Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,993,699 |
C→A |
100% |
intergenic (‑449/‑5) |
ygeR ← / → xdhA |
LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,993,699 | 0 | C | A | 98.0%
| 626.1
/ 3.3
| 196 | intergenic (‑449/‑5) | ygeR/xdhA | LysM domain‑containing M23 family putative peptidase; septation lipoprotein/xanthine dehydrogenase, molybdenum binding subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/0); new base A (92/100); total (96/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.83e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 212 total aligned reads displayed.
CATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAG > CP009273/2993554‑2993842
|
tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAATAACCAAATTTTAAAATCGAGGGGATTTCTATGGACGGGCGGGAAGCAACCGCTACGGGGGAATaatgc > 2:280747/1‑148 (MQ=255)
tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc < 1:143734/148‑1 (MQ=255)
tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc > 2:2505935/1‑148 (MQ=255)
tcaCACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgc < 2:1919359/148‑1 (MQ=255)
cacaCTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTGGCGGTAATATTGCCTGCTTAGACTAAATATTTTCCATAAGAAACAAATTTTAAAATCGGGGGGCTTTATATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgca > 1:61711/1‑148 (MQ=255)
cacaCTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgca > 1:1833818/1‑148 (MQ=255)
cacaCTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATaatgca < 2:2219706/148‑1 (MQ=255)
cacTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGGCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAATAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTTTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGTATaatgcatg > 1:2415960/1‑148 (MQ=255)
tCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTTCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGcgcg > 2:1547881/1‑148 (MQ=255)
tCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCCAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGcgcg > 2:598970/1‑148 (MQ=255)
cTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATg < 1:2703133/148‑1 (MQ=255)
tCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGCCTGCTTAGCCTAAATCTTTGCCATAATAAACAAAAGTTCAAATGGAGGGGATTTGTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACCGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGc > 2:8794/1‑148 (MQ=255)
cTTATCGTCGTTTCAGGCGTAAATCTTTCCTGCTTAGACGAAATCTTTGCCATAATAACCAAATGTTCAAAACGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATTCGCGTCGATGCCATTGCTAAg > 2:3041500/1‑148 (MQ=255)
cgtcgtTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCAc < 1:2116187/148‑1 (MQ=255)
tttCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggc > 2:82927/1‑148 (MQ=255)
cTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACcgggcggg > 1:1036281/1‑148 (MQ=255)
ggCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCa < 1:320711/148‑1 (MQ=255)
gTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGa < 1:2336368/148‑1 (MQ=255)
tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat > 1:1894195/1‑148 (MQ=255)
tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat < 1:3110840/148‑1 (MQ=255)
tAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGat < 1:2657055/148‑1 (MQ=255)
aaaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata < 1:3309172/148‑1 (MQ=255)
aaaTCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGata < 1:459100/148‑1 (MQ=255)
tCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATAc < 2:1163321/148‑1 (MQ=255)
ttGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTg < 1:1142930/148‑1 (MQ=255)
ccTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACg < 1:527700/148‑1 (MQ=255)
cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 2:1479574/148‑1 (MQ=255)
cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta < 2:1028966/148‑1 (MQ=255)
cTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAtta > 2:1720103/1‑148 (MQ=255)
ttAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttat < 2:1557028/148‑1 (MQ=255)
aGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgt < 2:679340/148‑1 (MQ=255)
gACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgtt < 1:322920/148‑1 (MQ=255)
aCTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt < 1:2208856/141‑1 (MQ=255)
aCTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAt > 2:2208856/1‑141 (MQ=255)
tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg > 1:2588500/1‑148 (MQ=255)
tAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAttatgttatg < 2:2357090/148‑1 (MQ=255)
aTCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCg > 2:2234455/1‑148 (MQ=255)
tCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCgg > 2:918923/1‑148 (MQ=255)
cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCggg < 2:2389802/148‑1 (MQ=255)
cTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCggg > 1:1552388/1‑148 (MQ=255)
ttGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAGTATGTTATGTCGGGCa > 2:2084451/1‑148 (MQ=255)
ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt > 2:779355/1‑148 (MQ=255)
ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt > 2:437286/1‑148 (MQ=255)
ccATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgt < 2:133211/148‑1 (MQ=255)
cATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCAtgtg > 1:1798479/1‑148 (MQ=255)
tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt < 1:3259460/148‑1 (MQ=255)
tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt > 1:1249698/1‑148 (MQ=255)
tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGtt > 1:2899544/1‑148 (MQ=255)
tAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAGTATGTTATGGCGGGCATGTGtt > 2:1778803/1‑148 (MQ=255)
gAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATg < 2:3133443/148‑1 (MQ=255)
aaCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGc > 1:2829756/1‑148 (MQ=255)
aCCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCg > 1:8059/1‑148 (MQ=255)
cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 2:3206043/1‑148 (MQ=255)
cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 2:3163551/148‑1 (MQ=255)
cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 2:3163092/148‑1 (MQ=255)
cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa > 1:128060/1‑148 (MQ=255)
cAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaa < 1:221667/148‑1 (MQ=255)
aaaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGaaa > 2:2394427/1‑148 (MQ=255)
aaTGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAat < 1:3023136/148‑1 (MQ=255)
tGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAatat > 1:2199660/1‑148 (MQ=255)
gTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATg > 1:341276/1‑148 (MQ=255)
ttCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGt < 1:981352/148‑1 (MQ=255)
ttCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGt < 2:1630159/148‑1 (MQ=255)
tCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTa < 2:1039317/148‑1 (MQ=255)
aTCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTa > 1:1569092/1‑148 (MQ=255)
aGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGccc < 2:1419836/148‑1 (MQ=255)
gggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa < 2:147145/148‑1 (MQ=255)
gggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTa > 2:1902521/1‑148 (MQ=255)
ggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTAt < 2:718006/148‑1 (MQ=255)
ggATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTAt < 1:1989399/148‑1 (MQ=255)
ttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGca > 1:1645593/1‑148 (MQ=255)
ttCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGca > 2:2469966/1‑148 (MQ=255)
tATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAt < 1:10706/148‑1 (MQ=255)
aTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATg > 2:3223214/1‑148 (MQ=255)
aTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATg > 2:2894217/1‑148 (MQ=255)
tGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATgg < 2:1795950/148‑1 (MQ=255)
gAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGtt < 2:2959109/148‑1 (MQ=255)
aaGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTa < 2:1511359/148‑1 (MQ=255)
aaGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTa < 2:3152852/148‑1 (MQ=255)
gcgcGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATg > 1:595575/1‑148 (MQ=255)
gcgcGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATg > 2:2662654/1‑148 (MQ=255)
cgcgGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGc < 2:2165677/148‑1 (MQ=255)
ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa > 2:385562/1‑148 (MQ=255)
ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa > 2:385594/1‑148 (MQ=255)
ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa > 1:2476635/1‑148 (MQ=255)
ggAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTa > 2:2299522/1‑148 (MQ=255)
gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGtca > 1:3155442/1‑146 (MQ=255)
gAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTaa > 1:990364/1‑148 (MQ=255)
aaGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAg > 1:2669791/1‑148 (MQ=255)
aCCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa > 1:372772/1‑148 (MQ=255)
aCCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa < 2:2690629/148‑1 (MQ=255)
aCCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTa > 1:2040611/1‑148 (MQ=255)
ccGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTaa > 1:2468905/1‑148 (MQ=255)
ccGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTaa > 1:2129805/1‑148 (MQ=255)
cGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat > 1:933752/1‑148 (MQ=255)
cGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat > 1:806303/1‑148 (MQ=255)
cGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAat > 1:1916431/1‑148 (MQ=255)
gCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAatg < 1:3046914/148‑1 (MQ=255)
tGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACaa < 1:2795869/148‑1 (MQ=255)
gAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAg < 2:8059/148‑1 (MQ=255)
|
CATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAG > CP009273/2993554‑2993842
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAG > CP009273/2993550‑2993846
|
ACGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATA < SRR19973070.1696121/150‑1 (MQ=60)
ATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTGGCGGTAATATTGCCTGCTTAGACTAAATATTTTCCATAAGAAACAAATTTTAAAATCGGGGGGCTTTATATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCA > SRR19973070.62406/1‑150 (MQ=60)
ATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCA > SRR19973070.1846426/1‑150 (MQ=60)
TCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCAT < SRR19973070.144970/150‑1 (MQ=60)
CACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGGCTGCTTAGACTAAATCTTTTCCATAATAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTTTGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGTATAATGCATG > SRR19973070.2431862/1‑150 (MQ=60)
CACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATG < SRR19973070.962417/150‑1 (MQ=60)
CACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATG < SRR19973070.3045437/150‑1 (MQ=60)
CCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCG < SRR19973070.183265/150‑1 (MQ=60)
CTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTGTTGCGTAAATATTGCCGGGGTAGACTAAATCATTTCCCTAAGAAACAAAAGTTAAAATAGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGGAGCAACCCCTACGGGTGTATAATTCATGCGCGTCGC > SRR19973070.1471133/1‑150 (MQ=51)
CTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATATTGGCTGGTTAGAATAAAAATTTTGCAAAAGAACCCAATGTTCAAATCGAGGGGCTTTTTATGGAAGCGCGGGAAGCCACCGCAAAGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGA > SRR19973070.1471075/1‑150 (MQ=60)
TACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGAT < SRR19973070.2043229/150‑1 (MQ=60)
CTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCC < SRR19973070.2720618/150‑1 (MQ=60)
TAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCT < SRR19973070.1172172/150‑1 (MQ=60)
TAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCT < SRR19973070.1099382/150‑1 (MQ=60)
TTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTC < SRR19973070.2059105/150‑1 (MQ=60)
TTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTC < SRR19973070.1597864/150‑1 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG < SRR19973070.2130661/150‑1 (MQ=60)
CGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCG < SRR19973070.2130372/150‑1 (MQ=60)
TTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGG > SRR19973070.312439/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGG > SRR19973070.1043602/1‑150 (MQ=60)
TTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGG > SRR19973070.2708060/1‑150 (MQ=60)
GGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACG < SRR19973070.323041/150‑1 (MQ=60)
GGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACG < SRR19973070.323176/150‑1 (MQ=60)
CGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGAT > SRR19973070.1907035/1‑150 (MQ=60)
GTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATA < SRR19973070.2351874/150‑1 (MQ=60)
GTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATA > SRR19973070.2621815/1‑150 (MQ=60)
TAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATAT < SRR19973070.2674337/150‑1 (MQ=60)
TAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATAT < SRR19973070.3130910/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATA < SRR19973070.462380/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATA < SRR19973070.462036/150‑1 (MQ=60)
AAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATA < SRR19973070.3330345/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACT < SRR19973070.2476693/150‑1 (MQ=60)
ATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACT < SRR19973070.222537/150‑1 (MQ=60)
TTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGAC < SRR19973070.1150860/150‑1 (MQ=60)
CCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGAT < SRR19973070.531265/150‑1 (MQ=60)
gatcTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973070.2223378/146‑1 (MQ=60)
gatcTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTA < SRR19973070.2223393/146‑1 (MQ=60)
TAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTT < SRR19973070.1884876/150‑1 (MQ=60)
GACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTAT < SRR19973070.1347266/150‑1 (MQ=60)
GACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTAT < SRR19973070.325268/150‑1 (MQ=60)
ACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATG < SRR19973070.3318885/150‑1 (MQ=60)
ACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATG > SRR19973070.2605411/1‑150 (MQ=60)
AAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCG > SRR19973070.1808353/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGG > SRR19973070.1563307/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGG > SRR19973070.601453/1‑150 (MQ=60)
ATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGG > SRR19973070.1563353/1‑150 (MQ=60)
GCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTG > SRR19973070.501386/1‑150 (MQ=60)
GCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTG > SRR19973070.501225/1‑150 (MQ=60)
GCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTG > SRR19973070.1810897/1‑150 (MQ=60)
CATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTT < SRR19973070.3276976/150‑1 (MQ=60)
CATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTT > SRR19973070.1258462/1‑150 (MQ=60)
CATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTT > SRR19973070.2918300/1‑150 (MQ=60)
ATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTA < SRR19973070.3141897/150‑1 (MQ=60)
TAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAT < SRR19973070.3213617/150‑1 (MQ=60)
TAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTAT < SRR19973070.3280448/150‑1 (MQ=60)
AAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATG > SRR19973070.572598/1‑150 (MQ=60)
AGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGC > SRR19973070.2848074/1‑150 (MQ=60)
AGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGC > SRR19973070.2848070/1‑150 (MQ=60)
GAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCG > SRR19973070.8174/1‑150 (MQ=60)
GAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCG < SRR19973070.282578/150‑1 (MQ=60)
ACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAA > SRR19973070.129187/1‑150 (MQ=60)
CAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAAT < SRR19973070.223271/150‑1 (MQ=60)
AATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATAT < SRR19973070.3042398/150‑1 (MQ=60)
AATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATAT > SRR19973070.2214163/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATG > SRR19973070.343765/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATG > SRR19973070.2158135/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATG > SRR19973070.262855/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATG > SRR19973070.343752/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATG > SRR19973070.2158394/1‑150 (MQ=60)
GTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTA < SRR19973070.355408/150‑1 (MQ=60)
TTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAC < SRR19973070.988350/150‑1 (MQ=60)
TTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAC < SRR19973070.2764863/150‑1 (MQ=60)
TTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTAC < SRR19973070.988390/150‑1 (MQ=60)
AAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTA > SRR19973070.1580122/1‑150 (MQ=60)
ATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGC > SRR19973070.2236750/1‑150 (MQ=60)
GGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCG < SRR19973070.2002872/150‑1 (MQ=60)
ATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCA > SRR19973070.1656963/1‑150 (MQ=60)
ATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCA > SRR19973070.1657178/1‑150 (MQ=60)
TTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACA < SRR19973070.854790/150‑1 (MQ=60)
TTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTG‑ATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAT < SRR19973070.2927952/150‑1 (MQ=60)
TCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAT < SRR19973070.1921978/150‑1 (MQ=60)
TCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACAT < SRR19973070.1267985/150‑1 (MQ=60)
CTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATG > SRR19973070.2415639/1‑150 (MQ=60)
TATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGG < SRR19973070.10868/150‑1 (MQ=60)
TATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGG < SRR19973070.10875/150‑1 (MQ=60)
TGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTT > SRR19973070.3141452/1‑150 (MQ=60)
AAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATG > SRR19973070.599713/1‑150 (MQ=60)
CGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCG < SRR19973070.2680922/150‑1 (MQ=60)
CGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTA > SRR19973070.2492766/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTCA > SRR19973070.3175833/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA > SRR19973070.997470/1‑150 (MQ=60)
GGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAA > SRR19973070.997425/1‑150 (MQ=60)
GGAAGCAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAG > SRR19973070.2687132/1‑150 (MQ=60)
CAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTA > SRR19973070.2054416/1‑150 (MQ=60)
CAACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTA > SRR19973070.375505/1‑150 (MQ=60)
AACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAA > SRR19973070.2485093/1‑150 (MQ=60)
AACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAA > SRR19973070.2485006/1‑150 (MQ=60)
AACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAA > SRR19973070.2144045/1‑150 (MQ=60)
ACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAT > SRR19973070.811773/1‑150 (MQ=60)
ACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAT > SRR19973070.811842/1‑150 (MQ=60)
ACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAT > SRR19973070.940416/1‑150 (MQ=60)
ACCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCAATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAAT > SRR19973070.1929362/1‑150 (MQ=60)
CCGCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAANG < SRR19973070.2522216/150‑1 (MQ=60)
GCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGAT < SRR19973070.3066291/150‑1 (MQ=60)
GCTACGGGTGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGAT < SRR19973070.1000673/150‑1 (MQ=60)
TGAATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGC < SRR19973070.2813908/150‑1 (MQ=60)
ATAATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAG < SRR19973070.288061/150‑1 (MQ=60)
|
ACGTCATCACACTTCCTACCTCCCCTAACGCTTATCGTCGTTTCTGGCGTAAATCTTGCCTGCTTAGACTAAATCTTTGCCATAAGAACCAAATGTTCAAATCGAGGGGATTTCTATGGAAGCGCGGGAAGCAACCGCTACGGGTGAATCATGCATGCGCGTCGATGCCATTGCTAAGGTCACCGGGCGGGCACGATATACTGACGATTATGTTATGGCGGGCATGTGTTATGCGAAATATGTACGTAGCCCTATCGCACATGGTTATGCCGTAAGTATTAATGATGAACAAGCCAG > CP009273/2993550‑2993846
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |