Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,049,740 |
C→A |
92.6% |
L47L (CTC→CTA) |
fau → |
5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,049,740 | 0 | C | A | 92.6%
| 533.2
/ 29.9
| 203 | L47L (CTC→CTA) | fau | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (9/6); new base A (83/105); total (92/111) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.86e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG > CP009273/3049596‑3049885
|
cAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGATTCCGCTCTTTTGTTGGCGAACTAGac > 2:1905712/1‑148 (MQ=255)
aaaaTGATTCGGCAACGTCGTGGTGCGTTAACGCCGGATCAAGAGCAGGATATGGGTCAACTAGCCGCTACCCGGATGTTGACTTATCGCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGaca < 1:3429486/148‑1 (MQ=255)
aTGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACTAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCGCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACAccc < 1:2054621/148‑1 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAg < 2:3128217/148‑1 (MQ=255)
ttCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGCACTAGAAACCCAGcc > 1:2558980/1‑148 (MQ=255)
tCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCa < 1:2253329/148‑1 (MQ=255)
gCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTc < 2:1416172/148‑1 (MQ=255)
gCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTc < 2:1415944/148‑1 (MQ=255)
cAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTGGCGTTTTATTGCGTCCTAGACacccacccccccc > 1:2418038/1‑143 (MQ=255)
cAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCGTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCcacaca > 1:3230611/1‑148 (MQ=255)
aCGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCGTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACGCATa > 2:1037091/1‑148 (MQ=255)
gtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaaca < 2:1004885/148‑1 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaacaa > 2:1492910/1‑148 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCGTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaacaa > 2:649758/1‑148 (MQ=255)
cgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTTGCGAACTAGACACCCCGCCACACAAAGaacaac > 2:3286561/1‑148 (MQ=255)
tGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCGTTTTTTGGCGAACGAGACACCCACCCCCACATAGaacaacac > 1:816029/1‑146 (MQ=255)
gCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAActct < 1:2343843/148‑1 (MQ=255)
gCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCCCTCATAGAACAAatct > 2:2824367/1‑148 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCTCATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTg < 2:3514953/148‑1 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTg < 1:2803905/148‑1 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTg < 2:2090354/148‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgcg < 2:2980809/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgcgcg < 2:2040487/148‑1 (MQ=255)
aCGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTGCTCTCGTTTTTTTGGGAACTAGACACCCACCCACACAAATAACAAAACAGgcgcg > 1:697578/1‑148 (MQ=255)
cGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACACGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCCGCCACTCATAGAACAACTCTGgcgcgc < 1:3116402/148‑1 (MQ=255)
gAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACAGGCGCGCCGGTa > 1:2311639/1‑148 (MQ=255)
aacaacAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTaa > 2:2930107/1‑148 (MQ=255)
acaacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCACCCCCACAGAGAACAACAATGGCGCGCCGGTAAg > 1:174185/1‑148 (MQ=255)
aacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAgcg > 2:1778801/1‑148 (MQ=255)
aacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAgcg > 2:2761567/1‑148 (MQ=255)
acaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCCCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACACTCTTTTGATGGCGAACTACAAACCCCGCCACACAAAGAACAACTCTGGCGCGCCCGGAAacgc > 2:3050994/1‑148 (MQ=255)
acaGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGTACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTTATTGCGAACTCGACAACCACCCACACCAAGAACAACAATGGCGCGCCGGTAAtcgc > 2:2520267/1‑148 (MQ=255)
gcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCGCTCTTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCCCCACATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGcgcgga > 1:2653808/1‑146 (MQ=255)
gcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGAATACTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGta > 2:1345081/1‑148 (MQ=255)
gcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTTATTGCGAACTAGACACCCAGCCCCACCAAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAACCGCCta > 2:2687179/1‑148 (MQ=255)
ggAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTTGCGAACTAGACACCCAGCCACACATATAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGatat > 1:1798451/1‑148 (MQ=255)
gAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATc < 2:692755/148‑1 (MQ=255)
gAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATc > 2:2838029/1‑148 (MQ=255)
aaTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCtt < 1:459736/148‑1 (MQ=255)
aaTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCtt < 1:1400572/148‑1 (MQ=255)
aTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTc < 1:3202132/148‑1 (MQ=255)
aTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTc < 2:3323531/148‑1 (MQ=255)
ggTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGTTTGGGAACTAGACACCCCGCCACGCAGAGAAAAACACTGGCGCGCCGGTCAGCGCGGGTATCTTGCAg > 1:3080828/1‑148 (MQ=255)
gTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGt < 1:2380438/148‑1 (MQ=255)
gTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGt < 1:495896/148‑1 (MQ=255)
gTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGt < 2:615531/148‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGtt < 2:2070169/148‑1 (MQ=255)
caacaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGTTTGCTCTCTTTTGTTTGGGAACAAGACACCCACCCCCACAAATAAAAAAACTGGCGCGCCGGGTAGCGCGGATATATTAAAGttt > 1:1629471/1‑148 (MQ=255)
acaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTg < 2:1857993/148‑1 (MQ=255)
cacgCCGCTACCCGGAGGATGACTTATCCCCCGGGGGTGAGGGAACATCCGGTCGCTGTATTCCTCTC‑TTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCa < 1:1627401/145‑1 (MQ=255)
caaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGc < 1:869925/148‑1 (MQ=255)
aaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTGCTCTGGTTTGTTGGCGGACTAGACACCCCGCCCCACATAGAAAAAATCGGGCGCGCCGGGAAGCGCGGATATCTTACAGTTTTTCa > 1:3148415/1‑148 (MQ=255)
aaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCa < 2:2538303/148‑1 (MQ=255)
aaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCa < 2:748152/148‑1 (MQ=255)
aaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGGTTTGCa > 2:1982591/1‑148 (MQ=255)
aGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCAt < 2:912209/148‑1 (MQ=255)
gCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATc < 1:3506777/148‑1 (MQ=255)
gCTACCCGGATGTTGTATTATCCCCCGGTGGTGATGCCTCCTTGGGTAGCTTTATTAGTCTCTTTTGATGGCGATCTATTCAACCAGCGAATCTTAGTACACCTCTGGCGGGACGGTAAGCGCGTAGTTCTTCCAGTTTTGCATCCCt < 2:1149197/148‑1 (MQ=255)
tACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCttt < 2:1309927/148‑1 (MQ=255)
aCCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTa < 1:838612/148‑1 (MQ=255)
aCCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTGCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTACAGTTTTGCATCCCTTTa > 1:3495918/1‑148 (MQ=255)
cccGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAg < 2:566095/148‑1 (MQ=255)
cGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGGACATAAGGTCGCTGTATTCCTCTCTTGTGATGGCGAACTAGACACCCATCCACTCTTAGATCAACTCTTGCGCGACGGTAAGCTCGTATATCTTCGAGTTTTGCATCCGTTTAGTg < 2:77979/148‑1 (MQ=255)
cGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTTTTCCTCACTTTTTATGGCGAACAAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACTGGCGCGCCGGGACGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCATTAGTg > 2:2996152/1‑148 (MQ=255)
atgatgACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCg < 1:1448217/148‑1 (MQ=255)
atgatgACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCg < 1:3342738/148‑1 (MQ=255)
gatgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGTTTGCGCTCTTTTTTTGGCGAACTAGACACCCAGCCCCTCATAGAACAACTCTGGGGCGCCGGGGAGCGCGGGTATATTACACTTTTGCATCCCTGTAGTGGCggg > 2:15458/1‑147 (MQ=255)
tgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTaa < 2:2416773/148‑1 (MQ=255)
gaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAAt < 2:1617043/148‑1 (MQ=255)
ttATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTg < 1:2178971/148‑1 (MQ=255)
cccccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGt < 1:1084708/148‑1 (MQ=255)
ggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAAt < 1:401405/148‑1 (MQ=255)
tgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTAATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTa < 1:877298/148‑1 (MQ=255)
tGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCa < 2:1730991/148‑1 (MQ=255)
tGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCa < 1:1918809/148‑1 (MQ=255)
tACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTGTATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCaa < 2:3080828/148‑1 (MQ=255)
tACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCaa < 2:3289346/148‑1 (MQ=255)
cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGaa < 1:2909618/148‑1 (MQ=255)
cTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt > 2:2177824/1‑148 (MQ=255)
gTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTgg < 2:514764/148‑1 (MQ=255)
tATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGt > 2:849675/1‑148 (MQ=255)
tATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGt > 2:2037188/1‑148 (MQ=255)
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TGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACC < SRR19973066.2924958/150‑1 (MQ=60)
TGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTAATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACC < SRR19973066.883554/150‑1 (MQ=60)
GATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCA < SRR19973066.358766/150‑1 (MQ=60)
TGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATC < SRR19973066.1932464/150‑1 (MQ=60)
GCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCG < SRR19973066.2540028/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973066.2929040/150‑1 (MQ=60)
GCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTG > SRR19973066.2072557/1‑150 (MQ=60)
CTTTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGACACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCATGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGG < SRR19973066.1438117/150‑1 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT > SRR19973066.229158/1‑150 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT > SRR19973066.3063629/1‑150 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT > SRR19973066.3063625/1‑150 (MQ=60)
TATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGA < SRR19973066.688856/150‑1 (MQ=60)
TATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGA > SRR19973066.629927/1‑150 (MQ=60)
ATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATACGCAAAGCGAACTGGTGAT > SRR19973066.240939/1‑150 (MQ=60)
CTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC > SRR19973066.1397297/1‑150 (MQ=60)
CTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC < SRR19973066.2671566/150‑1 (MQ=60)
CTATCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACAAATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC < SRR19973066.2671570/150‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAG < SRR19973066.2705104/150‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAG < SRR19973066.1402756/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGG < SRR19973066.334291/150‑1 (MQ=60)
TCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGG < SRR19973066.1862470/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTT > SRR19973066.2112562/1‑150 (MQ=60)
TGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAA < SRR19973066.3482280/150‑1 (MQ=60)
TGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAA < SRR19973066.1706704/150‑1 (MQ=60)
GAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCAT > SRR19973066.838635/1‑150 (MQ=60)
GAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCAT > SRR19973066.881848/1‑150 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973066.3415378/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973066.1044721/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATACCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973066.3415336/150‑1 (MQ=60)
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TCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG > CP009273/3049592‑3049885
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
