Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,049,740 |
C→A |
87.0% |
L47L (CTC→CTA) |
fau → |
5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,049,740 | 0 | C | A | 87.0%
| 416.8
/ 58.4
| 187 | L47L (CTC→CTA) | fau | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/19); new base A (62/100); total (68/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 188 total aligned reads displayed.
CCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA > CP009273/3049593‑3049883
|
cAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGac > 2:2620810/1‑148 (MQ=255)
aTGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACAccc > 1:224260/1‑148 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCTTTTGAATGCGAACTAGACACCCAg > 2:431903/1‑148 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTTTTGGCGAACAAGAAACCCaa > 1:238951/1‑147 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAg < 1:1956822/148‑1 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTGCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAg > 2:1520265/1‑148 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCGTTTTATGGCGTACTCGACACCCAg > 2:939414/1‑148 (MQ=255)
aTTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGc > 2:2709475/1‑148 (MQ=255)
tCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCa > 2:2317326/1‑148 (MQ=255)
cAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCa < 2:1947396/148‑1 (MQ=255)
cAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTGCTCTCTTTTGGTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCa > 2:2367708/1‑148 (MQ=255)
aaCGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCAt < 2:416143/148‑1 (MQ=255)
tcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaa > 2:2904429/1‑148 (MQ=255)
cgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACCCCCAGCCACTCATAGaac > 2:1073048/1‑148 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGaacaa < 2:2854899/148‑1 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCAGAGaacaa > 2:2259609/1‑148 (MQ=255)
gCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaacaaaact > 2:2375067/1‑144 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTCTTGCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACGCTg > 1:2851385/1‑148 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATGACGCAACTGTGCAGGCGTACAAGACACCCAGCCACCCCTACAAAAACACTg > 1:2851403/1‑148 (MQ=255)
gTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATCCGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTgg < 1:74408/148‑1 (MQ=255)
gTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTgg < 2:3011304/148‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgcg > 2:1028102/1‑148 (MQ=255)
cGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgcgcgc > 2:2379339/1‑148 (MQ=255)
aacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACCCCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAgcg > 2:260721/1‑148 (MQ=255)
aacaGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAgcg < 2:2978484/148‑1 (MQ=255)
cagcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGcgcg < 1:1498001/148‑1 (MQ=255)
cagcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCACCCACTCATAGAACAACTCGGGCGCGCCGGTAAGcgcg > 2:1340290/1‑148 (MQ=255)
agcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGt < 1:1964781/148‑1 (MQ=255)
agcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGt < 1:184674/148‑1 (MQ=255)
gcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTGCTGTCTTTTGATGGCGAACTAGAACCCCCCCCACACAAAGAACAACACAGGCGCGCCGGTAAGcgcgga > 1:57729/1‑146 (MQ=255)
cagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCACTATTTTTATGGGGAACTATACACCCACCCACACAAAGAAAAAATCTGGCGCGCCGGGAAGCGCGgat > 1:2637260/1‑148 (MQ=255)
cagAAAATGGGTCAACACGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGtat < 2:1920021/148‑1 (MQ=255)
ggAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTatat < 2:433754/148‑1 (MQ=255)
aaTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCtt < 2:349823/148‑1 (MQ=255)
aaTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCGCATTTGATGGCGAACTAGACAACCAACCACTCATATAACAAATCAGGCGCGCCGGTAATCCCGtataaatt > 1:2220630/1‑144 (MQ=255)
aTGGTTCAACAAGCCTCTACCCGGATGATGAATTATCCCCCGGTGGTGATGGAACATACTGTCGATTTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAAATAGACACCCAGCAACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTc < 1:786776/148‑1 (MQ=255)
aTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTc < 2:3173513/148‑1 (MQ=255)
aTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTc < 1:1882286/148‑1 (MQ=255)
ggTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTGCTCTCTTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATATTCCAg > 1:2434266/1‑148 (MQ=255)
tCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTTATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGtt < 1:3049245/148‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGtt < 2:3034319/148‑1 (MQ=255)
acaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGGGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAAAAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATATTCCAGTTTTg > 2:606848/1‑148 (MQ=255)
acaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTTTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCACCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTg > 2:2934284/1‑148 (MQ=255)
caaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTCCAGTTTTGc > 1:2186619/1‑148 (MQ=255)
caaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTGCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACGCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGc > 1:2752124/1‑148 (MQ=255)
aGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCAt < 1:785410/148‑1 (MQ=255)
aGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCAt < 1:2251027/148‑1 (MQ=255)
aGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTTTTCCTCGCGTTTTTTTGCGAACTAGACACCCACCCCCACAAATAAAAAAAATGGCGCGCCGGGAAGCGCGGATATATTACAGtttttgat > 1:952660/1‑144 (MQ=255)
aGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTCCTCTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCACCCACTCATAGAACAACACTGGCGCGCCGGGAAGCGCGGATATCTTCCAGTTTTGCAt > 1:2199801/1‑148 (MQ=255)
gCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATc < 2:148422/148‑1 (MQ=255)
gCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCGTTTTTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAAAGCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATc > 1:540854/1‑148 (MQ=255)
ccGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATcc < 1:1579182/148‑1 (MQ=255)
gCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCt < 1:1028102/148‑1 (MQ=255)
gCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCt < 1:2948631/148‑1 (MQ=255)
gCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCt < 2:1213481/148‑1 (MQ=255)
tACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCttt < 2:2207161/148‑1 (MQ=255)
tACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCttt < 2:816662/148‑1 (MQ=255)
gatgatGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTGCTCTCTTTTTATTGCGAACAAGAAACCCCCCCACACAAAGAACAACACTGGCGCGCCGGGAAGCGCCTATATCTTCCACTTTTTCATCCCATTatttcc > 1:699700/1‑143 (MQ=255)
tgatgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCgg < 2:2533581/148‑1 (MQ=255)
atgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTATGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTACAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGtc > 2:1033577/1‑147 (MQ=255)
tgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCTTAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTaa < 2:2011863/148‑1 (MQ=255)
tgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTaa < 2:1405276/148‑1 (MQ=255)
gaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAAt < 1:3078283/148‑1 (MQ=255)
aTCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTGCAGTTTTTCATACCTTTAGTGCCGGTAATTTGCt > 2:744135/1‑148 (MQ=255)
ccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc < 1:215492/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc < 1:215346/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGANCAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc < 1:1683090/148‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTcc < 2:3128205/148‑1 (MQ=255)
gtggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGa < 2:1122734/148‑1 (MQ=255)
ggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAAt < 1:2121249/148‑1 (MQ=255)
aTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTAcc < 1:2298234/148‑1 (MQ=255)
tGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCa < 1:689377/148‑1 (MQ=255)
ggCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCAt < 1:2378385/148‑1 (MQ=255)
ggCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCAt < 1:902345/148‑1 (MQ=255)
caTACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCACACAAAGAACAAAACTGGCGCGCCGGTAAGCCCGTATATCTTACAGTTTTTCAACCCTTTAGTGCCGGTAATTTGATGTTCCTTAATTAACATCCGc > 2:3188529/1‑148 (MQ=255)
caTACGGTCGCGGGATTGCACTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCAGCCACGCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATACCGTTAGTGCCGGTAAATTTCTGTTCCTGAAATACCATCCGc > 2:1368626/1‑148 (MQ=255)
aCGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCTAACTAGCCACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCaaa < 1:2673087/148‑1 (MQ=255)
cGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAg < 1:2795481/148‑1 (MQ=255)
gTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCAGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTTCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCg > 2:1461470/1‑148 (MQ=255)
gCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAAc < 1:2557575/148‑1 (MQ=255)
cTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt < 1:1051641/148‑1 (MQ=255)
tGTATTCCTCTCTTTTGAGGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTg < 2:2243054/148‑1 (MQ=255)
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ATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCAT < SRR19973070.2313527/150‑1 (MQ=60)
TGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATC < SRR19973070.694345/150‑1 (MQ=60)
TGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATC < SRR19973070.694296/150‑1 (MQ=60)
GGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCC < SRR19973070.908744/150‑1 (MQ=60)
GGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCC < SRR19973070.2395062/150‑1 (MQ=60)
GGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCC < SRR19973070.908778/150‑1 (MQ=60)
GGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCC < SRR19973070.2394103/150‑1 (MQ=60)
ACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCTAACTAGCCACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGC < SRR19973070.2690447/150‑1 (MQ=60)
ACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGC < SRR19973070.2690432/150‑1 (MQ=60)
CGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCG < SRR19973070.2813516/150‑1 (MQ=60)
CGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCG < SRR19973070.2812930/150‑1 (MQ=60)
CGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCG < SRR19973070.2144220/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973070.2000840/150‑1 (MQ=60)
GCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTG < SRR19973070.2574283/150‑1 (MQ=60)
CTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGG < SRR19973070.1059039/150‑1 (MQ=60)
CTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGG < SRR19973070.414440/150‑1 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT > SRR19973070.403089/1‑150 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT > SRR19973070.2852988/1‑150 (MQ=60)
CCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAA < SRR19973070.2254204/150‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAG < SRR19973070.984823/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGT > SRR19973070.1865685/1‑150 (MQ=60)
TTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTT < SRR19973070.2274597/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTT < SRR19973070.2274591/150‑1 (MQ=60)
TTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTG < SRR19973070.376009/150‑1 (MQ=60)
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TTTGATGGCGAACGCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTG < SRR19973070.3082540/150‑1 (MQ=60)
TGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATTAACAGGTTTAA > SRR19973070.3044188/1‑150 (MQ=60)
TGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGAT < SRR19973070.283459/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGAT < SRR19973070.1343334/150‑1 (MQ=60)
GGAGAACTAGACACACAGCCACTAATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTACTTAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGTTGATGAACAGGTTGAAGATC < SRR19973070.907329/150‑1 (MQ=60)
GCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCC < SRR19973070.1181016/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973070.2637907/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973070.2362961/150‑1 (MQ=60)
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AAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG > CP009273/3049598‑3049885
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
