Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,181,645 |
A→G |
100% |
N83N (AAT→AAC) |
yehA ← |
putative fimbrial‑like adhesin protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,181,645 | 0 | A | G | 100.0%
| 870.7
/ NA
| 215 | N83N (AAT→AAC) | yehA | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (100/115); total (100/115) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCC > CP009273/2181500‑2181788
|
catcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagttt > 2:3331498/1‑148 (MQ=255)
atcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagttta < 1:1275888/148‑1 (MQ=255)
atcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagttta > 2:1444206/1‑148 (MQ=255)
atcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCAATTTTTCATTACTGGCAGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTTATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagttta < 2:2893662/148‑1 (MQ=255)
tcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTTCTGGCCGCAGGTTTCACCGTAAGTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTTTTGGTACATTAAATATGTAagtttaa < 2:1395358/148‑1 (MQ=255)
tcaCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagtttaa < 1:2715394/148‑1 (MQ=255)
caCTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagtttaat > 1:255857/1‑148 (MQ=255)
cTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAagtttaattt > 2:1117961/1‑148 (MQ=255)
tGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAAtttt < 1:2331239/148‑1 (MQ=255)
aaCCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTAt < 1:3432752/148‑1 (MQ=255)
aCCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATg > 1:2424336/1‑148 (MQ=255)
gccgccCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTa < 2:2034276/148‑1 (MQ=255)
gccgccCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTa < 1:642154/148‑1 (MQ=255)
ccgccCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTAt > 2:2111290/1‑148 (MQ=255)
cccccGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGtt < 2:1088264/148‑1 (MQ=255)
cccccGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGtt < 2:2724611/148‑1 (MQ=255)
ccccGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTta < 1:2545891/148‑1 (MQ=255)
cGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATaa > 1:100603/1‑148 (MQ=255)
gCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATaaa > 1:1685615/1‑148 (MQ=255)
aGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGt > 2:2553075/1‑148 (MQ=255)
aGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGt > 2:2359351/1‑148 (MQ=255)
aaCATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCca < 2:773601/148‑1 (MQ=255)
aCATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaa > 1:1925722/1‑148 (MQ=255)
cATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaac > 2:3462000/1‑148 (MQ=255)
aTTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaaca < 2:1668878/148‑1 (MQ=255)
ttCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaacaa > 2:593026/1‑148 (MQ=255)
ttCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCcaacaa > 2:2909340/1‑148 (MQ=255)
cTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaataat > 1:1211078/1‑148 (MQ=255)
cTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACaataat < 2:2696747/148‑1 (MQ=255)
ttttGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAataata < 2:3221707/148‑1 (MQ=255)
ttGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATc > 2:313434/1‑148 (MQ=255)
cATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGa < 1:3331498/148‑1 (MQ=255)
aTTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGAc < 1:2411964/148‑1 (MQ=255)
ggCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTc > 2:2239627/1‑148 (MQ=255)
gCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAg > 1:3281102/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAggg > 2:2588898/1‑148 (MQ=255)
aGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAggg < 1:3247052/148‑1 (MQ=255)
ggTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAgggg > 1:3341887/1‑148 (MQ=255)
gtgtCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGt > 2:3287682/1‑148 (MQ=255)
gtgtCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGt < 2:625203/148‑1 (MQ=255)
tCACCGTAACTGAATAACCACGGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGAt < 2:972260/148‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAg < 1:886558/148‑1 (MQ=255)
aCCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAg < 1:886799/148‑1 (MQ=255)
ccGTAACTTCAGACCCACTGGTGAATCTGGTGTGATTATTTGACAACGTGTTGTTGTTTTTATTGGTCCATTCATAATGTAAGTTTAATTTGATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGt < 1:1845406/148‑1 (MQ=255)
ccGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACTTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGt < 2:1563872/148‑1 (MQ=255)
aCTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTg > 2:2273111/1‑148 (MQ=255)
aCTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTg < 2:1167508/148‑1 (MQ=255)
tGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTa < 2:180955/148‑1 (MQ=255)
gAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTAc < 1:3513101/148‑1 (MQ=255)
aTAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACtt < 2:92023/148‑1 (MQ=255)
tAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTa < 2:2711845/148‑1 (MQ=255)
aaCCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTAc > 1:1715284/1‑148 (MQ=255)
cTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATg > 1:1159360/1‑148 (MQ=255)
cTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATg < 2:1837469/148‑1 (MQ=255)
cTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATg < 1:1469638/148‑1 (MQ=255)
tGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGa < 2:855296/148‑1 (MQ=255)
tGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGa < 2:855337/148‑1 (MQ=255)
tGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATACGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTAAGCATGa > 1:2468822/1‑148 (MQ=255)
tGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGa > 2:2508117/1‑148 (MQ=255)
tGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGa < 2:2437768/148‑1 (MQ=255)
gAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGaa > 1:1996486/1‑148 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAt < 1:3226330/148‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAt < 2:336352/148‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAt < 1:1410236/148‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAt > 1:3233269/1‑148 (MQ=255)
aCTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCa < 2:3528285/148‑1 (MQ=255)
cTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCAt < 2:3205297/148‑1 (MQ=255)
tGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCAtt < 1:623958/148‑1 (MQ=255)
ggTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTa < 2:917054/148‑1 (MQ=255)
ggTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTa < 2:1649051/148‑1 (MQ=255)
gATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAAtt < 1:1235372/148‑1 (MQ=255)
gATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAAtt > 1:2203197/1‑148 (MQ=255)
attattTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTa > 1:1093332/1‑148 (MQ=255)
attTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGc > 1:2964663/1‑148 (MQ=255)
ttGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTc > 1:512787/1‑148 (MQ=255)
ttGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTc > 2:296617/1‑148 (MQ=255)
ttGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTc > 1:2902708/1‑148 (MQ=255)
tGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCa < 1:3534553/148‑1 (MQ=255)
aCAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCata < 1:315684/148‑1 (MQ=255)
aaCGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCATAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATg < 2:3051690/148‑1 (MQ=255)
aCGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGt > 1:3132277/1‑148 (MQ=255)
cGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTc > 1:724202/1‑148 (MQ=255)
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gTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCg > 1:265309/1‑148 (MQ=255)
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ACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGA > SRR19973067.2484733/1‑150 (MQ=60)
ACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATACGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTAAGCATGA > SRR19973067.2485053/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGAC < SRR19973067.1479397/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGAC < SRR19973067.1479431/150‑1 (MQ=60)
GTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAA > SRR19973067.2009966/1‑150 (MQ=60)
TGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAT > SRR19973067.3252704/1‑150 (MQ=60)
TGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAAT > SRR19973067.3253557/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA < SRR19973067.3246593/150‑1 (MQ=60)
AAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCA < SRR19973067.1419785/150‑1 (MQ=60)
TGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAA < SRR19973067.628080/150‑1 (MQ=60)
CTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATT > SRR19973067.2217892/1‑150 (MQ=60)
TGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTA > SRR19973067.1100793/1‑150 (MQ=60)
GATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTAT < SRR19973067.1243371/150‑1 (MQ=60)
GATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTAT < SRR19973067.1243660/150‑1 (MQ=60)
ATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATG > SRR19973067.1809908/1‑150 (MQ=60)
TTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGC > SRR19973067.2983386/1‑150 (MQ=60)
TTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGC < SRR19973067.578102/150‑1 (MQ=60)
TTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGC > SRR19973067.1266174/1‑150 (MQ=60)
ATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTC > SRR19973067.2921216/1‑150 (MQ=60)
ATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTC > SRR19973067.516277/1‑150 (MQ=60)
ATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTC > SRR19973067.2687011/1‑150 (MQ=60)
TGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATA < SRR19973067.3556893/150‑1 (MQ=60)
TGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATA < SRR19973067.3556719/150‑1 (MQ=60)
GACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATAT > SRR19973067.1784439/1‑150 (MQ=60)
GACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATAT > SRR19973067.338887/1‑150 (MQ=60)
GACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCAAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATAT > SRR19973067.338884/1‑150 (MQ=60)
ACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATG < SRR19973067.317803/150‑1 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGT > SRR19973067.3152179/1‑150 (MQ=60)
CAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGATCATATGT > SRR19973067.3015370/1‑150 (MQ=60)
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AACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTC > SRR19973067.729236/1‑150 (MQ=60)
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ACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCG > SRR19973067.267118/1‑150 (MQ=60)
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TGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTT < SRR19973067.437948/150‑1 (MQ=60)
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AATGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCC > SRR19973067.3273102/1‑150 (MQ=60)
TGTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCC < SRR19973067.2374732/150‑1 (MQ=60)
GTAAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCT > SRR19973067.1033903/1‑150 (MQ=60)
AAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGA > SRR19973067.2785103/1‑150 (MQ=60)
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AAGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGA > SRR19973067.2785107/1‑150 (MQ=60)
AGTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGAA > SRR19973067.3132550/1‑150 (MQ=60)
GTTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGAAC > SRR19973067.2377763/1‑150 (MQ=60)
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TTAATCATCACTGAACCGCCGCCCCCCGCAGAAACATTCACTTTTGCATTACTGGCCGCAGGTGTCACCGTAACTGAATAACCACTGGTGAAACTGGTCTGATTATTTGACAACGTGATGTTGTTTTTATTGGTCCATTCAAAATGTAAATTTAATTTTATGGTATCGTTATAAAGTCCAACAATAATATCCGACGGGCTCATAGGGGTGATAGTATTTGTACTTACGCATGACGAATCATTAAAATTATGCTCATATGTCGCCATTTGTGTTTGAGTAAGTGCAAAATCCCCCTGAAC > CP009273/2181496‑2181794
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
