Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,049,740 |
C→A |
100% |
L47L (CTC→CTA) |
fau → |
5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,049,740 | 0 | C | A | 98.9%
| 953.8
/ 0.1
| 307 | L47L (CTC→CTA) | fau | 5‑formyltetrahydrofolate cyclo‑ligase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/3); new base A (131/171); total (133/174) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 307 total aligned reads displayed.
CCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGA > CP009273/3049593‑3049886
|
gCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGTTGATGACTTATCCCCCTGTGGTGTTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGaca < 1:2393937/150‑1 (MQ=255)
cAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGacac > 2:26562/1‑150 (MQ=255)
aaaTGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAACTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGCGTCCGCTCTGTTGGTGGCGCACGCGCCAccc > 2:4471490/1‑150 (MQ=255)
aaTGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTACTCTCATTTTATGGCGAACTAGACACCCa > 1:2988816/1‑150 (MQ=255)
aTGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAg < 1:4162601/150‑1 (MQ=255)
tGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGc > 2:5049300/1‑150 (MQ=255)
gATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGATTCCTCTCGTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGcc > 2:144258/1‑150 (MQ=255)
tCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTGCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCAca > 1:3351850/1‑149 (MQ=255)
ggCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCCGCCACTCa > 2:234080/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCa > 2:383883/1‑150 (MQ=255)
gCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCAt < 1:204917/150‑1 (MQ=255)
cAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATa < 1:3219406/150‑1 (MQ=255)
aaCGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAg < 2:1218065/150‑1 (MQ=255)
cgtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTACTCTCGTTTGATTGAGAACTATAAACCCACCcacacagataa > 1:1906262/1‑145 (MQ=255)
cgtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATGCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCACTCAAAGaa > 2:2885615/1‑150 (MQ=255)
gtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaac < 2:3659339/150‑1 (MQ=255)
gtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaac < 2:1958642/150‑1 (MQ=255)
gtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGacc > 2:858635/1‑148 (MQ=255)
gtcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaac > 2:5203506/1‑150 (MQ=255)
tcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaaca < 2:3494135/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGaaca < 1:3839418/150‑1 (MQ=255)
tcgtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGATTCCTCTCTTTTGAAGGCGCACGAGACACCCCACCACACATAGaaca > 2:2047913/1‑150 (MQ=255)
gtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTGATTGCGAACTATAAACCCAGCCACTCATAGaacaac > 1:4797266/1‑150 (MQ=255)
gtcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACCCCCAGCCACGCATAGaacaaa > 2:2499423/1‑149 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAAct > 2:3212877/1‑150 (MQ=255)
tcgtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAAct < 1:4210420/150‑1 (MQ=255)
gtGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTGCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCCTAGAACAActct > 2:3374198/1‑150 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgc < 2:4784536/150‑1 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgc < 2:1157692/150‑1 (MQ=255)
cGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCATTTGAAGGCGAACAAGACACCCACCCACACATAGAACAACTCTGgc > 2:2441489/1‑150 (MQ=255)
tAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGgcgcg > 2:1229145/1‑150 (MQ=255)
cGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCg < 2:3612179/150‑1 (MQ=255)
cGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCAAAGAACAACACTGGCGCGCCGGTa > 1:2127146/1‑150 (MQ=255)
ggAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTGTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGGaa > 2:3953128/1‑150 (MQ=255)
acaacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCCGCCACACATAGAAAAAAAAAGGCGCGCCCGTAAgcg > 2:4904/1‑150 (MQ=255)
aacaGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACAAAGAACAACTCGGGCGCGCCGGTAAGcgcg > 1:1247420/1‑150 (MQ=255)
cagcagGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGACGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGta < 2:3524284/150‑1 (MQ=255)
aaTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTcc < 1:2600844/150‑1 (MQ=255)
aTGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCACTCTTTTGATGGCGAACAAGACAACCAGCCACTCATATAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTACa > 2:2776512/1‑150 (MQ=255)
ggTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCTTTTGATGGCGCACAAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATAACTTACAGtt > 1:1170932/1‑150 (MQ=255)
tCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGtttt < 1:1403627/150‑1 (MQ=255)
tCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGtttt < 1:320873/150‑1 (MQ=255)
caacaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGAATCCGATCTTTTGATGGCGAACAACACACCCCGCCCCGCATAGAACAACTCAGGCGCGCCCGTAAGCGCGTATATCTTCCCGgtttt > 1:375669/1‑149 (MQ=255)
aacaaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTCCTCTCGTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATATAAAAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTACAGtttttc > 1:4670339/1‑148 (MQ=255)
caaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTGCGCGCTTTTGTTGGCGGACTAGACACCCAGCCACTAATAGAAAAAAAATGGCGCGCCGGTAAGCGCGGTTATATTACAGGTTTGCAt > 1:9442/1‑150 (MQ=255)
caaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGAACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCAt < 1:3412171/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATc > 2:4426485/1‑150 (MQ=255)
cGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTACTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGAAACCCAGCCACTCATAGAACAACTCAGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATATTCCAGTTTTTCATACCtt > 2:3676070/1‑150 (MQ=255)
gCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCttt < 1:3572997/150‑1 (MQ=255)
gCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCttt < 2:760935/150‑1 (MQ=255)
cTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATATGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTa < 1:3625944/150‑1 (MQ=255)
cccGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTg < 2:3815552/150‑1 (MQ=255)
ggATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCg < 1:2254839/150‑1 (MQ=255)
gatgatGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTGTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGGTTTGCATCCCAGTAGTGGCgg > 2:532108/1‑150 (MQ=255)
gatgatGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCCCTCAAAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATATTCCAGGTTTGCATCCCTTTAGTGCCgg > 1:3860906/1‑150 (MQ=255)
atgatgACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGt < 2:4821543/150‑1 (MQ=255)
tgatgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTGCGCGCGTTTGTTTGCGAACTAGACACCCAGCCACACCTAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTCCAGTTTTGCATACCGTTAGTGGCGGTa > 1:1624966/1‑150 (MQ=255)
tgatgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTa < 2:2332580/150‑1 (MQ=255)
tgatgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACGCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCggga > 2:4562088/1‑148 (MQ=255)
atgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAAt < 2:225486/150‑1 (MQ=255)
tgaCTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAAtt < 2:1318118/150‑1 (MQ=255)
tCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGtt < 2:1665965/150‑1 (MQ=255)
ccGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTg < 2:1093052/150‑1 (MQ=255)
cGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGa < 2:1863662/150‑1 (MQ=255)
tggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAAtt < 1:2782937/150‑1 (MQ=255)
ggtgCTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTa < 1:5033163/150‑1 (MQ=255)
ggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCCGCCACTCATAGAACAACGCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCGTCCAGTTTTGCATCCCGTTAGTGCCGGGAATTTGCTGTTCCTGAATTa > 2:1348469/1‑150 (MQ=255)
ggtgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTa < 1:4010875/150‑1 (MQ=255)
tgATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTAcc < 1:3485349/150‑1 (MQ=255)
aTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCAt < 2:5106392/150‑1 (MQ=255)
tGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATc < 1:3886525/150‑1 (MQ=255)
tGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATc < 1:1762685/150‑1 (MQ=255)
cacaTACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCaaacgc > 2:283352/1‑145 (MQ=255)
acaTACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCa < 2:1565490/150‑1 (MQ=255)
caTACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCCGCCACTCATATAACAAATCTGGCGCCCCGGTAAGCGCGTATATATTACAGTTTTTCATCCCTTTAGTGCCGGTAAGTTGCTGTTACAGAATTACCATCCGCaa > 2:4237111/1‑150 (MQ=255)
aCGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGc < 1:3032412/150‑1 (MQ=255)
cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt < 1:651049/150‑1 (MQ=255)
cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt < 1:2677160/150‑1 (MQ=255)
cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt < 1:1021226/150‑1 (MQ=255)
cGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACt > 2:3909146/1‑150 (MQ=255)
tGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGt < 1:114170/150‑1 (MQ=255)
gTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGtg > 1:5268524/1‑150 (MQ=255)
aTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGtgat < 1:5127569/150‑1 (MQ=255)
aTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGtgat < 2:3126888/150‑1 (MQ=255)
ccTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGaa > 2:664326/1‑150 (MQ=255)
ctctctTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAc > 1:2618544/1‑150 (MQ=255)
ctctTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAg > 2:3045275/1‑150 (MQ=255)
ctTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGt < 1:144258/150‑1 (MQ=255)
ctTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGt < 2:3589398/150‑1 (MQ=255)
ttttGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGACCAGGtt < 2:5175798/150‑1 (MQ=255)
ttGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGa < 1:1536310/150‑1 (MQ=255)
gATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAg < 2:2561118/150‑1 (MQ=255)
aTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGa < 2:2625128/150‑1 (MQ=255)
tGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGAt > 1:766221/1‑150 (MQ=255)
cGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCa < 1:234074/150‑1 (MQ=255)
cGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCa < 2:4619649/150‑1 (MQ=255)
cGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCa < 2:4063130/150‑1 (MQ=255)
gAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCAt > 2:105307/1‑150 (MQ=255)
aaCTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATg < 1:1040096/150‑1 (MQ=255)
aCTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGa < 1:3356519/150‑1 (MQ=255)
|
CCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGA > CP009273/3049593‑3049886
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGC > CP009273/3049591‑3049888
|
ATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTA < SRR19973062.2291057/150‑1 (MQ=60)
TCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAG < SRR19973062.1029048/150‑1 (MQ=60)
TCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAG < SRR19973062.2211495/150‑1 (MQ=60)
CCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGA > SRR19973062.2142004/1‑150 (MQ=60)
GCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGTTGATGACTTATCCCCCTGTGGTGTTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACA < SRR19973062.2406778/150‑1 (MQ=60)
AATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCC > SRR19973062.3004499/1‑150 (MQ=60)
AATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTACTCTCATTTTATGGCGAACTAGACACCCA > SRR19973062.3004482/1‑150 (MQ=60)
ATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAG < SRR19973062.4184196/150‑1 (MQ=60)
ATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCA < SRR19973062.1035402/150‑1 (MQ=60)
ATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCA < SRR19973062.1035499/150‑1 (MQ=60)
TCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTGCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACA > SRR19973062.3369122/1‑150 (MQ=60)
TCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACT < SRR19973062.4126178/150‑1 (MQ=60)
TCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCATTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACG > SRR19973062.3369255/1‑150 (MQ=60)
GGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCA < SRR19973062.4239488/150‑1 (MQ=60)
GGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTTATTGCGAACTAGACACCCCGCCACTCA > SRR19973062.3280858/1‑150 (MQ=60)
GGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTACGCTCTTTTGTTTGCGAACAAGACACCCAGCCACACA > SRR19973062.2517851/1‑150 (MQ=60)
GCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCAT < SRR19973062.206011/150‑1 (MQ=60)
CAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATA < SRR19973062.3236121/150‑1 (MQ=60)
AACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGAAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAG < SRR19973062.2662691/150‑1 (MQ=60)
GTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTGATTGCGAACTAGACACCCCGCCACACATAGAAA > SRR19973062.2616683/1‑150 (MQ=60)
GTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAAC > SRR19973062.2616667/1‑150 (MQ=60)
TCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACA < SRR19973062.3440837/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACA < SRR19973062.3859066/150‑1 (MQ=60)
TCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACA < SRR19973062.3859052/150‑1 (MQ=60)
GTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAAaaaa > SRR19973062.4822156/1‑146 (MQ=60)
GTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAAC < SRR19973062.5009408/150‑1 (MQ=60)
GTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAAC < SRR19973062.2918809/150‑1 (MQ=60)
GTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTATCATTTGATTGCGAACTAGACACCCAGCCACACAAATAACAAC > SRR19973062.1255009/1‑150 (MQ=60)
GTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTGATTGCGAACTATAAACCCAGCCACTCATAGAACAAC > SRR19973062.4822152/1‑150 (MQ=60)
TCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT < SRR19973062.4232256/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACT < SRR19973062.1864139/150‑1 (MQ=60)
TCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACACTCTTTTTTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACA > SRR19973062.1240162/1‑150 (MQ=60)
TCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCACTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCCCTCATAGAACAACT > SRR19973062.1240134/1‑150 (MQ=60)
CGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTC < SRR19973062.1161240/150‑1 (MQ=60)
TGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTG < SRR19973062.2405344/150‑1 (MQ=60)
GTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCG < SRR19973062.5287239/150‑1 (MQ=60)
TAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGACCAAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACACTGGCGCG > SRR19973062.2101119/1‑150 (MQ=60)
AACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCGCTTTTGTTGGCGAACAAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACTGGCGCGC > SRR19973062.5310695/1‑150 (MQ=60)
CGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCGCTCTTTTGTTGGCGAACAAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCAGGCGCGCCG > SRR19973062.1290037/1‑150 (MQ=60)
CGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCAAAGAACAACACTGGCGCGCCGGTA > SRR19973062.2137960/1‑150 (MQ=60)
GGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTACTCTCGTTTGATTGCGAACAAGACACCCAGCCACACAGATAACAACACTGGCGCGCCCGTAA > SRR19973062.2080486/1‑150 (MQ=60)
GAACAACAGCTGGAAATGGGTCAACATGCCTCTTCCCGGTTGATGTGTTTTCCCCGGGTGGTGTTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTATACACCCAGCCACTCATATAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAG < SRR19973062.4226114/150‑1 (MQ=60)
GAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATTGCGAACAAGACACCCAGCCACACAAAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAG > SRR19973062.3534413/1‑150 (MQ=60)
AACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACAAAGAACAACTCGGGCGCGCCGGTAAGCGCG > SRR19973062.1253189/1‑150 (MQ=60)
AGCAGTAAATGGGTCATCAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGTTGGCAATTACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCAACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTAT < SRR19973062.1434980/150‑1 (MQ=60)
AGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTAT < SRR19973062.3887903/150‑1 (MQ=60)
AGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTAT < SRR19973062.2647448/150‑1 (MQ=60)
AATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCTAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCC < SRR19973062.1431998/150‑1 (MQ=60)
AATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCC < SRR19973062.2614606/150‑1 (MQ=60)
AATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCC < SRR19973062.3229562/150‑1 (MQ=60)
ATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCA < SRR19973062.2041351/150‑1 (MQ=60)
ATGGGTCAACAAGCCGATACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACTACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCA < SRR19973062.2548527/150‑1 (MQ=60)
GGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCTTTTGATGGCGCACAAGACACCCAGCCACACATAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATAACTTACAGTT > SRR19973062.1176414/1‑150 (MQ=60)
TCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTT < SRR19973062.1790379/150‑1 (MQ=60)
TCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTT < SRR19973062.1410331/150‑1 (MQ=60)
TCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTT < SRR19973062.322379/150‑1 (MQ=60)
TCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTT < SRR19973062.322365/150‑1 (MQ=60)
CAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTACAGTTTTG > SRR19973062.377333/1‑150 (MQ=60)
CAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGGAATCCGATCTTTTGATGGCGAACAACACACCCCGCCCCGCATAGAACAACTCAGGCGCGCCCGTAAGCGCGTATATCTTCCcggtttt > SRR19973062.377349/1‑143 (MQ=60)
AACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGGATTCCTCTCGTTTGTTGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATATAAAAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTACAGTTTTTC > SRR19973062.4694768/1‑150 (MQ=60)
CAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTGCGCGCTTTTGTTGGCGGACTAGACACCCAGCCACTAATAGAAAAAAAATGGCGCGCCGGTAAGCGCGgttatattacaggtttgcat > SRR19973062.9519/1‑130 (MQ=60)
CAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGAACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCAT < SRR19973062.3429646/150‑1 (MQ=60)
AAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATC < SRR19973062.4656469/150‑1 (MQ=60)
GCTACCCGGATGTTGACTTATCCCCCGTTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTT < SRR19973062.3591100/150‑1 (MQ=60)
GCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTT < SRR19973062.3591025/150‑1 (MQ=60)
GCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTT < SRR19973062.3591039/150‑1 (MQ=60)
GCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCGCTCTTTTTATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATATAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATATTACAGTTTTGCATCCCATT > SRR19973062.5246655/1‑150 (MQ=60)
CTACCCGGTTGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATATGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTA < SRR19973062.3645098/150‑1 (MQ=60)
CTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATATGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTA < SRR19973062.3644473/150‑1 (MQ=60)
ACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCTTTTGATGGCGAACTATACACCCAGCCACTCAAAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAATCGCGTATATCTTCCAGTTTTTCAGCCCGTTAGT > SRR19973062.407926/1‑150 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTTTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAAATCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATATTACAGTTTTGCATCCCATTAGTGCCG > SRR19973062.3050928/1‑150 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCG < SRR19973062.2266127/150‑1 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACTCAGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCATTAGTGCCG > SRR19973062.3421272/1‑150 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCACACAAATAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATAATCCAGTTTTGCATCCCATTAGTGCCG > SRR19973062.3050975/1‑150 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTTTTCCTCTCTTTTGTTTGCGAACTAGAAACCCACCCACGCATAGAACCACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCGTTAGTGGCG > SRR19973062.3369284/1‑150 (MQ=60)
GGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCACTTTTTATGGCCAAAAATACACCCCACCACACATATAACAACACTGGCGCGCCGGGAAGCCCGTAAATCTTACAGTTTTTCATCCCTATAGTGGCG > SRR19973062.3984348/1‑150 (MQ=41)
GATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACAAGACACCCAGCCCCTCAAAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATATTCCAGGTTTGCATCCCTTTAGTGCCGG > SRR19973062.3880615/1‑150 (MQ=60)
GATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTCCAGTGTTGCATCCCGTTAGTGCCGG > SRR19973062.3880546/1‑150 (MQ=60)
TGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTGCGCGCGTTTGTTTGCGAACTAGACACCCAGCCACACCTAGAACAACACTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTCCAGTTTTGCATACCGTTAGTGGCGGTA > SRR19973062.1632998/1‑150 (MQ=60)
TGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACACTCTTTTTATTGCGAACTATACACCCAGCCACACAAAGAAAAACAAAGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATAATACAGTTTTGCATACCATTAGTGCCGGTA > SRR19973062.1632978/1‑150 (MQ=60)
ACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTG < SRR19973062.165516/150‑1 (MQ=60)
CTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTTTTACTCGCGTTTGTTGGCGAACAAGACACCCAGCCACACATAGAACAACAATGGCGCGCCGGGAAGCGCGgatatattacaggttttcataccattatttgcgggtattttg > SRR19973062.1051613/1‑108 (MQ=45)
ATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCGTTTGATGGCGAAATAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGGTTTGCATACCGTTAGTGCCGGTAAATTGCTGT > SRR19973062.803310/1‑150 (MQ=60)
TCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTAGTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTT < SRR19973062.3028512/150‑1 (MQ=60)
CCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCGGTATTACTCTCTTTTTATGGCGAAAAATACACCCACCCACACAAAGAAAAACACTGGCGCGCCGGGAAGCGCGGGTATATTCCAGGTTTTCATACCGTTAGTGGGGGTAATTTGCTGTTCCTG > SRR19973062.3712104/1‑150 (MQ=24)
GGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAA < SRR19973062.1079076/150‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATT < SRR19973062.3800841/150‑1 (MQ=60)
TGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATT < SRR19973062.2797637/150‑1 (MQ=60)
GGTTATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTA < SRR19973062.5059892/150‑1 (MQ=60)
GGTGCTGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTA < SRR19973062.5059837/150‑1 (MQ=60)
GGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTA < SRR19973062.4031118/150‑1 (MQ=60)
GGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTA < SRR19973062.68185/150‑1 (MQ=60)
GTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTACTCTCGTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACACATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGGATATCTTCCAGTTTTTCATCCCATTAGTGGCGGGAATTTTCTGTTacagaattaa > SRR19973062.3427708/1‑140 (MQ=60)
TGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACC < SRR19973062.3503059/150‑1 (MQ=60)
TGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATC < SRR19973062.3906340/150‑1 (MQ=60)
TGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATC < SRR19973062.1771236/150‑1 (MQ=60)
GCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCG < SRR19973062.5083071/150‑1 (MQ=60)
TACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAG < SRR19973062.2250289/150‑1 (MQ=60)
ACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGC < SRR19973062.3048212/150‑1 (MQ=60)
GGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGA > SRR19973062.3993142/1‑150 (MQ=60)
GTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAA < SRR19973062.347198/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.654094/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.1026017/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.653900/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.2693371/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.2691188/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT < SRR19973062.2693379/150‑1 (MQ=60)
CGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACT > SRR19973062.3357733/1‑150 (MQ=60)
CTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGG > SRR19973062.4215033/1‑150 (MQ=60)
TGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGT < SRR19973062.114881/150‑1 (MQ=60)
GTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTG > SRR19973062.5296238/1‑150 (MQ=60)
GTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTG > SRR19973062.745079/1‑150 (MQ=60)
TTTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCTCTCATAGATCACCTCTGGCGCGCCGGTTAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGAT < SRR19973062.3552837/150‑1 (MQ=60)
ATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGAT < SRR19973062.5154696/150‑1 (MQ=60)
CTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC > SRR19973062.1063229/1‑150 (MQ=60)
CTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC < SRR19973062.3903914/150‑1 (MQ=60)
CTCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAAC > SRR19973062.2632360/1‑150 (MQ=60)
TCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACA < SRR19973062.2353699/150‑1 (MQ=60)
TCTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACA < SRR19973062.2826722/150‑1 (MQ=60)
CTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAG > SRR19973062.1522028/1‑150 (MQ=60)
CTCTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAG > SRR19973062.1521670/1‑150 (MQ=60)
CTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGT < SRR19973062.145107/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGACGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGT < SRR19973062.774131/150‑1 (MQ=60)
CTTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGACGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGT < SRR19973062.1694477/150‑1 (MQ=60)
TTTTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGTATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTT < SRR19973062.3604808/150‑1 (MQ=60)
TTGATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGA < SRR19973062.1543885/150‑1 (MQ=60)
ATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGA > SRR19973062.1408582/1‑150 (MQ=60)
ATGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGA > SRR19973062.691488/1‑150 (MQ=60)
TGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGAT < SRR19973062.162812/150‑1 (MQ=60)
TGGCGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGAT > SRR19973062.769673/1‑150 (MQ=60)
CGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAGAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA < SRR19973062.235279/150‑1 (MQ=60)
CGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA < SRR19973062.3780457/150‑1 (MQ=60)
CGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA < SRR19973062.235273/150‑1 (MQ=60)
CGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA < SRR19973062.235241/150‑1 (MQ=60)
CGAACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCA < SRR19973062.2058404/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973062.1044970/150‑1 (MQ=60)
AACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATG < SRR19973062.1170501/150‑1 (MQ=60)
ACTAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGA < SRR19973062.3373805/150‑1 (MQ=60)
TAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGC > SRR19973062.2361454/1‑150 (MQ=60)
TAGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGC < SRR19973062.1019685/150‑1 (MQ=60)
|
ATCCGCAAAATGATTCGGCAACGTCGTCGTGCGTTAACGCCGGAACAACAGCAGGAAATGGGTCAACAAGCCGCTACCCGGATGATGACTTATCCCCCGGTGGTGATGGCACATACGGTCGCTGTATTCCTCTCTTTTGATGGCGAACTCGACACCCAGCCACTCATAGAACAACTCTGGCGCGCCGGTAAGCGCGTATATCTTCCAGTTTTGCATCCCTTTAGTGCCGGTAATTTGCTGTTCCTGAATTACCATCCGCAAAGCGAACTGGTGATGAACAGGTTGAAGATCCATGAGC > CP009273/3049591‑3049888
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |