Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F110 I2 R1
|
8 |
55.0 |
1914758 |
94.7% |
1813275 |
142.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,184,542 |
C→A |
P1100Q (CCG→CAG) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,184,542 | 0 | C | A | 98.7%
| 224.3
/ NA
| 76 | P1100Q (CCG→CAG) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base A (39/36); total (40/36) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAG > NC_000913/4184402‑4184681
|
tCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGc > 1:83481/1‑143 (MQ=255)
ggCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACACCGAGAACGTGACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTgg > 2:397999/1‑143 (MQ=255)
gCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGCCGTAACCGTCAGTAATGCGTGATTTCTTCTCTTAACCCATTCGTAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACACCGGTAGACATCGTACTGAACAAGCTggg > 2:700071/1‑143 (MQ=255)
gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAAAGGTACGCCGGTAGACATCGTACAGAACCCGCGGGGCga > 1:180636/1‑142 (MQ=255)
gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGACGAACACGGTACGGCGGTAGACATCGTACTGAACCACCTCGGCga > 1:515467/1‑142 (MQ=255)
gTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAAATTCTAAGATGAACCAGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGACGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGt > 1:163456/1‑143 (MQ=255)
ttAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCAGCTGGGcaga > 2:664214/1‑140 (MQ=255)
aaaCGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTAcc > 2:788405/1‑143 (MQ=255)
aggcactATCCAGCCTGGTTACAAGATGGCAGGTCGTCACGCGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACTATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGt < 1:941514/137‑1 (MQ=255)
ccGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGTCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAACTGGGCGTACCGtctc < 2:152382/143‑1 (MQ=255)
ccGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGtctc < 2:712259/143‑1 (MQ=255)
gTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGt > 2:563433/1‑143 (MQ=255)
tacccAGCCTGGTGCCAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTa < 2:288340/140‑1 (MQ=255)
tCCAGCCGGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACTGTCTCGTATg < 2:826465/143‑1 (MQ=255)
cAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGGCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGaa < 1:552807/143‑1 (MQ=255)
ccTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGAAATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAAcgt > 2:646637/1‑141 (MQ=255)
cTGGTTACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATc < 1:742938/143‑1 (MQ=255)
tGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCg < 2:827822/143‑1 (MQ=255)
gATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTCCGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAGCGAGCTGCGCGAACCGTCTCGCACGAACACCGGGCAGATcc > 1:419312/1‑143 (MQ=255)
ttgCAGCTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAAGTTCTAAGATCAACACGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 1:41819/141‑1 (MQ=255)
tGGTAGGTCGTCAGGGGAACAAGGGTGGAATTCCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 2:118386/143‑1 (MQ=255)
tGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTc < 2:533923/143‑1 (MQ=255)
ggCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCg > 1:168563/1‑143 (MQ=255)
aGGTCTACACGGTATCACGGTTGTACTTTGTACGCTCAACCCGATCGAAGCTATGCCTTACGCTGAAATCCGTGCTCCTGTCCACCTCGTACTCAACCAGCGGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa < 1:831403/143‑1 (MQ=255)
aGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGaaa > 2:112250/1‑143 (MQ=255)
gtcgtcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAAcc > 2:391689/1‑143 (MQ=255)
cgtcACGGTAACGAGGGTGTAATTTCTAAGATCACCCCGCTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCa < 1:543892/143‑1 (MQ=255)
cgtcACGGTAACAAGGGTGGAATTTCTAAGAGCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAGCGGGACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCa < 1:769177/143‑1 (MQ=255)
tcACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATCAACATCGGTCAGATCCTCGAAAcccccc > 1:80956/1‑143 (MQ=255)
taaCGGGAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGACCCTCGAAACCCAcc > 1:166821/3‑143 (MQ=255)
acaattttttAATTTCTAATATCAACCCGATCGAATATATGCCTTACGATGAAAACTGTACTCCGATAGACATCGTACTGAACCATCTGGTCATACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 1:210495/134‑1 (MQ=255)
aCAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATg < 2:202885/143‑1 (MQ=255)
aCAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTCCCGTCTCGTATGATCATCCGTCACGTCCACGAAACCCACCTGGGTATg > 2:130544/1‑143 (MQ=255)
aaGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTCACGATGAAAACGGTACGCAGGTAGACATCGCACTGAACCAGCTCGGCGTAACGTCTCGTAGGGACATCGGTCGGGTGCTCGGCACCGCCCAGGGTACGGc > 1:922403/1‑143 (MQ=255)
aGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCt < 2:726764/143‑1 (MQ=255)
ggTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGCACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGGCACCCACGTGGGCGTGGCTGc > 1:31661/1‑143 (MQ=255)
ggTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCAGTAGACAGCGTTCTGAGCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACAGCGCTGAGATCCCCGAAAGCCACCAGGATATGGccca > 1:721099/1‑140 (MQ=255)
gtgtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCg > 1:525695/1‑143 (MQ=255)
gtAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCCGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGTTCTGGCTGCGaa > 2:878841/1‑143 (MQ=255)
ggaaTTTCGAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaa < 2:281335/141‑1 (MQ=255)
tAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGaaa > 2:783507/1‑143 (MQ=255)
aaTTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAGACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAg < 1:535926/143‑1 (MQ=255)
tCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAGGGTAt > 1:182911/1‑143 (MQ=255)
tCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTAt > 2:829945/1‑143 (MQ=255)
tAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg > 2:801840/1‑143 (MQ=255)
gATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACCGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGCAACCCACCAGGGTATGGATGCGAAAGGAATCGGCg > 1:18488/1‑143 (MQ=255)
aTCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCAGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCCGTCAGCTCCTCGAAACCCACCCCGGTCTCGCTGCGGAAGGTATCGGCGa > 1:76268/1‑143 (MQ=255)
tCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGCATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCCGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGAc > 1:120152/1‑143 (MQ=255)
accccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACGTCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACATAGATCTGGCGGCGAAAGGTAGCGGCGACaa < 1:581783/141‑1 (MQ=255)
aCCCGATCGAGGATATGCCTTACGATGACAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAg < 1:47724/143‑1 (MQ=255)
cccGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGa > 2:168677/1‑143 (MQ=255)
cGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATc < 2:839764/143‑1 (MQ=255)
aTCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCaa < 2:683908/143‑1 (MQ=255)
tctacgatctgtgctACTATGAAAACTGTACGCCTGTACACATCGTACTCAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCTAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:919243/129‑1 (MQ=255)
tagagcatatGCTTTGCTATCAAAACGGGAGGCGGGGATAAATCATACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTTTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCAACTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:61010/137‑1 (MQ=255)
tCGATGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCTAAAGGTATCGGCGACAAGATCAAc < 1:609401/143‑1 (MQ=255)
aaGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGcc > 2:732123/1‑143 (MQ=255)
aaGATATGCCTTACGATGAAAACCGTAACACGAAAAAATTGGGACTTAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGcc > 2:909262/1‑143 (MQ=255)
aGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCCGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGAGCAACACCa > 2:230625/1‑143 (MQ=255)
cTTACGATGAAACCGGTGCGCCGGTAGACTTCGTACTGAACCAGCTGCGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCGCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGaaa < 2:420403/143‑1 (MQ=255)
aTGAAAGCAGTACGCCGTTAGACATCCTACTCAACCAGCTGCTCCTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGGTCCTCCAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAcagcag < 1:658860/143‑1 (MQ=255)
gAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGAATCAGCGACAAGATCAACGCCACGCTGAACcagcaacc > 1:759780/1‑140 (MQ=255)
aaaaCGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCACCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCaa < 2:863360/143‑1 (MQ=255)
ggccggcGGTAGACATCGGACTGAACCAGCTGGGCGGACCGTCTCGGATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTc < 1:937413/137‑1 (MQ=255)
aCGCCGTTAGGCGTCGTACTGCACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTcgc < 1:688780/143‑1 (MQ=255)
gTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACt > 1:788305/1‑143 (MQ=255)
gTAGACATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGCATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAAAAGCAGCAAGGAGTCGCGAAACt > 1:276909/1‑143 (MQ=255)
aCATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGGCAAGATCAACGCCATGCCGAAACCGCAGCACGAAGCCACGAAACTgcgc > 2:868897/1‑143 (MQ=255)
cATCGTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGcgcg < 1:130544/143‑1 (MQ=255)
cGTACTGACCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAAt < 2:296112/143‑1 (MQ=255)
gTACTGAACCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAAtt < 2:525695/143‑1 (MQ=255)
aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg < 2:228979/79‑1 (MQ=255)
aaCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCg > 1:228979/1‑79 (MQ=255)
aCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGGGAAACTGCGCGAATTCATCCAg > 2:692196/1‑143 (MQ=255)
aCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCaacaag > 2:211381/1‑138 (MQ=255)
aCCAGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAg < 2:341930/143‑1 (MQ=255)
|
TCTGGCGGTTAAACGCCGTATCCAGCCTGGTGACAAGATGGCAGGTCGTCACGGTAACAAGGGTGTAATTTCTAAGATCAACCCGATCGAAGATATGCCTTACGATGAAAACGGTACGCCGGTAGACATCGTACTGAACCCGCTGGGCGTACCGTCTCGTATGAACATCGGTCAGATCCTCGAAACCCACCTGGGTATGGCTGCGAAAGGTATCGGCGACAAGATCAACGCCATGCTGAAACAGCAGCAAGAAGTCGCGAAACTGCGCGAATTCATCCAG > NC_000913/4184402‑4184681
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
