Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,988,554 |
G→A |
100% |
intergenic (‑103/+119) |
ygeK ← / ← ygeN |
pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,988,554 | 0 | G | A | 96.6%
| 478.6
/ 4.8
| 146 | intergenic (‑103/+119) | ygeK/ygeN | pseudogene; putative 2‑component transcriptional regulator/pseudogene |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/2); new base A (87/54); total (90/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 150 total aligned reads displayed.
ATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACA > CP009273/2988408‑2988700
|
aTAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATaaaa < 2:5007266/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAAtata < 2:1266142/150‑1 (MQ=255)
cGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATaa > 1:3069948/1‑150 (MQ=255)
tgctgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaa > 1:2562624/1‑150 (MQ=255)
tgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAATATATAATTaaaaa > 1:2122548/1‑150 (MQ=255)
tgATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTaaaaa > 1:2122807/1‑150 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAaaaataa > 1:1385357/1‑150 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa > 2:926779/1‑150 (MQ=255)
tCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataa > 2:926716/1‑150 (MQ=255)
cTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaa < 2:986023/150‑1 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa > 2:1645127/1‑150 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa > 2:1645064/1‑150 (MQ=255)
tGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAaaaataaaa > 2:4016743/1‑150 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtt < 2:1281507/150‑1 (MQ=255)
aaaCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtt > 1:2169486/1‑150 (MQ=255)
aCTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAAtttt > 1:2760796/1‑150 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg > 1:1958765/1‑150 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg > 1:1958875/1‑150 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg > 1:4866599/1‑150 (MQ=255)
tACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTg > 1:2352001/1‑150 (MQ=255)
cAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCg > 1:3946719/1‑150 (MQ=255)
attttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTa < 2:630446/150‑1 (MQ=255)
ttttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaa < 1:5024858/150‑1 (MQ=255)
ttttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaa < 2:1912666/150‑1 (MQ=255)
ttttaattttTCCAATATATTCATCCTGAGTTTAAATTCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCTAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaa < 1:5163806/150‑1 (MQ=255)
tttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaa > 1:3996465/1‑150 (MQ=255)
ttaattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaaa > 1:31980/1‑150 (MQ=255)
taattttTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTaaaaa > 1:313212/1‑150 (MQ=255)
tttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAAt > 2:1074258/1‑150 (MQ=255)
tttttCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAAt > 2:1074433/1‑150 (MQ=255)
tCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACTCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCAAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATAcaa < 1:1167109/150‑3 (MQ=255)
tCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACca > 1:5006962/1‑150 (MQ=255)
tCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGAGTAAAAAAATACca > 2:581700/1‑150 (MQ=255)
ccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATacaaca > 1:1341531/1‑150 (MQ=255)
ccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACcaca < 1:2896778/150‑1 (MQ=255)
ccATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAA‑TTTTGCGTAAAAAAATACCACAg < 1:2370782/150‑1 (MQ=255)
tatatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGc > 2:2730483/1‑150 (MQ=255)
tatatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGc < 1:2874196/150‑1 (MQ=255)
tatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCAt > 1:933137/1‑150 (MQ=255)
tatTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCAt < 1:556127/150‑1 (MQ=255)
tCCTGTGTGTTATTGCTTTATCGCAGTCATTTATTTTCATCCCTTCCTTTTTTTTTTTATGCTAAATCCAAAGAATACTTTGATGAAATTTTATTATAAGATAATTAACATTATAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTtaaaa < 2:427066/150‑1 (MQ=255)
ccTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTaaaaaa > 1:2167985/1‑150 (MQ=255)
cTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAt > 1:4306499/1‑150 (MQ=255)
cTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAAt > 1:1848587/1‑150 (MQ=255)
gAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCa < 2:3405977/150‑1 (MQ=255)
aGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAATAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATTAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCAt < 1:4434791/150‑1 (MQ=255)
aGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCAt > 2:4462042/1‑150 (MQ=255)
aGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCAt < 1:2827995/150‑1 (MQ=255)
gtgtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATg > 2:3257443/1‑150 (MQ=255)
gtgtAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATg < 1:4461039/150‑1 (MQ=255)
tAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATgaga > 2:5006243/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgat < 1:4095492/150‑1 (MQ=255)
tGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAgatgat > 2:991684/1‑150 (MQ=255)
gatttAACGCTTTCATTTATAATCATCCCTTCAATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATTAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGAtt < 1:66677/148‑1 (MQ=255)
gCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGAtt < 1:4623007/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCACAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa < 1:2657710/150‑1 (MQ=255)
cTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATACTTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTa < 1:2110698/150‑1 (MQ=255)
tAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaaa > 2:5042741/1‑150 (MQ=255)
tAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTaaaa > 1:3739714/1‑150 (MQ=255)
gCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATAtt > 1:4023608/1‑150 (MQ=255)
gCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATAtt > 1:3995776/1‑150 (MQ=255)
gCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATAtt > 2:4061603/1‑150 (MQ=255)
aaTCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATta < 2:3303073/150‑1 (MQ=255)
tcCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTc > 1:1019275/1‑150 (MQ=255)
cTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCaaa > 1:1693938/1‑150 (MQ=255)
ttCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAAt > 1:481172/1‑150 (MQ=255)
ccATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCa > 1:3623266/1‑150 (MQ=255)
ccATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCa > 1:1403613/1‑150 (MQ=255)
ttattattaTAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTa > 1:347717/1‑150 (MQ=255)
tattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACt < 2:1534910/150‑1 (MQ=255)
tattatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACt > 1:2387403/1‑150 (MQ=255)
ttatAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTg < 1:1581674/150‑1 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGc < 2:1520211/150‑1 (MQ=255)
taAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGc < 2:4096367/150‑1 (MQ=255)
aaGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGcc < 1:3197319/150‑1 (MQ=255)
gCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAg < 1:3451752/150‑1 (MQ=255)
cAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAgg < 2:2217403/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAggg > 2:2244327/1‑150 (MQ=255)
aaaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAggg > 2:2244334/1‑150 (MQ=255)
aaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGa < 1:1056580/150‑1 (MQ=255)
aaaTCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATAACACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAAATTGAGCCAGGGa > 2:4758746/1‑150 (MQ=255)
tCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCt > 1:1505544/1‑150 (MQ=255)
ccAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCta > 1:4009339/1‑150 (MQ=255)
aaGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATaa < 1:1602618/150‑1 (MQ=255)
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gAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGt > 1:1454841/1‑150 (MQ=255)
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TATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGA < SRR19973063.4003933/150‑1 (MQ=60)
AAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCC > SRR19973063.944853/1‑150 (MQ=60)
AAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCC < SRR19973063.3207598/150‑1 (MQ=60)
GCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAG < SRR19973063.3462726/150‑1 (MQ=60)
AAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGG > SRR19973063.3461849/1‑150 (MQ=60)
AAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGA < SRR19973063.1059780/150‑1 (MQ=60)
AATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAG > SRR19973063.4954963/1‑150 (MQ=60)
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GAATACATTGATGAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGT < SRR19973063.4646734/150‑1 (MQ=60)
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GAAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTG > SRR19973063.256179/1‑150 (MQ=60)
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AAATAATAATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGC > SRR19973063.1266501/1‑150 (MQ=60)
AATAAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACA > SRR19973063.1411952/1‑150 (MQ=60)
AAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAGAA > SRR19973063.2246592/1‑150 (MQ=60)
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ATAAACGGCTGCTGATCTGAAACTACAATTTTAATTTTTCCCATATATTCATCCTGAGTGTAAATGCTTTAACGCATTCATTTATAATCATCCCTTCCATTATTATTATAAGCAAAATCCAAAGAATACATTGATGAAATAATAATGAAATATAATTAAAAATAAAATTTTTGCGTAAAAAAATACCACAGGCATTAAAAAATCATGAGATGATTAAAATATTACAATTAGATTATATTCAAATCATTAAACTTGAGCCAGGGAGCTATAAGTCCTCAGGGCTTGCCAAAACAGAA > CP009273/2988408‑2988703
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |