Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,139,910 |
G→T |
100% |
R1055L (CGA→CTA) |
yegE → |
putative diguanylate cyclase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,139,910 | 0 | G | T | 98.8%
| 804.7
/ 0.4
| 247 | R1055L (CGA→CTA) | yegE | putative diguanylate cyclase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (104/140); total (104/143) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.66e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 247 total aligned reads displayed.
CCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCG > CP009273/2139764‑2140055
|
ccAGGTGGTCAGCGATCTTCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATTTCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTAc < 2:1374858/149‑1 (MQ=255)
ccAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTAc < 2:507108/149‑1 (MQ=255)
aGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATCATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTc < 1:3933134/149‑1 (MQ=255)
ggTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCg > 2:2663233/1‑149 (MQ=255)
gggCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGa > 2:3919935/1‑149 (MQ=255)
cgATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGaaaa > 1:3865954/1‑149 (MQ=255)
cgATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGaaaa < 2:1360256/149‑1 (MQ=255)
gATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAc > 1:1468764/1‑149 (MQ=255)
aTCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAcc < 1:162538/149‑1 (MQ=255)
tCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCa < 2:29822/149‑1 (MQ=255)
cTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCAt < 1:562525/149‑1 (MQ=255)
tGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATc > 1:1173308/1‑149 (MQ=255)
cAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGATTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACTATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGc < 2:3682297/149‑1 (MQ=255)
aaaTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGcc > 1:4002365/1‑149 (MQ=255)
aaTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCg > 1:195228/1‑149 (MQ=255)
aTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCgg > 1:447090/1‑149 (MQ=255)
aTCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCgg > 2:1599525/1‑149 (MQ=255)
ttCCACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGcc < 2:3908927/149‑1 (MQ=255)
cAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAg > 1:1782101/1‑149 (MQ=255)
aCTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTc < 1:3475279/149‑1 (MQ=255)
tCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGt > 1:1331622/1‑149 (MQ=255)
cGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGtt < 2:2007780/149‑1 (MQ=255)
cGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGtt < 2:1906521/149‑1 (MQ=255)
cGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGtt < 2:3025726/149‑1 (MQ=255)
gAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAc > 2:3809839/1‑149 (MQ=255)
aaaGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAcc < 2:2354928/149‑1 (MQ=255)
aaGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTGCTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAccc > 2:174942/1‑149 (MQ=255)
aGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATTGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGTGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGAACGATCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCt < 2:839111/149‑1 (MQ=255)
aGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCt > 1:1437625/1‑149 (MQ=255)
aaTATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGt < 1:702309/149‑1 (MQ=255)
atatGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTg < 2:4049555/149‑1 (MQ=255)
atGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGAt < 2:2505468/149‑1 (MQ=255)
ggCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg > 1:4089862/1‑149 (MQ=255)
ggCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATgg > 2:2646417/1‑149 (MQ=255)
gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCTGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGa < 2:847312/149‑1 (MQ=255)
gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGa < 2:282662/149‑1 (MQ=255)
gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGa > 2:3613731/1‑149 (MQ=255)
gCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGa > 1:321591/1‑149 (MQ=255)
cAGATTACCTGCTACTTTATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGAt < 2:2585552/149‑1 (MQ=255)
aGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATa < 2:4090466/149‑1 (MQ=255)
aGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATa > 2:3263129/1‑149 (MQ=255)
aTTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATaag > 1:1717852/1‑147 (MQ=255)
aTTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACg > 1:901978/1‑149 (MQ=255)
tACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCt > 1:1028864/1‑149 (MQ=255)
tACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCt < 2:3863019/149‑1 (MQ=255)
aCCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCtt > 2:3402265/1‑149 (MQ=255)
ccTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCttt < 1:2236409/149‑1 (MQ=255)
tGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCt < 1:173916/149‑1 (MQ=255)
tGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCt < 1:464110/149‑1 (MQ=255)
gCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTg < 1:3185905/149‑1 (MQ=255)
tGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCg < 1:2602488/149‑1 (MQ=255)
gATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCgg > 1:1912195/1‑149 (MQ=255)
tGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCg > 1:1983973/1‑149 (MQ=255)
gTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTc < 1:1590708/149‑1 (MQ=255)
gTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATc < 2:2617783/149‑1 (MQ=255)
ttATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCt < 2:3423657/149‑1 (MQ=255)
tATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTg < 2:155229/149‑1 (MQ=255)
tGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCCTCGGCGTCGATCTGAt > 2:2471970/1‑149 (MQ=255)
gcgcCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGAtt < 1:2973593/149‑1 (MQ=255)
ccAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTAt < 2:1717852/149‑1 (MQ=255)
aCGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGCTCTGATTTATggt > 2:1496223/1‑149 (MQ=255)
aCGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATggt < 1:2946040/149‑1 (MQ=255)
gTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGTTTTATggtga > 2:1083517/1‑149 (MQ=255)
tGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATggtgag > 2:3487863/1‑149 (MQ=255)
cAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATggtgaggt < 1:3307298/149‑1 (MQ=255)
aGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTTCCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCCTCGGCGGCGCTCTGATTTTTggtgaggtg > 1:1823879/1‑149 (MQ=255)
aGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATggtgaggtg < 1:2071091/149‑1 (MQ=255)
aGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATggtgaggtg < 1:4104672/149‑1 (MQ=255)
aGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTGTGGCAAAGGCGTCGATCGGTTTTATtgtgtggtg > 1:1824497/1‑149 (MQ=255)
gggTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTATTGATTGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGAGGTGGTTTTTtgtgtggtgt > 1:769587/1‑148 (MQ=255)
ggTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGAt > 1:3416069/1‑149 (MQ=255)
ggTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGAt < 1:497040/149‑1 (MQ=255)
aaTTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGc > 2:737434/1‑149 (MQ=255)
aaTTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGc < 1:268041/149‑1 (MQ=255)
ttGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGa < 2:2124213/149‑1 (MQ=255)
tGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGAt < 2:3799839/149‑1 (MQ=255)
gatggatgAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATg > 1:2289240/1‑149 (MQ=255)
gagaTGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGGCGATCTGGTTTATGGGGAGGTGTTTGCCGATGCCCCAcc > 1:129551/1‑149 (MQ=255)
gagaTGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGCTTCCCAAcc > 1:2204941/1‑149 (MQ=255)
gaTGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGc < 1:3441961/149‑1 (MQ=255)
aTGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCt < 1:2646474/149‑1 (MQ=255)
tGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTg > 1:3377264/1‑149 (MQ=255)
gCTGATTACGATTATACAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTgg > 2:932281/1‑149 (MQ=255)
tGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAt < 1:2478006/149‑1 (MQ=255)
gATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGGCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTTCCGATGCCCAACCGCTGGAtt > 2:3257497/1‑149 (MQ=255)
gATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAtt > 1:2583249/1‑149 (MQ=255)
aTTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAttt < 2:901978/149‑1 (MQ=255)
tACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGc < 1:1075366/149‑1 (MQ=255)
tACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGc < 2:3046988/149‑1 (MQ=255)
aCGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTATTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATTGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAAACGCTGGATTTGCt > 2:2703871/1‑149 (MQ=255)
aCGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCt < 1:2953506/149‑1 (MQ=255)
gATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTgg < 1:3724342/149‑1 (MQ=255)
attattCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGt < 2:2289240/149‑1 (MQ=255)
attattCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGt > 2:3566750/1‑149 (MQ=255)
ggggCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagta < 2:2805801/149‑1 (MQ=255)
ggggCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAAtagta < 1:1796315/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGtt < 2:413460/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGtt < 2:66623/149‑1 (MQ=255)
gCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATGTGATTTATGGTGAGGTGTTTGGCGATTCCCCACCCCTGGGTTTGCTGGTGAAAATTAGtt > 1:2175718/1‑149 (MQ=255)
cGCTCAGCTACTCGTGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTAtt < 1:3099981/149‑1 (MQ=255)
|
CCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCG > CP009273/2139764‑2140055
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CAGCCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATT > CP009273/2139761‑2140058
|
CAGCCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCT > SRR19973068.520743/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTA > SRR19973068.4073930/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTA > SRR19973068.3015629/1‑150 (MQ=60)
CAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTC > SRR19973068.3550751/1‑150 (MQ=60)
AGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATCATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCG < SRR19973068.3956950/150‑1 (MQ=60)
GTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGG < SRR19973068.3192891/150‑1 (MQ=60)
GGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATG > SRR19973068.4134364/1‑150 (MQ=60)
GGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATG > SRR19973068.4134297/1‑150 (MQ=60)
GCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAA > SRR19973068.3889299/1‑150 (MQ=60)
GCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAA > SRR19973068.182725/1‑150 (MQ=60)
CGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAAC > SRR19973068.1478416/1‑150 (MQ=60)
GATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACC > SRR19973068.219759/1‑150 (MQ=60)
ATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCA < SRR19973068.163887/150‑1 (MQ=60)
CTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATC < SRR19973068.566612/150‑1 (MQ=60)
CTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATC < SRR19973068.566396/150‑1 (MQ=60)
CTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATC > SRR19973068.1181159/1‑150 (MQ=60)
CTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGAGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATC > SRR19973068.328285/1‑150 (MQ=60)
CAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCC > SRR19973068.4026554/1‑150 (MQ=60)
CAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCC > SRR19973068.4026186/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCG > SRR19973068.197524/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCG > SRR19973068.196750/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCG > SRR19973068.1639785/1‑150 (MQ=60)
AATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGG > SRR19973068.535876/1‑150 (MQ=60)
AATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGG > SRR19973068.450263/1‑150 (MQ=60)
TCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGC > SRR19973068.41290/1‑150 (MQ=60)
TCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAG > SRR19973068.1793703/1‑150 (MQ=60)
ACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCG < SRR19973068.450656/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCG < SRR19973068.3496364/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCG > SRR19973068.2137049/1‑150 (MQ=60)
CTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGT > SRR19973068.3401966/1‑150 (MQ=60)
CTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGT > SRR19973068.1340242/1‑150 (MQ=60)
TCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTT < SRR19973068.2076492/150‑1 (MQ=60)
TGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAC < SRR19973068.2530349/150‑1 (MQ=60)
AAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCT < SRR19973068.1836630/150‑1 (MQ=60)
AAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCT < SRR19973068.2265559/150‑1 (MQ=60)
AAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTAACCT > SRR19973068.1447034/1‑150 (MQ=60)
CGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAG > SRR19973068.764538/1‑150 (MQ=60)
AATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTG < SRR19973068.706787/150‑1 (MQ=60)
AATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTG < SRR19973068.1283185/150‑1 (MQ=60)
TGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGG > SRR19973068.4114380/1‑150 (MQ=60)
TGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGG > SRR19973068.4114382/1‑150 (MQ=60)
GGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGA > SRR19973068.323668/1‑150 (MQ=60)
GGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGATGGA > SRR19973068.1798476/1‑150 (MQ=60)
AGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGATGGATAA > SRR19973068.1093357/1‑150 (MQ=60)
GATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATAAG > SRR19973068.1728788/1‑150 (MQ=60)
GATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCTTAGTGATGGATACG > SRR19973068.908069/1‑150 (MQ=60)
TTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCT > SRR19973068.1035504/1‑150 (MQ=60)
ACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTAACCTTAGTTCTGGTTACGCTTT > SRR19973068.3834927/1‑150 (MQ=60)
CCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTC < SRR19973068.2251002/150‑1 (MQ=60)
CCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTC < SRR19973068.4076586/150‑1 (MQ=60)
CCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTC < SRR19973068.2250747/150‑1 (MQ=60)
TGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTG < SRR19973068.467381/150‑1 (MQ=60)
TGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTG < SRR19973068.2263136/150‑1 (MQ=60)
TGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTG < SRR19973068.467430/150‑1 (MQ=60)
TGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTG < SRR19973068.175324/150‑1 (MQ=60)
TGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTG < SRR19973068.175208/150‑1 (MQ=60)
GCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGG < SRR19973068.3205517/150‑1 (MQ=60)
ACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCAT < SRR19973068.2664512/150‑1 (MQ=60)
TTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCG < SRR19973068.3935034/150‑1 (MQ=60)
TTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCG < SRR19973068.3935804/150‑1 (MQ=60)
TGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGG < SRR19973068.2618911/150‑1 (MQ=60)
TGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCGG > SRR19973068.1924899/1‑150 (MQ=60)
TGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCTTAGTGATGGATACCCTTTCTTGCATCGG > SRR19973068.1924813/1‑150 (MQ=60)
GATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGC < SRR19973068.3231605/150‑1 (MQ=60)
GATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGC < SRR19973068.2439185/150‑1 (MQ=60)
ATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCG > SRR19973068.1997078/1‑150 (MQ=60)
GTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCG < SRR19973068.3345704/150‑1 (MQ=60)
GTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCG < SRR19973068.1601196/150‑1 (MQ=60)
GTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCG < SRR19973068.1601148/150‑1 (MQ=60)
TGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGGTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATT > SRR19973068.2622928/1‑150 (MQ=60)
GCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTT < SRR19973068.2992003/150‑1 (MQ=60)
GCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTT < SRR19973068.2991992/150‑1 (MQ=60)
CGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGATGGATAAGCTTTCTGGCATAGGCGGCGATCGGTTTTA > SRR19973068.2817195/1‑150 (MQ=60)
GCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTAT < SRR19973068.954253/150‑1 (MQ=60)
GCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTAT < SRR19973068.954152/150‑1 (MQ=60)
ACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTG < SRR19973068.2964331/150‑1 (MQ=60)
ACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTG < SRR19973068.2964323/150‑1 (MQ=60)
CAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTTCCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCCTCGGCGGCGCTCTGATTTTTGGTGAGGTG > SRR19973068.1835882/1‑150 (MQ=60)
CAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTG < SRR19973068.3327526/150‑1 (MQ=60)
CAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTGTGGCAAAGGCGTCGATCGGTTTTATTGTGTGGTG > SRR19973068.1836502/1‑150 (MQ=60)
CAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTTACCTTAGGGATGGTTACGCTTTCTGGCATAGGCGTCGTTCTGATTTTTTGTGATGTG > SRR19973068.1836460/1‑150 (MQ=60)
AGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTATTGATTGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGAggtggttttttgtgtggtgt > SRR19973068.774787/1‑130 (MQ=60)
AGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGA < SRR19973068.4129241/150‑1 (MQ=60)
AGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGA < SRR19973068.2084519/150‑1 (MQ=60)
AGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTAGTGATTGATACGCTTTCTGGCctaggcggggcgggggtttatggtgtggggt > SRR19973068.385239/1‑119 (MQ=60)
GGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTATTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATTGTGAGGTGAT > SRR19973068.3436691/1‑150 (MQ=60)
GGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCGGATTTATGGTGATGTGAT > SRR19973068.3436806/1‑150 (MQ=60)
GGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATT < SRR19973068.500516/150‑1 (MQ=60)
GTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTG < SRR19973068.1374596/150‑1 (MQ=60)
GTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTG < SRR19973068.1374868/150‑1 (MQ=60)
AATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCC < SRR19973068.269929/150‑1 (MQ=60)
TTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGAT < SRR19973068.2051056/150‑1 (MQ=60)
TGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTATGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATG > SRR19973068.2304066/1‑150 (MQ=60)
TGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCC < SRR19973068.1664127/150‑1 (MQ=60)
TGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGGCGATCTGGTTTATGGGGAGGTGTTTGCCGATGCCCCACC > SRR19973068.130736/1‑150 (MQ=60)
TGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGCTTCCCAACC > SRR19973068.2219355/1‑150 (MQ=60)
TGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTATTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCGGATTTATTGTGTGGTGATTTCCGATTCCCAACC > SRR19973068.130777/1‑150 (MQ=60)
GATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCT < SRR19973068.1458663/150‑1 (MQ=60)
GATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCT < SRR19973068.3462700/150‑1 (MQ=60)
GATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCT < SRR19973068.3462751/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTG > SRR19973068.3397755/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTG < SRR19973068.495842/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTG < SRR19973068.2663013/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTG < SRR19973068.2663070/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCGGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTG > SRR19973068.3397752/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTTCCGATGCCCAACCCCTG > SRR19973068.636218/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATAAGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGCTTTATTGGGGGGTGATTGCCGTTGCCCAACCGCTG > SRR19973068.1820828/1‑150 (MQ=60)
CTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGAT < SRR19973068.2210553/150‑1 (MQ=60)
TGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATTGATAAGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCCCAGGATT > SRR19973068.2599565/1‑150 (MQ=60)
TGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTGGATGGGTTTTATGGTGTGGTGATTGCCGATGCCCCACCGCTGGCTT > SRR19973068.2599835/1‑150 (MQ=60)
TGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATT < SRR19973068.859800/150‑1 (MQ=60)
TGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATT < SRR19973068.3635670/150‑1 (MQ=60)
TGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATT > SRR19973068.2599576/1‑150 (MQ=60)
TGATTACGATTAGTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATT < SRR19973068.2493812/150‑1 (MQ=60)
ATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTG < SRR19973068.176351/150‑1 (MQ=60)
ATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTG < SRR19973068.176355/150‑1 (MQ=60)
ATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGAGCTGTTTTATTGTGGGGGGATTGCCGATGCCCAACCCCTGGATTTG > SRR19973068.1575757/1‑150 (MQ=60)
TACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCT < SRR19973068.1046088/150‑1 (MQ=60)
TACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCT < SRR19973068.1082459/150‑1 (MQ=60)
ACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTG < SRR19973068.2971824/150‑1 (MQ=60)
CGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGG < SRR19973068.1189212/150‑1 (MQ=60)
GATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGT < SRR19973068.3746703/150‑1 (MQ=60)
ATTATTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTG < SRR19973068.3449003/150‑1 (MQ=60)
TTCAGGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATTAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATA < SRR19973068.1936371/150‑1 (MQ=60)
GGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAG < SRR19973068.1808066/150‑1 (MQ=60)
GGGGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGTTGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGGCGGTCTGATTTATTGTGAGGTGATTGGCGATGCCCCACCGCTGGATTTTGTGGTGTATAGTAG > SRR19973068.157517/1‑150 (MQ=60)
GGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTT < SRR19973068.2973064/150‑1 (MQ=60)
GGCACGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTAACCTTAGTGATGGATACGCGTTCTGGCATCGGCGTCGATGTGATTTATGGTGAGGTGTTTGGCGATTCCCCACCCCTGGGTTTGCTGGTGAAAATTAGTT > SRR19973068.2189964/1‑150 (MQ=60)
CGCTCAGCTACTCGTGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTT < SRR19973068.3118845/150‑1 (MQ=60)
CGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTT < SRR19973068.3120771/150‑1 (MQ=60)
CGCTCAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTT < SRR19973068.2879820/150‑1 (MQ=60)
CAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGGTTTATGGTGTGGTGATTTCCGATGCCCCACCGCTGGATTTGCTGGTGTATAGTAGTTATTTAGCG > SRR19973068.3037029/1‑150 (MQ=60)
CAGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCGTAGTGTTGGATAAGCTTTATGGCCTCGGCGTCGATGTGTGTTATTGTGAGGTGATTGCCGAAGCCCAAACCCGGGATTTTCTGGTGGATATTATTTATTTCGCG > SRR19973068.1229920/1‑150 (MQ=53)
AGCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCAACGGCGGCGATCTGAGTTATGGGGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCGGGAATTGCTGGTGAATAGTTGTTATTTCGCGG > SRR19973068.3298176/1‑150 (MQ=60)
GCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAT < SRR19973068.677551/150‑1 (MQ=60)
GCTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTGTTACCCGTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATGGGGTTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGCTTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGAT > SRR19973068.3355398/1‑150 (MQ=60)
CTACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATT < SRR19973068.2679878/150‑1 (MQ=60)
|
CAGCCAGGTGGGCCGCGATCTGCAAATCTTCAACTCGCTGAAAGCGAATATGGCAGATTACCTGCTACTTGATGGTGAGTTATGCGCCAACGTGCAGGGTAATTTGATGGATGAGATGCTGATTACGATTATTCAGGGGCACGCTCAGCGACTCGGGATGAAAACCATCGCCGGGCCAGTCGTTTTACCCTTAGTGATGGATACGCTTTCTGGCATCGGCGTCGATCTGATTTATGGTGAGGTGATTGCCGATGCCCAACCGCTGGATTTGCTGGTGAATAGTAGTTATTTCGCGATT > CP009273/2139761‑2140058
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |