Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,825,783 |
C→T |
100% |
intergenic (‑135/‑52) |
norR ← / → norV |
anaerobic nitric oxide reductase DNA‑binding transcriptional activator/anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,825,783 | 0 | C | T | 100.0%
| 887.2
/ ‑6.7
| 250 | intergenic (‑135/‑52) | norR/norV | anaerobic nitric oxide reductase DNA‑binding transcriptional activator/anaerobic nitric oxide reductase flavorubredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (100/149); minor base G (0/1); total (100/150) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
CGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGG > CP009273/2825636‑2825929
|
cGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTg < 2:3441710/150‑1 (MQ=255)
ggAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGc < 1:1364973/150‑1 (MQ=255)
aaaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAt < 1:2922914/150‑1 (MQ=255)
aaaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAAtt > 2:436463/1‑150 (MQ=255)
aaCTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTa < 1:3641953/150‑1 (MQ=255)
cTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGc > 1:252157/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAg < 1:1442547/150‑1 (MQ=255)
aTCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACAATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTATCAAg > 1:2462896/1‑150 (MQ=255)
tGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATc > 2:2051250/1‑150 (MQ=255)
tGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATAATGTCATATCGACCATTTCATTGATAGTCATATTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATc > 2:141769/1‑150 (MQ=255)
ctaaCTGTCAATTTGTCTATAGATATTGTCATATCGACAATTTGATTGATTGTCTTTGTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTTTAGAGTAAAAACAATCAGATATCAATCTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGTCATCttt < 2:579210/147‑1 (MQ=255)
cTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCTCGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttt < 2:324389/150‑1 (MQ=255)
cTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttt > 1:413302/1‑150 (MQ=255)
cTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttt > 2:2383630/1‑150 (MQ=255)
cTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttt > 1:476770/1‑150 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt < 1:2367366/150‑1 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt > 1:2053052/1‑150 (MQ=255)
tCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCtttt < 2:2277553/150‑1 (MQ=255)
cACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttttt < 1:1571202/150‑1 (MQ=255)
cACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCttttt < 1:3045785/150‑1 (MQ=255)
cTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAg < 2:2995006/150‑1 (MQ=255)
tGTCAATTTGACTATAGAGATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGa < 1:2271682/150‑1 (MQ=255)
tCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAac < 2:3619525/150‑1 (MQ=255)
tttGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGc > 2:1300933/1‑150 (MQ=255)
gACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGGCATCTTTTTAGAACACGCTGa < 1:76959/150‑1 (MQ=255)
cTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAAt < 2:2966718/150‑1 (MQ=255)
aGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAAt < 1:2893615/150‑1 (MQ=255)
aGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAAt < 1:1978905/150‑1 (MQ=255)
aGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAAt > 2:2162304/1‑150 (MQ=255)
gATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAAtt < 1:1523917/150‑1 (MQ=255)
atTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATTGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAg < 2:2302281/150‑1 (MQ=255)
ttGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAgg < 2:1617476/150‑1 (MQ=255)
atatCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCt < 1:3740106/150‑1 (MQ=255)
atCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAATAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTAt > 1:1069607/1‑150 (MQ=255)
atCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTAt < 1:3047789/150‑1 (MQ=255)
tCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATg < 2:2129497/150‑1 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt < 1:1784/150‑1 (MQ=255)
cGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGt < 2:2091234/150‑1 (MQ=255)
gACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACACTCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTc < 2:3957261/150‑1 (MQ=255)
gACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTc < 2:3957230/150‑1 (MQ=255)
aCCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCt < 1:2992624/150‑1 (MQ=255)
cATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTAt < 2:2525881/150‑1 (MQ=255)
ttgattgaTAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAATACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATtgt > 1:2821705/1‑150 (MQ=255)
tgattgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATtgtg > 1:3232100/1‑150 (MQ=255)
tgattgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTCTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATtgtg > 2:3700978/1‑150 (MQ=255)
attgatAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTgtggt > 1:2157496/1‑150 (MQ=255)
aGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGaaaaa < 1:654306/150‑1 (MQ=255)
gTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTTGCACTCAATTTGCAATTAGAAAGACATATTTTTAGAACACGCTGAATAATTTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAAt < 2:3290534/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCTAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATa < 1:3139386/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATa < 1:811634/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATa < 1:811766/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATa < 2:603737/150‑1 (MQ=255)
tCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATa < 2:94099/150‑1 (MQ=255)
ttttGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAca < 2:4115970/150‑1 (MQ=255)
ttGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAcatt > 2:3201710/1‑150 (MQ=255)
ttGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAcatt < 1:992165/150‑1 (MQ=255)
actactCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAcattcat > 2:1744032/1‑150 (MQ=255)
ctactCATTAATTGGAATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAAcattcatt < 2:1720704/150‑1 (MQ=255)
ctCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTggg < 2:1207642/150‑1 (MQ=255)
ctCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTggg < 2:2009500/150‑1 (MQ=255)
tCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGt > 1:2691464/1‑150 (MQ=255)
aTGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCa < 2:3996906/150‑1 (MQ=255)
aTGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCa < 2:3681682/150‑1 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATATAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCGAGTGTGGTGAAAAATAACCTTAATAGGGTTGGTCAACg > 1:3758634/1‑150 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACg > 2:779830/1‑150 (MQ=255)
ggCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACg > 1:71095/1‑150 (MQ=255)
tAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGAc < 1:1967276/150‑1 (MQ=255)
aTTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTg > 2:1734919/1‑150 (MQ=255)
aTTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTg > 2:2635820/1‑150 (MQ=255)
aTTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTg > 2:3045123/1‑150 (MQ=255)
ttatttatAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGa < 2:2576174/150‑1 (MQ=255)
agTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAt < 2:191770/150‑1 (MQ=255)
gTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAtt < 1:1210994/150‑1 (MQ=255)
gTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAtt < 1:1211376/150‑1 (MQ=255)
tAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAttt < 1:3511377/150‑1 (MQ=255)
aaaaaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTCTTGTGGTGAAAAATAACATTCCTGGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAttgt > 1:3620249/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAtttt > 2:816668/1‑150 (MQ=255)
aaaaaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGAtttt < 1:3889992/150‑1 (MQ=255)
aaaaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTc > 2:2840531/1‑150 (MQ=255)
aaCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcac > 2:2343022/1‑150 (MQ=255)
aCAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacg < 1:357225/150‑1 (MQ=255)
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aaTCAGATAAAAAACTGGCACGCAATTTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTcacggc > 1:341252/1‑150 (MQ=255)
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ACGGAAAAACTCATCTTTGCCTCACTGTCAATTTGACTATAGATATTGTCATATCGACCATTTGATTGATAGTCATTTTGACTACTCATTAATGGGCATAATTTTATTTATAGAGTAAAAACAATCAGATAAAAAACTGGCACGCAATCTGCAATTAGCAAGACATCTTTTTAGAACACGCTGAATAAATTGAGGTTGCTATGTCTATTGTGGTGAAAAATAACATTCATTGGGTTGGTCAACGTGACTGGGAAGTGCGTGATTTTCACGGCACGGAATATAAAACGCTGCGCGGCA > CP009273/2825635‑2825931
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |