Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R3
|
46 |
423.2 |
7875468 |
99.1% |
7804588 |
124.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AssemblyC74_contig_12 |
59,182 |
C→T |
L52L (TTG→TTA) |
rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 ← |
Putative peptidoglycan bound protein (LPXTG motif) Lmo2178 homolog |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AssemblyC74_contig_12 | 59,182 | 0 | C | T | 78.3%
| 3843.3
/ inf
| 2003 | L52L (TTG→TTA) | rasttk_feature_annotation_tool=annotate_proteins_km er_v2 | Putative peptidoglycan bound protein (LPXTG motif) Lmo2178 homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (219/214); new base T (787/780); total (1008/995) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.14e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2005 total aligned reads displayed.
CTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAA > AssemblyC74_contig_12/59049‑59313
|
tgcaggatTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAAt > 1:1192000‑M1/9‑135 (MQ=255)
tgcaggatTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAAt > 2:3129058‑M1/9‑135 (MQ=255)
caggatTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTc > 1:1075302‑M1/7‑135 (MQ=255)
aggatTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTc < 2:3848052‑M1/129‑1 (MQ=255)
aggatTTCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCa < 2:2152184‑M1/130‑1 (MQ=255)
ttCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATAccc < 1:939744/135‑1 (MQ=255)
ttCCCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATAccc < 2:522688/135‑1 (MQ=255)
ccGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATAccctatt > 1:2274520/1‑131 (MQ=255)
cGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATAccctatt > 1:872431/1‑130 (MQ=255)
cGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATAccctatt > 2:1468540/1‑130 (MQ=255)
cGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTAACACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGtt > 2:414482/1‑134 (MQ=255)
cTTTGGTCATCGATCTTTGTCACCTCGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCTATTCTACCCCCTCTGTCTTACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGgc < 2:3730938/135‑1 (MQ=255)
ttGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGgcg < 2:3211407/134‑1 (MQ=255)
ttGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGgcg < 2:2717291/134‑1 (MQ=255)
tGGTCCTCGATCTTAGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGTCGCt > 2:747049/1‑135 (MQ=255)
tGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCt > 2:389366/1‑135 (MQ=255)
tGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCt > 2:2844390/1‑135 (MQ=255)
cATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTgag > 1:1679872/1‑133 (MQ=255)
aTCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGt > 1:3440108/1‑135 (MQ=255)
aTCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGt > 2:1406419/1‑135 (MQ=255)
gATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTc < 2:2985201/135‑1 (MQ=255)
gATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTc < 1:1806738/135‑1 (MQ=255)
gATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTGTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTc < 2:1629120/135‑1 (MQ=255)
tCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCt > 1:3678738/1‑134 (MQ=255)
cTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc < 1:114720/135‑1 (MQ=39)
cTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc < 2:795959/135‑1 (MQ=39)
cTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc < 1:3501522/135‑1 (MQ=39)
cTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc < 2:3531243/135‑1 (MQ=39)
tttGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTAcc < 2:1344386/135‑1 (MQ=255)
gTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTAcc > 1:2491290/1‑132 (MQ=255)
gTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTAcc > 1:3084684/1‑132 (MQ=255)
atcacGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTGTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTg < 2:1123901/132‑1 (MQ=255)
aaCTCGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTg < 1:2792032/134‑1 (MQ=255)
aaCCCGACACCGCCCGGCGACAGCCGATTTACTTTCGTAAATTCTACCACCGCTGACTTTCTTGTTGACTTCGACAAGTCGTCTGGGTGATG‑TTAAAATTACTACCCCGTTGGCGCTTGTGTTTCTACCAGCTg < 1:695264/134‑1 (MQ=255)
aaCACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGa > 1:750970/1‑135 (MQ=38)
acacGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGAt < 2:841767/135‑1 (MQ=38)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc < 2:2557287/135‑4 (MQ=37)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc < 2:923083/135‑4 (MQ=37)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATatgt < 1:3922395/135‑4 (MQ=38)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATatgt < 2:2204824/135‑4 (MQ=38)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc > 1:1750011/1‑123 (MQ=38)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc < 1:1438171/135‑4 (MQ=37)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc < 2:3677846/135‑4 (MQ=37)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc < 1:1583440/135‑4 (MQ=37)
gACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATAGGTGTCGCATCTAATTc > 1:2029802/1‑96 (MQ=255)
cacCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc > 1:386152/1‑121 (MQ=38)
cTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTc < 2:3328748/112‑1 (MQ=255)
ggTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTAc > 1:559743/1‑113 (MQ=38)
ggTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCt > 2:3285164/1‑135 (MQ=25)
ggTGTAAGTCGGTTATCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTTACTTACTACATTCGATATCAAAATCG‑ATTGGTGTCGCATATAATTCATTCCCTATTGGCGCTTGGGTTTGTTCGAGCTGATATGTGCCTGGTGCt > 2:3605879/1‑135 (MQ=255)
ggTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATacac < 2:1714264/125‑1 (MQ=255)
ggTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCt > 1:3345925/1‑135 (MQ=255)
aaGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAcc > 1:512298/1‑135 (MQ=25)
aaGTCGGTTTTATTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATatgt > 1:242107/1‑117 (MQ=37)
ggttttctTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAa < 1:3292403‑M2/133‑2 (MQ=255)
ggttttctTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAa < 1:628457‑M2/133‑2 (MQ=255)
ttctttcGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgc < 1:318964‑M2/135‑6 (MQ=255)
ttctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgc < 1:2357744‑M2/135‑6 (MQ=255)
ttctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgc < 1:2097559‑M2/135‑6 (MQ=255)
ttctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgc < 1:1001437‑M2/135‑6 (MQ=255)
tctttcGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgcc < 1:3762097‑M2/135‑7 (MQ=255)
tctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgcc < 1:1509912‑M2/135‑7 (MQ=255)
tctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgcc < 1:2551286‑M2/135‑7 (MQ=255)
tctttcGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgcc < 1:2155235‑M2/135‑7 (MQ=255)
cGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgctagttt > 2:595163‑M2/1‑124 (MQ=255)
aaTCCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGAACTCAACCTCG‑CTTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTATACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAatcgccagttttcc > 2:202601‑M2/1‑120 (MQ=255)
aTTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccat > 2:1948748‑M2/1‑119 (MQ=255)
aTTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccat > 2:2440583‑M2/1‑119 (MQ=255)
aTTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttcc < 2:3450247‑M2/133‑15 (MQ=255)
aTTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgctagttttccat > 1:999918‑M2/1‑119 (MQ=255)
tACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttc > 2:670391‑M2/1‑115 (MQ=255)
tACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttc > 2:1057491‑M2/1‑115 (MQ=255)
tACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAatcgccagttttccatctgc > 2:3410518‑M2/1‑115 (MQ=255)
accaccGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttct > 2:2274520‑M2/1‑114 (MQ=255)
accaccGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGATGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttct > 1:2717240‑M2/1‑114 (MQ=255)
accaccGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgctagttttccatcttct > 1:125111‑M2/1‑114 (MQ=255)
caccGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgctagttttccatcttctcc > 1:2613763‑M2/1‑112 (MQ=255)
gTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCTTACCATATTGGCTCTTGGGTTTCTACAAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGtt < 1:132538/135‑1 (MQ=255)
gTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttctcctgtagtt > 1:799636‑M2/1‑105 (MQ=255)
gTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCTAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGtt < 2:2363445/135‑1 (MQ=17)
tCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTc < 2:2631639/70‑1 (MQ=255)
tCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttctcctgtagtta < 1:1878473‑M2/135‑32 (MQ=255)
tGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAa > 1:3026487‑M1/1‑133 (MQ=255)
tGACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAatcgccagttttccatctgctcctgtggttaga > 1:2941801‑M2/1‑102 (MQ=255)
gACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATatgc > 2:178377/1‑79 (MQ=18)
gACTTCTTTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAattgccagttttccatcttctcctgtagttagac < 1:1916943‑M2/135‑35 (MQ=255)
tcttTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGAccggt > 1:443437/1‑132 (MQ=17)
cttTCGATCTCAAACTCG‑ATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGAccggtt < 2:11935/135‑5 (MQ=17)
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ATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGACAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATAtgctc < SRR22894673.437028/151‑6 (MQ=60)
ATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTC < SRR22894673.3517247/151‑1 (MQ=60)
TCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCC < SRR22894673.2840010/151‑1 (MQ=60)
TTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGG < SRR22894673.3084717/151‑1 (MQ=60)
TGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGT > SRR22894673.2478416/1‑151 (MQ=60)
GTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTG > SRR22894673.2550093/1‑151 (MQ=60)
TCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTG < SRR22894673.1458409/150‑1 (MQ=60)
TCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTG < SRR22894673.39824/150‑1 (MQ=60)
CAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATAtg < SRR22894673.3429802/140‑3 (MQ=60)
CAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGCTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTG > SRR22894673.2084973/1‑149 (MQ=60)
ACACGACACCGCCTGGTGTAGGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCAGCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAA > SRR22894673.2123600/1‑151 (MQ=60)
ACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATAtgctc < SRR22894673.1027762/141‑6 (MQ=60)
ACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAA > SRR22894673.2905175/1‑151 (MQ=60)
ACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATAC > SRR22894673.464194/1‑104 (MQ=60)
CCGACACCGCACGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGGTCATACTCCCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.182772/151‑1 (MQ=34)
ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.2518934/151‑1 (MQ=60)
ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.260180/151‑1 (MQ=60)
ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.390791/151‑1 (MQ=60)
ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.3654301/151‑1 (MQ=60)
ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.3603588/151‑1 (MQ=60)
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ACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAC < SRR22894673.1332261/151‑1 (MQ=60)
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CGACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAAC > SRR22894673.1208535/1‑150 (MQ=60)
ACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATAtgc < SRR22894673.1938986/134‑4 (MQ=60)
ACACCGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGT > SRR22894673.174624/1‑151 (MQ=60)
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CGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTTAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAAT < SRR22894673.186719/151‑1 (MQ=60)
CGCCTGGTGTAAGTCGGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAAT > SRR22894673.1792975/1‑151 (MQ=60)
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CGTTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCAT < SRR22894673.3058414/151‑1 (MQ=60)
GGTTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCAT > SRR22894673.1410270/1‑150 (MQ=60)
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TTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGA > SRR22894673.1694312/1‑151 (MQ=60)
TTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCATGTAGTTAGA > SRR22894673.1643780/1‑151 (MQ=51)
TCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGTTTGGTGTCGCATCTATTTCACTCCCTATTGTCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAAAC < SRR22894673.4009038/151‑1 (MQ=36)
TCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGAC < SRR22894673.2561711/151‑1 (MQ=59)
CTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATTTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAG < SRR22894673.3955860/144‑1 (MQ=49)
CTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAAAC > SRR22894673.3103237/1‑150 (MQ=56)
CTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGATGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCATGTAGTTAGACC < SRR22894673.2786080/151‑1 (MQ=54)
CTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGaatataagaaccatgtcctaaaccgacaaaagatatagtaccagcgtctcctgtagttagac > SRR22894673.142624/1‑88 (MQ=60)
CTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCTAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACC < SRR22894673.3587769/151‑1 (MQ=48)
ACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAAT > SRR22894673.2457643/1‑113 (MQ=36)
CCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccggtttg > SRR22894673.1952856/1‑136 (MQ=50)
CCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCT < SRR22894673.1575013/47‑1 (MQ=60)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccggtttgtag < SRR22894673.3262268/151‑19 (MQ=45)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtag < SRR22894673.3227428/151‑10 (MQ=43)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtag > SRR22894673.2352832/1‑142 (MQ=43)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtag < SRR22894673.641643/151‑10 (MQ=43)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtag < SRR22894673.2963022/151‑10 (MQ=43)
CTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATCGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCTAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtag < SRR22894673.2687237/151‑10 (MQ=34)
GTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGAaatgttcctggtgctaaacctgtatcttatacacatatccgagcccacgagacgaattccaacaacaagt > SRR22894673.1222456/1‑81 (MQ=60)
GTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTT < SRR22894673.574477/135‑1 (MQ=40)
GNCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCGCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcg > SRR22894673.3012485/1‑140 (MQ=51)
TCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAAC < SRR22894673.3457699/151‑1 (MQ=60)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTCCCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgttt > SRR22894673.1101537/1‑136 (MQ=60)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATAtgttcc > SRR22894673.1476948/1‑79 (MQ=60)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATAtg < SRR22894673.2859707/81‑3 (MQ=60)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAAC > SRR22894673.3631514/1‑96 (MQ=39)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccggtttgtagcgttt > SRR22894673.2441895/1‑127 (MQ=34)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCGG > SRR22894673.158537/1‑138 (MQ=33)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTT > SRR22894673.3495977/1‑131 (MQ=33)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGT > SRR22894673.2583683/1‑151 (MQ=60)
GACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGC > SRR22894673.2021601/1‑96 (MQ=60)
TCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATAC > SRR22894673.1202803/1‑76 (MQ=60)
CTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATAC > SRR22894673.2061360/1‑42 (MQ=60)
TTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTG < SRR22894673.2206479/151‑1 (MQ=60)
ATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggt > SRR22894673.1357458/1‑125 (MQ=32)
ATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccggtttgtagcgtttctccttctcgg < SRR22894673.796691/150‑35 (MQ=16)
ATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccggtttgtagcgt < SRR22894673.883644/137‑22 (MQ=16)
ATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTagttaaaccgggttgtagcgtttctccttctcggt > SRR22894673.2877086/1‑116 (MQ=16)
ATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACC < SRR22894673.2066020/125‑1 (MQ=15)
TCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGAGTTTCTACCAGCTGATATGCTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTT < SRR22894673.2112540/119‑1 (MQ=13)
CTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACGAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttc < SRR22894673.3810264/151‑29 (MQ=60)
CTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttc < SRR22894673.714624/151‑29 (MQ=28)
GATTGGTGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTT < SRR22894673.3177336/109‑1 (MQ=14)
TGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttctgtaactcaaaaac < SRR22894673.842269/150‑43 (MQ=5)
TGTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttctgtaactcaaaaac < SRR22894673.862015/150‑43 (MQ=5)
GTCGCATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttctgtaactc < SRR22894673.1565624/143‑37 (MQ=5)
ATCTAATTCATACCCTATTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATATGTTCCTGGTGCTAAACCGTCAATTGCCAGTTTTCCATCTTCTCCTGTAGTTAGACCggtttgtagcgtttctccttctcggttctgtaactcaaaaacagctc > SRR22894673.529139/1‑102 (MQ=5)
ATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTC > SRR22894673.1172718/1‑149 (MQ=54)
TCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTT < SRR22894673.1147399/151‑1 (MQ=54)
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TAACTCAAAAACAGCTCCTTGCAGGACTTCTCCGCTTTGGTCATCGATCTTTGTCAACACGACACCGCCTGGTGTAAGTCGATTTTCTTTCGTCAATTCTACCACCGCTGTCTGACTTCTTTCGATCTCAAACTCGATTGGTGTCGCATCCAATTCATACCCCGTTGGCGCTTGGGTTTCTACCAGCTGATACACTCCTGGTGCTAAGCCGTCAATCGCCAGTTTTCCATCTGCTCCTGTGGTTAGACCTGACTGCAGAACGGTTCCATTGGCATCTTGTAACTCAAAAACAGCTCCTTGC > AssemblyC74_contig_12/59032‑59332
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
