Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
647,422 |
G→T |
100% |
intergenic (‑110/‑269) |
citC ← / → citA |
[citrate [pro‑3S]‑lyase] ligase/sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CitB |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 647,422 | 0 | G | T | 99.3%
| 1032.6
/ ‑2.3
| 321 | intergenic (‑110/‑269) | citC/citA | [citrate [pro‑3S]‑lyase] ligase/sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CitB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/0); new base T (167/151); total (170/151) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.50e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
ACGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTTTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCA > CP009273/647277‑647564
|
aCGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGt < 2:552059/148‑1 (MQ=255)
gTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGtat < 1:2169256/148‑1 (MQ=255)
ttttACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAATGGGGTGATCGATGtata < 1:675139/148‑1 (MQ=255)
ttACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATc > 2:1319556/1‑148 (MQ=255)
aCGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCtt < 1:1036385/148‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCttt < 2:839382/148‑1 (MQ=255)
cgcgGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCttt < 2:1684456/148‑1 (MQ=255)
gTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTtctc < 2:3436530/148‑1 (MQ=255)
gTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTtctc > 2:3080079/1‑148 (MQ=255)
tGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTcc < 2:1165279/148‑1 (MQ=255)
tGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTcc < 2:1547303/148‑1 (MQ=255)
gAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCt < 1:440286/148‑1 (MQ=255)
gAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCt > 1:3627942/1‑148 (MQ=255)
aaaaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCtt < 1:2051854/148‑1 (MQ=255)
aaaaTATCATTGCAGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCtt < 2:324432/148‑1 (MQ=255)
aaaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCttt > 1:2694010/1‑148 (MQ=255)
aaaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCttt > 2:3007093/1‑148 (MQ=255)
aaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTc > 1:2823113/1‑148 (MQ=255)
aaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCATTTc > 1:2759790/1‑148 (MQ=255)
atatCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCg > 2:3401671/1‑148 (MQ=255)
atCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCt > 2:3635509/1‑148 (MQ=255)
atCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACGTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCt > 2:1740234/1‑148 (MQ=255)
cATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCtat > 1:3607851/1‑148 (MQ=255)
tGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACa > 2:3278911/1‑148 (MQ=255)
gCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACAt > 1:3126852/1‑148 (MQ=255)
gAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCt > 2:2811354/1‑148 (MQ=255)
ataataAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAgg < 1:1907320/148‑1 (MQ=255)
ataaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGt < 2:3359355/148‑1 (MQ=255)
ataaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGt < 2:3163603/148‑1 (MQ=255)
taaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATAAATACTAAGGAGTa > 2:2889075/1‑148 (MQ=255)
aaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAt > 2:2485240/1‑148 (MQ=255)
aaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAt > 1:1728734/1‑148 (MQ=255)
aataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAtt < 2:1487400/148‑1 (MQ=255)
ataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAttt < 2:3239951/148‑1 (MQ=255)
tGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGaa > 2:3543122/1‑148 (MQ=255)
gAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGaaa > 1:3279687/1‑148 (MQ=255)
ggTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAttt < 1:1579909/148‑1 (MQ=255)
gTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAtttt < 1:1487935/148‑1 (MQ=255)
tGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTg > 1:1941628/1‑148 (MQ=255)
tGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTg < 2:3767677/148‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGa < 1:3422935/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGatt > 2:1868962/1‑148 (MQ=255)
aTGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGatt < 1:1677010/148‑1 (MQ=255)
gttATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGatttattt < 1:963244/148‑1 (MQ=255)
tCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTcaca < 2:667870/148‑1 (MQ=255)
tCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTcaca > 2:2597655/1‑148 (MQ=255)
cGATTTGCACCGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACAt < 1:2818096/148‑1 (MQ=255)
cGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACAt > 1:210050/1‑148 (MQ=255)
aTTTTCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATag < 2:3699324/148‑1 (MQ=255)
aTTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATag > 1:982121/1‑148 (MQ=255)
ttGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATagag > 1:76837/1‑148 (MQ=255)
ttGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATagag > 1:398563/1‑148 (MQ=255)
cAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTa > 2:382692/1‑148 (MQ=255)
aCGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGt > 1:3502115/1‑148 (MQ=255)
aCGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGt > 1:1605337/1‑148 (MQ=255)
aCGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGt > 1:481082/1‑148 (MQ=255)
gAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTgg > 1:2926498/1‑148 (MQ=255)
aTGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGtt < 2:3502464/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGtt < 1:177760/148‑1 (MQ=255)
tCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatt < 2:503827/148‑1 (MQ=255)
tCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatt < 2:504456/148‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctattta < 1:2458284/148‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctattta < 1:149821/148‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctattta < 2:472308/148‑1 (MQ=255)
aTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttat < 2:1167531/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttatt > 2:922596/1‑148 (MQ=255)
tGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttatt < 1:1958091/148‑1 (MQ=255)
ttGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttattta < 2:610245/148‑1 (MQ=255)
tGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTaa < 2:3009989/148‑1 (MQ=255)
aaCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAt > 1:1455517/1‑148 (MQ=255)
aCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAtt < 2:1595953/148‑1 (MQ=255)
gATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTa > 2:2121132/1‑148 (MQ=255)
gATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTa > 2:192070/1‑148 (MQ=255)
gATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTa < 1:3290800/148‑1 (MQ=255)
tAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAg < 2:961146/148‑1 (MQ=255)
tttATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGtttttt > 2:2236015/1‑148 (MQ=255)
tttATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGtttttt > 1:939615/1‑148 (MQ=255)
tATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTttaa < 1:1868962/148‑1 (MQ=255)
tttCACTTGGGATAAAGGGGGTGATCGATTTATATCTTTTTCTCCTTTCTCTATACATCATAATGAGTATTTCGGCGTGAAAGTTTGATATATATCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTAAATGATTTTAACTTTTttaatta > 2:2698565/1‑148 (MQ=255)
tttCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTttaatta < 2:1232224/148‑1 (MQ=255)
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ttCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTttaattaa < 1:227313/148‑1 (MQ=255)
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ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTA > SRR19973069.1023473/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTA < SRR19973069.1688695/150‑1 (MQ=60)
ATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTA < SRR19973069.1689221/150‑1 (MQ=60)
GTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGTTAAACTTTTATTTTCACTTGTTAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCA < SRR19973069.970520/150‑1 (MQ=60)
GTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCA < SRR19973069.969674/150‑1 (MQ=60)
TTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGACATTTTGATTTATTTCAC > SRR19973069.387943/1‑150 (MQ=60)
TTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCAC > SRR19973069.387955/1‑150 (MQ=60)
TATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACA > SRR19973069.794389/1‑150 (MQ=60)
ATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACAT > SRR19973069.511862/1‑150 (MQ=60)
ATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACAT > SRR19973069.3294106/1‑150 (MQ=60)
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ATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACAT > SRR19973069.1378313/1‑150 (MQ=60)
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CGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAG < SRR19973069.2837023/150‑1 (MQ=60)
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ATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAG < SRR19973069.3020226/150‑1 (MQ=60)
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TTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTT < SRR19973069.2109054/150‑1 (MQ=60)
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CAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGT > SRR19973069.2587887/1‑150 (MQ=60)
AACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTG > SRR19973069.742496/1‑150 (MQ=60)
ACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGG > SRR19973069.2945896/1‑150 (MQ=60)
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CGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGT < SRR19973069.2511920/150‑1 (MQ=60)
GAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTT > SRR19973069.1795159/1‑150 (MQ=60)
ATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTT < SRR19973069.179254/150‑1 (MQ=60)
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TGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTA > SRR19973069.977723/1‑150 (MQ=60)
GTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATT < SRR19973069.704603/150‑1 (MQ=60)
CAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTAT > SRR19973069.2839827/1‑150 (MQ=60)
CAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTAT > SRR19973069.1629510/1‑150 (MQ=60)
CAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTAT > SRR19973069.3575889/1‑150 (MQ=60)
AATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATT < SRR19973069.2474802/150‑1 (MQ=60)
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GGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTAC < SRR19973069.2741507/150‑1 (MQ=60)
AGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAA > SRR19973069.969316/1‑150 (MQ=60)
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TGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCA > SRR19973069.1018914/1‑150 (MQ=60)
GATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAG < SRR19973069.48042/150‑1 (MQ=60)
CGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTT > SRR19973069.2822703/1‑150 (MQ=60)
GATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTTT < SRR19973069.3774387/150‑1 (MQ=60)
TGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTTTAA > SRR19973069.867248/1‑150 (MQ=60)
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TGAACGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTTTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTTTAA > CP009273/647274‑647571
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
