Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,400,858 |
C→A |
100% |
intergenic (‑738/‑182) |
lrhA ← / → alaA |
transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,400,858 | 0 | C | A | 97.8%
| 714.7
/ 5.6
| 228 | intergenic (‑738/‑182) | lrhA/alaA | transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/5); new base A (93/129); total (93/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.03e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 228 total aligned reads displayed.
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACG > CP009273/2400713‑2401001
|
gTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaa < 1:512366/148‑1 (MQ=255)
ttAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaaa > 2:2798687/1‑148 (MQ=255)
ttAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaaa > 1:16243/1‑148 (MQ=255)
tAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAg > 2:2087405/1‑148 (MQ=255)
aaCTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCa < 1:2513796/148‑1 (MQ=255)
aaCTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCa < 1:1574911/148‑1 (MQ=255)
aaCTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCa < 2:2895554/148‑1 (MQ=255)
ctcCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCAtata < 2:2979705/148‑1 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATaca < 1:2733306/148‑1 (MQ=255)
gTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATCCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACAcc > 1:448990/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCa < 2:511192/148‑1 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCa < 1:1585/148‑1 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCa < 1:297894/148‑1 (MQ=255)
tGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat > 2:617877/1‑148 (MQ=255)
tGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAAGTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat < 2:1818598/148‑1 (MQ=255)
gAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCatt < 1:3048983/148‑1 (MQ=255)
gAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt < 1:2625355/148‑1 (MQ=255)
aaaTATCATCATCGCTTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAttt < 1:1797323/148‑1 (MQ=255)
aaaTATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAttt > 1:1019756/1‑148 (MQ=255)
tatCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGt < 2:1930216/148‑1 (MQ=255)
atcataataGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTTAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTc < 1:2060207/148‑1 (MQ=255)
atcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCatt > 2:3220688/1‑148 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat < 1:2217130/148‑1 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat < 1:1959727/148‑1 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat > 2:1034513/1‑148 (MQ=255)
atcTCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattatt < 2:542548/148‑1 (MQ=255)
tcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAttatta > 2:237330/1‑148 (MQ=255)
tcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAttatta < 2:213671/148‑1 (MQ=255)
gTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtt < 2:28612/148‑1 (MQ=255)
tttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtta > 1:246134/1‑148 (MQ=255)
tttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtta > 1:2760747/1‑148 (MQ=255)
tttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtta > 2:2742056/1‑148 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttat > 1:746426/1‑148 (MQ=255)
cATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttatta > 2:143532/1‑148 (MQ=255)
ttAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAc < 1:2008463/148‑1 (MQ=255)
ttAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAc < 2:881544/148‑1 (MQ=255)
aaTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGcaca < 2:958944/148‑1 (MQ=255)
aaTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGcaca < 1:2463482/148‑1 (MQ=255)
aTTCTTAAATGAGTCATTTTCACACAATTATCTTACAGATTAAAAATCCTTACTTACAATTATGAATCTGAACAATTCACTATATTACTTTGTATGTAAAGCATATTCTCCTGATTATTTTGTCATTATTTAGTTTTTAACatgagat < 2:225744/148‑7 (MQ=255)
aTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACaa < 1:2094129/148‑1 (MQ=255)
tAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAg > 1:2195751/1‑148 (MQ=255)
aaTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGcc < 2:1990601/148‑1 (MQ=255)
aTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCt > 2:1362255/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCt > 2:3108987/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCt > 1:1495278/1‑148 (MQ=255)
tGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCtt < 1:2812179/148‑1 (MQ=255)
gAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTc > 2:1777688/1‑148 (MQ=255)
aGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcc < 2:396214/148‑1 (MQ=255)
ggCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTccc < 1:3327496/148‑1 (MQ=255)
cATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCct < 1:652129/148‑1 (MQ=255)
tttCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTg < 1:1386479/148‑1 (MQ=255)
cacacaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcc < 1:241760/139‑1 (MQ=255)
cacaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCaaa > 1:326379/1‑148 (MQ=255)
tATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCACTGGCAAAATCTTa > 1:3199509/1‑148 (MQ=255)
tATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTCACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTa > 2:1734311/1‑148 (MQ=255)
cTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTc < 1:813880/148‑1 (MQ=255)
cTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTc < 1:1071153/148‑1 (MQ=255)
ttACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCt > 2:2927373/1‑148 (MQ=255)
aTAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAc > 2:1160562/1‑148 (MQ=255)
tAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAcc < 2:3330359/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCt > 2:645099/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCt < 1:2427335/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCt > 2:2258752/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaCCAGACTTACAATTAATAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAACCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCtt < 2:1977388/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCtt < 1:1233628/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCtt < 1:912178/148‑1 (MQ=255)
aaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaa > 1:2318744/1‑148 (MQ=255)
aCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaaaa > 1:349718/1‑148 (MQ=255)
aCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaaaa < 2:1545162/148‑1 (MQ=255)
cAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAaca > 1:2707538/1‑148 (MQ=255)
aGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAacac < 2:706830/148‑1 (MQ=255)
aGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAacac < 2:256230/148‑1 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAcc < 1:998212/148‑1 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTAAAAACAcc > 2:118067/1‑148 (MQ=255)
aCTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCACAACACCg > 2:3408853/1‑148 (MQ=255)
aCTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg > 1:3165490/1‑148 (MQ=255)
cTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGt > 2:2602547/1‑148 (MQ=255)
ttACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTTAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTc < 2:2888308/148‑1 (MQ=255)
ttACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTc < 1:2828027/148‑1 (MQ=255)
ttACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTc > 1:1517377/1‑148 (MQ=255)
ttACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTc > 2:2589388/1‑148 (MQ=255)
cAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTg < 2:2790556/148‑1 (MQ=255)
cAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTg > 2:747312/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTgggg < 1:2569085/148‑1 (MQ=255)
tAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTggggg < 1:1165696/148‑1 (MQ=255)
tCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACa < 2:1610037/148‑1 (MQ=255)
tCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACa < 2:2760747/148‑1 (MQ=255)
cAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACAt < 2:479502/148‑1 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt < 1:1502899/148‑1 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt < 1:2234025/148‑1 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt < 1:2233876/148‑1 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAg > 1:827599/1‑148 (MQ=255)
cACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGc < 1:865293/148‑1 (MQ=255)
aCTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCt < 1:101358/148‑1 (MQ=255)
tatataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGa > 2:3319385/1‑148 (MQ=255)
tatataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGa < 1:3138365/148‑1 (MQ=255)
ataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACtt > 2:695591/1‑148 (MQ=255)
taACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTc < 1:617877/148‑1 (MQ=255)
aaCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc < 1:2258752/148‑1 (MQ=255)
aaCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc > 2:1906135/1‑148 (MQ=255)
|
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACG > CP009273/2400713‑2401001
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGG > CP009273/2400716‑2401006
|
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAA > SRR19973065.16481/1‑150 (MQ=60)
GTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAG < SRR19973065.515759/150‑1 (MQ=60)
GTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAG < SRR19973065.515728/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATA < SRR19973065.2529591/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATA < SRR19973065.757306/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATA < SRR19973065.310421/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATA < SRR19973065.2090761/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTAATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATA < SRR19973065.1585399/150‑1 (MQ=60)
ACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATAT < SRR19973065.2134631/150‑1 (MQ=60)
ACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATAT > SRR19973065.2328770/1‑150 (MQ=60)
ACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATAT > SRR19973065.2328744/1‑150 (MQ=60)
TCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATAC < SRR19973065.1071344/150‑1 (MQ=60)
CCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACC < SRR19973065.2750309/150‑1 (MQ=60)
CCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATCCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACC > SRR19973065.452106/1‑150 (MQ=60)
TAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCA > SRR19973065.2822235/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTGTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCAGATACACCTCAT > SRR19973065.711543/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973065.1601/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT > SRR19973065.582040/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973065.299815/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973065.1143363/150‑1 (MQ=60)
GAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAT < SRR19973065.3067635/150‑1 (MQ=60)
GAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAT < SRR19973065.3067602/150‑1 (MQ=60)
GGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTT > SRR19973065.1026518/1‑150 (MQ=60)
GAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTT < SRR19973065.2641597/150‑1 (MQ=60)
AAATATCATCATCGCTTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTG < SRR19973065.1809131/150‑1 (MQ=60)
AAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTG < SRR19973065.1809138/150‑1 (MQ=60)
TATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCA < SRR19973065.3262075/150‑1 (MQ=60)
ATCATAATAGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTTAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAT < SRR19973065.2073351/150‑1 (MQ=60)
CATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTA > SRR19973065.1618888/1‑150 (MQ=60)
CATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTA < SRR19973065.2232915/150‑1 (MQ=60)
ATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTAT < SRR19973065.1519134/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA < SRR19973065.1634080/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA < SRR19973065.2231261/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA < SRR19973065.2231288/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA < SRR19973065.1972526/150‑1 (MQ=60)
CGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGT > SRR19973065.316398/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA > SRR19973065.2778257/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA > SRR19973065.2777909/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA > SRR19973065.247875/1‑150 (MQ=60)
GTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTAT > SRR19973065.751421/1‑150 (MQ=60)
ATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACAAAATTATCTTACAGATAAAAAAAACAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACA < SRR19973065.938264/150‑1 (MQ=60)
TTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAG < SRR19973065.2021429/150‑1 (MQ=60)
TGAATTCTTAAATGAGGAATTTTAACAAAATTATATTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACA < SRR19973065.2558762/150‑1 (MQ=60)
GAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAGTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGACTGAAAAGCATATACACATCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAA > SRR19973065.3064593/1‑150 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT < SRR19973065.2478940/150‑1 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT < SRR19973065.87485/150‑1 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT < SRR19973065.2479009/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973065.2107582/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC > SRR19973065.1234685/1‑150 (MQ=60)
CTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAG > SRR19973065.2209820/1‑150 (MQ=60)
AAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCT > SRR19973065.1504892/1‑150 (MQ=60)
TGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCC < SRR19973065.2829566/150‑1 (MQ=60)
ccgatcTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCC < SRR19973065.243482/144‑1 (MQ=60)
GGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCT < SRR19973065.3347801/150‑1 (MQ=60)
GGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCT < SRR19973065.3308289/150‑1 (MQ=60)
gattttcaacacatttaaCTTACACATAAAAAAACCAGACTTCAATTTAAGAATCATAACATTTCACT‑TTTTACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973065.655700/132‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973065.1473261/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973065.656423/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAGTATTAAGGTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTG > SRR19973065.2837027/1‑150 (MQ=60)
TTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGNC < SRR19973065.1395589/150‑1 (MQ=60)
TTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCA > SRR19973065.1509556/1‑150 (MQ=60)
TCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAA > SRR19973065.1991394/1‑150 (MQ=60)
CACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAA > SRR19973065.328651/1‑150 (MQ=60)
ATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCACTGGCAAAATCTTA > SRR19973065.3218778/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTAT < SRR19973065.2033317/150‑1 (MQ=60)
TCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCT < SRR19973065.2748697/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTG < SRR19973065.819255/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTG < SRR19973065.1078241/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTG < SRR19973065.819246/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC < SRR19973065.2442652/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC < SRR19973065.2442658/150‑1 (MQ=60)
AAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCA < SRR19973065.2682795/150‑1 (MQ=60)
AAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCA < SRR19973065.918119/150‑1 (MQ=60)
AAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCA < SRR19973065.1241708/150‑1 (MQ=60)
AAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAA > SRR19973065.2333276/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAA > SRR19973065.352166/1‑150 (MQ=60)
ACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACA > SRR19973065.2724369/1‑150 (MQ=60)
CCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAC < SRR19973065.1751129/150‑1 (MQ=60)
AGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCG > SRR19973065.3184666/1‑150 (MQ=60)
GACTTACAATTAAGAATCATAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGT < SRR19973065.2766974/150‑1 (MQ=60)
GACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGT < SRR19973065.1004843/150‑1 (MQ=60)
ACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTC > SRR19973065.1527298/1‑150 (MQ=60)
ACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTC > SRR19973065.1527284/1‑150 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973065.2845477/150‑1 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973065.2845557/150‑1 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973065.867806/150‑1 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973065.867306/150‑1 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973065.3214488/150‑1 (MQ=60)
TTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGA < SRR19973065.2585124/150‑1 (MQ=60)
TAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAG < SRR19973065.1173140/150‑1 (MQ=60)
TAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAG < SRR19973065.1173458/150‑1 (MQ=60)
AATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACA > SRR19973065.1021980/1‑150 (MQ=60)
AATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACA > SRR19973065.2220917/1‑150 (MQ=60)
TCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATT < SRR19973065.2441202/150‑1 (MQ=60)
CAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTG < SRR19973065.2605504/150‑1 (MQ=60)
CAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTG < SRR19973065.2605425/150‑1 (MQ=60)
AGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGT < SRR19973065.2464169/150‑1 (MQ=60)
AACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTC > SRR19973065.2512637/1‑150 (MQ=60)
AACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTC > SRR19973065.3419301/1‑150 (MQ=60)
ACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACACTCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACCCCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCT < SRR19973065.2248250/150‑1 (MQ=60)
ACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCT < SRR19973065.2248174/150‑1 (MQ=60)
ACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCT < SRR19973065.2248086/150‑1 (MQ=60)
ACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCT < SRR19973065.2248235/150‑1 (MQ=60)
ACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCT < SRR19973065.1512624/150‑1 (MQ=60)
CAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTA < SRR19973065.3534529/150‑1 (MQ=60)
ATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTGACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAG < SRR19973065.239035/150‑1 (MQ=60)
ATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAG > SRR19973065.2038452/1‑150 (MQ=60)
ATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAG > SRR19973065.833016/1‑150 (MQ=60)
TTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGC < SRR19973065.1536364/150‑1 (MQ=60)
CACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTG < SRR19973065.870853/150‑1 (MQ=60)
ACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGA < SRR19973065.102289/150‑1 (MQ=60)
ACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGA < SRR19973065.3533691/150‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT > SRR19973065.3282634/1‑150 (MQ=60)
TATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT < SRR19973065.3157444/150‑1 (MQ=60)
ATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCC > SRR19973065.1594719/1‑150 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973065.621847/150‑1 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA > SRR19973065.1324315/1‑150 (MQ=60)
AACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCAC < SRR19973065.2273040/150‑1 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC < SRR19973065.741326/150‑1 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973065.2398054/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973065.2398075/1‑150 (MQ=60)
TGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAG > SRR19973065.1192084/1‑150 (MQ=60)
TGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAG > SRR19973065.1191670/1‑150 (MQ=60)
TGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAG > SRR19973065.1191645/1‑150 (MQ=60)
GAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGG < SRR19973065.3199986/150‑1 (MQ=60)
|
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGG > CP009273/2400716‑2401006
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
