Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,474,353 |
G→T |
100% |
Q435K (CAG→AAG) |
emrY ← |
putative multidrug efflux system |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,474,353 | 0 | G | T | 96.6%
| 986.8
/ 20.9
| 321 | Q435K (CAG→AAG) | emrY | putative multidrug efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/6); new base T (191/119); total (196/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 321 total aligned reads displayed.
CTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTGACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > CP009273/2474207‑2474500
|
ctcATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACt > 1:5191950/1‑150 (MQ=255)
tcATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTa < 2:3892772/150‑1 (MQ=255)
tcATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATGTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTa > 2:5324811/1‑150 (MQ=255)
tttGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTTTCAACTTACTATgg > 1:707779/1‑150 (MQ=255)
aGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTaa < 2:2337714/150‑1 (MQ=255)
aTAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGAt > 1:1273472/1‑150 (MQ=255)
tAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGAtt > 1:1189487/1‑150 (MQ=255)
aGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGcgt > 1:597112/1‑150 (MQ=255)
ctgctgGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTcc > 1:2666174/1‑150 (MQ=255)
tgGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCcac > 2:4925986/1‑150 (MQ=255)
tgGGTTATTTCATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCcac > 2:2776806/1‑150 (MQ=255)
ggTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAg > 1:4508909/1‑150 (MQ=255)
ggTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAg > 2:3944100/1‑150 (MQ=255)
gTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGc > 1:4410432/1‑150 (MQ=255)
tATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGt > 2:3807379/1‑150 (MQ=255)
aTTTCATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTc > 1:3121794/1‑150 (MQ=255)
cATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTg > 2:2616786/1‑150 (MQ=255)
cATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTg > 1:183255/1‑150 (MQ=255)
attattAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGt > 2:3236214/1‑150 (MQ=255)
ttattaATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTc < 1:818764/150‑1 (MQ=255)
ttattaATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGTGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTc < 1:391276/150‑1 (MQ=255)
tattaATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCa > 1:4089880/1‑150 (MQ=255)
attaATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTAGCTGTCAACTTACTAAGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCaa > 2:4899922/1‑150 (MQ=255)
ttaATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAac < 1:1017847/150‑1 (MQ=255)
aaTATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAacga > 1:616274/1‑150 (MQ=255)
atatCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAacgac < 1:1927001/147‑1 (MQ=255)
aTTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAacgac > 2:4676759/1‑150 (MQ=255)
aTTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAacgac < 2:1934218/150‑1 (MQ=255)
cATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAc > 1:1105407/1‑150 (MQ=255)
cATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAc > 2:4153738/1‑150 (MQ=255)
aTTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAcc > 2:5032447/1‑150 (MQ=255)
aTTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAcc < 2:745840/150‑1 (MQ=255)
aTTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAcc < 2:2278468/150‑1 (MQ=255)
ttAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCa < 1:1802707/150‑1 (MQ=255)
tAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCaa > 2:1774665/1‑150 (MQ=255)
tAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCaa > 1:3656358/1‑150 (MQ=255)
tAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCaa > 2:1995011/1‑150 (MQ=255)
aaGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAAc > 2:1051717/1‑150 (MQ=255)
gAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTg < 1:145596/150‑1 (MQ=255)
tCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATcc > 2:1918651/1‑150 (MQ=255)
tCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATcc < 2:3044669/150‑1 (MQ=255)
ccTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCt < 1:3978666/150‑1 (MQ=255)
gAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTAc > 2:4409503/1‑150 (MQ=255)
aGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAg < 2:1683703/150‑1 (MQ=255)
cGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGt < 2:4598778/150‑1 (MQ=255)
cGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGt > 1:2367191/1‑150 (MQ=255)
cGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGt > 1:3065537/1‑150 (MQ=255)
aaCCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTAc > 2:1469175/1‑150 (MQ=255)
aaCCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTAc < 2:1877776/150‑1 (MQ=255)
aCCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACg > 1:4856114/1‑150 (MQ=255)
ccATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTAGGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGa > 1:3963058/1‑150 (MQ=255)
cATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGaa < 2:866330/150‑1 (MQ=255)
aataTTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGaaaaa < 2:2677127/150‑1 (MQ=255)
atTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAAt < 2:3143716/150‑1 (MQ=255)
ttATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTa > 1:4681656/1‑150 (MQ=255)
tATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAc > 1:4128372/1‑150 (MQ=255)
aTCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCTACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACt < 1:1758493/150‑1 (MQ=255)
aTCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACt > 2:1640381/1‑150 (MQ=255)
tCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAcac > 1:2237217/1‑148 (MQ=255)
ccATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCa > 1:4427181/1‑150 (MQ=255)
cATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCAt < 2:3655192/150‑1 (MQ=255)
aTAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATa > 2:4711265/1‑150 (MQ=255)
aaTTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACt < 2:1302682/150‑1 (MQ=255)
aTTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTc > 2:355640/1‑150 (MQ=255)
tttGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCg > 2:1105160/1‑150 (MQ=255)
tgtgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAg > 1:4983933/1‑150 (MQ=255)
tgtgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAg > 1:3261261/1‑150 (MQ=255)
tgtgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAg > 2:2985284/1‑150 (MQ=255)
gtgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAgg < 2:5174210/150‑1 (MQ=255)
tgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGTTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGc > 2:2092734/1‑150 (MQ=255)
tgACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGc > 2:511241/1‑150 (MQ=255)
gACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCa > 2:1829383/1‑150 (MQ=255)
aCGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCAt > 2:4378374/1‑150 (MQ=255)
aTGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTgg > 1:341887/1‑150 (MQ=255)
gAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCa > 2:2472895/1‑150 (MQ=255)
aaTTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCaa > 2:1231409/1‑150 (MQ=255)
aaTTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCaa > 2:2885333/1‑150 (MQ=255)
aaTTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCaa > 2:680433/1‑150 (MQ=255)
aTTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCaaa > 1:4184282/1‑150 (MQ=255)
ttAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAAt > 2:2159357/1‑150 (MQ=255)
tAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAAtt > 2:2571645/1‑150 (MQ=255)
aaaCACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAAttt > 1:3725543/1‑150 (MQ=255)
acGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATttatta > 2:4073656/1‑150 (MQ=255)
ggggTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATc > 1:1320928/1‑150 (MQ=255)
ggggTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATc < 1:1728291/150‑1 (MQ=255)
aTTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGc > 2:424000/1‑150 (MQ=255)
aTTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGc < 2:4209095/150‑1 (MQ=255)
gATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTg < 1:4905748/150‑1 (MQ=255)
tCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGaa > 1:3336490/1‑150 (MQ=255)
tCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGaa > 1:2044129/1‑150 (MQ=255)
tCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGaa > 2:3363853/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAAc > 1:2608134/1‑150 (MQ=255)
aTGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAAc < 1:25834/150‑1 (MQ=255)
tGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACg < 2:3413376/150‑1 (MQ=255)
tGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACg > 1:4265233/1‑150 (MQ=255)
gTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGaa > 1:2405324/1‑150 (MQ=255)
tGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAt < 1:4676759/150‑1 (MQ=255)
tGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAt < 1:93517/150‑1 (MQ=255)
cAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCgttgt < 1:2885333/150‑1 (MQ=255)
aaCTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCgttgtt > 1:3824761/1‑150 (MQ=255)
|
CTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTGACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > CP009273/2474207‑2474500
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTGACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAAGG > CP009273/2474204‑2474502
|
AATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTT < SRR19973062.2810918/150‑1 (MQ=60)
AATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTT < SRR19973062.3953538/150‑1 (MQ=60)
AATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTT < SRR19973062.3953506/150‑1 (MQ=60)
ATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTA < SRR19973062.2919334/150‑1 (MQ=60)
ATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTA < SRR19973062.4202727/150‑1 (MQ=60)
CTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACT < SRR19973062.3229336/150‑1 (MQ=60)
CTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACT > SRR19973062.5219353/1‑150 (MQ=60)
TCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTA < SRR19973062.2599417/150‑1 (MQ=60)
CATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTAT < SRR19973062.4127334/150‑1 (MQ=60)
TTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTTTCAACTTACTATGG > SRR19973062.711039/1‑150 (MQ=60)
TGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTG > SRR19973062.3342083/1‑150 (MQ=60)
CAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTA < SRR19973062.1312177/150‑1 (MQ=60)
ATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGAT > SRR19973062.1279342/1‑150 (MQ=60)
TAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATT < SRR19973062.2210432/150‑1 (MQ=60)
TAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATT > SRR19973062.1302172/1‑150 (MQ=60)
TAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATT > SRR19973062.1195045/1‑150 (MQ=60)
TAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATT > SRR19973062.1194847/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTC > SRR19973062.1762470/1‑150 (MQ=60)
AGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGT > SRR19973062.599915/1‑150 (MQ=60)
AGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGT > SRR19973062.599909/1‑150 (MQ=60)
AGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGT > SRR19973062.2604875/1‑150 (MQ=60)
TGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCG < SRR19973062.1800905/150‑1 (MQ=60)
TGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCG > SRR19973062.4907074/1‑150 (MQ=60)
CTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCC > SRR19973062.2680162/1‑150 (MQ=60)
GCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCC < SRR19973062.1391914/150‑1 (MQ=60)
GGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAG > SRR19973062.4532289/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGC > SRR19973062.4433106/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGC > SRR19973062.4432986/1‑150 (MQ=60)
GTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGC < SRR19973062.1061398/150‑1 (MQ=60)
TTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACAATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCG < SRR19973062.4739069/150‑1 (MQ=60)
TATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGT > SRR19973062.2879000/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTC > SRR19973062.3546792/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTC > SRR19973062.3137861/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTC > SRR19973062.2173076/1‑150 (MQ=60)
TTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCAT > SRR19973062.432539/1‑150 (MQ=60)
TTCATTATTAATATCATTTAGAACTCCTGAAAGCGAAACATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGATTTAAACACGGGGTTAAATTTATCTTTGGTTGCTGTCTACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCAT < SRR19973062.1925980/150‑1 (MQ=60)
CATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTG > SRR19973062.184258/1‑150 (MQ=60)
CATTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTG < SRR19973062.5138844/150‑1 (MQ=60)
ATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGT > SRR19973062.1737447/1‑150 (MQ=60)
TTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTC < SRR19973062.822377/150‑1 (MQ=60)
TTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTC < SRR19973062.2389664/150‑1 (MQ=60)
TTATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGTGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTC < SRR19973062.393017/150‑1 (MQ=60)
TATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCA > SRR19973062.4110936/1‑150 (MQ=60)
TATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCA > SRR19973062.4230924/1‑150 (MQ=60)
TATTAATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCA > SRR19973062.4231069/1‑150 (MQ=60)
ATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAA > SRR19973062.820658/1‑150 (MQ=60)
TTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAAC < SRR19973062.1022612/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAAC < SRR19973062.801926/150‑1 (MQ=60)
AATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGA > SRR19973062.619153/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGAC > SRR19973062.3408359/1‑150 (MQ=60)
ATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGAC < SRR19973062.839360/150‑1 (MQ=60)
ATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGAC < SRR19973062.303512/150‑1 (MQ=60)
ATATCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGAC < SRR19973062.1936872/150‑1 (MQ=60)
CATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTAC > SRR19973062.1110605/1‑150 (MQ=60)
TTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCA < SRR19973062.1811429/150‑1 (MQ=60)
TAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAA > SRR19973062.3675104/1‑150 (MQ=60)
TAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAA > SRR19973062.3675160/1‑150 (MQ=60)
AGAACTCCTGAAAGCGAACCATGATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACT > SRR19973062.4540482/1‑150 (MQ=60)
AGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACT < SRR19973062.2514494/150‑1 (MQ=60)
GAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTG < SRR19973062.146451/150‑1 (MQ=60)
AACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGA > SRR19973062.1029103/1‑150 (MQ=60)
ACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGAT > SRR19973062.3739296/1‑150 (MQ=60)
ACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGAT > SRR19973062.4474273/1‑150 (MQ=60)
ACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGAT > SRR19973062.5302253/1‑150 (MQ=60)
ACTCCTGAAAGCGAACCATAATAATTATCCATAAGTTGGGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCGACGACGTACCAACAGAT > SRR19973062.5302314/1‑150 (MQ=60)
TCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCC > SRR19973062.3975298/1‑150 (MQ=60)
CCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCT > SRR19973062.2302196/1‑150 (MQ=60)
CCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCT < SRR19973062.3998805/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTT < SRR19973062.4529042/150‑1 (MQ=60)
CTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTT < SRR19973062.1554468/150‑1 (MQ=60)
GAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTAC < SRR19973062.678027/150‑1 (MQ=60)
AAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACA > SRR19973062.191095/1‑150 (MQ=60)
AGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAG < SRR19973062.1208605/150‑1 (MQ=60)
AGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGCACCAACTGATCCTTACAAG > SRR19973062.4430311/1‑150 (MQ=60)
CGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGT > SRR19973062.3081430/1‑150 (MQ=60)
CGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGT > SRR19973062.2379859/1‑150 (MQ=60)
GAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTA > SRR19973062.3756664/1‑150 (MQ=60)
AACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTAC < SRR19973062.585937/150‑1 (MQ=60)
ACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACG > SRR19973062.4881260/1‑150 (MQ=60)
ACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACG > SRR19973062.4881171/1‑150 (MQ=60)
CCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGA > SRR19973062.3983065/1‑150 (MQ=60)
CCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTAGGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGA > SRR19973062.3983149/1‑150 (MQ=60)
ATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACTATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCATAAAAGGTACGAAA > SRR19973062.871218/1‑150 (MQ=60)
ATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAA > SRR19973062.3984456/1‑150 (MQ=60)
ATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAA > SRR19973062.3984414/1‑150 (MQ=60)
AATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAA > SRR19973062.1881329/1‑150 (MQ=60)
ATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAAT > SRR19973062.2556630/1‑150 (MQ=60)
ATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAAT > SRR19973062.896130/1‑150 (MQ=60)
TTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATT < SRR19973062.953023/150‑1 (MQ=60)
TTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATT < SRR19973062.2644456/150‑1 (MQ=60)
TTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATT < SRR19973062.3641996/150‑1 (MQ=60)
TTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTA > SRR19973062.4705875/1‑150 (MQ=60)
TTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTA > SRR19973062.4706130/1‑150 (MQ=60)
TATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAC > SRR19973062.1345758/1‑150 (MQ=60)
TATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAC > SRR19973062.4149746/1‑150 (MQ=60)
TATCCATAATTTGTGAAGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGATGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCTTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAC < SRR19973062.4951655/150‑1 (MQ=60)
ATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCTACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACT < SRR19973062.1767022/150‑1 (MQ=60)
TCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTC > SRR19973062.2248514/1‑150 (MQ=60)
TCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTC < SRR19973062.2795950/150‑1 (MQ=60)
TCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTC > SRR19973062.2533447/1‑150 (MQ=60)
TCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTC > SRR19973062.1823861/1‑150 (MQ=60)
TCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACAC > SRR19973062.2248395/1‑150 (MQ=60)
CCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCA > SRR19973062.4837504/1‑150 (MQ=60)
CCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCA > SRR19973062.4449787/1‑150 (MQ=60)
CCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCA > SRR19973062.4367199/1‑150 (MQ=60)
TGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAG > SRR19973062.5010245/1‑150 (MQ=60)
TGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAG > SRR19973062.3278177/1‑150 (MQ=60)
TGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAG > SRR19973062.3850303/1‑150 (MQ=60)
TGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAG > SRR19973062.3850428/1‑150 (MQ=60)
GACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCA > SRR19973062.3010473/1‑150 (MQ=60)
GACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCA > SRR19973062.4574790/1‑150 (MQ=60)
ACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCAT > SRR19973062.4031997/1‑150 (MQ=60)
ACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCAA > SRR19973062.4031907/1‑150 (MQ=60)
ATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGG > SRR19973062.343461/1‑150 (MQ=60)
ATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTAATCATACTCGAGGCATAGG > SRR19973062.3314307/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAA > SRR19973062.4755601/1‑150 (MQ=60)
AATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAA > SRR19973062.3376043/1‑150 (MQ=60)
ATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAA > SRR19973062.4205990/1‑150 (MQ=60)
ATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAA > SRR19973062.2400456/1‑150 (MQ=60)
AAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTT > SRR19973062.3744661/1‑150 (MQ=60)
AACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGTTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTA < SRR19973062.123295/150‑1 (MQ=60)
CGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTAT > SRR19973062.1398786/1‑150 (MQ=60)
GGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATC < SRR19973062.3996433/150‑1 (MQ=60)
GGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATC < SRR19973062.264668/150‑1 (MQ=60)
GGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATC < SRR19973062.1736711/150‑1 (MQ=60)
GGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATC > SRR19973062.1326944/1‑150 (MQ=60)
GGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCT < SRR19973062.4449732/150‑1 (MQ=60)
GTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGG > SRR19973062.3152001/1‑150 (MQ=60)
AAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAA < SRR19973062.3826854/150‑1 (MQ=60)
TGATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCT > SRR19973062.5193112/1‑150 (MQ=60)
GATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTG < SRR19973062.4931084/150‑1 (MQ=60)
ATCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGA > SRR19973062.4135686/1‑150 (MQ=60)
TCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAA > SRR19973062.3353706/1‑150 (MQ=60)
TCGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAA > SRR19973062.2054612/1‑150 (MQ=60)
CGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAA < SRR19973062.1783266/150‑1 (MQ=60)
CGATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAA < SRR19973062.4931885/150‑1 (MQ=60)
ATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAAC < SRR19973062.26032/150‑1 (MQ=60)
ATGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAAC > SRR19973062.2621913/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACG > SRR19973062.1611994/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACG > SRR19973062.4287313/1‑150 (MQ=60)
TGGTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACG < SRR19973062.1811790/150‑1 (MQ=60)
GTTGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAA > SRR19973062.2418240/1‑150 (MQ=60)
TGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAT < SRR19973062.94132/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAT > SRR19973062.4166183/1‑150 (MQ=60)
TGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAT < SRR19973062.4701222/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAT < SRR19973062.4701210/150‑1 (MQ=60)
TGCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAAT < SRR19973062.655634/150‑1 (MQ=60)
GCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATC < SRR19973062.418002/150‑1 (MQ=60)
GCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATC < SRR19973062.3095198/150‑1 (MQ=60)
GCTGTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATC < SRR19973062.3095141/150‑1 (MQ=60)
GTCAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTT > SRR19973062.2015800/1‑150 (MQ=60)
CAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGT < SRR19973062.2900567/150‑1 (MQ=60)
CAACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGT < SRR19973062.359267/150‑1 (MQ=60)
AACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTT > SRR19973062.61555/1‑150 (MQ=60)
AACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTT < SRR19973062.2005275/150‑1 (MQ=60)
AACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTT < SRR19973062.1167840/150‑1 (MQ=60)
AACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTT > SRR19973062.3844336/1‑150 (MQ=60)
ACTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACG‑AAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > SRR19973062.3136122/1‑150 (MQ=60)
CTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > SRR19973062.3990526/1‑150 (MQ=60)
CTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > SRR19973062.5232931/1‑150 (MQ=60)
CTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA > SRR19973062.5232915/1‑150 (MQ=60)
CTTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAA < SRR19973062.2840744/150‑1 (MQ=60)
TTACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAAG < SRR19973062.1677391/150‑1 (MQ=60)
TACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTTACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAAGG < SRR19973062.3731911/150‑1 (MQ=60)
|
AATCTCATTTGCAGAAATAGAAAGTGACTGCTGGGTTATTTCATTATTAATTTCATTAAGAACTCCTGAAAGCGAACCATAATATTTATCCATAATTTGTGACGATGAATTAAACACGGGGTTAAATTGATCGATGGTTGCTGTCAACTGACTATGGTGTAACGATTCGCGTCGTCCCCACAGCGTCATTGTCAACGACGTACCAACTGATCCTGACAAGGTACGAAAAAAATTACTCATACTCGAGGCATTGGCAAATTTATTATCTGGCAAGCCTGAAAACGAAATCGTTGTTAAGG > CP009273/2474204‑2474502
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |