Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,988,554 |
G→A |
100% |
intergenic (‑103/+119) |
ygeK ← / ← ygeN |
pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,988,554 | 0 | G | A | 98.9%
| 648.3
/ ‑2.5
| 188 | intergenic (‑103/+119) | ygeK/ygeN | pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/0); new base A (96/90); total (98/90) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAAC > CP009273/2988409‑2988699
|
caaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat < 1:2465300/148‑1 (MQ=255)
acaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCCTCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat < 2:1294456/147‑1 (MQ=255)
aaaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATACTCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat < 1:3363754/149‑1 (MQ=255)
ggCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATaa > 1:2115959/1‑149 (MQ=255)
gctgctGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAAt < 1:3711404/149‑1 (MQ=255)
ctgctgAACTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAAtt < 1:3025303/149‑1 (MQ=255)
tgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaa > 1:70778/1‑149 (MQ=255)
tgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaa < 1:3867340/149‑1 (MQ=255)
gATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTcaaaa > 2:1629444/1‑149 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaata < 1:3614503/149‑1 (MQ=255)
cagAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa < 1:4446682/147‑1 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa < 1:251540/149‑1 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCACATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa < 2:1352288/149‑1 (MQ=255)
cTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtttt > 1:3556295/1‑149 (MQ=255)
aattttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCg > 1:1860611/1‑149 (MQ=255)
attttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGt > 2:292159/1‑149 (MQ=255)
ttttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTa > 1:4076702/1‑149 (MQ=255)
ttttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTa < 1:1309413/149‑1 (MQ=255)
tttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaa > 2:3458725/1‑149 (MQ=255)
ttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaa < 1:1025539/149‑1 (MQ=255)
ttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaa < 1:1025604/149‑1 (MQ=255)
attttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaaaaa > 2:1446991/1‑149 (MQ=255)
ttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAAt < 2:355870/149‑1 (MQ=255)
ttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATAc < 1:1067329/149‑1 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACca > 2:3437938/1‑149 (MQ=255)
ccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACcac > 1:1744161/1‑149 (MQ=255)
ttatatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAg < 2:4292862/148‑1 (MQ=255)
atatatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAg < 2:790582/149‑1 (MQ=255)
tatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCa < 1:4437949/149‑1 (MQ=255)
atTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCAt > 2:4676869/1‑149 (MQ=255)
tCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaa > 2:659274/1‑149 (MQ=255)
ccTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaaa < 1:4385298/149‑1 (MQ=255)
ccTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaaa > 2:951498/1‑149 (MQ=255)
cTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaaaa < 2:4754981/149‑1 (MQ=255)
tGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAt > 2:2657312/1‑149 (MQ=255)
tGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAt > 2:1886768/1‑149 (MQ=255)
gAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATc < 1:4368018/149‑1 (MQ=255)
gAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACAACAGGCATTAAAAAATc > 1:287969/1‑149 (MQ=255)
aGTGTAAATGCTTTAACGAATTCATTTATAATCATCCCTTACATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCa < 1:2822443/149‑1 (MQ=255)
tgtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATg < 2:3848734/149‑1 (MQ=255)
ttAAATTCTTTAACTAATTAATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAATCAAAATCCAAAGAATACATTTATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATga < 1:2429566/148‑1 (MQ=255)
gtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATga > 2:3140185/1‑149 (MQ=255)
tAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgag < 1:148888/149‑1 (MQ=255)
tAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgag > 2:4315380/1‑149 (MQ=255)
aaaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgaga < 2:1058102/149‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgat < 1:318283/149‑1 (MQ=255)
aaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgat > 1:4509012/1‑149 (MQ=255)
aaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgat > 2:737627/1‑149 (MQ=255)
aTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatg < 2:1771307/149‑1 (MQ=255)
aTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatg < 1:4740089/149‑1 (MQ=255)
gCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatgat > 2:921050/1‑149 (MQ=255)
tttAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAATATATACCACAGGCATTATAAAATCATGAGATGATTa > 2:3443313/1‑149 (MQ=255)
ttAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaa < 1:4214418/149‑1 (MQ=255)
aaCGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaaa > 1:2486996/1‑149 (MQ=255)
aCGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAat > 1:141198/1‑149 (MQ=255)
aCGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAat > 2:265215/1‑149 (MQ=255)
cGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAata < 1:91126/149‑1 (MQ=255)
gCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAatat > 1:1813597/1‑149 (MQ=255)
cattcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATAtt < 1:2625870/149‑1 (MQ=255)
cattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACaa < 2:1416487/149‑1 (MQ=255)
attTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAAt > 1:3237635/1‑149 (MQ=255)
tttATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAAtt < 1:2119982/149‑1 (MQ=255)
ttATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTa < 2:1398403/149‑1 (MQ=255)
taATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGAt < 1:722875/149‑1 (MQ=255)
atcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATATATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGTTTAAAGTATTTCAATTAGTTta > 1:2662875/1‑149 (MQ=255)
atcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATta > 1:1333840/1‑149 (MQ=255)
atcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTatat > 1:1598308/1‑149 (MQ=255)
atcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTatat > 2:1748779/1‑149 (MQ=255)
tcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATAtt > 2:2699417/1‑149 (MQ=255)
cccTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTc > 2:1213681/1‑149 (MQ=255)
ccTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCa < 1:2210176/149‑1 (MQ=255)
tCCATTATTTTTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt < 2:2266456/149‑1 (MQ=255)
tCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt > 2:232037/1‑149 (MQ=255)
ccATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATc > 2:182473/1‑149 (MQ=255)
attattattATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCAt > 2:4367153/1‑149 (MQ=255)
attattattATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCAt < 2:3622924/149‑1 (MQ=255)
tattattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTa < 2:997358/149‑1 (MQ=255)
attatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACt > 1:308937/1‑149 (MQ=255)
ataAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGa > 2:1486139/1‑149 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAg > 2:226890/1‑149 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAg < 1:2726245/149‑1 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAg < 1:3474099/149‑1 (MQ=255)
aaGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGc > 2:3991635/1‑149 (MQ=255)
gCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCa > 1:2745652/1‑149 (MQ=255)
cAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAg < 2:2066161/149‑1 (MQ=255)
aaaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAgg > 1:3813958/1‑149 (MQ=255)
aaaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAgg < 1:3362678/149‑1 (MQ=255)
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TTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTA < SRR19973071.2127813/150‑1 (MQ=60)
TTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTA < SRR19973071.2127865/150‑1 (MQ=60)
ATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGAT > SRR19973071.1082905/1‑150 (MQ=60)
TAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATT < SRR19973071.369533/150‑1 (MQ=60)
TAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATT < SRR19973071.725385/150‑1 (MQ=60)
AATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATATATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGTTTAAAGTATTTCAATTAGTTTA > SRR19973071.2672427/1‑150 (MQ=60)
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CATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATAT > SRR19973071.1603942/1‑150 (MQ=60)
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AGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCA > SRR19973071.2755375/1‑150 (MQ=60)
CAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGG > SRR19973071.3827493/1‑150 (MQ=60)
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AATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATCATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAG > SRR19973071.3251747/1‑150 (MQ=60)
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CAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTAT > SRR19973071.519255/1‑150 (MQ=60)
ACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTC > SRR19973071.1425500/1‑150 (MQ=60)
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TGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGG > SRR19973071.3385419/1‑150 (MQ=60)
TGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGG > SRR19973071.3385538/1‑150 (MQ=60)
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GAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTG > SRR19973071.83551/1‑150 (MQ=60)
AAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATACGTGCTCTGGGCTTGC > SRR19973071.3023125/1‑150 (MQ=60)
AAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGC > SRR19973071.1518628/1‑150 (MQ=60)
ATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCA > SRR19973071.61893/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAG > SRR19973071.1336366/1‑150 (MQ=60)
ATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAG > SRR19973071.3732916/1‑150 (MQ=60)
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CATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAG > CP009273/2988407‑2988701
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
