Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,993,699 |
C→A |
88.4% |
intergenic (‑449/‑5) |
ygeR ← / → xdhA |
LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,993,699 | 0 | C | A | 88.4%
| 652.3
/ 78.8
| 234 | intergenic (‑449/‑5) | ygeR/xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/21); new base A (87/119); total (94/140) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.92e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.72e-01 |
Only 100 of 244 total aligned reads displayed.
GTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAGAA > CP009273/2993552‑2993848
|
gTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATTTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGaataat > 2:146715/1‑150 (MQ=255)
tcatcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatg < 1:1282958/150‑1 (MQ=255)
tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAAACTTGCCTGCTTATACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATAGAGGGGATTTCTATTGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgcat > 1:1396652/1‑150 (MQ=255)
acTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTTCCTGCTTATACTAAATCTTTTCCATAAGAAACAAATGTTGAAATAGTGGGGTTTTGTATTGTAGCGCGGGGAGCAACCGCTACGGGTGAATTATTCATgcgc > 1:2890116/1‑150 (MQ=255)
tACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAt < 1:4319836/150‑1 (MQ=255)
aCCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATg < 1:3129210/150‑1 (MQ=255)
cTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGcc < 2:512799/150‑1 (MQ=255)
ccccTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAt < 2:2138632/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTa < 2:4304946/150‑1 (MQ=255)
aCGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTATACTAAATATTTTCCAAAAGAACCAAATGTTAAAATAGAGGGGATTTATATGGAATCGCGGGAAGCAACCGCAAAGGGTGAATAATTCAAGCGCGTCGATGCCATTGCTaa > 1:4158725/1‑150 (MQ=255)
aCGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGCAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCCATGCTaa > 2:4247781/1‑150 (MQ=255)
ttATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTc < 2:2137168/150‑1 (MQ=255)
ttATCGTCGTTTCTGGCGTAAATAATGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCAAAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCAACGGGTGAATCATGCATGCGCGTAGATGCCATTGCTAAGGTc > 2:1797662/1‑150 (MQ=255)
aTCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAc < 1:2051927/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAcc < 1:3282864/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAcc < 1:56603/150‑1 (MQ=255)
cgtcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcg < 1:586964/150‑1 (MQ=255)
tcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcggg > 2:2531608/1‑150 (MQ=255)
cgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggc < 2:3453178/150‑1 (MQ=255)
gtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg > 1:543021/1‑150 (MQ=255)
gtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg > 2:728625/1‑150 (MQ=255)
gtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATAGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcg > 2:4472918/1‑150 (MQ=255)
tCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCgggcgggc < 2:3633176/150‑1 (MQ=255)
tGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCAc > 2:3222014/1‑150 (MQ=255)
ggCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACg < 1:848530/150‑1 (MQ=255)
cGTAAATCTGGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat < 2:3565738/150‑1 (MQ=255)
gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata > 1:2341082/1‑150 (MQ=255)
aaaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAtata < 1:3563489/150‑1 (MQ=255)
ttGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGAc > 1:3744916/1‑150 (MQ=255)
tGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACg < 2:2032836/150‑1 (MQ=255)
ccTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt < 2:4432064/150‑1 (MQ=255)
cTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtt < 1:1410236/150‑1 (MQ=255)
tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 1:4535922/150‑1 (MQ=255)
tGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 1:472139/150‑1 (MQ=255)
gCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat < 2:2872879/150‑1 (MQ=255)
gCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat < 2:4167613/150‑1 (MQ=255)
gCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat > 1:2683833/1‑150 (MQ=255)
ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgt < 2:2237170/150‑1 (MQ=255)
tAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt < 2:2921930/150‑1 (MQ=255)
aGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtta > 2:3801585/1‑150 (MQ=255)
cTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATgg < 2:3671903/150‑1 (MQ=255)
aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCg > 1:3175316/1‑150 (MQ=255)
aaaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCg < 1:1461170/150‑1 (MQ=255)
aaTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCgg > 2:306366/1‑150 (MQ=255)
cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCa < 2:662944/150‑1 (MQ=255)
tttGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAt > 1:647604/1‑150 (MQ=255)
tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt > 2:4299275/1‑150 (MQ=255)
tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt > 2:3305236/1‑150 (MQ=255)
tGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt < 2:1082532/150‑1 (MQ=255)
ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt > 1:2733542/1‑150 (MQ=255)
ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATgtgt > 1:2115847/1‑150 (MQ=255)
cATAAGAACCAACTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt < 2:1737696/150‑1 (MQ=255)
aTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa < 1:1128915/150‑1 (MQ=255)
aTAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGAACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTa < 1:1007533/150‑1 (MQ=255)
gAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCg > 1:4274048/1‑150 (MQ=255)
aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 1:2428672/1‑150 (MQ=255)
aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 2:1820355/1‑150 (MQ=255)
aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 2:2117204/150‑1 (MQ=255)
aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 1:3599459/1‑150 (MQ=255)
aaaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAata > 1:1489225/1‑150 (MQ=255)
aTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATg < 2:692373/150‑1 (MQ=255)
tGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGt > 1:2169857/1‑150 (MQ=255)
tGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGt > 1:2683614/1‑150 (MQ=255)
gTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTa < 2:1369535/150‑1 (MQ=255)
ttCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAc < 2:2939455/150‑1 (MQ=255)
cAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGt > 1:522912/1‑150 (MQ=255)
aaaTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTa < 2:2854276/150‑1 (MQ=255)
aTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGc > 2:2330079/1‑150 (MQ=255)
tCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGcc < 2:2880970/150‑1 (MQ=255)
tCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGcc > 1:3621537/1‑150 (MQ=255)
tCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGcc < 1:4363973/150‑1 (MQ=255)
aGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa > 1:880879/1‑150 (MQ=255)
aGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa < 2:1225279/150‑1 (MQ=255)
aGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa > 1:3057838/1‑150 (MQ=255)
ggggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTAt < 2:78771/150‑1 (MQ=255)
tttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGcac < 2:3880210/150‑1 (MQ=255)
ttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGcaca < 1:2635290/150‑1 (MQ=255)
tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg < 2:2701944/150‑1 (MQ=255)
tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg < 1:749721/150‑1 (MQ=255)
tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg > 2:127938/1‑150 (MQ=255)
tGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGtt > 2:4360346/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTa > 2:4122054/1‑150 (MQ=255)
ggAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTa < 2:3674511/150‑1 (MQ=255)
ggAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCAGGCGCGTCGAGGCCAGTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTa < 2:3251905/150‑1 (MQ=255)
aGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc > 2:1031279/1‑150 (MQ=255)
cgcgGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCg < 2:1520746/150‑1 (MQ=255)
cgGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa < 2:1219006/150‑1 (MQ=255)
gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa < 1:2512846/150‑1 (MQ=255)
gggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 1:3985046/1‑150 (MQ=255)
aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAt > 1:919054/1‑150 (MQ=255)
aGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAt < 1:631411/150‑1 (MQ=255)
cAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa < 1:1755080/150‑1 (MQ=255)
gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgat < 2:245434/150‑1 (MQ=255)
cTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg < 1:1635962/150‑1 (MQ=255)
cTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg < 1:4136932/150‑1 (MQ=255)
cTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg > 1:339551/1‑150 (MQ=255)
cTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatgatg > 2:3139083/1‑150 (MQ=255)
cGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAAc > 2:1635684/1‑150 (MQ=255)
tGAATACTGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGc < 2:3500291/150‑1 (MQ=255)
gAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGcc < 1:554429/150‑1 (MQ=255)
|
GTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAGAA > CP009273/2993552‑2993848
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC > CP009273/2993552‑2993844
|
GTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCGTAGACTAAATCTTTTCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAAT > SRR19973080.2135702/1‑150 (MQ=60)
TCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATG < SRR19973080.1290716/150‑1 (MQ=60)
ATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGGGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCA > SRR19973080.2646553/1‑150 (MQ=60)
TCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAAACTTGCCTGCTTATACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATAGAGGGGATTTCTATTGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCAT > SRR19973080.1404943/1‑150 (MQ=60)
CACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTAAAATAGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATG > SRR19973080.4477929/1‑150 (MQ=60)
CACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGCCGGCGTAGACTAAATAATTGCCATAAGAACCAAATGTTAAAATCGAGGGGATTTCTTTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCG > SRR19973080.1037493/1‑150 (MQ=60)
ACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTTCCTGCTTATACTAAATCTTTTCCATAAGAAACAAATGTTGAAATAGTGGGGTTTTGTATTGTAGCGCGGGGAGCAACCGCTACGGGTGAATTATTCATGCGC > SRR19973080.2905903/1‑150 (MQ=60)
ACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTATATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGC > SRR19973080.704925/1‑150 (MQ=60)
CTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCG < SRR19973080.436338/150‑1 (MQ=60)
CTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAAACTTGCCTGCTTATACTAAATATTTGCCATAAGAACCAAATGTTAAAATAGAGGGGCTTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCCCTACGGGTGAAAAATGCATTCGCG > SRR19973080.640247/1‑150 (MQ=60)
TACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAT < SRR19973080.4343341/150‑1 (MQ=60)
TACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAT < SRR19973080.4343435/150‑1 (MQ=60)
ACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATG < SRR19973080.3146435/150‑1 (MQ=60)
ACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATG < SRR19973080.3146413/150‑1 (MQ=60)
CCCCTAACGCTTATCGTCGTTTATTGCGTAAATATTGCCTGCTTAGACTAAATATTTTCCATAATAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTGTTTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGGGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCAT > SRR19973080.121131/1‑150 (MQ=60)
CCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTGGCGTAAATATTGCCTGCTTAGTCTAAATCATTGCCATAAGAAACAAAATTTCAAATCGAGGGGTTTTCTATGGAAGCGCGGGTAGCAAACGCTACGGGTTTATAATGCATTCGCGTCGATTCCATT > SRR19973080.1264453/1‑150 (MQ=60)
ACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTATACTAAATATTTTCCAAAAGAACCAAATGTTAAAATAGAGGGGATTTATATGGAATCGCGGGAAGCAACCGCAAAGGGTGAATAATTCAAGCGCGTCGATGCCATTGCTAA > SRR19973080.4181167/1‑150 (MQ=60)
CTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGT < SRR19973080.374690/150‑1 (MQ=60)
ATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAC < SRR19973080.2063575/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACC < SRR19973080.3300890/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACC < SRR19973080.3300889/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACC < SRR19973080.3300882/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACC < SRR19973080.57159/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACC < SRR19973080.498788/150‑1 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG < SRR19973080.555300/150‑1 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG < SRR19973080.590617/150‑1 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGCCAGCTTATACTAAAACTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATTGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG > SRR19973080.528693/1‑150 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCATAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG < SRR19973080.590561/150‑1 (MQ=60)
CGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGC > SRR19973080.863366/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCG > SRR19973080.546480/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCG > SRR19973080.55031/1‑150 (MQ=60)
GTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCG > SRR19973080.2823347/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCAC > SRR19973080.792893/1‑150 (MQ=60)
TGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCAC > SRR19973080.1328451/1‑150 (MQ=60)
GGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACG > SRR19973080.3791750/1‑150 (MQ=60)
GGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACG < SRR19973080.853657/150‑1 (MQ=60)
GTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATA > SRR19973080.2354093/1‑150 (MQ=60)
TAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATAT < SRR19973080.4162263/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATA < SRR19973080.3583235/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATA < SRR19973080.3583197/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACT < SRR19973080.22924/150‑1 (MQ=60)
TCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTG < SRR19973080.4069617/150‑1 (MQ=60)
TTGCTTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGAC < SRR19973080.4464887/150‑1 (MQ=60)
TTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGAC > SRR19973080.3765375/1‑150 (MQ=60)
GCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGA > SRR19973080.3182564/1‑150 (MQ=60)
CCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAT < SRR19973080.3554309/150‑1 (MQ=60)
CTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATT < SRR19973080.1419668/150‑1 (MQ=60)
CTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATT < SRR19973080.1418565/150‑1 (MQ=60)
CTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATT < SRR19973080.1417952/150‑1 (MQ=60)
TGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973080.475137/150‑1 (MQ=60)
TGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973080.2993519/150‑1 (MQ=60)
TGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973080.4560334/150‑1 (MQ=60)
TGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973080.4560490/150‑1 (MQ=60)
GCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTAT > SRR19973080.2698439/1‑150 (MQ=60)
GCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTAT > SRR19973080.2698470/1‑150 (MQ=60)
GCTTAGACTAAATATTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATTGAAGCGCGGGAATCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTTCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTAT > SRR19973080.4287941/1‑150 (MQ=60)
CTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGG > SRR19973080.626672/1‑150 (MQ=60)
TAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGC < SRR19973080.917787/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCG > SRR19973080.3192833/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCG < SRR19973080.1469547/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCG < SRR19973080.1469612/150‑1 (MQ=60)
ATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGG > SRR19973080.2890577/1‑150 (MQ=60)
TTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAT > SRR19973080.651518/1‑150 (MQ=60)
TGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGT < SRR19973080.861677/150‑1 (MQ=60)
TGACATAAGAACCATATTTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGT < SRR19973080.3137236/150‑1 (MQ=60)
CCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGT > SRR19973080.2127789/1‑150 (MQ=60)
CCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGT < SRR19973080.161211/150‑1 (MQ=60)
CCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGT > SRR19973080.2748571/1‑150 (MQ=60)
CATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTT > SRR19973080.2493561/1‑150 (MQ=60)
ATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTA < SRR19973080.1135462/150‑1 (MQ=60)
ATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGAACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTA < SRR19973080.1013559/150‑1 (MQ=60)
TAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAT < SRR19973080.3362231/150‑1 (MQ=60)
AAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATG < SRR19973080.1364194/150‑1 (MQ=60)
GAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCG > SRR19973080.427824/1‑150 (MQ=60)
GAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCG > SRR19973080.4297379/1‑150 (MQ=60)
ACCAAATGTTCAAATCGAGGTGATTTCTATGGACGCGCGGGAAGCAACCGCTACGCGAGAATAATGAATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAAAGTGCGTGCACGATATAATGACTATTATGTTATTGAGGGCATGTGTTATGCTAA > SRR19973080.3620390/1‑150 (MQ=60)
ACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAA > SRR19973080.3619351/1‑150 (MQ=60)
ACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAA > SRR19973080.2442142/1‑150 (MQ=60)
AAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATA > SRR19973080.1497452/1‑150 (MQ=60)
AAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATA > SRR19973080.1497728/1‑150 (MQ=60)
TGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGT > SRR19973080.2181964/1‑150 (MQ=60)
TGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGT > SRR19973080.2698248/1‑150 (MQ=60)
TCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACG < SRR19973080.1882370/150‑1 (MQ=60)
TCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACG > SRR19973080.1523501/1‑150 (MQ=60)
CAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGT > SRR19973080.526249/1‑150 (MQ=60)
TCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCC < SRR19973080.4387778/150‑1 (MQ=60)
TCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCC > SRR19973080.3641556/1‑150 (MQ=60)
CGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCC > SRR19973080.5622/1‑150 (MQ=60)
AGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTA > SRR19973080.886275/1‑150 (MQ=60)
AGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTA > SRR19973080.3074438/1‑150 (MQ=60)
TTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACA < SRR19973080.2649531/150‑1 (MQ=60)
TTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACA < SRR19973080.2650976/150‑1 (MQ=60)
TTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACA < SRR19973080.2261010/150‑1 (MQ=60)
TATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGG < SRR19973080.753966/150‑1 (MQ=60)
TATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGG < SRR19973080.753437/150‑1 (MQ=60)
GGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTA > SRR19973080.2066144/1‑150 (MQ=60)
GAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTAT < SRR19973080.3443788/150‑1 (MQ=60)
AGCGCGGGACGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCAGGCGCGTCGATGCCAGTGCTACGGTCACCGGGCGGGCACGATATCCGGACGATTCTGTTATGGCGGGCAGGTGTTATGCGAACTATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGC > SRR19973080.2708299/1‑150 (MQ=60)
GCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCC < SRR19973080.3725354/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA > SRR19973080.4006996/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA > SRR19973080.4006967/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA < SRR19973080.2526672/150‑1 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA < SRR19973080.2526688/150‑1 (MQ=60)
AGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAT > SRR19973080.924679/1‑150 (MQ=60)
AGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTAT < SRR19973080.635266/150‑1 (MQ=60)
CAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTA > SRR19973080.518287/1‑150 (MQ=60)
CAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTA < SRR19973080.1765196/150‑1 (MQ=60)
CGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGA < SRR19973080.2377971/150‑1 (MQ=60)
CTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATG < SRR19973080.1645684/150‑1 (MQ=60)
CTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATG < SRR19973080.1645548/150‑1 (MQ=60)
CTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATG > SRR19973080.341590/1‑150 (MQ=60)
CTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATG < SRR19973080.4159318/150‑1 (MQ=60)
CGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAAC < SRR19973080.2695987/150‑1 (MQ=60)
GAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC > SRR19973080.208063/1‑150 (MQ=60)
GAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC < SRR19973080.557934/150‑1 (MQ=60)
|
GTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCC > CP009273/2993552‑2993844
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |