Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,400,858 |
C→A |
100% |
intergenic (‑738/‑182) |
lrhA ← / → alaA |
transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,400,858 | 0 | C | A | 97.4%
| 973.3
/ 13.5
| 309 | intergenic (‑738/‑182) | lrhA/alaA | transcriptional repressor of flagellar, motility and chemotaxis genes/valine‑pyruvate aminotransferase 2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/2); new base A (145/156); total (151/158) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.67e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 309 total aligned reads displayed.
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGG > CP009273/2400713‑2401002
|
cGCATTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGAATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAAt < 2:2325869/148‑1 (MQ=255)
gTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaa < 1:1326447/148‑1 (MQ=255)
gTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaa < 2:1838436/148‑1 (MQ=255)
ttAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTaaa > 1:3604167/1‑148 (MQ=255)
aaCTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCa < 1:1663342/148‑1 (MQ=255)
aCTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAC‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCat > 2:1870287/1‑148 (MQ=255)
tcCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATac < 2:2218394/148‑1 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATTAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATac < 2:1907533/148‑1 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATaca < 2:2116089/148‑1 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATaca > 2:765875/1‑148 (MQ=255)
ccGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCAATAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATTAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATac < 2:3504705/148‑1 (MQ=255)
tGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat > 1:1430795/1‑148 (MQ=255)
tGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAAGTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCat < 2:2670265/148‑1 (MQ=255)
gAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCatt > 1:3249586/1‑148 (MQ=255)
gAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCatt > 1:484593/1‑148 (MQ=255)
gAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCatt < 1:332688/148‑1 (MQ=255)
gAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCatt < 1:1537603/148‑1 (MQ=255)
gAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt > 2:1702297/1‑148 (MQ=255)
gAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCattatt < 2:471063/148‑1 (MQ=255)
aaaTATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAttt < 1:536650/148‑1 (MQ=255)
atatCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTg < 1:2945650/148‑1 (MQ=255)
tatCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATAAACCTCATTATTTTGt > 2:3374066/1‑148 (MQ=255)
atcatcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTc < 2:2864024/148‑1 (MQ=255)
atcatcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTc < 1:1570744/148‑1 (MQ=255)
tcatcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCa > 1:1988531/1‑148 (MQ=255)
catcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACAcc > 2:2979217/1‑133 (MQ=255)
catcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCat > 2:334215/1‑148 (MQ=255)
atcatcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCatt < 2:269821/148‑1 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat > 2:3676162/1‑148 (MQ=255)
catcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCattat < 2:3715184/148‑1 (MQ=255)
tcGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAttatta < 2:1324680/148‑1 (MQ=255)
gcgTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAg < 2:3604167/148‑1 (MQ=255)
gcgTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAg < 2:1087997/148‑1 (MQ=255)
gTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtt < 1:676683/148‑1 (MQ=255)
tttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAC‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGtta > 2:1219756/1‑148 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttat > 1:1950032/1‑148 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttat < 1:3656053/148‑1 (MQ=255)
ttCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttat < 2:2030094/148‑1 (MQ=255)
cATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGttatta < 2:3100005/148‑1 (MQ=255)
aTTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTaa > 2:1401172/1‑148 (MQ=255)
gTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGc > 2:2130791/1‑148 (MQ=255)
tGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGca > 2:2773282/1‑148 (MQ=255)
tGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGca < 1:1081893/148‑1 (MQ=255)
aaTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGcaca > 1:1717937/1‑148 (MQ=255)
aTTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACaa < 1:1552910/148‑1 (MQ=255)
ttCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAt > 1:2550404/1‑148 (MQ=255)
aTGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCt > 1:2143639/1‑148 (MQ=255)
gCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcccc > 1:2671897/1‑148 (MQ=255)
gCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTcccc < 1:3403400/148‑1 (MQ=255)
cATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCct < 1:400046/148‑1 (MQ=255)
cATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCct < 1:2491555/148‑1 (MQ=255)
cATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCct < 1:2000467/148‑1 (MQ=255)
tttCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTg > 1:1200935/1‑148 (MQ=255)
aTTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCt > 1:3048956/1‑148 (MQ=255)
ttATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCtt > 1:3461686/1‑148 (MQ=255)
ttATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCtt > 2:703258/1‑148 (MQ=255)
ttATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCtt > 2:224706/1‑148 (MQ=255)
ttATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCtt > 1:2126936/1‑148 (MQ=255)
ttATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCtt > 2:2618750/1‑148 (MQ=255)
tATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTa < 1:1517237/148‑1 (MQ=255)
aTCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTAt > 2:3486913/1‑148 (MQ=255)
tCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTAtt > 2:6030/1‑148 (MQ=255)
cTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTc > 1:2224756/1‑148 (MQ=255)
cTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTc > 2:2819783/1‑148 (MQ=255)
gAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGa > 2:177843/1‑148 (MQ=255)
aT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTGAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAc > 1:3668049/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCt < 1:2210878/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaCCAGACTTACACTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCtt < 2:3162049/148‑1 (MQ=255)
aaaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCa > 1:2338144/1‑148 (MQ=255)
aaaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaa > 2:890004/1‑148 (MQ=255)
aaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaaa > 2:1492205/1‑148 (MQ=255)
aaCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCaaa > 2:1540644/1‑148 (MQ=255)
aCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAcc > 1:1633951/1‑141 (MQ=255)
aCCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAcc < 2:1633951/141‑1 (MQ=255)
gACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACAcc > 2:1044629/1‑148 (MQ=255)
aCTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg > 1:2773721/1‑148 (MQ=255)
aCTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCg > 1:2290193/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTgggg > 1:3528143/1‑148 (MQ=255)
ttAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTgggg < 2:2144374/148‑1 (MQ=255)
tAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTggggg < 2:556943/148‑1 (MQ=255)
tAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTggggg > 1:82251/1‑148 (MQ=255)
aaTCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTa > 2:699763/1‑148 (MQ=255)
aaTCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTa > 1:2377944/1‑148 (MQ=255)
aaTCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTa > 1:593658/1‑148 (MQ=255)
tCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACa > 1:724924/1‑148 (MQ=255)
aaCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGt > 2:1176306/1‑148 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt > 1:903174/1‑148 (MQ=255)
aCAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGtt < 2:3167938/148‑1 (MQ=255)
ttCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTaa > 1:3782795/1‑148 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAg < 2:3329174/148‑1 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAg > 2:3776020/1‑148 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAg > 2:2379797/1‑148 (MQ=255)
tCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAg < 2:2274627/148‑1 (MQ=255)
cACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGc > 1:325927/1‑148 (MQ=255)
aCTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCt > 1:3572173/1‑148 (MQ=255)
atataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAc < 2:825865/148‑1 (MQ=255)
ataACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACtt < 2:2750255/148‑1 (MQ=255)
aaCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc < 1:177843/148‑1 (MQ=255)
aaCATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTcc > 1:3141297/1‑148 (MQ=255)
ttGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACgg > 1:1911530/1‑148 (MQ=255)
|
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGAT‑AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGG > CP009273/2400713‑2401002
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCA > CP009273/2400710‑2401004
|
TCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAA < SRR19973069.1481147/150‑1 (MQ=60)
CACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAAT < SRR19973069.302050/150‑1 (MQ=60)
CACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAAT < SRR19973069.3520223/150‑1 (MQ=60)
CGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGT < SRR19973069.3337978/150‑1 (MQ=60)
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAA > SRR19973069.3627698/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAA > SRR19973069.1554619/1‑150 (MQ=60)
AGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAA > SRR19973069.831690/1‑150 (MQ=60)
GTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAG < SRR19973069.1335568/150‑1 (MQ=60)
TTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGC > SRR19973069.1114406/1‑150 (MQ=60)
AACTCTCCTTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATA < SRR19973069.1674872/150‑1 (MQ=60)
AACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATA < SRR19973069.1674488/150‑1 (MQ=60)
CTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATA < SRR19973069.1524094/150‑1 (MQ=60)
TCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTTAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATAC < SRR19973069.674021/150‑1 (MQ=60)
TCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACAC < SRR19973069.2466170/150‑1 (MQ=60)
gctcttccgatcTATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTC < SRR19973069.2998995/138‑1 (MQ=60)
AATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCAT > SRR19973069.1440786/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCAT < SRR19973069.1125828/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973069.3594582/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT > SRR19973069.3270858/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT > SRR19973069.488093/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT > SRR19973069.488101/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973069.513616/150‑1 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT > SRR19973069.591451/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATT < SRR19973069.698753/150‑1 (MQ=60)
GAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAT < SRR19973069.1548146/150‑1 (MQ=60)
GAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTAT < SRR19973069.334983/150‑1 (MQ=60)
AAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTG < SRR19973069.539921/150‑1 (MQ=60)
AAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTG < SRR19973069.540433/150‑1 (MQ=60)
ATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTC < SRR19973069.2965195/150‑1 (MQ=60)
TATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCA > SRR19973069.2002771/1‑150 (MQ=60)
TATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCA > SRR19973069.2002384/1‑150 (MQ=60)
ATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCAT < SRR19973069.1581434/150‑1 (MQ=60)
TCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATT < SRR19973069.3610537/150‑1 (MQ=60)
TCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATT < SRR19973069.3610581/150‑1 (MQ=60)
TCATCATCGCGTGTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATT < SRR19973069.2220964/150‑1 (MQ=60)
ATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTNT < SRR19973069.3275844/150‑1 (MQ=60)
ATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTAT < SRR19973069.2485104/150‑1 (MQ=60)
TCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATT < SRR19973069.3051970/150‑1 (MQ=60)
CATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTA > SRR19973069.2154566/1‑150 (MQ=60)
CGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGACAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTA < SRR19973069.1476352/150‑1 (MQ=60)
GTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTAT < SRR19973069.2470859/150‑1 (MQ=60)
GTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTAT < SRR19973069.681367/150‑1 (MQ=60)
GTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTAT > SRR19973069.1963508/1‑150 (MQ=60)
TTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATT < SRR19973069.2611267/150‑1 (MQ=60)
TTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTA < SRR19973069.3680152/150‑1 (MQ=60)
TTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTA < SRR19973069.3679995/150‑1 (MQ=60)
AGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCA < SRR19973069.2010229/150‑1 (MQ=60)
GTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCAC < SRR19973069.2707711/150‑1 (MQ=60)
GTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCAC < SRR19973069.904/150‑1 (MQ=60)
TGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACA > SRR19973069.1729994/1‑150 (MQ=60)
TGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACA > SRR19973069.1729981/1‑150 (MQ=60)
TGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACA < SRR19973069.1089446/150‑1 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACTTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT > SRR19973069.3788547/1‑150 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT < SRR19973069.3811996/150‑1 (MQ=60)
AATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAAT > SRR19973069.2567253/1‑150 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973069.3427758/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973069.1563523/150‑1 (MQ=60)
ATTCTTAAATGAGGCATTTTCAAACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATC < SRR19973069.3428037/150‑1 (MQ=60)
TTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCG > SRR19973069.3493900/1‑150 (MQ=60)
TTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGC < SRR19973069.440841/150‑1 (MQ=60)
TAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCC < SRR19973069.1536311/150‑1 (MQ=60)
AAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCT > SRR19973069.2158354/1‑150 (MQ=60)
AATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTT > SRR19973069.2914549/1‑150 (MQ=60)
ATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTC > SRR19973069.1270349/1‑150 (MQ=60)
TGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCC < SRR19973069.1567597/150‑1 (MQ=60)
GAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCC < SRR19973069.3651063/150‑1 (MQ=60)
GAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCC < SRR19973069.2065013/150‑1 (MQ=60)
GAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCC < SRR19973069.3650109/150‑1 (MQ=60)
AGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCC > SRR19973069.759481/1‑150 (MQ=60)
AGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCC > SRR19973069.2689813/1‑150 (MQ=60)
GGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCT > SRR19973069.198873/1‑150 (MQ=60)
GCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTC < SRR19973069.3425598/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.2508221/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.2542020/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.402765/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.2014400/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.402971/150‑1 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT > SRR19973069.1806459/1‑150 (MQ=60)
CATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCT < SRR19973069.723703/150‑1 (MQ=60)
ATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTG > SRR19973069.1209194/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTG > SRR19973069.1368293/1‑150 (MQ=60)
ATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTG > SRR19973069.3427478/1‑150 (MQ=60)
TTTTCACAAAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGG < SRR19973069.3238121/150‑1 (MQ=60)
TTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGC < SRR19973069.296268/150‑1 (MQ=60)
ACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATC < SRR19973069.1602575/150‑1 (MQ=60)
CAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCT > SRR19973069.3069145/1‑150 (MQ=60)
CAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATATAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCT > SRR19973069.3080969/1‑150 (MQ=60)
CAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATATAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCT > SRR19973069.3080970/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTT > SRR19973069.2141571/1‑150 (MQ=60)
AATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTT > SRR19973069.3484098/1‑150 (MQ=60)
TTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTAT < SRR19973069.3276132/150‑1 (MQ=60)
TATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCNTATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATT < SRR19973069.1950860/150‑1 (MQ=60)
TATATTACAGATAAAAAAAACAGACTTACTATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATT < SRR19973069.1527709/150‑1 (MQ=60)
ATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTC > SRR19973069.3405645/1‑150 (MQ=60)
ATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTC < SRR19973069.3683288/150‑1 (MQ=60)
ATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTC > SRR19973069.1811034/1‑150 (MQ=60)
ATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTC > SRR19973069.2239794/1‑150 (MQ=60)
TACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCA < SRR19973069.2244806/150‑1 (MQ=60)
TACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATATTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCA > SRR19973069.2341952/1‑150 (MQ=60)
TACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATAAGAACAATTCACTATATAACATTGAACGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCA < SRR19973069.1575739/150‑1 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTGAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973069.3692057/1‑150 (MQ=60)
AGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGAC > SRR19973069.264070/1‑150 (MQ=60)
GATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACC > SRR19973069.935156/1‑150 (MQ=60)
ATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCT < SRR19973069.785627/150‑1 (MQ=60)
TAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTT < SRR19973069.1704447/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC < SRR19973069.2225858/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTC < SRR19973069.2226184/150‑1 (MQ=60)
AAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCA > SRR19973069.2354052/1‑150 (MQ=60)
AAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTagatc > SRR19973069.1645134/1‑145 (MQ=60)
CAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACC > SRR19973069.1542302/1‑150 (MQ=60)
CAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACC < SRR19973069.2145447/150‑1 (MQ=60)
AGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCG > SRR19973069.2305755/1‑150 (MQ=60)
AGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCG > SRR19973069.2792195/1‑150 (MQ=60)
TTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCT < SRR19973069.2315408/150‑1 (MQ=60)
TACAGTTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTG < SRR19973069.1988189/150‑1 (MQ=60)
CAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGG < SRR19973069.1639677/150‑1 (MQ=60)
CAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGG < SRR19973069.2141180/150‑1 (MQ=60)
CAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGG < SRR19973069.3589519/150‑1 (MQ=60)
AATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGG > SRR19973069.3550968/1‑150 (MQ=60)
AATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGG > SRR19973069.3193652/1‑150 (MQ=60)
AATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGG > SRR19973069.2516274/1‑150 (MQ=60)
ATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGG > SRR19973069.83143/1‑150 (MQ=60)
TAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAG > SRR19973069.3514731/1‑150 (MQ=60)
AGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTA > SRR19973069.2394072/1‑150 (MQ=60)
AGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTA > SRR19973069.597684/1‑150 (MQ=60)
AGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTA > SRR19973069.597687/1‑150 (MQ=60)
AATCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACA > SRR19973069.730043/1‑150 (MQ=60)
TCAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCGTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATT < SRR19973069.2226222/150‑1 (MQ=60)
CAGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTG > SRR19973069.3289800/1‑150 (MQ=60)
AGAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGT < SRR19973069.1704312/150‑1 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973069.1376761/1‑150 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973069.612781/1‑150 (MQ=60)
GAACAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTT > SRR19973069.909374/1‑150 (MQ=60)
CAATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTA > SRR19973069.64210/1‑150 (MQ=60)
AATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAA > SRR19973069.3807347/1‑150 (MQ=60)
AATTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCACCTCAGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTACAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAA > SRR19973069.3807311/1‑150 (MQ=60)
TTCACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGC > SRR19973069.328118/1‑150 (MQ=60)
TCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCT > SRR19973069.3595444/1‑150 (MQ=60)
ACTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGA < SRR19973069.3370351/150‑1 (MQ=60)
CTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAC < SRR19973069.236491/150‑1 (MQ=60)
CTATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGAC < SRR19973069.236439/150‑1 (MQ=60)
TATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT > SRR19973069.181246/1‑150 (MQ=60)
TATATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACT > SRR19973069.2252856/1‑150 (MQ=60)
ATAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCC > SRR19973069.3161858/1‑150 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973069.2791756/150‑1 (MQ=60)
TAACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCA < SRR19973069.2182837/150‑1 (MQ=60)
AACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCAC < SRR19973069.179337/150‑1 (MQ=60)
AACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTGAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCAC < SRR19973069.179304/150‑1 (MQ=60)
ACATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACG < SRR19973069.1673019/150‑1 (MQ=60)
CATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGG > SRR19973069.1924716/1‑150 (MQ=60)
CATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGG > SRR19973069.1924826/1‑150 (MQ=60)
ATTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAACCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGC > SRR19973069.1869829/1‑150 (MQ=60)
TTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCA < SRR19973069.1554646/150‑1 (MQ=60)
TTGAATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCA < SRR19973069.1228100/150‑1 (MQ=60)
|
TCACGCAGTTAAACTCTCCGTAATGAGGAAATATCATCATCGCGTTTCATTAGTGAATTCTTAAATGAGGCATTTTCACACAATTATCTTACAGATAAAAAAACCAGACTTACAATTAAGAATCAGAACAATTCACTATATAACATTGCATGTAAAGCATATACACCTCATTATTTTGTCATTATTAAGTTATTAACAGCACAATCGAGCCTTCCCCTCTGGCAAAATCTTATTCTGCAGACCTTCAAAACACCGTCCTGGGGGAGTACATTGTTCTAAGCTGACTTCCACGGCA > CP009273/2400710‑2401004
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |