Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
647,422 |
G→T |
100% |
intergenic (‑110/‑269) |
citC ← / → citA |
[citrate [pro‑3S]‑lyase] ligase/sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CitB |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 647,422 | 0 | G | T | 100.0%
| 696.8
/ NA
| 211 | intergenic (‑110/‑269) | citC/citA | [citrate [pro‑3S]‑lyase] ligase/sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with CitB |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (106/105); total (106/105) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 211 total aligned reads displayed.
ACGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTTTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGT > CP009273/647277‑647567
|
aCGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGta > 1:3534795/1‑149 (MQ=255)
aCGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGta > 2:3470172/1‑149 (MQ=255)
gTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGtata > 2:907754/1‑149 (MQ=255)
gTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGtata < 2:1926074/149‑1 (MQ=255)
ttttACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTatat < 1:444276/149‑1 (MQ=255)
ttttACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTatat < 1:311758/149‑1 (MQ=255)
ttttACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTatat > 1:1970996/1‑149 (MQ=255)
ggTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGTAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTtctc < 1:2695646/149‑1 (MQ=255)
tGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCt < 2:3067436/149‑1 (MQ=255)
gAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCtt < 2:1718958/149‑1 (MQ=255)
aaaTATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTc < 2:2217963/149‑1 (MQ=255)
tatCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCt < 1:3755334/149‑1 (MQ=255)
tCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCtat > 1:2187262/1‑149 (MQ=255)
tCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCtat > 2:3883398/1‑149 (MQ=255)
cATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCtata > 1:2212159/1‑149 (MQ=255)
tGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACAt < 2:178567/149‑1 (MQ=255)
cGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCt > 1:1605378/1‑149 (MQ=255)
gAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTa > 2:2541382/1‑149 (MQ=255)
aaCATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATATCCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTaa < 2:2733879/149‑1 (MQ=255)
aaCATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTaa < 2:1623027/149‑1 (MQ=255)
aCATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAg > 1:956201/1‑149 (MQ=255)
aCATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAg > 1:1446805/1‑149 (MQ=255)
cATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAgg > 2:2685518/1‑149 (MQ=255)
cATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAgg > 2:4109039/1‑149 (MQ=255)
taataaATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAg < 2:3819066/149‑1 (MQ=255)
taataaATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAg > 1:756394/1‑149 (MQ=255)
aataaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGt < 2:691323/149‑1 (MQ=255)
aataaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTATCCTTTCGCTATACATCATAAGGAGt > 1:2561619/1‑149 (MQ=255)
taaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAt < 1:3488300/149‑1 (MQ=255)
aaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAtt > 1:1438348/1‑149 (MQ=255)
aaataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAtt < 2:3408575/149‑1 (MQ=255)
aataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAttt < 1:3708956/149‑1 (MQ=255)
ataGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTc < 2:752959/149‑1 (MQ=255)
taGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCg > 2:1650758/1‑149 (MQ=255)
tATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCg > 2:1820460/1‑149 (MQ=255)
tCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAACGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTAGTTCGGCGTg > 1:3599414/1‑149 (MQ=255)
cTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGaa > 1:1071024/1‑149 (MQ=255)
cTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGaa < 1:2152975/149‑1 (MQ=255)
gAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAt < 1:890249/149‑1 (MQ=255)
aGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAttt > 2:3929399/1‑149 (MQ=255)
aGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAttt > 1:285722/1‑149 (MQ=255)
aGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAttt < 1:757609/149‑1 (MQ=255)
ggTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAAtttt > 2:2992319/1‑149 (MQ=255)
gTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTg > 1:2165299/1‑149 (MQ=255)
aTGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACGTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGattt > 2:2405499/1‑149 (MQ=255)
tgttgtTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGTAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGattta > 1:3357091/1‑149 (MQ=255)
tgttATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGatttattt < 2:2191835/149‑1 (MQ=255)
gttATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTc > 1:1384019/1‑149 (MQ=255)
ttATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTca < 2:861809/149‑1 (MQ=255)
aTCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTcaca < 1:3153170/149‑1 (MQ=255)
aTCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTcaca > 2:416260/1‑149 (MQ=255)
aTCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTcaca < 1:630973/149‑1 (MQ=255)
gATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATag > 1:3825615/1‑149 (MQ=255)
aTTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATaga > 2:625232/1‑149 (MQ=255)
gCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTa > 2:1403773/1‑149 (MQ=255)
aaCGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGt > 1:1802381/1‑149 (MQ=255)
cggaTGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTgg < 1:3679421/146‑1 (MQ=255)
cGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTgg < 1:678424/149‑1 (MQ=255)
gAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGt < 1:3106433/149‑1 (MQ=255)
aaTGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGtt < 2:3106196/149‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGttt > 2:3314428/1‑149 (MQ=255)
ttCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatt < 2:2480198/149‑1 (MQ=255)
cAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctattta < 1:2917381/149‑1 (MQ=255)
aTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttatt < 2:290799/149‑1 (MQ=255)
aTGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttatt > 1:812289/1‑149 (MQ=255)
tGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTAGGCGTGAAATTTTTATTTATTTAAAATATATTTATTTGTTTtatatatatta > 2:460297/1‑148 (MQ=255)
ttGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTaa < 1:3496474/149‑1 (MQ=255)
gCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATg < 2:3808021/149‑1 (MQ=255)
aaaCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAt > 1:514890/1‑149 (MQ=255)
aaaCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAt < 2:281193/149‑1 (MQ=255)
aaCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAtt > 2:319424/1‑149 (MQ=255)
aCTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAttt < 2:1267298/149‑1 (MQ=255)
aTAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAg > 1:1903825/1‑149 (MQ=255)
aTAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAg > 1:529953/1‑149 (MQ=255)
tAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGt < 2:1543726/149‑1 (MQ=255)
aaCCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGtt < 2:275134/149‑1 (MQ=255)
tttATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTtctatttat < 2:2604800/128‑1 (MQ=255)
tttATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTtta > 2:3625457/1‑149 (MQ=255)
tATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTttaat > 1:1238773/1‑149 (MQ=255)
aTTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTttaatt > 1:3356832/1‑149 (MQ=255)
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ttCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTtaattaat < 2:1098847/149‑1 (MQ=255)
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tccgatctATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCT < SRR19973068.463543/142‑1 (MQ=60)
GTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATT > SRR19973068.1891537/1‑150 (MQ=60)
GTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATT > SRR19973068.1899245/1‑150 (MQ=60)
GTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATT < SRR19973068.885545/150‑1 (MQ=60)
TCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTA < SRR19973068.3964105/150‑1 (MQ=60)
CAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTAT < SRR19973068.2935525/150‑1 (MQ=60)
AATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATT < SRR19973068.930036/150‑1 (MQ=60)
AATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATT > SRR19973068.817818/1‑150 (MQ=60)
AATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGGATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATGTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTGTCTATTTATT > SRR19973068.1241424/1‑150 (MQ=60)
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CAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGAT > SRR19973068.518460/1‑150 (MQ=60)
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CTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTT > SRR19973068.2170944/1‑150 (MQ=60)
TTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTagatcggaagagcacacgtc > SRR19973068.2621229/1‑130 (MQ=60)
TTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAAT > SRR19973068.1246991/1‑150 (MQ=60)
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TTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCATGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAAT > SRR19973068.195229/1‑150 (MQ=60)
TATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATT > SRR19973068.3377326/1‑150 (MQ=60)
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ATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTA > SRR19973068.1685134/1‑150 (MQ=60)
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TTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAAT > SRR19973068.3037700/1‑150 (MQ=60)
TTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAAT > SRR19973068.1192301/1‑150 (MQ=60)
TCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGT > SRR19973068.276516/1‑150 (MQ=60)
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AAAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTAAGAAAT > SRR19973068.2117651/1‑150 (MQ=60)
AAGGGGGTGATCGATGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATTTAATTACGAAATG > SRR19973068.2919283/1‑150 (MQ=60)
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TGTATATCTTTTTCTCATTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGNGTTAGTGGTTTTCTATTTATTTAATGATTTTAAGTTCTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTTTAA < SRR19973068.2095441/150‑1 (MQ=60)
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AACGTTTTACGCGGGTGAAAATATCATTGCCGAACATAATAAATAGTATCCTGAAGGTGCATGTTGTTATCGATTTGCAACGAATGTTGTTCAATGTTGCAAACTGATAACCTTTTATTTTCACTTGGGAGAAAGGGGGTGATCGAGGTATATCTTTTTCTCCTTTCGCTATACATCCTAAGGAGTATTTCGGCGTGAAATTTTGATTTATTTCACATAGAGTTAGTGGTTTTTTATTTATTTAATGATTTTAAGTTTTTTAATTAATGTAATTACGAAATGACTCGCAGGTTTAA > CP009273/647276‑647571
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |