Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,988,554 |
G→A |
94.1% |
intergenic (‑103/+119) |
ygeK ← / ← ygeN |
pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,988,554 | 0 | G | A | 94.1%
| 564.2
/ 19.3
| 169 | intergenic (‑103/+119) | ygeK/ygeN | pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (8/2); new base A (67/92); total (75/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.39e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
ATCATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAAC > CP009273/2988405‑2988699
|
caTAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATaaa > 2:457169/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAatat > 2:2369593/1‑150 (MQ=255)
cGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATaa > 2:3314970/1‑150 (MQ=255)
tgctgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaa < 2:1962777/150‑1 (MQ=255)
ctgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaa > 1:919089/1‑150 (MQ=255)
ctgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaa > 1:1793040/1‑150 (MQ=255)
gATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaat > 1:3548678/1‑150 (MQ=255)
aTCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaata < 2:3734025/150‑1 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa > 1:1902155/1‑150 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa > 1:1903552/1‑150 (MQ=255)
cTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaa < 2:2575411/150‑1 (MQ=255)
cTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaa < 1:3704009/150‑1 (MQ=255)
cTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaa > 1:4540885/1‑150 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa > 1:4292891/1‑150 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa < 2:2867468/150‑1 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtt > 1:1564300/1‑150 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtt > 1:1564100/1‑150 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACAATGATGAAATAATAATAAAAAATAATTAAAAAAAAAAtt > 1:1564084/1‑150 (MQ=255)
aaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAttt > 2:1175855/1‑150 (MQ=255)
cTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAttttt < 2:2624016/150‑1 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg < 1:3607937/150‑1 (MQ=255)
aCAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGc > 1:4493210/1‑150 (MQ=255)
aattttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGt < 1:2656714/150‑1 (MQ=255)
tttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑aaa < 1:3520614/150‑1 (MQ=255)
tttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑aaa < 1:2476261/150‑1 (MQ=255)
ttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑aaaa > 1:3962327/1‑150 (MQ=255)
attttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑aaaaaaa > 1:2033061/1‑150 (MQ=255)
tttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAAt < 1:3135121/150‑1 (MQ=255)
tttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAAt < 1:1023145/150‑1 (MQ=255)
tttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAAt > 1:806701/1‑150 (MQ=255)
tttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATAc < 1:2676426/150‑1 (MQ=255)
ttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATAcc < 1:403977/150‑1 (MQ=255)
tCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACca < 2:1682612/150‑1 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACcac < 2:2820539/150‑1 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACcac < 1:3194702/150‑1 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACcac > 1:3408862/1‑150 (MQ=255)
cATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAg > 2:4473335/1‑150 (MQ=255)
atatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCa < 2:1099561/150‑1 (MQ=255)
atTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCAtt > 1:3324016/1‑150 (MQ=255)
atTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCAtt < 2:1926792/150‑1 (MQ=255)
cATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTaaa > 2:4077562/1‑150 (MQ=255)
ccTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCACAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTaaaaaa < 1:761223/150‑1 (MQ=255)
cTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAt > 1:23622/1‑150 (MQ=255)
gAGTGTAAAAGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCAAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAAATAAAAATAAAATTTTTTCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCa > 2:2876439/1‑150 (MQ=255)
gtgtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATg > 1:4211629/1‑150 (MQ=255)
gtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGACATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgag > 1:2913581/1‑150 (MQ=255)
aaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatg < 1:2184109/150‑1 (MQ=255)
aTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatga < 1:1376737/150‑1 (MQ=255)
aTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatga < 1:1376753/150‑1 (MQ=255)
gCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGAtt < 1:3886506/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa < 2:3183237/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa < 2:3730029/150‑1 (MQ=255)
ttAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaa < 2:861986/150‑1 (MQ=255)
ttAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaa < 1:855972/150‑1 (MQ=255)
ttAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaa < 2:3185808/150‑1 (MQ=255)
tAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaaa < 1:2969006/150‑1 (MQ=255)
cattcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTa < 2:1920420/150‑1 (MQ=255)
cattaattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTa < 2:3521213/150‑1 (MQ=255)
attcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTAc > 1:714805/1‑150 (MQ=255)
ttcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACa < 1:77103/150‑1 (MQ=255)
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ataATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGAt > 2:2220764/1‑150 (MQ=255)
aaTCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATta > 1:1253026/1‑150 (MQ=255)
atcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATcat < 1:1092538/150‑1 (MQ=255)
tcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATcata < 2:2969406/150‑1 (MQ=255)
catcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCatat < 2:3340869/150‑1 (MQ=255)
catcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCatat > 1:2671528/1‑150 (MQ=255)
acTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGTTTATATTCaa < 2:3460643/149‑1 (MQ=255)
ttCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt < 2:4347903/150‑1 (MQ=255)
ttCAATTATTATTATAAGCAAAATACAAATAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt < 2:3966883/150‑1 (MQ=255)
tCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATc > 2:3234985/1‑150 (MQ=255)
tCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATc > 2:3234970/1‑150 (MQ=255)
tCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATc < 2:4480980/150‑1 (MQ=255)
cATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCAt < 2:292750/150‑1 (MQ=255)
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ttattattaTAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTa > 2:3920745/1‑150 (MQ=255)
ttattattaAAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTa < 1:1921516/150‑1 (MQ=255)
tattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACt < 1:2078913/150‑1 (MQ=255)
aTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGc > 1:3169386/1‑150 (MQ=255)
gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt < 2:2631190/150‑1 (MQ=255)
gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt < 2:1516751/150‑1 (MQ=255)
gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt < 2:1516737/150‑1 (MQ=255)
gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt < 2:2631193/150‑1 (MQ=255)
gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt < 1:4018766/150‑1 (MQ=255)
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aCATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTc < 1:2441458/150‑1 (MQ=255)
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ATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGAT > SRR19973072.2086875/1‑150 (MQ=60)
AATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATT > SRR19973072.4268862/1‑150 (MQ=60)
AATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTA > SRR19973072.1255720/1‑150 (MQ=60)
ATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCAT < SRR19973072.1094847/150‑1 (MQ=60)
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CATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATAT > SRR19973072.2677233/1‑150 (MQ=60)
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AATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCC < SRR19973072.3009302/150‑1 (MQ=60)
ATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAA > SRR19973072.286161/1‑150 (MQ=60)
TAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAAC > SRR19973072.1732444/1‑150 (MQ=60)
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TCATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAAC > CP009273/2988406‑2988699
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
