Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
2,004,533 |
G→T |
100% |
T151T (ACG→ACT) |
yedL → |
putative acyl transferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 2,004,533 | 0 | G | T | 100.0%
| 503.0
/ ‑6.7
| 202 | T151T (ACG→ACT) | yedL | putative acyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (4/2); major base T (86/103); minor base A (7/0); total (97/105) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GATGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACGCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTG > CP009273/2004388‑2004677
|
aTGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTa < 1:1955171/148‑1 (MQ=255)
gCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTCATTTACTCTATg > 1:2534234/1‑148 (MQ=255)
gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 1:111615/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 2:42948/148‑1 (MQ=255)
gCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAaataa < 1:1590005/148‑1 (MQ=255)
tGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGa < 2:2473056/148‑1 (MQ=255)
tGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGa < 2:2473395/148‑1 (MQ=255)
gAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGaa < 2:927491/148‑1 (MQ=255)
aGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCa < 1:259578/148‑1 (MQ=255)
aGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCa < 1:186407/148‑1 (MQ=255)
gAAACGGGTACACAGGCTGGATGTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCAt < 2:3300834/148‑1 (MQ=255)
aaaCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATg > 2:1239167/1‑148 (MQ=255)
aaaCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATg > 2:3006717/1‑148 (MQ=255)
aCGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAg > 1:1246955/1‑148 (MQ=255)
cGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGc < 2:2409696/148‑1 (MQ=255)
gggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGcc < 2:3096896/148‑1 (MQ=255)
gggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGcc < 2:1929564/148‑1 (MQ=255)
ggTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCa > 1:2829661/1‑148 (MQ=255)
gTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAATTTACTAAATTCG‑AAAATAATTAATTTGCATGATcccg > 1:1881281/1‑146 (MQ=255)
gTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAg < 1:3436212/148‑1 (MQ=255)
tACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGa < 2:560295/148‑1 (MQ=255)
tACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGAGTTTTTTAAATTACTCTATTCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCaca > 1:2789718/1‑146 (MQ=255)
tACACAGGCTGGATTTACGCCCTCCCATCNACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATAATNCACTACAACCACACAGACGATTTTTATGATTGTCACCATTCC‑CAAATAATGAAAAGCCAAGAGcccta > 2:1815917/1‑145 (MQ=255)
tGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGcaca < 1:3176749/148‑1 (MQ=255)
ggATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTCTATTCG‑AAAATAATTAATTTACATGAGCCAGACGCAGCACAt > 1:3149950/1‑148 (MQ=255)
ggATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTATATTCG‑AAAATAAATAATTTGCATGAGCCAGACGCAGcacaa > 1:3151010/1‑147 (MQ=255)
aTTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAAAAAAGAATTTCCATGAGCCAGACGCCCCACAtta > 1:2548527/1‑147 (MQ=255)
tttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTTCTATATGCG‑AAAATAATGAATTTCCCAGAGCCAGACGCAGCACAATCt > 2:326181/1‑148 (MQ=255)
ttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTAAATGTGTCTATTCG‑AAAATAAATAATTTGCAAGAGCCAGACGCAGCCCAtaaat > 1:3239713/1‑144 (MQ=255)
ttACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGAATCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCtt > 2:2693176/1‑148 (MQ=255)
cGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGAATCTATGCG‑AAAAAAATGAATTGCCCTGGTCCAGACGCAGCCCATTATTGCa > 1:2859217/1‑148 (MQ=255)
ggCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCAt < 2:3471944/148‑1 (MQ=255)
tGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACAATCTTGCAATCGa > 2:3716636/1‑148 (MQ=255)
tGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAAAAATGAATTGCCAAGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTCGa > 2:3711290/1‑148 (MQ=255)
ccATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACg < 2:594983/148‑1 (MQ=255)
cATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCGATGCG‑AAAAAAATGAATTTGCATGTTCCAGTCGCCGCACATTCATGCAATAGACGt > 2:2245720/1‑148 (MQ=255)
aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑AAAATAATTAATTGCCAAGAGCCACACGCAGCACATTCTTGCAATAGACGtg > 2:896745/1‑148 (MQ=255)
aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCCTTCGACGtg > 2:1898863/1‑148 (MQ=255)
aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGtg < 2:480487/148‑1 (MQ=255)
aTCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCAATGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGATCCAGACGCAGCACATTCTTTCATTAGACGtg > 2:1898349/1‑148 (MQ=255)
aCTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAAATGACTCTATGCG‑AAAATAATGAAATTGCATGATCCACACGCAGCACAATCTTGCAATCGACGtgctgc > 2:1056339/1‑148 (MQ=255)
ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑CAAAAAATTAAATGGCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGcc > 2:1634282/1‑148 (MQ=255)
ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAAATTCCATGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTAGACGTGCTGCGcc > 2:1474400/1‑148 (MQ=255)
ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATGGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGcc < 2:2937745/148‑1 (MQ=255)
ttATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTTCTCTATTCG‑AAAATAATTAAATTCCAAGAGCCAGACGCCCCACAATCTTGCATTAGACCTGGTGCGcc > 1:2472962/1‑148 (MQ=255)
tATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCt < 2:1478575/148‑1 (MQ=255)
aTTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtt < 1:3289344/148‑1 (MQ=255)
tttGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGAATCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTTCATTCGACGTGCTGCGCCttt > 2:627528/1‑148 (MQ=255)
tGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttat < 1:2991750/148‑1 (MQ=255)
tGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttat < 1:1725476/148‑1 (MQ=255)
aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATTATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattt < 2:2014606/148‑1 (MQ=255)
aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAAATTTATATATGCGAAAAAAAATAATTTGCCA‑GAGCCCCACGCACCCCAAAATTGCATTCGAAGTTCTGCGCCggtattt > 2:981021/1‑148 (MQ=255)
aaGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGAGTTTTTTGAATTTCTCTATTCG‑CAAAAAATTAATTGGCAAGAGCCCCACGCAGCACAATATTTCATTAGACGTGCTGCGGCgttattt > 1:202380/1‑148 (MQ=255)
aGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattta < 1:1062334/148‑1 (MQ=255)
aGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCtttattta < 1:3617576/148‑1 (MQ=255)
aTGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCa < 2:1580594/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATTCG‑GAAATAATGTATTTGCCTGAGCCAGAAGCACCACAATATTTCATTAGACCTGGGGCGGCGTTATTTATCAc > 1:3782529/1‑148 (MQ=255)
ggTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCAcc < 1:823529/148‑1 (MQ=255)
tCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTACTCAATGCG‑CAAATAATGAATTTCCAATATCCAGACGCCTCACATTATTGCATTCGAAGTGCTGCGCCTTTATTTATCAAcagca > 2:382249/1‑148 (MQ=255)
tCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCAAGAGCCAGACGCAGCACATTATTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTTTTTATAACcagca > 2:382246/1‑148 (MQ=255)
tGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGaa < 2:2402397/148‑1 (MQ=255)
gATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGaaa < 2:55298/148‑1 (MQ=255)
aTTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCATTCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGaaaa > 2:2292413/1‑147 (MQ=255)
aTTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTTCATTAGAAGTGCTGCGCCATTATTTATAACCAGCAGGAAAc > 2:3420335/1‑148 (MQ=255)
tGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTTTGAATTTATCTATTCG‑AAAATAATGAAATTGCATGAGCCAGACCCAGCACCTTATTGCATTAGACGTTCTGCGCCTTTTTTTATAAACAGCACGAAACGc > 1:2189043/1‑148 (MQ=255)
tGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTAATCTATTCG‑AAAAAAATTTATTTGCATGAGCCAGACGCAGCCCAATCTTTAAATAGACGTGGGGGGGCTTTTTTTTTAAACAGCACGAAAAGc > 1:2715503/1‑148 (MQ=255)
tGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTTAAAAAATTCG‑AAAATAATGAAATTCCCTGAGCCACACGCAACACATTCTTTCAATAGACGTTCTGAGCCTTTAATTTTAACACGCATGAAACGc > 2:3201078/1‑148 (MQ=255)
gCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGcc < 1:2295385/148‑1 (MQ=255)
aCCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGt < 2:2343949/148‑1 (MQ=255)
aCCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGt < 2:151821/148‑1 (MQ=255)
aCCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGt < 1:1479697/148‑1 (MQ=255)
ccGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATAATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGTGCCAGACCCAGCACATTCTTGCCTTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATAACCAGCAGGAAACGCCTTGTc > 2:446224/1‑148 (MQ=255)
cGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTcc < 1:991735/148‑1 (MQ=255)
tttGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCAt > 2:205903/1‑148 (MQ=255)
tGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAg < 1:1851571/148‑1 (MQ=255)
gCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGa < 2:3583831/148‑1 (MQ=255)
aTTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑CAAATAATTAATTTCCCTGAGCCCCACGCAGCACATTCTTTCCTTCGAAGTTCTGCGCCGTTATTTATCACCACCAGGAAAACCCATGTCCAAAGACGcc > 2:2341349/1‑148 (MQ=255)
tATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATTCG‑AAAAAAATGAAATTCCATGAGCCACGAGCACCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCGGTATTTATAACCAGCAGGAAACCCCTTGTCCATATACGcccc > 2:2719037/1‑148 (MQ=255)
cGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTc < 2:2646335/148‑1 (MQ=255)
aCTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGACTCTATGCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCca < 2:805421/148‑1 (MQ=255)
cTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTTACTCTATGCG‑AAAATAATGAAATGCCATGAGCCAGACGCAGCACAATCTTTCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATAACCACCAGGAAAAGCCTTGTCCATAGACGCCCCGTCcac > 2:749889/1‑148 (MQ=255)
tCCACACAGTCGATTTTTATAAATGACTCTATGCG‑AAAAAAATGAAATTCCATGAGCCAGACGCAGCACAATATTGCATTCGACGTGCTGCGCCGTTATTTATCAACACCAGGAAACGCCGTGTCCATAGACGCCCCGACcacaatcg > 2:1719661/1‑144 (MQ=255)
tCCACACAGTCGATGTTTATCATTGACTCTATTCG‑AAAATAATGAATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAAAGCCTTGTCCATATACGCCCCATCCACATgcg > 2:717807/1‑148 (MQ=255)
ccACACAGTCGATTTTTATAAATTAAACAATTCC‑AAAAAAAAGAAATGCCAAGAGCCCGACCCCGCACAATCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTGTATTTTTAACCACCAGCAAACCCCTAGTACAAATAAGCCCCAGACACAAgcgc > 2:676005/1‑148 (MQ=255)
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CAGTCGATTTTTATCATTTA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATT‑AATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCACCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAACA > SRR19973069.255457/1‑150 (MQ=60)
AGTCGATTTTTATCATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTTCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAA > SRR19973069.1935040/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTATCATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCT < SRR19973069.2362241/150‑1 (MQ=60)
GATTTTTATCATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCT > SRR19973069.550390/1‑150 (MQ=60)
TTTTATCATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTA < SRR19973069.3026668/150‑1 (MQ=60)
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CATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAG < SRR19973069.2652058/150‑1 (MQ=60)
ATTGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGT > SRR19973069.2951982/1‑150 (MQ=60)
TGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTGA > SRR19973069.1169448/1‑150 (MQ=60)
TGA‑‑‑‑CTCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGAGA > SRR19973069.2046147/1‑150 (MQ=60)
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CAGATGCCTTCATCGCCTGAGCTTAGAAACGGGTACACAGGCTGGATTTACGGCCTGCCATCAACTTTATTTGAAGCATGGTTTCGCTGATTGCGAACCGTTTGCTGATTATCGACTTGATCCACACAGTCGATTTTTATCATTGA‑‑‑‑CGCTATGCG‑AAAATAATG‑AATTGCCATGAGCCAGACGCAGCACATTCTTGCATTCGACGTGCTGCGCCTTTATTTATCACCAGCAGGAAACGCCTTGTCCATAGACGCCCCTTCCACATGCGCCACAAGAAACCTCTATTCCAGTGA > CP009273/2004386‑2004678
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
