Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,988,554 |
G→A |
100% |
intergenic (‑103/+119) |
ygeK ← / ← ygeN |
pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,988,554 | 0 | G | A | 98.9%
| 1129.9
/ ‑0.3
| 343 | intergenic (‑103/+119) | ygeK/ygeN | pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/1); new base A (183/156); total (186/157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.28e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
CATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACA > CP009273/2988407‑2988700
|
aTAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATaaaa > 1:696298/1‑150 (MQ=255)
tAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat < 2:3419936/150‑1 (MQ=255)
tAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat > 1:5233826/1‑150 (MQ=255)
tAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAat < 2:4084411/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCCAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAatat < 1:344247/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAatat < 1:3196194/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAAtata > 2:1070215/1‑150 (MQ=255)
aCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAAtata < 1:3684512/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAAtata < 2:1798962/150‑1 (MQ=255)
ggCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAAt < 1:4190435/150‑1 (MQ=255)
gctgcaGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAAtt < 2:2533182/150‑1 (MQ=255)
ctgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCAAACCAACCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAAAACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaa > 1:4601467/1‑150 (MQ=255)
gATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaat > 1:3934203/1‑150 (MQ=255)
gATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaat < 1:1388238/150‑1 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa < 2:3390415/150‑1 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa > 1:4931410/1‑150 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaat < 2:3050820/150‑1 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaat < 1:4941308/150‑1 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaat < 2:3556935/150‑1 (MQ=255)
gAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaat > 2:3071594/1‑150 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtt < 2:3530443/150‑1 (MQ=255)
aCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtttt < 1:5017149/150‑1 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg < 1:4853847/150‑1 (MQ=255)
aCAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGc < 1:4692827/150‑1 (MQ=255)
cAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCg > 1:119043/1‑150 (MQ=255)
aattttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGt > 1:293464/1‑150 (MQ=255)
ttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCATCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATAcc < 2:1439885/150‑1 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACcac > 1:2265298/1‑150 (MQ=255)
cccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACaac > 2:4421069/1‑150 (MQ=255)
cATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAg > 1:4471913/1‑150 (MQ=255)
atatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCa > 1:4705292/1‑150 (MQ=255)
tatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCAt > 2:5213430/1‑150 (MQ=255)
atTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCAtt > 2:775063/1‑150 (MQ=255)
atTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGAGTAAAAAAATACCACAGGCAtt > 2:2336197/1‑150 (MQ=255)
ttCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTa < 2:5326179/150‑1 (MQ=255)
tCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaa > 1:2519680/1‑150 (MQ=255)
ccTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaaaa < 2:462227/150‑1 (MQ=255)
tGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATc > 1:4137763/1‑150 (MQ=255)
gAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCa < 1:1751234/150‑1 (MQ=255)
gtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgag < 1:2566883/150‑1 (MQ=255)
tAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgaga < 2:2174873/150‑1 (MQ=255)
tGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGTCATTAAAAAATCATGAgatgat > 2:2955430/1‑150 (MQ=255)
gCTTTAAAGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAATCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGAtt < 1:967279/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa > 2:2405810/1‑150 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa < 1:2308581/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa > 2:612170/1‑150 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa > 2:1161720/1‑150 (MQ=255)
aaCGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAat > 1:96917/1‑150 (MQ=255)
gCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATAtt < 2:727928/150‑1 (MQ=255)
cattcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTa > 2:2095740/1‑150 (MQ=255)
cattcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACAACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTa > 1:2607731/1‑150 (MQ=255)
ttcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACa < 1:2066897/150‑1 (MQ=255)
ttcattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACa < 2:2366900/150‑1 (MQ=255)
cattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAAt > 2:87985/1‑150 (MQ=255)
cattTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAAt < 1:2646732/150‑1 (MQ=255)
attTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAAtt < 1:3883547/150‑1 (MQ=255)
tttATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTa < 2:5239342/150‑1 (MQ=255)
tttATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTa < 1:4406682/150‑1 (MQ=255)
ttATAATCATCCATTCCAGTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAg < 2:4539869/150‑1 (MQ=255)
tataATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGa > 1:3417987/1‑150 (MQ=255)
ataATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGAt < 2:1321291/150‑1 (MQ=255)
aaTCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATta > 2:4523237/1‑150 (MQ=255)
aaTCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATta > 1:3299788/1‑150 (MQ=255)
atcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATtat > 1:3766979/1‑150 (MQ=255)
atcatcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATtat > 1:1624843/1‑150 (MQ=255)
catcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTatat > 1:1015056/1‑150 (MQ=255)
catcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTatat > 2:109323/1‑150 (MQ=255)
atcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATAtt < 2:2726277/150‑1 (MQ=255)
atcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATAtt < 1:1714351/150‑1 (MQ=255)
ttCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt < 2:2005475/150‑1 (MQ=255)
cATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCAt > 2:4983046/1‑150 (MQ=255)
tattattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTaa > 2:3250983/1‑150 (MQ=255)
attattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTaaa > 1:2789848/1‑150 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGc < 1:3230841/150‑1 (MQ=255)
aGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCa > 1:5171746/1‑150 (MQ=255)
cAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAgg > 2:2281335/1‑150 (MQ=255)
cAAAATCAAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAgg < 2:3929332/150‑1 (MQ=255)
cAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCtat > 1:3974355/1‑150 (MQ=255)
aaaGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGT‑AAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATaa > 2:280393/1‑150 (MQ=255)
aaGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATaa > 1:3032017/1‑150 (MQ=255)
aGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAg > 1:3355400/1‑150 (MQ=255)
aaTACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTc > 1:2878275/1‑150 (MQ=255)
aaTACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTc > 1:4212142/1‑150 (MQ=255)
aaTACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTc < 2:2150301/150‑1 (MQ=255)
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ttGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAgg < 1:4039625/150‑1 (MQ=255)
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ATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAA < SRR19973062.4017431/150‑1 (MQ=60)
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CTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAT > SRR19973062.722456/1‑150 (MQ=60)
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GAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCA < SRR19973062.1759730/150‑1 (MQ=60)
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GTAAATGATTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAG < SRR19973062.2580538/150‑1 (MQ=60)
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AAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAA > SRR19973062.3047816/1‑150 (MQ=60)
AAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAA > SRR19973062.3673040/1‑150 (MQ=60)
AAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAA < SRR19973062.2381375/150‑1 (MQ=60)
AGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGCGCTATCAG > SRR19973062.2310476/1‑150 (MQ=60)
AGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAG > SRR19973062.3372686/1‑150 (MQ=60)
AATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTC > SRR19973062.4233987/1‑150 (MQ=60)
AATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTC > SRR19973062.2893483/1‑150 (MQ=60)
ACATTGATTAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTC < SRR19973062.4219298/150‑1 (MQ=60)
ACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTC < SRR19973062.1542697/150‑1 (MQ=60)
ACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTC < SRR19973062.1542696/150‑1 (MQ=60)
ATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAG > SRR19973062.3386952/1‑150 (MQ=60)
ATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAG > SRR19973062.45546/1‑150 (MQ=60)
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TTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGG > SRR19973062.293128/1‑150 (MQ=60)
TGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGG > SRR19973062.2015823/1‑150 (MQ=60)
GATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGC > SRR19973062.2767006/1‑150 (MQ=60)
TGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTT < SRR19973062.2450683/150‑1 (MQ=60)
GAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTG > SRR19973062.2591190/1‑150 (MQ=60)
GAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTG > SRR19973062.4516556/1‑150 (MQ=60)
AAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGC > SRR19973062.3370090/1‑150 (MQ=60)
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AAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGC > SRR19973062.4481890/1‑150 (MQ=60)
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ATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCA > SRR19973062.3446829/1‑150 (MQ=60)
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TAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAA > SRR19973062.4765952/1‑150 (MQ=60)
AATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAA < SRR19973062.3627823/150‑1 (MQ=60)
TAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAAC < SRR19973062.3242506/150‑1 (MQ=60)
ATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAG > SRR19973062.580732/1‑150 (MQ=60)
AAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAGAA < SRR19973062.4739271/150‑1 (MQ=60)
AAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAGAA > SRR19973062.2432026/1‑150 (MQ=60)
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ATCATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAGAA > CP009273/2988405‑2988703
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |