Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A24 F31 I1 R1
|
16 |
84.1 |
2897778 |
94.0% |
2723911 |
143.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913_3_pae_tpiA |
4,604,632 |
C→A |
A186E (GCA→GAA) |
bglJ → |
bgl operon transcriptional activator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913_3_pae_tpiA | 4,604,632 | 0 | C | A | 98.9%
| 298.7
/ NA
| 92 | A186E (GCA→GAA) | bglJ | bgl operon transcriptional activator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (52/38); total (53/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GACCGACCGACTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGCACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTTC > NC_000913_3_pae_tpiA/4604486‑4604777
|
gaccgaccgacTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGaac > 1:393793/1‑149 (MQ=255)
gaccgaccgacTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGCACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCGCAAACCCAATATCAAAAAAACCCGTGaac > 2:262459/1‑149 (MQ=255)
gacTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAAttt > 1:252171/1‑149 (MQ=255)
tGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAAt > 2:1109962/1‑149 (MQ=255)
tGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACACTCCGAGAACATAAATTTAAt > 1:979622/1‑149 (MQ=255)
tGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGA‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAAGATAAATTTAAt > 1:296210/1‑149 (MQ=255)
gAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGCGAGCAAAATATTGCGCTTTATGTCAC‑GTGGCTACTCCCGGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAACCGCAATATCAACACGATCCGTGGCAATAACTTTAAtg > 1:662913/1‑149 (MQ=255)
aaCAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAAtgt > 2:472452/1‑149 (MQ=255)
aaTCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGAt > 1:1371766/1‑149 (MQ=255)
aTCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATg > 1:1362918/1‑149 (MQ=255)
tGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGaa > 1:1370762/1‑149 (MQ=255)
ggTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGaaa < 1:1085706/149‑1 (MQ=255)
aCATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATTCAGGCCTGGCGGGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTg < 1:710718/149‑1 (MQ=255)
tttAACCAAAGCCGGACGGTAAGGCCGACGGGGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAAAGGCCGAGCAGTTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTggg < 2:561867/148‑1 (MQ=255)
aTTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAAAGAAATATTTCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCTGATTCAGCGGAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTggg < 1:282009/149‑1 (MQ=255)
ttAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGc < 2:808165/149‑1 (MQ=255)
ttAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGc > 1:1441601/1‑149 (MQ=255)
cAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAg > 1:1240634/1‑149 (MQ=255)
cGGACGTTAAGCCTGATGGAGAGATAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGa < 2:434459/149‑1 (MQ=255)
gACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGATATATTGCGCCTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCCGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACg < 1:437548/149‑1 (MQ=255)
gTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGGGATGTCGAAACTAGGCGTCAGTTCTGATGCAg > 1:1340327/1‑149 (MQ=255)
ttAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACAAAATGGGACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGCCGCAgg > 1:646257/1‑149 (MQ=255)
tAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAggg < 2:1349528/149‑1 (MQ=255)
tAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAggg < 1:1092010/149‑1 (MQ=255)
aGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGACACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGgtt > 1:1347282/1‑149 (MQ=255)
aGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGgtt < 1:472452/149‑1 (MQ=255)
cccGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACCCAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGgttgt > 1:531029/1‑149 (MQ=255)
ccGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGgttgtt < 1:293056/149‑1 (MQ=255)
ccaCGGAGAGGGAAATATTGCGCTTCATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGttgttg < 1:262459/147‑1 (MQ=255)
gACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGGTCTGACGCAGGGTTGTTgg > 1:305707/1‑149 (MQ=255)
accgagagagaAAAATTGTGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGa < 1:552799/146‑1 (MQ=255)
agagaAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGa < 1:659606/103‑1 (MQ=255)
agagaAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGa > 2:659606/1‑103 (MQ=255)
agagaAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGc > 2:756581/1‑149 (MQ=255)
agagaAATATTCAGCTTTAT‑TGGCTGCGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGc > 2:1404973/1‑149 (MQ=255)
agaAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTggg > 2:1383756/1‑114 (MQ=255)
agaAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTggg < 1:1383756/114‑1 (MQ=255)
atatTGCGCTGTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGatat < 1:1109962/149‑1 (MQ=255)
atTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCACAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTc > 1:1214612/1‑149 (MQ=255)
ttGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGTGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCt < 1:1101584/149‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTATGTTGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTg < 1:232537/149‑1 (MQ=255)
gcgcTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGt < 2:1362918/149‑1 (MQ=255)
tttATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatg > 1:602082/1‑149 (MQ=255)
tttATATGGC‑GTGGCTACTCAATGACAGAAATTGTGCGGCAGCGTTAAGGCAATATAAAAACGATCCGTGAACATAAATGTTATGGGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTTGCGGAGGGGTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatg < 2:662913/149‑1 (MQ=255)
tGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAgg > 1:242100/1‑115 (MQ=255)
tGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAgg < 2:242100/115‑1 (MQ=255)
tGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtttgtatg > 1:804476/1‑149 (MQ=255)
tGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatgtatg > 2:1062970/1‑149 (MQ=255)
gTCGC‑GTGGCTACACAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACTCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATTTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGc < 2:600878/149‑1 (MQ=255)
gTCCC‑GTGGCGACTGAATGACACAAAGTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCACAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTTTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGc > 2:682811/1‑149 (MQ=255)
cgc‑gTGCCTACTCAATGACACAAATTGCCGATGAGCTTAATCGCAATATCAATACGCTCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGGCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCgg < 1:228929/149‑1 (MQ=255)
gTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCAt < 1:1404210/149‑1 (MQ=255)
ggCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTg < 2:602082/149‑1 (MQ=255)
gCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGc < 2:531029/149‑1 (MQ=255)
tCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAAc > 1:26148/1‑149 (MQ=255)
agtGAAACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACaa < 2:529481/147‑1 (MQ=255)
aaTGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTCTGTATGCGGCCTTTCGAAACaa > 2:99033/1‑149 (MQ=255)
aaTGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACaa < 2:638410/149‑1 (MQ=255)
aaTGACACAAATTGACGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACAGAAATTTAAGGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTTTTGGAGGCCGCAGATGTTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGCAAcca > 2:243283/1‑147 (MQ=255)
cacaAATTGGCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAACCGATCCGTGCAGGTGTGGGTATTGTTAGGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAt < 2:305707/149‑1 (MQ=255)
cacaAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCCAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGATGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCCTTGCGAAACACGTAAt > 2:1012008/1‑149 (MQ=255)
acaAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTgg < 2:1120638/74‑1 (MQ=255)
acaAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTgg > 1:1120638/1‑74 (MQ=255)
acaAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAtg > 2:168982/1‑149 (MQ=255)
acaAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAtg > 1:1330973/1‑149 (MQ=255)
aaaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGAAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAAtgtg > 2:1279792/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAg > 2:879729/1‑100 (MQ=255)
aaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAg < 1:879729/100‑1 (MQ=255)
aaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATgtgt > 2:1012113/1‑149 (MQ=255)
aaTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATgtgt < 2:393793/149‑1 (MQ=255)
aTTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGtt < 2:1240634/149‑1 (MQ=255)
aTTGCCCAGCAGCTTAAACGAAATATCACACCGCTCCGTGAACATAAATTTAGTGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGtt < 1:385596/149‑1 (MQ=255)
ccGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCAt > 2:1070605/1‑149 (MQ=255)
cGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATc > 1:435687/1‑149 (MQ=255)
gAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATcc > 1:419456/1‑149 (MQ=255)
gcTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatgtatg < 1:914104/112‑1 (MQ=255)
gcTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTtatctatg > 2:914104/1‑112 (MQ=255)
aaCGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCCGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATCCTGTTATGTATGCGGCATTGCGATACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATcc > 2:114207/1‑149 (MQ=255)
aCGCAATATCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCACTATTAATCCg > 1:1047609/1‑149 (MQ=255)
gaaTATCAAAACGATCAGTGAACATAAATTTAAGGTGATGTCGAAGCTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAATTAATGTGTTGCATGCCTATTAATCCGCat < 2:172900/148‑1 (MQ=255)
atatCAAAACGAGCCGTGAACATAAATTTAATGTTATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCGGCCGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTGTTATTCCGCatga < 2:174911/149‑1 (MQ=255)
tCAAAACGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTATGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCatcctgt > 2:1443558/1‑144 (MQ=255)
aaaaCGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCg > 1:727443/1‑149 (MQ=255)
aaaaCGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGACTTGTTGGAGGCCGCAGAAATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACGAGTAATGTCTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCg > 2:599734/1‑149 (MQ=255)
aaaaCGATCCGTGAACATAAATTTAATGAGACGCAAAAATGGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCg > 1:1074537/1‑149 (MQ=255)
aaaCGATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCgg > 2:1079117/1‑149 (MQ=255)
gATCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGttt > 2:270645/1‑149 (MQ=255)
acccGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTa < 1:1163572/147‑1 (MQ=255)
tCCGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTAc < 1:270645/149‑1 (MQ=255)
ccGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCACATGATGCCGGGTTTACt > 2:354434/1‑149 (MQ=255)
cGTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACtt > 1:1440270/1‑149 (MQ=255)
gTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTGATCCGCATGATGCCGGGTTTACTTc > 1:1305383/1‑149 (MQ=255)
gTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTTc > 2:605014/1‑149 (MQ=255)
gTGAACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTTc > 1:1016842/1‑149 (MQ=255)
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GACCGACCGACTGAACAATCAGTGGTACATTAACCAAAGCCGGACGTTAAGCCCGACGGAGAGAGAAATATTGCGCTTTATGTCGC‑GTGGCTACTCAATGACACAAATTGCCGAGCAGCTTAAACGCAATATCAAAACGATCCGTGCACATAAATTTAATGTGATGTCGAAACTGGGCGTCAGTTCTGACGCAGGGTTGTTGGAGGCCGCAGATATTCTGTTATGTATGCGGCATTGCGAAACAAGTAATGTGTTGCATCCCTATTAATCCGCATGATGCCGGGTTTACTTC > NC_000913_3_pae_tpiA/4604486‑4604777
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
