Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,400,858 |
C→A |
100% |
intergenic (‑738/‑182) |
lrhA ← / → alaA |
transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,400,858 | 0 | C | A | 96.9%
| 813.3
/ 13.6
| 260 | intergenic (‑738/‑182) | lrhA/alaA | transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/4); new base A (135/117); total (139/121) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 260 total aligned reads displayed.
ACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > CP009273/2400712‑2401003
|
cAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTa < 2:180925/149‑1 (MQ=255)
ctctCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCatat < 1:3912059/149‑1 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATacac > 2:2529945/1‑149 (MQ=255)
cGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACAcc < 1:111324/149‑1 (MQ=255)
tAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTc < 1:3224629/149‑1 (MQ=255)
aaTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCa < 2:737286/149‑1 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat < 2:3906506/149‑1 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat > 2:1674855/1‑149 (MQ=255)
aTGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat > 2:106145/1‑149 (MQ=255)
aGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattat < 1:916763/149‑1 (MQ=255)
ggAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt > 1:1012870/1‑149 (MQ=255)
ggAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt > 1:1012865/1‑149 (MQ=255)
ggAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt < 1:1408668/149‑1 (MQ=255)
gAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAttt > 1:1907279/1‑149 (MQ=255)
atatCATCATCGCGTTTAATTAGTGAATTCTTAAATGAGTCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGt < 2:2876581/149‑1 (MQ=255)
atcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCatta > 2:615368/1‑149 (MQ=255)
atcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCatta < 1:2912783/149‑1 (MQ=255)
tcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat < 2:2865988/149‑1 (MQ=255)
tcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat > 1:1186123/1‑149 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattatt < 2:208059/149‑1 (MQ=255)
atcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAttatta > 2:1625140/1‑149 (MQ=255)
atcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAttatta < 1:1267312/149‑1 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttatt < 2:51801/149‑1 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttatt < 1:3648582/149‑1 (MQ=255)
tCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttatta > 2:2449330/1‑149 (MQ=255)
cATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTaa < 2:1282415/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAc > 1:1073015/1‑149 (MQ=255)
gTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGca < 2:4112340/149‑1 (MQ=255)
gTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAAAGca > 2:1967915/1‑149 (MQ=255)
gAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGcaca > 1:4014432/1‑149 (MQ=255)
gAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTCGTCATTATTAAGTTATTAACAGcaca > 2:1414026/1‑149 (MQ=255)
aTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAt < 1:1809683/149‑1 (MQ=255)
ttCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATc < 1:3143428/149‑1 (MQ=255)
ttCTTAAATGAGGCATTTTCACAATATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGAATTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTTAATGTAAAGCATATACTCCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATc < 1:3224783/149‑1 (MQ=255)
ttAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAg < 2:3594967/149‑1 (MQ=255)
ttAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAg < 2:3594444/149‑1 (MQ=255)
ttAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAg < 2:1974589/149‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGcc < 2:136433/149‑1 (MQ=255)
aaTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCt < 1:2229163/149‑1 (MQ=255)
aTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCtt > 1:1356380/1‑149 (MQ=255)
gAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcc > 1:2298820/1‑149 (MQ=255)
gAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcc < 1:449737/149‑1 (MQ=255)
cacacaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCaa > 1:3525220/1‑149 (MQ=255)
cacacaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCaa > 1:1476983/1‑149 (MQ=255)
cacaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCaaaa > 1:3027286/1‑149 (MQ=255)
acaATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAAt > 1:1658369/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTa > 1:2326681/1‑149 (MQ=255)
ttATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTa < 2:3914419/149‑1 (MQ=255)
tCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTc < 1:625365/149‑1 (MQ=255)
ttACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTa > 1:3994583/1‑144 (MQ=255)
tACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGc < 1:1939047/149‑1 (MQ=255)
tACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGc > 2:2827692/1‑149 (MQ=255)
aGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCAGTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGa > 2:4048253/1‑149 (MQ=255)
gATAAAAAAACCAGACTTACAGTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAc > 2:2144516/1‑149 (MQ=255)
gATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAc > 1:1947164/1‑149 (MQ=255)
gATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAc > 1:1308436/1‑149 (MQ=255)
aTAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAcc > 2:2675257/1‑149 (MQ=255)
tAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCt > 2:1117401/1‑149 (MQ=255)
aaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaaaa > 1:2324151/1‑149 (MQ=255)
aCCAGACTTACAGTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAATac > 2:3951990/1‑149 (MQ=255)
aCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGTCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAac < 2:3277349/149‑1 (MQ=255)
ccAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAaca < 1:2104128/149‑1 (MQ=255)
aGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAcc < 1:456203/149‑1 (MQ=255)
aGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAcc > 1:2550918/1‑149 (MQ=255)
aGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAcc > 1:2755697/1‑149 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg > 2:1705355/1‑149 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg < 2:2535149/149‑1 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg > 2:3875317/1‑149 (MQ=255)
aCTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGt > 2:1528032/1‑149 (MQ=255)
aCAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTg > 1:3960900/1‑149 (MQ=255)
aaTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTggg > 2:2324110/1‑149 (MQ=255)
aTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTgggg > 2:2314988/1‑149 (MQ=255)
aTCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACa < 2:178708/149‑1 (MQ=255)
tCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTGCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACAt > 2:2728546/1‑149 (MQ=255)
gAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGt < 1:2360419/149‑1 (MQ=255)
aaCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt > 1:2603451/1‑149 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGAACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTc > 2:2140875/1‑149 (MQ=255)
cAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCt > 2:3654604/1‑149 (MQ=255)
aaTTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTa > 1:1694732/1‑149 (MQ=255)
aTTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTaa > 2:3212633/1‑149 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGc < 1:2530518/149‑1 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGc > 1:3414899/1‑149 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGc > 1:4087356/1‑149 (MQ=255)
cACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCt > 2:3506713/1‑149 (MQ=255)
cACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGCTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCGGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCt > 2:1459204/1‑149 (MQ=255)
tatataACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc < 1:823921/149‑1 (MQ=255)
tatataACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc < 1:823405/149‑1 (MQ=255)
tatataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc > 2:30038/1‑149 (MQ=255)
tatataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc < 2:3823791/149‑1 (MQ=255)
tatataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc > 2:2111739/1‑149 (MQ=255)
tataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACtt < 1:1804329/149‑1 (MQ=255)
tataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACtt > 1:331968/1‑149 (MQ=255)
taACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc < 1:1288680/149‑1 (MQ=255)
taACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc > 1:2063728/1‑149 (MQ=255)
taACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc < 1:173431/149‑1 (MQ=255)
aaCATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCa > 1:375457/1‑149 (MQ=255)
aaCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCa > 2:2632136/1‑149 (MQ=255)
aCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCAc < 2:2095976/149‑1 (MQ=255)
ttGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGc > 1:1336752/1‑149 (MQ=255)
ttGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGc > 1:268661/1‑149 (MQ=255)
|
ACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > CP009273/2400712‑2401003
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGGG > CP009273/2400709‑2401007
|
ATCACGCATTTAAACTATAAGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGA < SRR19973068.3007724/150‑1 (MQ=60)
ATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGA < SRR19973068.3007954/150‑1 (MQ=60)
CACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAAT < SRR19973068.674676/150‑1 (MQ=60)
ACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATG < SRR19973068.1251154/150‑1 (MQ=60)
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGT < SRR19973068.2979997/150‑1 (MQ=60)
gtggcatgacgttattgccggaatAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAACTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTA < SRR19973068.1563315/126‑1 (MQ=60)
gtggcatgacgttattgccggaatAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTA < SRR19973068.1563247/126‑1 (MQ=60)
gtggcatgacgttattgccggaatAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTA < SRR19973068.1563335/126‑1 (MQ=60)
CAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATAAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAA < SRR19973068.1928125/150‑1 (MQ=60)
AAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCAT > SRR19973068.3424448/1‑150 (MQ=60)
ACTCTCATTAATGATGAAATATCATCATCGCGTTTCTTTAGTGAATTATTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACATATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATAT < SRR19973068.1409172/150‑1 (MQ=60)
CTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATA < SRR19973068.3935729/150‑1 (MQ=60)
CTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACA > SRR19973068.1799114/1‑150 (MQ=60)
CGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCT < SRR19973068.112400/150‑1 (MQ=60)
CGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCT < SRR19973068.2925691/150‑1 (MQ=60)
GTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTC < SRR19973068.485806/150‑1 (MQ=60)
TAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCA < SRR19973068.3244453/150‑1 (MQ=60)
AATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCAT > SRR19973068.1342271/1‑150 (MQ=60)
TGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTA > SRR19973068.1024038/1‑150 (MQ=60)
AGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATT < SRR19973068.922936/150‑1 (MQ=60)
AGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATT > SRR19973068.1019453/1‑150 (MQ=60)
AGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATT > SRR19973068.1019452/1‑150 (MQ=60)
AGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATT > SRR19973068.1019457/1‑150 (MQ=60)
GGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTT > SRR19973068.1919942/1‑150 (MQ=60)
GGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTT < SRR19973068.408685/150‑1 (MQ=60)
GGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTT < SRR19973068.1417750/150‑1 (MQ=60)
AAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTG < SRR19973068.2293324/150‑1 (MQ=60)
ATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAT > SRR19973068.3181595/1‑150 (MQ=60)
ATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAT < SRR19973068.3317187/150‑1 (MQ=60)
ATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTAT > SRR19973068.1194048/1‑150 (MQ=60)
ATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTAT < SRR19973068.2930900/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA < SRR19973068.3988660/150‑1 (MQ=60)
ATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAA < SRR19973068.1275674/150‑1 (MQ=60)
ATCGCGTTTCATTAGTGAATCCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAA < SRR19973068.177651/150‑1 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA > SRR19973068.2511674/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA > SRR19973068.3528972/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA < SRR19973068.458291/150‑1 (MQ=60)
GTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTAT > SRR19973068.657330/1‑150 (MQ=60)
TTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTA < SRR19973068.3670677/150‑1 (MQ=60)
CATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAC < SRR19973068.4035210/150‑1 (MQ=60)
CATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAC > SRR19973068.411855/1‑150 (MQ=60)
CATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAC > SRR19973068.1080082/1‑150 (MQ=60)
CATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAAC > SRR19973068.552481/1‑150 (MQ=60)
TAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGC < SRR19973068.2716306/150‑1 (MQ=60)
TAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGC < SRR19973068.86120/150‑1 (MQ=60)
TGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACA > SRR19973068.4038675/1‑150 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT < SRR19973068.848537/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973068.1821559/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973068.2029205/150‑1 (MQ=60)
TTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCG < SRR19973068.3162723/150‑1 (MQ=60)
TTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCG < SRR19973068.3244559/150‑1 (MQ=60)
TTCTTAAATGAGGCATTTTCACAATATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGAATTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTTAATGTAAAGCATATACTCCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCG < SRR19973068.3244607/150‑1 (MQ=60)
TCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGA < SRR19973068.174736/150‑1 (MQ=60)
AAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCT < SRR19973068.3070798/150‑1 (MQ=60)
AATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTT < SRR19973068.2243259/150‑1 (MQ=60)
AATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTT > SRR19973068.1365092/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTT < SRR19973068.2243712/150‑1 (MQ=60)
TGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCC > SRR19973068.2313686/1‑150 (MQ=60)
GAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCC < SRR19973068.13931/150‑1 (MQ=60)
GAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCC < SRR19973068.452925/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCC < SRR19973068.785300/150‑1 (MQ=60)
GCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTC < SRR19973068.1093518/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTTTCTTACATATAAAAAAACCAGAATTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAACCTTCCCCTCT < SRR19973068.1279093/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAACCTTCCCCTCT < SRR19973068.3842432/150‑1 (MQ=60)
TTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGG > SRR19973068.2344610/1‑150 (MQ=60)
TCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAA > SRR19973068.3546656/1‑150 (MQ=60)
TCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAA > SRR19973068.3546851/1‑150 (MQ=60)
TCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAA > SRR19973068.1486694/1‑150 (MQ=60)
TCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAA < SRR19973068.1389429/150‑1 (MQ=60)
ACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAA > SRR19973068.3045897/1‑150 (MQ=60)
CACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAAT > SRR19973068.1669109/1‑150 (MQ=60)
CACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAAT > SRR19973068.1669642/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTT > SRR19973068.3933508/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTT > SRR19973068.233904/1‑150 (MQ=60)
ATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTA > SRR19973068.2340397/1‑150 (MQ=60)
ATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTA > SRR19973068.2341665/1‑150 (MQ=60)
TATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATT < SRR19973068.364636/150‑1 (MQ=60)
TCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCT < SRR19973068.629507/150‑1 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATagat > SRR19973068.4018729/1‑146 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATagat > SRR19973068.4018509/1‑146 (MQ=60)
CTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTG < SRR19973068.3107114/150‑1 (MQ=60)
TACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCA < SRR19973068.1951938/150‑1 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973068.1311156/1‑150 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973068.1316998/1‑150 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973068.1960098/1‑150 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC < SRR19973068.1138968/150‑1 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973068.1311116/1‑150 (MQ=60)
TAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTT < SRR19973068.2194579/150‑1 (MQ=60)
AAAAACACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC < SRR19973068.16746/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC > SRR19973068.3760486/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC > SRR19973068.2630859/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAA > SRR19973068.2339123/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAA > SRR19973068.2339172/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAA > SRR19973068.1852424/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAA > SRR19973068.1852419/1‑150 (MQ=60)
AACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAAC > SRR19973068.265616/1‑150 (MQ=60)
CCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAC < SRR19973068.2117853/150‑1 (MQ=60)
CAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACC > SRR19973068.2567096/1‑150 (MQ=60)
CAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACC > SRR19973068.2772626/1‑150 (MQ=60)
CAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACC > SRR19973068.2772618/1‑150 (MQ=60)
AGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCG < SRR19973068.459432/150‑1 (MQ=60)
AGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCG > SRR19973068.426361/1‑150 (MQ=60)
GACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGT < SRR19973068.1958362/150‑1 (MQ=60)
GACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGT < SRR19973068.1958547/150‑1 (MQ=60)
CTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCC > SRR19973068.1561289/1‑150 (MQ=60)
CTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCC > SRR19973068.1350363/1‑150 (MQ=60)
TACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTG > SRR19973068.3984856/1‑150 (MQ=60)
TACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTG > SRR19973068.3984838/1‑150 (MQ=60)
TTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGA > SRR19973068.1363599/1‑150 (MQ=60)
TTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGA < SRR19973068.1132188/150‑1 (MQ=60)
CAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTCGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTG < SRR19973068.1423191/150‑1 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973068.2618268/1‑150 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973068.2619875/1‑150 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT < SRR19973068.2375533/150‑1 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973068.3261561/1‑150 (MQ=60)
CAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTA < SRR19973068.1070613/150‑1 (MQ=60)
CAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTA > SRR19973068.1705591/1‑150 (MQ=60)
CAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTA > SRR19973068.1705620/1‑150 (MQ=60)
AATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAA > SRR19973068.319596/1‑150 (MQ=60)
AATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAA > SRR19973068.4038268/1‑150 (MQ=60)
TTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGC > SRR19973068.3435516/1‑150 (MQ=60)
TTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGC > SRR19973068.4111865/1‑150 (MQ=60)
TCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCT < SRR19973068.2546031/150‑1 (MQ=60)
TCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCT < SRR19973068.2546608/150‑1 (MQ=60)
CTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAC < SRR19973068.2339082/150‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT < SRR19973068.829520/150‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT < SRR19973068.829484/150‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT < SRR19973068.829003/150‑1 (MQ=60)
ATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTT > SRR19973068.334084/1‑150 (MQ=60)
TATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTC < SRR19973068.1817029/150‑1 (MQ=60)
TATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTC < SRR19973068.1816154/150‑1 (MQ=60)
ATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCC > SRR19973068.124146/1‑150 (MQ=60)
ATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCC > SRR19973068.2077134/1‑150 (MQ=60)
ATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCC > SRR19973068.2077235/1‑150 (MQ=60)
TAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA > SRR19973068.378010/1‑150 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973068.1297147/150‑1 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973068.2553781/150‑1 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973068.174839/150‑1 (MQ=60)
ACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACG > SRR19973068.1988833/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973068.1345399/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973068.270551/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCACCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTGAAAACACCGTCCTGGGGGAGTAAATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973068.3530837/1‑150 (MQ=60)
TTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCA < SRR19973068.2588233/150‑1 (MQ=60)
TGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAG > SRR19973068.112449/1‑150 (MQ=60)
GAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGG < SRR19973068.1418721/150‑1 (MQ=60)
GAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGG < SRR19973068.1576758/150‑1 (MQ=60)
AATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGGG > SRR19973068.1074343/1‑150 (MQ=60)
|
ATCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCAGGG > CP009273/2400709‑2401007
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
