Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F78 I0 R1
|
626 |
241.3 |
10389380 |
77.7% |
8072548 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,825,783 |
C→T |
100% |
intergenic (‑135/‑52) |
norR ← / → norV |
anaerobic nitric oxide reductase DNA‑binding transcriptional activator/anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,825,783 | 0 | C | T | 90.0%
| 499.3
/ 33.5
| 171 | intergenic (‑135/‑52) | norR/norV | anaerobic nitric oxide reductase DNA‑binding transcriptional activator/anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/17); new base T (74/78); total (75/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.53e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
CGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGG > CP009273/2825636‑2825929
|
cGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTg < 1:1574593/150‑1 (MQ=255)
cGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTg < 1:888829/150‑1 (MQ=255)
cGGAAAAACTCATATTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATTTTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAACAAACTGGCACGCAATCTg < 1:3899772/150‑1 (MQ=255)
ggAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGc > 2:193190/1‑150 (MQ=255)
gAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCa > 1:1729230/1‑150 (MQ=255)
gAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCa < 2:2484218/150‑1 (MQ=255)
gAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCa < 2:692729/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAt < 2:2967722/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAt > 2:3340086/1‑150 (MQ=255)
aaaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAt < 2:34250/150‑1 (MQ=255)
aaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAtt < 2:2836539/150‑1 (MQ=255)
cTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGc < 2:3080593/150‑1 (MQ=255)
cATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCaa < 2:3289443/150‑1 (MQ=255)
cTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGAc > 1:104238/1‑150 (MQ=255)
ttGCCTCACTGTAAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACAt > 2:80036/1‑150 (MQ=255)
gCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCt < 1:688635/150‑1 (MQ=255)
gCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCt > 2:2815777/1‑150 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt > 1:2474038/1‑150 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt < 1:2662166/150‑1 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt < 1:2662016/150‑1 (MQ=255)
tGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGa < 2:1633185/150‑1 (MQ=255)
ctaTTTGTCTTTAGATAGTGTCTTATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTATTGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAaca < 2:3273804/148‑1 (MQ=255)
cAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAaca < 2:2108698/150‑1 (MQ=255)
cAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAaca < 2:2108998/150‑1 (MQ=255)
aaTTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAacan < 1:907064/150‑2 (MQ=255)
aTTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACg > 1:1484939/1‑150 (MQ=255)
aCTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTAATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGaa < 2:3641398/150‑1 (MQ=255)
cTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAAt < 1:2554612/150‑1 (MQ=255)
ataGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATaa > 2:753031/1‑150 (MQ=255)
aGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAAt > 1:2980627/1‑150 (MQ=255)
atTGTCATATCGTCCATTTGATTGATAGTAATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACACTCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAg < 2:4315205/150‑1 (MQ=255)
gTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCACGACATCTTTTTAGAACACGCTGACTAAATTGAGGtt > 2:4636723/1‑150 (MQ=255)
gTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGtt < 1:4951985/150‑1 (MQ=255)
atatCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCt > 1:2006777/1‑150 (MQ=255)
atatCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCt > 1:2006724/1‑150 (MQ=255)
tatCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTa < 1:759156/150‑1 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt < 2:1465965/150‑1 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt < 2:4185728/150‑1 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt > 2:246609/1‑150 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt > 2:70860/1‑150 (MQ=255)
gACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTc < 1:1771409/150‑1 (MQ=255)
aCCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCt > 1:189202/1‑150 (MQ=255)
aTTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTAtt > 1:2639476/1‑150 (MQ=255)
ttgattgaTAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTAgtgt > 2:2706531/1‑150 (MQ=255)
ttgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTgtggtg < 2:3394633/150‑1 (MQ=255)
ttgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTgtggtg > 1:3776771/1‑150 (MQ=255)
ttgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTgtggtg < 2:1152398/150‑1 (MQ=255)
tgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGa > 1:284965/1‑150 (MQ=255)
gatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCACTTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGaa > 1:810295/1‑150 (MQ=255)
aGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGaaaaa > 1:3758617/1‑150 (MQ=255)
gTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAAt > 2:5061493/1‑150 (MQ=255)
gTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAAt > 2:2481798/1‑150 (MQ=255)
ttttGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAca < 2:4730259/150‑1 (MQ=255)
tGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAcattc > 1:2139241/1‑150 (MQ=255)
actCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCAGTgg > 2:4028873/1‑150 (MQ=255)
actCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCAGTgg > 2:4475489/1‑150 (MQ=255)
ttAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTgg > 2:4671699/1‑150 (MQ=255)
tAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGt < 1:4198992/150‑1 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACg < 2:4684249/150‑1 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACg < 1:1833528/150‑1 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACg < 1:1833601/150‑1 (MQ=255)
tAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGAc < 1:2360230/150‑1 (MQ=255)
tAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGAc < 1:4383051/150‑1 (MQ=255)
tAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGAc < 2:4345243/150‑1 (MQ=255)
ttttATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTgg > 2:1777140/1‑150 (MQ=255)
ttttATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTgg < 1:470096/150‑1 (MQ=255)
atttagAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAg < 2:4975501/150‑1 (MQ=255)
tttatAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGt < 1:3302634/150‑1 (MQ=255)
tttatAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGt < 1:3302612/150‑1 (MQ=255)
ataGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCg > 2:2726593/1‑150 (MQ=255)
ataGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATGTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCg < 1:1167677/150‑1 (MQ=255)
agTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGAAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAt < 2:3737832/150‑1 (MQ=255)
gTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAtt > 2:623763/1‑150 (MQ=255)
tAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAttt > 1:4610131/1‑150 (MQ=255)
aaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcac < 1:2549271/150‑1 (MQ=255)
aCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacg < 2:2474038/150‑1 (MQ=255)
aCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacg > 2:102100/1‑150 (MQ=255)
cAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacgg > 1:4037904/1‑150 (MQ=255)
aTCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacggca > 1:4945292/1‑150 (MQ=255)
cAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacggcacg < 2:970308/150‑1 (MQ=255)
cAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacggcacg < 1:2540671/150‑1 (MQ=255)
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aaaaCTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAAtata > 1:1534975/1‑150 (MQ=255)
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AACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCAC < SRR19973083.2562173/150‑1 (MQ=60)
CAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGG > SRR19973083.4055854/1‑150 (MQ=60)
ATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCA > SRR19973083.4966551/1‑150 (MQ=60)
ATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCA > SRR19973083.2959116/1‑150 (MQ=60)
CAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACG < SRR19973083.2553674/150‑1 (MQ=60)
CAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACG < SRR19973083.2553552/150‑1 (MQ=60)
AAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATA > SRR19973083.1542700/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATCTAA > SRR19973083.3574366/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAA > SRR19973083.2069114/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAA > SRR19973083.2069092/1‑150 (MQ=60)
AACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAA < SRR19973083.2521263/150‑1 (MQ=60)
TGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACG > SRR19973083.63593/1‑150 (MQ=60)
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GGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGC > SRR19973083.4586386/1‑150 (MQ=60)
ACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGC < SRR19973083.930114/150‑1 (MQ=60)
CGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCG < SRR19973083.2643390/150‑1 (MQ=60)
CAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCG < SRR19973083.697051/150‑1 (MQ=60)
TTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGGCA < SRR19973083.984044/150‑1 (MQ=60)
TTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGGCA < SRR19973083.984050/150‑1 (MQ=60)
TTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGGCA < SRR19973083.984085/150‑1 (MQ=60)
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AACGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGGCA > CP009273/2825634‑2825931
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |