Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,181,645 |
A→G |
71.7% |
N83N (AAT→AAC) |
yehA ← |
putative fimbrial‑like adhesin protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,181,645 | 0 | A | G | 71.7%
| 340.8
/ 161.8
| 194 | N83N (AAT→AAC) | yehA | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/30); new base G (59/80); total (84/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
AATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTG > CP009273/2181498‑2181791
|
aaTCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagtt > 2:1277600/1‑150 (MQ=255)
tcatcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAaattta < 2:4328830/150‑1 (MQ=255)
atcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCACAATGTAagttgaat > 2:2315373/1‑150 (MQ=255)
atcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagtttaat > 1:2000780/1‑150 (MQ=255)
aCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAAtttt > 2:1487187/1‑150 (MQ=255)
aCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAAtttt < 2:631395/150‑1 (MQ=255)
gAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATg > 2:4167944/1‑150 (MQ=255)
cgccgcCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTAt < 1:909201/150‑1 (MQ=255)
cgccgcCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTAt > 1:1470020/1‑150 (MQ=255)
gccgccCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATc < 1:3359078/150‑1 (MQ=255)
ccccGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATTGTATAGTtata > 1:3972657/1‑150 (MQ=255)
cGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAg > 2:76825/1‑150 (MQ=255)
cAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTc < 1:1808562/150‑1 (MQ=255)
aaCATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaac < 1:676745/150‑1 (MQ=255)
aaCATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaac > 1:2674145/1‑150 (MQ=255)
cATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaacaa > 2:26901/1‑150 (MQ=255)
aTTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaat < 1:1406499/150‑1 (MQ=255)
aTTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaat > 1:1052515/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAataata > 1:1748997/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAataata > 1:1748705/1‑150 (MQ=255)
aCTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAataata < 1:4439108/150‑1 (MQ=255)
cTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAatat < 2:2885404/150‑1 (MQ=255)
cTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAatat < 2:3667159/150‑1 (MQ=255)
ttttGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTTATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATc < 2:3175036/150‑1 (MQ=255)
ttttGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATc < 2:4360600/150‑1 (MQ=255)
tttGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATcc < 1:1764706/150‑1 (MQ=255)
cATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACg > 1:2149483/1‑150 (MQ=255)
aTTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACgg < 1:2439662/150‑1 (MQ=255)
ttACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACggg > 2:2841702/1‑150 (MQ=255)
ttACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACggg > 2:1279473/1‑150 (MQ=255)
tACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGc < 2:3917195/150‑1 (MQ=255)
cTGTCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGTTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTc < 1:3103096/150‑1 (MQ=255)
ggCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCAt < 1:1689540/150‑1 (MQ=255)
ggTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTg > 2:2427436/1‑150 (MQ=255)
ggTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTg < 1:3458557/150‑1 (MQ=255)
gtgtCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa < 2:2449385/150‑1 (MQ=255)
gtgtCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGa < 2:2448672/150‑1 (MQ=255)
tCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAg < 1:1973863/150‑1 (MQ=255)
cACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGt < 2:1521350/150‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTa > 1:775899/1‑150 (MQ=255)
aCCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTa < 2:2986352/150‑1 (MQ=255)
ccGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTAt > 2:4033032/1‑150 (MQ=255)
ccGTAACTGAAGAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTAt < 2:1640133/150‑1 (MQ=255)
cGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTAtt > 1:3869403/1‑150 (MQ=255)
aCTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTa < 1:2723310/150‑1 (MQ=255)
cTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTAc > 1:1335157/1‑150 (MQ=255)
aaTAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTa < 1:1040348/150‑1 (MQ=255)
ccACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCAt < 1:26901/150‑1 (MQ=255)
aCTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGa < 2:2003297/150‑1 (MQ=255)
tGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCATAATGTAAATTTTATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATTGTATTTGTACTTACGCATGACg < 1:4149499/150‑1 (MQ=255)
tGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACg < 1:3511804/150‑1 (MQ=255)
tGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAt < 2:203319/150‑1 (MQ=255)
gAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATc > 2:3998087/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCa > 1:69393/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCa > 1:3073416/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTCTCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTTCTTGCGCCGGTCGATTCAtg > 1:2787839/1‑149 (MQ=255)
tGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTaa > 1:4516442/1‑150 (MQ=255)
tGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTaa > 2:45065/1‑150 (MQ=255)
cTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAAtt > 1:1048128/1‑150 (MQ=255)
tGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTa > 2:4200132/1‑150 (MQ=255)
gATTATTTGACACCGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTAt < 2:543422/150‑1 (MQ=255)
gATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTAt < 2:178287/150‑1 (MQ=255)
attattTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATg < 2:1708515/150‑1 (MQ=255)
attattTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATg > 2:3903592/1‑150 (MQ=255)
tGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCata > 2:1545945/1‑150 (MQ=255)
cAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGt < 1:1615242/150‑1 (MQ=255)
cAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGt < 1:1198641/150‑1 (MQ=255)
cAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGt > 1:1496969/1‑150 (MQ=255)
aCGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCg < 1:1118632/150‑1 (MQ=255)
cGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGc > 2:3431673/1‑150 (MQ=255)
gTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGcc < 2:1165284/150‑1 (MQ=255)
gTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGcc < 1:2299927/150‑1 (MQ=255)
gTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGcc < 1:3608772/150‑1 (MQ=255)
tGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCa > 1:3399862/1‑150 (MQ=255)
gATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATCATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACACATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCAt < 2:3959816/150‑1 (MQ=255)
aTGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCAtt > 1:2930601/1‑150 (MQ=255)
tgttgtTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCAttt > 2:851815/1‑150 (MQ=255)
tgttgtTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCAttt > 2:1388137/1‑150 (MQ=255)
tgttgtTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCAttt > 1:3292164/1‑150 (MQ=255)
gttgttTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTtg > 1:2314407/1‑150 (MQ=255)
gttgttTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTtg < 1:3726585/150‑1 (MQ=255)
tgttTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTtgtg < 2:1998413/150‑1 (MQ=255)
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gttTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTgtgt < 2:482620/150‑1 (MQ=255)
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GAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATC > SRR19973080.3211438/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA > SRR19973080.70061/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA > SRR19973080.70076/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA < SRR19973080.3429368/150‑1 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA > SRR19973080.3090167/1‑150 (MQ=60)
ACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTCTCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTtcttgcgccggtcgattcatg > SRR19973080.2803219/1‑129 (MQ=60)
ACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATT > SRR19973080.2803119/1‑150 (MQ=60)
TGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAA > SRR19973080.4540798/1‑150 (MQ=60)
CTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATT > SRR19973080.1054296/1‑150 (MQ=60)
TGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATA < SRR19973080.269654/150‑1 (MQ=60)
GACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATAT < SRR19973080.1285331/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT < SRR19973080.1205866/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT < SRR19973080.1205844/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT < SRR19973080.1624690/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGTTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT < SRR19973080.3916655/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT > SRR19973080.1505487/1‑150 (MQ=60)
ACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCG < SRR19973080.3480212/150‑1 (MQ=60)
ACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCG < SRR19973080.1125025/150‑1 (MQ=60)
CGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGC > SRR19973080.686479/1‑150 (MQ=60)
GTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCC < SRR19973080.2312640/150‑1 (MQ=60)
GTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCC > SRR19973080.1843509/1‑150 (MQ=60)
GTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCC < SRR19973080.3628726/150‑1 (MQ=60)
TGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCA > SRR19973080.3418235/1‑150 (MQ=60)
TGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCA < SRR19973080.2654467/150‑1 (MQ=60)
ATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATT > SRR19973080.2946538/1‑150 (MQ=60)
TGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTT > SRR19973080.3310216/1‑150 (MQ=60)
GTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTG > SRR19973080.2327239/1‑150 (MQ=60)
GTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTG > SRR19973080.2324478/1‑150 (MQ=60)
GTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTG < SRR19973080.3746986/150‑1 (MQ=60)
GTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTG < SRR19973080.4015047/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTT < SRR19973080.1892365/150‑1 (MQ=60)
TTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTT < SRR19973080.1892496/150‑1 (MQ=60)
TTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTT < SRR19973080.3617734/150‑1 (MQ=60)
TTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGA < SRR19973080.4501791/150‑1 (MQ=60)
GTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGT < SRR19973080.1259912/150‑1 (MQ=60)
AAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATC > SRR19973080.3345763/1‑150 (MQ=60)
AAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCC < SRR19973080.4494321/150‑1 (MQ=60)
GTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCT < SRR19973080.2524816/150‑1 (MQ=60)
GTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCT < SRR19973080.248307/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTG > SRR19973080.990405/1‑150 (MQ=60)
|
TTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTG > CP009273/2181496‑2181791
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
