SRR19973065.3292586/1‑150 (MQ=60)
AATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAG < SRR19973065.1933677/150‑1 (MQ=60)
ATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGT < SRR19973065.186258/150‑1 (MQ=60)
CCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTT < SRR19973065.982816/150‑1 (MQ=60)
CTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTC > SRR19973065.3445160/1‑150 (MQ=60)
TTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCG < SRR19973065.3376866/150‑1 (MQ=60)
CGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGC < SRR19973065.217632/150‑1 (MQ=60)
CTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCT < SRR19973065.1950580/150‑1 (MQ=60)
TCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTC > SRR19973065.2567603/1‑150 (MQ=60)
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ATAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTCCCGCCAAACCTGGCAAGAGTGGTG < SRR19973065.858487/150‑1 (MQ=60)
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TTAGATATTGATACTCCGGACGACTTTATTACAGCGAAGGAAAGGTATACTGAAATTTAGAAAACGTAGTTAAACGATTGCGTTCAAATATTTAATCCTTCCGGCACTCATTATCATAATGATAAGGAATCACTGATTTTGAGAAAAGAGAAAAATTGATAAATGGGCTGGCAATAATAATTTTCAGGAGTGATTTTAATTCTCATTTAGCACCTGTGAGTTCATTCACAAAAAGCCCTTAAGTTTCGAGCCGCCTCACATTTTTTTATATTTCCCGCCAAACCTGGCAAGAGTGGTG > CP009273/3009038‑3009335
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |